Published May 3, 2024 | Version v1
Publication Open

Prevalence and genetic basis of Mycobacterium tuberculosis resistance to pretomanid in China

Creators

  • 1. Chinese Center For Disease Control and Prevention
  • 2. Beijing Children's Hospital
  • 3. Capital Medical University
  • 4. TB Alliance
  • 5. Peking University
  • 6. Gansu Provincial Center for Disease Control and Prevention
  • 7. Chengdu Center for Disease Control and Prevention

Description

Abstract Background Pretomanid is a key component of new regimens for the treatment of drug-resistant tuberculosis (TB) which are being rolled out globally. However, there is limited information on the prevalence of pre-existing resistance to the drug. Methods To investigate pretomanid resistance rates in China and its underlying genetic basis, as well as to generate additional minimum inhibitory concentration (MIC) data for epidemiological cutoff (ECOFF)/breakpoint setting, we performed MIC determinations in the Mycobacterial Growth Indicator Tube™ (MGIT) system, followed by WGS analysis, on 475 Mycobacterium tuberculosis (MTB) isolated from Chinese TB patients between 2013 and 2020. Results We observed a pretomanid MIC distribution with a 99% ECOFF equal to 0.5 mg/L. Of the 15 isolates with MIC values > 0.5 mg/L, one (MIC = 1 mg/L) was identified as MTB lineage 1 (L1), a genotype previously reported to be intrinsically less susceptible to pretomanid, two were borderline resistant (MIC = 2–4 mg/L) and the remaining 12 isolates were highly resistant (MIC ≥ 16 mg/L) to the drug. Five resistant isolates did not harbor mutations in the known pretomanid resistant genes. Conclusions Our results further support a breakpoint of 0.5 mg/L for a non-L1 MTB population, which is characteristic of China. Further, our data point to an unexpected high (14/475, 3%) pre-existing pretomanid resistance rate in the country, as well as to the existence of yet-to-be-discovered pretomanid resistance genes.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية مجردة تعد مادة بريتومانيد مكونًا رئيسيًا في الأنظمة الجديدة لعلاج السل المقاوم للأدوية والتي يتم طرحها على مستوى العالم. ومع ذلك، هناك معلومات محدودة عن انتشار المقاومة الموجودة مسبقًا للدواء. طرق للتحقيق في معدلات مقاومة الطفيليات في الصين وأساسها الجيني الأساسي، بالإضافة إلى إنشاء بيانات إضافية للحد الأدنى من التركيز المثبط (MIC) لتحديد القطع الوبائي (ECOFF)/نقطة التوقف، أجرينا تحديدات MIC في نظام أنبوب مؤشر النمو الفطري (MGIT)، متبوعًا بتحليل WGS، على 475 مرض السل الفطري (MTB) المعزول عن مرضى السل الصينيين بين عامي 2013 و 2020. النتائج لاحظنا توزيع ميكروفون ما قبل الأومانيد بنسبة 99 ٪ ECOFF تساوي 0.5 مجم/لتر. من بين 15 عزلًا بقيم ميكروفون > 0.5 مجم/لتر، تم تحديد واحد (ميكروفون = 1 مجم/لتر) على أنه سلالة MTB 1 (L1)، وهو نمط وراثي تم الإبلاغ عنه سابقًا بأنه أقل عرضة جوهريًا لما قبل الأومانيد، واثنان كانا مقاومين للحدود (ميكروفون = 2–4 مجم/لتر) والعزلات الـ 12 المتبقية كانت شديدة المقاومة (ميكروفون > 16 مجم/لتر) للدواء. لم تكن هناك خمس عزلات مقاومة تحتوي على طفرات في الجينات المقاومة لما قبل الغيبوبة المعروفة. الاستنتاجات تدعم نتائجنا أيضًا نقطة توقف قدرها 0.5 مجم/لتر للسكان غير L1 MTB، وهي سمة من سمات الصين. علاوة على ذلك، تشير بياناتنا إلى ارتفاع غير متوقع (14/475، 3 ٪) لمعدل مقاومة ما قبل الإغماء الموجود مسبقًا في البلاد، بالإضافة إلى وجود جينات مقاومة ما قبل الإغماء التي لم يتم اكتشافها بعد.

Translated Description (French)

Résumé Contexte Le prétomanide est un élément clé des nouveaux schémas thérapeutiques pour le traitement de la tuberculose pharmacorésistante (TB) qui sont en cours de déploiement à l'échelle mondiale. Cependant, il existe peu d'informations sur la prévalence de la résistance préexistante au médicament. Méthodes Pour étudier les taux de résistance aux prétomanides en Chine et sa base génétique sous-jacente, ainsi que pour générer des données supplémentaires sur la concentration inhibitrice minimale (CMI) pour l'établissement du seuil épidémiologique (ECOFF)/du point de rupture, nous avons effectué des déterminations de la CMI dans le système Mycobacterial Growth Indicator Tube™ (MGIT), suivies d'une analyse WGS, sur 475 Mycobacterium tuberculosis (MTB) isolés de patients tuberculeux chinois entre 2013 et 2020. Résultats Nous avons observé une distribution de CMI prétomanide avec un ECOFF à 99 % égal à 0,5 mg/L. Sur les 15 isolats avec des valeurs de CMI > 0,5 mg/L, un (CMI = 1 mg/L) a été identifié comme étant la lignée 1 (L1) du MTB, un génotype précédemment signalé comme étant intrinsèquement moins sensible au prétomanide, deux étaient résistants à la limite (CMI = 2–4 mg/L) et les 12 isolats restants étaient très résistants (CMI ≥ 16 mg/L) au médicament. Cinq isolats résistants ne portaient pas de mutations dans les gènes résistants aux prétomanides connus. Conclusions Nos résultats confirment en outre un point de rupture de 0,5 mg/L pour une population de MTB non L1, ce qui est caractéristique de la Chine. En outre, nos données indiquent un taux de résistance aux prétomanides pré-existant inattendu (14/475, 3 %) dans le pays, ainsi que l'existence de gènes de résistance aux prétomanides encore à découvrir.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes abstractos La pretomanida es un componente clave de los nuevos regímenes para el tratamiento de la tuberculosis resistente a los medicamentos (TB) que se están implementando a nivel mundial. Sin embargo, hay información limitada sobre la prevalencia de resistencia preexistente al fármaco. Métodos Para investigar las tasas de resistencia a pretománidos en China y su base genética subyacente, así como para generar datos adicionales de concentración inhibitoria MÍNIMA (CIM) para el ajuste de corte epidemiológico (ECOFF)/punto de interrupción, realizamos determinaciones de CIM en el sistema Mycobacterial Growth Indicator Tube™ (MGIT), seguido de análisis WGS, en 475 Mycobacterium tuberculosis (MTB) aislados de pacientes chinos con TB entre 2013 y 2020. Resultados Observamos una distribución de MIC pretomanida con un ECOFF del 99% igual a 0.5 mg/L. De los 15 aislados con valores de MIC > 0.5 mg/L, uno (MIC = 1 mg/L) se identificó como linaje MTB 1 (L1), un genotipo previamente informado como intrínsecamente menos susceptible a pretomanida, dos eran resistentes al límite (MIC = 2–4 mg/L) y los 12 aislados restantes eran altamente resistentes (MIC ≥ 16 mg/L) al fármaco. Cinco aislados resistentes no albergaron mutaciones en los genes resistentes a pretománidos conocidos. Conclusiones Nuestros resultados respaldan aún más un punto de ruptura de 0,5 mg/L para una población de MTB no L1, que es característica de China. Además, nuestros datos apuntan a una tasa de resistencia pretománida inesperadamente alta (14/475, 3%) preexistente en el país, así como a la existencia de genes de resistencia pretománida aún por descubrir.

Files

s12941-024-00697-0.pdf

Files (1.9 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:797b3fc7b90ff5d6bcb98223b236d713
1.9 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الانتشار والأساس الوراثي لمقاومة المتفطرة السلية لما قبل الجنين في الصين
Translated title (French)
Prévalence et base génétique de la résistance de Mycobacterium tuberculosis au prétomanide en Chine
Translated title (Spanish)
Prevalencia y base genética de la resistencia de Mycobacterium tuberculosis a pretomanida en China

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4396625671
DOI
10.1186/s12941-024-00697-0

Is supplement to
https://openalex.org/W4387653263 (Other)
https://openalex.org/W2950988122 (Other)
https://openalex.org/W2506149209 (Other)
https://openalex.org/W2388615761 (Other)
https://openalex.org/W2380167321 (Other)
https://openalex.org/W2361749487 (Other)
https://openalex.org/W2352153050 (Other)
https://openalex.org/W2351380870 (Other)
https://openalex.org/W2140071436 (Other)
https://openalex.org/W1983144055 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W2010320265
  • https://openalex.org/W2069290534
  • https://openalex.org/W2338427111
  • https://openalex.org/W2801963931
  • https://openalex.org/W2898147485
  • https://openalex.org/W2929344608
  • https://openalex.org/W2970043508
  • https://openalex.org/W2973028036
  • https://openalex.org/W3004563929
  • https://openalex.org/W3009705041
  • https://openalex.org/W3011638906
  • https://openalex.org/W3022473231
  • https://openalex.org/W3092751309
  • https://openalex.org/W3175334768
  • https://openalex.org/W3202639926
  • https://openalex.org/W3204880959
  • https://openalex.org/W4213204962
  • https://openalex.org/W4214714440
  • https://openalex.org/W4221007313
  • https://openalex.org/W4291019294
  • https://openalex.org/W4293105242