Published January 1, 2018 | Version v1
Publication Open

Antimicrobial potential of actinomycetes isolated from unexplored hot Merzouga desert and their taxonomic diversity

Creators

  • 1. Centre National pour la Recherche Scientifique et Technique (CNRST)
  • 2. Cadi Ayyad University
  • 3. Université Ibn Zohr

Description

The absence of new antibiotics is guiding more and more researchers to specific ecosystems. One hundred and sixty-three Actinobacteria isolates were isolated from Merzouga sand and screened for their antibacterial and antifungal activities. To test the antimicrobial effect of isolates, four microorganisms known as human potential pathogens were used. The electrophoretic profiles of isolates obtained by repetitive element PCR fingerprinting (rep-PCR) were compared by clustering. Results showed that among the tested isolates, 59% were active against one or more in testing Gram-positive, Gram-negative and the yeast Candida albicans The importance of culture media for the activity expression was revealed. Comparative analysis of antimicrobial activity divided isolates into 15 groups. The comparison of the average diameters of inhibition zones using Minitab V.17 allowed subdivision of the 15 groups into 20 subgroups. Dendrograms derived from the BOXA1R-PCR fingerprints showed that 36 isolates were grouped in 16 clusters, containing from two to four isolates while 127 isolates were not grouped. The tested antimicrobial activities showed a high biological diversity with important inhibition of pathogens tested. The rep-PCR revealed a high taxonomic diversity of isolates. The combination of antimicrobial activity and rep-PCR results revealed the diverse pattern of Merzouga sand dune Actinobacteria.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يؤدي عدم وجود مضادات حيوية جديدة إلى توجيه المزيد والمزيد من الباحثين إلى أنظمة بيئية محددة. تم عزل مائة وثلاثة وستين عزلة من البكتيريا الشعاعية من رمل مرزوقا وفحصها لأنشطتها المضادة للبكتيريا والفطريات. لاختبار التأثير المضاد للميكروبات للعزلات، تم استخدام أربعة كائنات دقيقة تعرف باسم مسببات الأمراض البشرية المحتملة. تمت مقارنة التشكيلات الكهرومغناطيسية للعزلات التي تم الحصول عليها عن طريق بصمة PCR للعناصر المتكررة (rep - PCR) عن طريق التجميع. أظهرت النتائج أنه من بين العزلات التي تم اختبارها، كان 59 ٪ نشطين ضد واحد أو أكثر في اختبار إيجابية الجرام وسلبية الجرام والخميرة المبيضات البيضاء تم الكشف عن أهمية وسائط الاستزراع للتعبير عن النشاط. ينقسم التحليل المقارن لنشاط مضادات الميكروبات إلى 15 مجموعة. سمحت مقارنة متوسط أقطار مناطق التثبيط باستخدام Minitab V.17 بتقسيم المجموعات الـ 15 إلى 20 مجموعة فرعية. أظهرت الشجيرات المستمدة من بصمات أصابع BOXA1R - PCR أن 36 عزلًا تم تجميعها في 16 مجموعة، تحتوي على اثنين إلى أربعة عزلات بينما لم يتم تجميع 127 عزلًا. أظهرت الأنشطة المضادة للميكروبات التي تم اختبارها تنوعًا بيولوجيًا كبيرًا مع تثبيط مهم لمسببات الأمراض التي تم اختبارها. كشف REP - PCR عن تنوع تصنيفي عالٍ للعزلات. كشف الجمع بين النشاط المضاد للميكروبات ونتائج تفاعل البوليميراز المتسلسل Rep - PCR عن النمط المتنوع لكثبان ميرزوجا الرملية الشعاعية.

Translated Description (French)

L'absence de nouveaux antibiotiques oriente de plus en plus de chercheurs vers des écosystèmes spécifiques. Cent soixante-trois isolats d'Actinobactéries ont été isolés du sable de Merzouga et criblés pour leurs activités antibactériennes et antifongiques. Pour tester l'effet antimicrobien des isolats, quatre micro-organismes connus sous le nom d'agents pathogènes potentiels humains ont été utilisés. Les profils électrophorétiques des isolats obtenus par PCR par éléments répétitifs (REP-PCR) ont été comparés par clustering. Les résultats ont montré que parmi les isolats testés, 59% étaient actifs contre un ou plusieurs dans les tests Gram positif, Gram négatif et la levure Candida albicans. L'importance des milieux de culture pour l'expression de l'activité a été révélée. L'analyse comparative de l'activité antimicrobienne a divisé les isolats en 15 groupes. La comparaison des diamètres moyens des zones d'inhibition à l'aide de Minitab V.17 a permis de subdiviser les 15 groupes en 20 sous-groupes. Les dendrogrammes dérivés des empreintes BOXA1R-PCR ont montré que 36 isolats ont été regroupés en 16 grappes, contenant de deux à quatre isolats tandis que 127 isolats n'ont pas été regroupés. Les activités antimicrobiennes testées ont montré une grande diversité biologique avec une inhibition importante des agents pathogènes testés. La REP-PCR a révélé une grande diversité taxonomique d'isolats. La combinaison de l'activité antimicrobienne et des résultats de la REP-PCR a révélé la diversité des caractéristiques des Actinobactéries des dunes de Merzouga.

Translated Description (Spanish)

La ausencia de nuevos antibióticos está guiando cada vez a más investigadores a ecosistemas específicos. Se aislaron ciento sesenta y tres cepas de Actinobacteria de la arena de Merzouga y se examinaron para determinar sus actividades antibacterianas y antifúngicas. Para probar el efecto antimicrobiano de los aislados, se utilizaron cuatro microorganismos conocidos como patógenos potenciales humanos. Los perfiles electroforéticos de los aislados obtenidos mediante huella digital de PCR de elementos repetitivos (rep-PCR) se compararon mediante agrupamiento. Los resultados mostraron que entre los aislados probados, el 59% eran activos contra uno o más en las pruebas Gram-positivas, Gram-negativas y la levadura Candida albicans. Se reveló la importancia de los medios de cultivo para la expresión de la actividad. El análisis comparativo de la actividad antimicrobiana dividió los aislados en 15 grupos. La comparación de los diámetros medios de las zonas de inhibición utilizando Minitab V.17 permitió la subdivisión de los 15 grupos en 20 subgrupos. Los dendrogramas derivados de las huellas dactilares de BOXA1R-PCR mostraron que 36 aislados se agruparon en 16 grupos, que contenían de dos a cuatro aislados, mientras que 127 aislados no se agruparon. Las actividades antimicrobianas probadas mostraron una alta diversidad biológica con una importante inhibición de los patógenos probados. La rep-PCR reveló una alta diversidad taxonómica de aislados. La combinación de la actividad antimicrobiana y los resultados de rep-PCR revelaron el patrón diverso de las Actinobacterias de la duna de arena de Merzouga.

Files

bio035410.full.pdf.pdf

Files (93 Bytes)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:b0d506893d4802090edf1644f5f082cd
93 Bytes
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
إمكانات مضادات الميكروبات للفطريات الشعاعية المعزولة عن صحراء مرزوقا الساخنة غير المستكشفة وتنوعها التصنيفي
Translated title (French)
Potentiel antimicrobien des actinomycètes isolés du désert chaud inexploré de Merzouga et leur diversité taxonomique
Translated title (Spanish)
Potencial antimicrobiano de los actinomicetos aislados del desierto caliente inexplorado de Merzouga y su diversidad taxonómica

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2888415848
DOI
10.1242/bio.035410

Is supplement to
https://openalex.org/W4362508968 (Other)
https://openalex.org/W4309514212 (Other)
https://openalex.org/W3091777037 (Other)
https://openalex.org/W3029732278 (Other)
https://openalex.org/W2778267304 (Other)
https://openalex.org/W2742010288 (Other)
https://openalex.org/W2367173716 (Other)
https://openalex.org/W2347270899 (Other)
https://openalex.org/W2247003880 (Other)
https://openalex.org/W2102861863 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Morocco

References

  • https://openalex.org/W1489988168
  • https://openalex.org/W1552237914
  • https://openalex.org/W1891093925
  • https://openalex.org/W1970472057
  • https://openalex.org/W1973507391
  • https://openalex.org/W1985191032
  • https://openalex.org/W2008989822
  • https://openalex.org/W2017324943
  • https://openalex.org/W2019410656
  • https://openalex.org/W2025661061
  • https://openalex.org/W2046364391
  • https://openalex.org/W2048163712
  • https://openalex.org/W2074294833
  • https://openalex.org/W2075396004
  • https://openalex.org/W2178324140
  • https://openalex.org/W2183183766
  • https://openalex.org/W2225787375
  • https://openalex.org/W2275786037
  • https://openalex.org/W2285949578
  • https://openalex.org/W2576163548
  • https://openalex.org/W2606094535
  • https://openalex.org/W2608351237
  • https://openalex.org/W2611870706
  • https://openalex.org/W2789258863
  • https://openalex.org/W4285719527
  • https://openalex.org/W69220301