Published May 11, 2022 | Version v1
Publication Open

Development and validation a pyroptosis related gene prognostic index for metastatic urothelial carcinoma based on immune checkpoint blockade therapy

Creators

  • 1. Peking University

Description

Abstract Background Immune checkpoint blockade (ICB) therapy has become a first-line treatment option for metastatic urothelial carcinoma (mUC) patients who do not meet the criteria of cisplatin. Still, only a few people can benefit from it, so useful predictive markers are needed. Methods Download the ICB-based mUC and chemotherapy-based bladder cancer cohorts, and extract the expression data of pyroptosis-related genes (PRG). The LASSO algorithm was used to construct the PRG prognostic index (PRGPI) in the mUC cohort, and we verified the prognostic ability of PRGPI in two mUC and two bladder cancer cohorts. Results Most of the PRG in the mUC cohort were immune-activated genes, and a few were immunosuppressive genes. The PRGPI composed of GZMB, IRF1, and TP63 can stratify the risk of mUC. In IMvigor210 and GSE176307 cohorts, the P-values of Kaplan Meier analysis was < 0.01 and 0.002, respectively. PRGPI could also predict ICB response, and the chi-square test of the two cohorts had P-values of 0.002 and 0.046, respectively. In addition, PRGPI can also predict the prognosis of two bladder cancer cohorts based on chemotherapy. The PRGPI and the expression of PDCD1 / CD274 had a high degree of synergistic correlation. The Low PRGPI group showed prominent characteristics of immune infiltration and was enriched in the immune signal activation pathway. Conclusion The PRGPI we constructed can effectively predict the treatment response and overall survival rate of mUC patients treated with ICB. The PRGPI can help mUC patients achieve individualized and accurate treatment in the future.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

أصبح العلاج بحصار نقطة التفتيش المناعية (ICB) خيارًا علاجيًا أوليًا لمرضى سرطان الظهارة البولية النقيلي (MUC) الذين لا يستوفون معايير السيسبلاتين. ومع ذلك، لا يمكن إلا لعدد قليل من الناس الاستفادة منه، لذلك هناك حاجة إلى علامات تنبؤية مفيدة. الطرق قم بتنزيل MCU القائم على ICB ومجموعات سرطان المثانة القائمة على العلاج الكيميائي، واستخرج بيانات التعبير عن الجينات المرتبطة بالتدلي الحراري (PRG). تم استخدام خوارزمية لاسو لبناء مؤشر PRG التنبئي (PRGPI) في مجموعة mUC، وتحققنا من القدرة التنبؤية لـ PRGPI في مجموعتين من mUC ومجموعتين من سرطان المثانة. النتائج معظم PRG في مجموعة mUC كانت جينات نشطة مناعيًا، وعدد قليل منها كان جينات مثبطة للمناعة. يمكن أن يقوم PRGPI المكون من GZMB و IRF1 و TP63 بتقسيم مخاطر mUC. في مجموعات IMvigor210 و GSE176307، كانت قيم P لتحليل كابلان ماير < 0.01 و 0.002 على التوالي. يمكن أن يتنبأ PRGPI أيضًا باستجابة ICB، وكان لاختبار مربع كاي للمجموعتين قيم P تبلغ 0.002 و 0.046 على التوالي. بالإضافة إلى ذلك، يمكن لـ PRGPI أيضًا التنبؤ بتشخيص مجموعتين من سرطان المثانة بناءً على العلاج الكيميائي. كان لـ PRGPI والتعبير عن PDCD1 /CD274 درجة عالية من الارتباط التآزري. أظهرت مجموعة PRGPI المنخفضة خصائص بارزة للتسلل المناعي وتم إثرائها في مسار تنشيط الإشارة المناعية. الخلاصة يمكن لـ PRGPI الذي أنشأناه أن يتنبأ بشكل فعال باستجابة العلاج ومعدل البقاء الإجمالي لمرضى MCU الذين عولجوا بـ ICB. يمكن أن يساعد PRGPI مرضى mUC على تحقيق علاج فردي ودقيق في المستقبل.

Translated Description (French)

Résumé Contexte Le traitement par blocage des points de contrôle immunitaires (ICB) est devenu une option de traitement de première intention pour les patients atteints de carcinome urothélial métastatique (mUC) qui ne répondent pas aux critères du cisplatine. Pourtant, seules quelques personnes peuvent en bénéficier, des marqueurs prédictifs utiles sont donc nécessaires. Méthodes Téléchargez les cohortes de cancers de la vessie à base de mUC et de chimiothérapie basées sur ICB, et extrayez les données d'expression des gènes liés à la pyroptose (PRG). L'algorithme LASSO a été utilisé pour construire l'indice pronostique PRG (PRGPI) dans la cohorte mUC, et nous avons vérifié la capacité pronostique de PRGPI dans deux cohortes de cancer mUC et deux cohortes de cancer de la vessie. Résultats La plupart des PRG dans la cohorte mUC étaient des gènes immuno-activés, et quelques-uns étaient des gènes immunosuppresseurs. Le PRGPI composé de GZMB, IRF1 et TP63 peut stratifier le risque de MUC. Dans les cohortes IMvigor210 et GSE176307, les valeurs P de l'analyse de Kaplan Meier étaient < 0,01 et 0,002, respectivement. PRGPI pouvait également prédire la réponse ICB, et le test du chi carré des deux cohortes avait des valeurs de P de 0,002 et 0,046, respectivement. De plus, le PRGPI peut également prédire le pronostic de deux cohortes de cancer de la vessie en fonction de la chimiothérapie. Le PRGPI et l'expression de PDCD1 / CD274 présentaient un degré élevé de corrélation synergique. Le groupe à faible PRGPI a montré des caractéristiques importantes d'infiltration immunitaire et a été enrichi dans la voie d'activation du signal immunitaire. Conclusion Le PRGPI que nous avons construit peut prédire efficacement la réponse au traitement et le taux de survie global des patients atteints de mUC traités par ICB. Le PRGPI peut aider les patients atteints de MUC à obtenir un traitement individualisé et précis à l'avenir.

Translated Description (Spanish)

Resumen Antecedentes La terapia de bloqueo de puntos de control inmunitario (ICB) se ha convertido en una opción de tratamiento de primera línea para pacientes con carcinoma urotelial metastásico (mUC) que no cumplen con los criterios de cisplatino. Aún así, solo unas pocas personas pueden beneficiarse de ella, por lo que se necesitan marcadores predictivos útiles. Métodos Descargue las cohortes de cáncer de vejiga basadas en mUC y quimioterapia basadas en ICB y extraiga los datos de expresión de genes relacionados con la piroptosis (PRG). El algoritmo LASSO se utilizó para construir el índice de pronóstico PRG (PRGPI) en la cohorte de mUC, y verificamos la capacidad de pronóstico de PRGPI en dos cohortes de mUC y dos de cáncer de vejiga. Resultados La mayoría de los PRG en la cohorte mUC eran genes inmunoactivados, y algunos eran genes inmunosupresores. El PRGPI compuesto por GZMB, IRF1 y TP63 puede estratificar el riesgo de mUC. En las cohortes IMvigor210 y GSE176307, los valores P del análisis de Kaplan Meier fueron < 0,01 y 0,002, respectivamente. PRGPI también pudo predecir la respuesta de ICB, y la prueba de chi-cuadrado de las dos cohortes tuvo valores P de 0.002 y 0.046, respectivamente. Además, el PRGPI también puede predecir el pronóstico de dos cohortes de cáncer de vejiga en función de la quimioterapia. El PRGPI y la expresión de PDCD1 / CD274 tuvieron un alto grado de correlación sinérgica. El grupo de PRGPI bajo mostró características prominentes de infiltración inmune y se enriqueció en la vía de activación de la señal inmune. Conclusión El PRGPI que construimos puede predecir de manera efectiva la respuesta al tratamiento y la tasa de supervivencia general de los pacientes con mUC tratados con ICB. El PRGPI puede ayudar a los pacientes con mUC a lograr un tratamiento individualizado y preciso en el futuro.

Files

latest.pdf.pdf

Files (2.7 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:af5cefc5388ee1b46c5a4850eec98b55
2.7 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تطوير والتحقق من صحة مؤشر تنبؤي للجينات المتعلقة بالتنامي الحراري لسرطان الظهارة البولية النقيلي بناءً على علاج الحصار المناعي لنقطة التفتيش
Translated title (French)
Développement et validation d'un index de pronostic génique lié à la pyroptose pour le carcinome urothélial métastatique basé sur un traitement de blocage du point de contrôle immunitaire
Translated title (Spanish)
Desarrollo y validación de un índice de pronóstico genético relacionado con la piroptosis para el carcinoma urotelial metastásico basado en la terapia de bloqueo de puntos de control inmunitario

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4280503804
DOI
10.21203/rs.3.rs-1625353/v1

Is supplement to
https://openalex.org/W4362515066 (Other)
https://openalex.org/W4362158722 (Other)
https://openalex.org/W4361271945 (Other)
https://openalex.org/W4200507838 (Other)
https://openalex.org/W3197188017 (Other)
https://openalex.org/W3166800855 (Other)
https://openalex.org/W3029432090 (Other)
https://openalex.org/W2575161424 (Other)
https://openalex.org/W2263980547 (Other)
https://openalex.org/W2085972006 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W2101670384
  • https://openalex.org/W2123106337
  • https://openalex.org/W2123879591
  • https://openalex.org/W2124614719
  • https://openalex.org/W2133225803
  • https://openalex.org/W2210073947
  • https://openalex.org/W2289712604
  • https://openalex.org/W2588916311
  • https://openalex.org/W2763670669
  • https://openalex.org/W2774605139
  • https://openalex.org/W2785803176
  • https://openalex.org/W2955518591
  • https://openalex.org/W3011500848
  • https://openalex.org/W3012485477
  • https://openalex.org/W3016811071
  • https://openalex.org/W3103119004
  • https://openalex.org/W3106723715
  • https://openalex.org/W3134056000
  • https://openalex.org/W3183142599
  • https://openalex.org/W3195490970
  • https://openalex.org/W3202013745
  • https://openalex.org/W3206305860