Published August 13, 2020 | Version v1
Publication Open

HLA-B*35 as a new marker for susceptibility to Human T-cell Lymphotropic Virus type 1 (HTLV-1) Associated Myelopathy/Tropical Spastic Paraparesis (HAM/TSP) in patients living in Argentina

Creators

  • 1. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida
  • 2. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
  • 3. University of Buenos Aires
  • 4. Weatherford College
  • 5. Kimberly-Clark (Canada)
  • 6. University of California, San Francisco

Description

Abstract Background: Human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) is the etiological agent of HTLV associated myelopathy/ Tropical Spastic Paraparesis (HAM/TSP) and Adult T cell leukemia/lymphoma (ATLL), in around 2-5% of the infected individuals. Host genetic background might play a role in disease progression. Several previous studies across many countries report HLA haplotype to be one such factor. Here, we sequenced HLA-A, -B and -C of 66 individuals by Sequence-Based Typing (SBT), and compared the frequency of different alleles among ATLL patients, HAM/TSP patients, asymptomatic carriers and non-infected individuals living in Argentina. Results: The frequency of HLA-A, -B and -C alleles largely matched that of the general population in Argentina. We identified HLA-A*02, HLA-B*35 and HLA-C*07 as associated to protection from ATLL (p=0.031), susceptibility to HAM/TSP (p<0.001) and susceptibility to ATLL (p=0.017), respectively. We also found a strong correlation between high proviral load (PVL) and disease (p=0.008), but were unable to identify any particular allele associated with high or low PVL. Conclusions: We have found HLA-A*02, HLA-B*35 and HLA-C*07 to be associated to protection from ATLL (HLA-A*02) and susceptibility to HAM/TSP (HLA-B*35) or to ATLL (HLA-C*07), respectively. Whereas HLA-A*02 protection from ATLL has already been extensively described in other regions of the world, this is the first report that links HLA-B*35 and an increased susceptibility to HAM/TSP. As for HLA-C*07 it has previously been associated to susceptibility to HAM/TSP in other countries but in our population it has been linked to ATLL.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

نبذة مختصرة: الفيروس الليمفاوي للخلايا التائية البشرية من النوع 1 (HTLV -1) هو العامل المسبب للاعتلال النخاعي المرتبط بفيروس HTLV/الخزل النخاعي التشنجي الاستوائي (HAM/TSP) وسرطان الدم/الورم الليمفاوي للخلايا التائية للبالغين (ATLL)، في حوالي 2-5 ٪ من الأفراد المصابين. قد تلعب الخلفية الوراثية للمضيف دورًا في تطور المرض. أفادت العديد من الدراسات السابقة في العديد من البلدان أن النمط الفرداني لـ HLA هو أحد هذه العوامل. هنا، قمنا بتسلسل HLA - A و - B و - C لـ 66 فردًا حسب الطباعة القائمة على التسلسل (SBT)، وقارنا تواتر الأليلات المختلفة بين مرضى ATLL ومرضى HAM/TSP وناقلات بدون أعراض والأفراد غير المصابين الذين يعيشون في الأرجنتين. النتائج: تطابق تواتر أليلات HLA - A و - B و - C إلى حد كبير مع تواتر عموم السكان في الأرجنتين. حددنا HLA - A*02 و HLA - B*35 و HLA - C *07 على أنها مرتبطة بالحماية من ATLL (p=0.031)، وقابلية الإصابة بـ HAM/TSP (p<0.001) وقابلية الإصابة بـ ATLL (p=0.017)، على التوالي. وجدنا أيضًا ارتباطًا قويًا بين الحمل البروفيرالي المرتفع (PVL) والمرض (p=0.008)، لكننا لم نتمكن من تحديد أي أليل معين مرتبط بالحمل البروفيرالي المرتفع أو المنخفض. الاستنتاجات: وجدنا أن HLA - A*02 و HLA - B*35 و HLA - C *07 مرتبطة بالحماية من ATLL (HLA - A*02) وقابلية الإصابة بـ HAM/TSP (HLA - B*35) أو ATLL (HLA - C *07)، على التوالي. في حين أن حماية HLA - A*02 من ATLL قد تم وصفها بالفعل على نطاق واسع في مناطق أخرى من العالم، فإن هذا هو التقرير الأول الذي يربط HLA - B*35 وزيادة التعرض لحم الخنزير/ملعقة صغيرة. أما بالنسبة لـHLA - C *07 فقد ارتبط سابقًا بالتعرض لحم الخنزير/ملعقة صغيرة في بلدان أخرى ولكن في سكاننا تم ربطه بـ ATLL.

Translated Description (French)

Résumé Contexte : Le virus lymphotrope T humain de type 1 (HTLV-1) est l'agent étiologique de la myélopathie/paraparésie spastique tropicale (HAM/TSP) associée au HTLV et de la leucémie/lymphome T de l'adulte (ATLL), chez environ 2 à 5 % des personnes infectées. Le contexte génétique de l'hôte pourrait jouer un rôle dans la progression de la maladie. Plusieurs études antérieures menées dans de nombreux pays indiquent que l'haplotype HLA est l'un de ces facteurs. Ici, nous avons séquencé HLA-A, -B et -C de 66 personnes par typage basé sur la séquence (SBT), et comparé la fréquence de différents allèles chez les patients ATLL, les patients HAM/TSP, les porteurs asymptomatiques et les personnes non infectées vivant en Argentine. Résultats : La fréquence des allèles HLA-A, -B et -C correspondait largement à celle de la population générale en Argentine. Nous avons identifié HLA-A*02, HLA-B*35 et HLA-C*07 comme associés à la protection contre l'ATLL (p=0,031), à la sensibilité au JAMBON/TSP (p<0,001) et à la sensibilité à l'ATLL (p=0,017), respectivement. Nous avons également trouvé une forte corrélation entre la charge provirale élevée (PVL) et la maladie (p=0,008), mais nous n'avons pas pu identifier d'allèle particulier associé à une PVL élevée ou faible. Conclusions : Nous avons constaté que HLA-A*02, HLA-B*35 et HLA-C*07 sont associés à la protection contre l'ATLL (HLA-A*02) et à la sensibilité au JAMBON/TSP (HLA-B*35) ou à l'ATLL (HLA-C*07), respectivement. Alors que la protection HLA-A*02 contre l'ATLL a déjà été largement décrite dans d'autres régions du monde, il s'agit du premier rapport qui relie HLA-B*35 et une sensibilité accrue au JAMBON/TSP. Quant au HLA-C*07, il a déjà été associé à une sensibilité au JAMBON/TSP dans d'autres pays, mais dans notre population, il a été lié à l'ATLL.

Translated Description (Spanish)

Resumen Antecedentes: El virus linfotrópico de células T humanas tipo 1 (HTLV-1) es el agente etiológico de la mielopatía asociada al HTLV/Paraparesia espástica tropical (HAM/TSP) y la leucemia/linfoma de células T adultas (ATLL), en alrededor del 2-5% de los individuos infectados. Los antecedentes genéticos del huésped podrían desempeñar un papel en la progresión de la enfermedad. Varios estudios previos en muchos países informan que el haplotipo HLA es uno de esos factores. Aquí, secuenciamos HLA-A, -B y -C de 66 individuos mediante tipificación basada en secuencia (SBT) y comparamos la frecuencia de diferentes alelos entre pacientes con ATLL, pacientes con HAM/TSP, portadores asintomáticos e individuos no infectados que viven en Argentina. Resultados: La frecuencia de los alelos HLA-A, -B y -C coincidió en gran medida con la de la población general en Argentina. Identificamos HLA-A*02, HLA-B*35 y HLA-C*07 como asociados a la protección contra ATLL (p=0,031), susceptibilidad a HAM/TSP (p<0,001) y susceptibilidad a ATLL (p=0,017), respectivamente. También encontramos una fuerte correlación entre la alta carga proviral (PVL) y la enfermedad (p=0.008), pero no pudimos identificar ningún alelo particular asociado con la PVL alta o baja. Conclusiones: Hemos encontrado que HLA-A*02, HLA-B*35 y HLA-C*07 están asociados a la protección contra ATLL (HLA-A*02) y la susceptibilidad a HAM/TSP (HLA-B*35) o a ATLL (HLA-C*07), respectivamente. Si bien la protección HLA-A*02 contra ATLL ya se ha descrito ampliamente en otras regiones del mundo, este es el primer informe que vincula HLA-B*35 y una mayor susceptibilidad a HAM/TSP. En cuanto a HLA-C*07 se ha asociado previamente a susceptibilidad a HAM/TSP en otros países pero en nuestra población se ha vinculado a ATLL.

Files

latest.pdf.pdf

Files (3.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:7a3f2ad7aefdf4648b89cc4dd96cb5c3
3.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
HLA - B*35 كعلامة جديدة لقابلية الإصابة بالفيروس اللمفاوي للخلايا التائية البشرية من النوع 1 (HTLV -1) المرتبط باعتلال النخاع الشوكي/خزل شوكي استوائي (HAM/TSP) في المرضى الذين يعيشون في الأرجنتين
Translated title (French)
HLA-B*35 comme nouveau marqueur de la sensibilité au virus lymphotrope T humain de type 1 (HTLV-1) associé à la myélopathie/paraparésie spastique tropicale (JAM/TSP) chez les patients vivant en Argentine
Translated title (Spanish)
HLA-B*35 como nuevo marcador de susceptibilidad al virus linfotrópico de células T humanas tipo 1 (HTLV-1) Mielopatía asociada/Paraparesia espástica tropical (HAM/TSP) en pacientes que viven en Argentina

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4232378745
DOI
10.21203/rs.3.rs-30627/v3

Is supplement to
https://openalex.org/W2429239164 (Other)
https://openalex.org/W2339980524 (Other)
https://openalex.org/W2171787185 (Other)
https://openalex.org/W2147544359 (Other)
https://openalex.org/W2107961028 (Other)
https://openalex.org/W2094346537 (Other)
https://openalex.org/W2089048401 (Other)
https://openalex.org/W2076751939 (Other)
https://openalex.org/W2040547974 (Other)
https://openalex.org/W1977162384 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Argentina

References

  • https://openalex.org/W1780523975
  • https://openalex.org/W1984903732
  • https://openalex.org/W1986777034
  • https://openalex.org/W2006716066
  • https://openalex.org/W2007313776
  • https://openalex.org/W2009009026
  • https://openalex.org/W2014251742
  • https://openalex.org/W2016004199
  • https://openalex.org/W2069667541
  • https://openalex.org/W2080441045
  • https://openalex.org/W2089869396
  • https://openalex.org/W2107866356
  • https://openalex.org/W2124597475
  • https://openalex.org/W2131287383
  • https://openalex.org/W2148459761
  • https://openalex.org/W2153236663
  • https://openalex.org/W2165109848
  • https://openalex.org/W2399778456
  • https://openalex.org/W2989602891
  • https://openalex.org/W4250178961