Published June 1, 2023
| Version v1
Publication
Open
eDNA testing reveals surprising findings on fish population dynamics in Thailand
- 1. Chiang Mai University
- 2. University of Phayao
Description
COVID-19, a global health concern, has an effect on all aspects of the economy. The aquaculture and fishing industries were severely harmed as a result of the closures in multiple nations. Regular systems for inventory monitoring, production, and supply were disrupted. Cancellation of programmes for research, fieldwork, sampling, and tagging influences management-required data. For effective species management, fish dispersion assessments are indispensable. However, due to the difficulty of accessing sampling sites and the associated costs, there is frequently a lack of comprehensive information regarding the distribution and abundance of organisms. The COVID-19 prohibition made fish monitoring more problematic. Due to constant pressure, populations of the stone lapping minnow (Garra cambodgiensis), one of Thailand's overfished fish, are rapidly declining. Therefore, eDNA-based monitoring was devised and implemented to reveal the likely dispersal of the species in Thailand prior to and following the lockdown. At 28 locations within the Chao Phraya River Basin, water samples were collected. qPCR was used to determine the presence or absence of G. cambodgiensis in water samples. In 78 of 252 water samples, a wide range of computed copy numbers for G. cambodgiensis eDNA was observed. It was discovered that samples collected in 2021 (after the lockdown) contain a higher concentration of G. cambodgiensis eDNA than samples collected in 2018 or 2019 (prior to the lockdown). The closure appears to be a boon and may result in a substantial restocking of the fish we have studied. Overall, eDNA-based analysis is an extremely promising new survey instrument.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
يؤثر كوفيد-19، وهو مصدر قلق صحي عالمي، على جميع جوانب الاقتصاد. تضررت صناعات الاستزراع المائي وصيد الأسماك بشدة نتيجة للإغلاق في دول متعددة. تعطلت الأنظمة المنتظمة لرصد المخزون والإنتاج والإمداد. يؤثر إلغاء برامج البحث والعمل الميداني وأخذ العينات ووضع العلامات على البيانات المطلوبة للإدارة. من أجل الإدارة الفعالة للأنواع، لا غنى عن تقييمات تشتت الأسماك. ومع ذلك، نظرًا لصعوبة الوصول إلى مواقع أخذ العينات والتكاليف المرتبطة بها، غالبًا ما يكون هناك نقص في المعلومات الشاملة المتعلقة بتوزيع الكائنات الحية ووفرتها. جعل حظر COVID -19 مراقبة الأسماك أكثر إشكالية. بسبب الضغط المستمر، يتناقص عدد أسماك المنوة المتلطخة بالحجارة (Garra cambodgiensis)، وهي واحدة من أسماك تايلاند التي تتعرض للصيد المفرط، بسرعة. لذلك، تم تصميم وتنفيذ المراقبة القائمة على eDNA للكشف عن التشتت المحتمل للأنواع في تايلاند قبل وبعد الإغلاق. في 28 موقعًا داخل حوض نهر تشاو فرايا، تم جمع عينات المياه. تم استخدام qPCR لتحديد وجود أو عدم وجود G. cambodgiensis في عينات المياه. في 78 من 252 عينة مياه، لوحظت مجموعة واسعة من أرقام النسخ المحسوبة لـ G. cambodgiensis eDNA. تم اكتشاف أن العينات التي تم جمعها في عام 2021 (بعد الإغلاق) تحتوي على تركيز أعلى من G. cambodgiensis eDNA من العينات التي تم جمعها في عام 2018 أو 2019 (قبل الإغلاق). يبدو أن الإغلاق نعمة وقد يؤدي إلى إعادة تخزين كبيرة للأسماك التي درسناها. بشكل عام، يعد التحليل القائم على eDNA أداة مسح جديدة واعدة للغاية.Translated Description (French)
Le COVID-19, un problème de santé mondial, a un effet sur tous les aspects de l'économie. Les industries de l'aquaculture et de la pêche ont été gravement touchées par les fermetures dans plusieurs pays. Les systèmes réguliers de suivi des stocks, de production et d'approvisionnement ont été perturbés. L'annulation des programmes de recherche, de travail sur le terrain, d'échantillonnage et de marquage influence les données requises par la direction. Pour une gestion efficace des espèces, des évaluations de la dispersion des poissons sont indispensables. Cependant, en raison de la difficulté d'accès aux sites d'échantillonnage et des coûts associés, il y a souvent un manque d'informations complètes sur la distribution et l'abondance des organismes. L'interdiction de la COVID-19 a rendu la surveillance des poissons plus problématique. En raison de la pression constante, les populations de ménés lapidaires (Garra cambodgiensis), l'un des poissons thaïlandais surexploités, sont en déclin rapide. Par conséquent, une surveillance basée sur l'ADN électronique a été conçue et mise en œuvre pour révéler la dispersion probable de l'espèce en Thaïlande avant et après le confinement. Des échantillons d'eau ont été prélevés à 28 endroits dans le bassin de la rivière Chao Phraya. La qPCR a été utilisée pour déterminer la présence ou l'absence de G. cambodgiensis dans les échantillons d'eau. Dans 78 des 252 échantillons d'eau, un large éventail de nombres de copies calculées pour l'ADNe de G. cambodgiensis a été observé. Il a été découvert que les échantillons prélevés en 2021 (après le confinement) contiennent une concentration plus élevée d'ADNe de G. cambodgiensis que les échantillons prélevés en 2018 ou 2019 (avant le confinement). La fermeture semble être une aubaine et peut entraîner un repeuplement important des poissons que nous avons étudiés. Dans l'ensemble, l'analyse basée sur l'ADN électronique est un nouvel instrument d'enquête extrêmement prometteur.Translated Description (Spanish)
El COVID-19, un problema de salud mundial, tiene un efecto en todos los aspectos de la economía. Las industrias de la acuicultura y la pesca se vieron gravemente perjudicadas como resultado de los cierres en varias naciones. Se interrumpieron los sistemas regulares de monitoreo de inventario, producción y suministro. La cancelación de programas de investigación, trabajo de campo, muestreo y etiquetado influye en los datos requeridos por la administración. Para una gestión eficaz de las especies, las evaluaciones de dispersión de peces son indispensables. Sin embargo, debido a la dificultad de acceso a los sitios de muestreo y los costos asociados, con frecuencia existe una falta de información integral sobre la distribución y abundancia de organismos. La prohibición de COVID-19 hizo que el monitoreo de peces fuera más problemático. Debido a la presión constante, las poblaciones del pececillo (Garra cambodgiensis), uno de los peces sobreexplotados de Tailandia, están disminuyendo rápidamente. Por lo tanto, se ideó e implementó un monitoreo basado en eDNA para revelar la probable dispersión de la especie en Tailandia antes y después del confinamiento. En 28 ubicaciones dentro de la cuenca del río Chao Phraya, se recolectaron muestras de agua. qPCR se utilizó para determinar la presencia o ausencia de G. cambodgiensis en muestras de agua. En 78 de 252 muestras de agua, se observó una amplia gama de números de copia calculados para eDNA de G. cambodgiensis. Se descubrió que las muestras recolectadas en 2021 (después del confinamiento) contienen una mayor concentración de eDNA de G. cambodgiensis que las muestras recolectadas en 2018 o 2019 (antes del confinamiento). El cierre parece ser una bendición y puede resultar en una repoblación sustancial de los peces que hemos estudiado. En general, el análisis basado en eDNA es un nuevo instrumento de encuesta extremadamente prometedor.Files
pdf.pdf
Files
(16.0 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:6ed4ac0364e5d9c1e051bf18d9bef032
|
16.0 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- يكشف اختبار eDNA عن نتائج مفاجئة حول ديناميكيات أعداد الأسماك في تايلاند
- Translated title (French)
- les tests eDNA révèlent des résultats surprenants sur la dynamique des populations de poissons en Thaïlande
- Translated title (Spanish)
- las pruebas de ADNe revelan hallazgos sorprendentes sobre la dinámica de la población de peces en Tailandia
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4380200141
- DOI
- 10.1016/j.heliyon.2023.e17102
References
- https://openalex.org/W1501319480
- https://openalex.org/W1552342091
- https://openalex.org/W1963762596
- https://openalex.org/W1975487785
- https://openalex.org/W1999121382
- https://openalex.org/W1999707424
- https://openalex.org/W2000256327
- https://openalex.org/W2032019813
- https://openalex.org/W2036390749
- https://openalex.org/W2037132010
- https://openalex.org/W2039133821
- https://openalex.org/W2063726689
- https://openalex.org/W2088695664
- https://openalex.org/W2144819879
- https://openalex.org/W2146048484
- https://openalex.org/W2152917310
- https://openalex.org/W2164313753
- https://openalex.org/W2171100005
- https://openalex.org/W2198736673
- https://openalex.org/W2216003651
- https://openalex.org/W2291467831
- https://openalex.org/W2331239048
- https://openalex.org/W2398092094
- https://openalex.org/W2520334322
- https://openalex.org/W2538761605
- https://openalex.org/W2738937228
- https://openalex.org/W2807946431
- https://openalex.org/W2895632034
- https://openalex.org/W2911813797
- https://openalex.org/W2940868702
- https://openalex.org/W2955025593
- https://openalex.org/W2971761152
- https://openalex.org/W2974095620
- https://openalex.org/W2975606474
- https://openalex.org/W2981417217
- https://openalex.org/W2986980359
- https://openalex.org/W3005808645
- https://openalex.org/W3012515801
- https://openalex.org/W3026582775
- https://openalex.org/W3028559526
- https://openalex.org/W3036497772
- https://openalex.org/W3045818358
- https://openalex.org/W3047379538
- https://openalex.org/W3048190739
- https://openalex.org/W3049732719
- https://openalex.org/W3086868605
- https://openalex.org/W3087942109
- https://openalex.org/W3088561654
- https://openalex.org/W3089330201
- https://openalex.org/W3096257853
- https://openalex.org/W3104614168
- https://openalex.org/W3108465019
- https://openalex.org/W3112185477
- https://openalex.org/W3127058133
- https://openalex.org/W3139148610
- https://openalex.org/W3157721851
- https://openalex.org/W3164174927
- https://openalex.org/W3184309389
- https://openalex.org/W3192208616
- https://openalex.org/W3214572197
- https://openalex.org/W4205896249
- https://openalex.org/W4245043124
- https://openalex.org/W4280521878
- https://openalex.org/W4309269849
- https://openalex.org/W577087891
- https://openalex.org/W584264561