Published April 15, 2021
| Version v1
Publication
Open
Molecular Identification of Diplodia seriata Causing Dieback Effect on Grapevines and Evaluation of Five Different Synthetic Fungicide Efficacy against This Disease in Vitro
Description
The aim of this study was to realize the molecular identification of Diplodia seriata De Not., a member of the Botryosphaericea family, isolated from 2-10 years old vines in vineyards showing symptoms of dieback disease. The susceptibility of the pathogen against the fungicides with the fosetyl-Al+triadimenol, azoxystorbin+difecanozole, fludioxanil+cyprodinil, metrafenone, fluopyram+tebuconazole combinations were evaluated. The isolates obtained from the root and crown parts of the vine samples were identified as D. seriata according to the morphological and molecular methods. In molecular identification, the ITS (Internal Transcribed Spacer) and TUB2 (β-tubulin) gene regions of the isolates were amplified by Real-Time PCR and the nucleotide sequences were obtained in these gene regions. After using the MEGA 7 software, ITS and TUB2 sequences were aligned and a combined phylogenetic tree was made. It has been molecularly confirmed that the D. seriata isolate has a 100% similarity index with Diplodia species according to the phylogenetic analyses. The mean effective concentration (EC50) values of fungicides used with different concentrations (0, 1, 3, 10, 30, 50, 100 μL mL-1) were determined by Probit analysis. Cyprodinil + fludioxonil showed the highest efficacy (100%) at a concentration of 1 μL mL-1. According to EC50 values, cyprodinil + fludioxonil (0.001 μL mL-1) was recorded as the most effective fungicide followed by fluopyram + tebuconazole (0.520 μL mL-1) and, azoxystrobin + difenoconazole (2.958 μL mL-1), respectively.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
كان الهدف من هذه الدراسة هو تحقيق التحديد الجزيئي لـ Diplodia seriata De Not.، وهو عضو في عائلة Botryosphaericea، معزول عن الكروم التي يتراوح عمرها بين 2 و 10 سنوات في كروم العنب والتي تظهر عليها أعراض مرض الموت. تم تقييم قابلية العامل الممرض ضد مبيدات الفطريات مع تركيباتفوسيتيل-آل + ترياديمينول، آزوكسيستوربين + ديفيكانوزول، فلوديوكسانيل + سايبرودينيل،ميترافينون، فلوبيرام +تيبوكونازول. تم تحديد العزلات التي تم الحصول عليها من أجزاء الجذر والتاج من عينات الكرمة على أنها D. Seriata وفقًا للطرق المورفولوجية والجزيئية. في التحديد الجزيئي، تم تضخيم مناطق جين ITS (الفاصل الداخلي المنسوخ) و TUB2 (β - tubulin) في العزلات بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي وتم الحصول على تسلسل النيوكليوتيدات في مناطق الجينات هذه. بعد استخدام برنامج ميجا 7، تمت محاذاة تسلسلات ITS و TUB2 وتم إنشاء شجرة سلالات مجتمعة. تم التأكيد جزيئيًا على أن عزل D. seriata له مؤشر تشابه بنسبة 100 ٪ مع أنواع Diplodia وفقًا لتحليلات النشوء والتطور. تم تحديد قيم التركيز الفعال المتوسط (EC50) لمبيدات الفطريات المستخدمة بتركيزات مختلفة (0، 1، 3، 10، 30، 50، 100 ميكرولتر ملليلتر -1) من خلال تحليل Probit. أظهر سيبرودينيل + فلوديوكسونيل أعلى فعالية (100 ٪) بتركيز 1 ميكرولتر مل -1. وفقًا لقيم التركيز النصفي الفعال، تم تسجيل سيبرودينيل + فلوديوكسونيل (0.001 ميكرولتر-1) على أنه مبيد الفطريات الأكثر فعالية يليه فلوبيرام + تيبوكونازول (0.520 ميكرولتر-1) وأزوكسيستروبين + ديفينوكونازول (2.958 ميكرولتر-1)، على التوالي.Translated Description (French)
Le but de cette étude était de réaliser l'identification moléculaire de Diplodia seriata De Not., un membre de la famille Botryosphaericea, isolé de vignes âgées de 2 à 10 ans dans des vignobles présentant des symptômes de dépérissement. La sensibilité de l'agent pathogène aux fongicides avec les associations fosétyl-Al+triadiménol, azoxystorbine+difécanozole, fludioxanil+cyprodinil, métrafénone, fluopyram+tébuconazole a été évaluée. Les isolats obtenus à partir des parties racine et couronne des échantillons de vigne ont été identifiés comme D. seriata selon les méthodes morphologiques et moléculaires. En identification moléculaire, les régions du gène ITS (Internal Transcribed Spacer) et TUB2 (β-tubulin) des isolats ont été amplifiées par PCR en temps réel et les séquences nucléotidiques ont été obtenues dans ces régions du gène. Après avoir utilisé le logiciel MEGA 7, les séquences ITS et TUB2 ont été alignées et un arbre phylogénétique combiné a été réalisé. Il a été confirmé moléculairement que l'isolat de D. seriata a un indice de similarité de 100% avec les espèces Diplodia selon les analyses phylogénétiques. Les valeurs de concentration efficace moyenne (CE50) des fongicides utilisés avec différentes concentrations (0, 1, 3, 10, 30, 50, 100 μL mL-1) ont été déterminées par analyse Probit. Le cyprodinil + fludioxonil a montré l'efficacité la plus élevée (100 %) à une concentration de 1 μL mL-1. Selon les valeurs de la CE50, le cyprodinil + fludioxonil (0,001 μL mL-1) a été enregistré comme le fongicide le plus efficace, suivi du fluopyram + tébuconazole (0,520 μL mL-1) et de l'azoxystrobine + difénoconazole (2,958 μL mL-1), respectivement.Translated Description (Spanish)
El objetivo de este estudio fue realizar la identificación molecular de Diplodia seriata De Not., un miembro de la familia Botryosphaericea, aislado de vides de 2-10 años de edad en viñedos que muestran síntomas de enfermedad de muerte regresiva. Se evaluó la susceptibilidad del patógeno frente a los fungicidas con las combinaciones fosetil-Al+triadimenol, azoxistrobina +difecanozol, fludioxanilo +ciprodinilo, metrafenona, fluopiram+tebuconazol. Los aislados obtenidos de las partes de raíz y corona de las muestras de vid se identificaron como D. seriata de acuerdo con los métodos morfológicos y moleculares. En la identificación molecular, las regiones génicas ITS (Internal Transcribed Spacer) y TUB2 (β-tubulina) de los aislados se amplificaron mediante PCR en tiempo real y las secuencias de nucleótidos se obtuvieron en estas regiones génicas. Después de utilizar el software MEGA 7, se alinearon las secuencias ITS y TUB2 y se realizó un árbol filogenético combinado. Se ha confirmado molecularmente que el aislado de D. seriata tiene un índice de similitud del 100% con las especies de Diplodia según los análisis filogenéticos. Los valores medios de concentración efectiva (EC50) de los fungicidas utilizados con diferentes concentraciones (0, 1, 3, 10, 30, 50, 100 μL mL-1) se determinaron mediante análisis Probit. Cyprodinil + fludioxonil mostró la mayor eficacia (100%) a una concentración de 1 μL mL-1. De acuerdo con los valores de EC50, se registró ciprodinil + fludioxonil (0.001 μL mL-1) como el fungicida más efectivo seguido de fluopiram + tebuconazol (0.520 μL mL-1) y, azoxistrobina + difenoconazol (2.958 μL mL-1), respectivamente.Files
1517497.pdf
Files
(928.5 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:80f81f368c64ccf6b433c820bf8b7eff
|
928.5 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التحديد الجزيئي للديبلوديا سيرياتا المسببة لتأثير الارتداد على كروم العنب وتقييم خمس فعالية مختلفة لمبيدات الفطريات الاصطناعية ضد هذا المرض في المختبر
- Translated title (French)
- Identification moléculaire de Diplodia seriata causant un effet de dépérissement sur la vigne et évaluation de l'efficacité de cinq fongicides synthétiques différents contre cette maladie in vitro
- Translated title (Spanish)
- Identificación molecular de Diplodia seriata que causa el efecto de la muerte regresiva en las vides y evaluación de la eficacia de cinco fungicidas sintéticos diferentes contra esta enfermedad in vitro
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3154951113
- DOI
- 10.23902/trkjnat.863506
References
- https://openalex.org/W1569161606
- https://openalex.org/W1869907716
- https://openalex.org/W2021847300
- https://openalex.org/W2025569701
- https://openalex.org/W2032625481
- https://openalex.org/W2049448264
- https://openalex.org/W2057142059
- https://openalex.org/W2061421781
- https://openalex.org/W2107710405
- https://openalex.org/W2126142552
- https://openalex.org/W2127139523
- https://openalex.org/W2132632499
- https://openalex.org/W2139031276
- https://openalex.org/W2149437707
- https://openalex.org/W2165872248
- https://openalex.org/W2752431348
- https://openalex.org/W2758286886
- https://openalex.org/W2921504790
- https://openalex.org/W3040339057