Published February 9, 2017 | Version v1
Publication Open

MicroRNA expression patterns and target prediction in multiple myeloma development and malignancy

Creators

  • 1. Institute for Medical Research
  • 2. University of Malaya

Description

Epigenetic changes have emerged as key causes in the development and progression of multiple myeloma (MM). In this study, global microRNA (miRNA) expression profiling were performed for 27 MM (19 specimens and 8 cell lines) and 3 normal controls by microarray. miRNA-targets were identified by integrating the miRNA expression profiles with mRNA expression profiles of the matched samples (unpublished data). Two miRNAs were selected for verification by RT-qPCR (miR-150-5p and miR-4430). A total of 1791 and 8 miRNAs were over-expressed and under-expressed, respectively in MM compared to the controls (fold change ≥2.0; p < 0.05). The miRNA-mRNA integrative analysis revealed inverse correlation between 5 putative target genes (RAD54L, CCNA2, CYSLTR2, RASGRF2 and HKDC1) and 15 miRNAs (p < 0.05). Most of the differentially expressed miRNAs are involved in survival, proliferation, migration, invasion and drug resistance in MM. Some have never been described in association with MM (miR-33a, miR-9 and miR-211). Interestingly, our results revealed 2 miRNAs, which are closely related to B cell differentiation (miR-150 and miR-125b). For the first time, we suggest that miR-150 might be potential negative regulator for two critical cell cycle control genes, RAD54L and CCNA2, whereas miR-125b potentially target RAS and CysLT signaling proteins, namely RASGRF2 and CYSLTR2, respectively. This study has enhanced our understanding on the pathobiology of MM and opens up new avenues for future research in myelomagenesis.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ظهرت التغيرات اللاجينية كأسباب رئيسية في تطور وتطور الورم النخاعي المتعدد (MM). في هذه الدراسة، تم إجراء تنميط تعبير microRNA العالمي (miRNA) لـ 27 MM (19 عينة و 8 خطوط خلوية) و 3 عناصر تحكم طبيعية بواسطة المصفوفة الدقيقة. تم تحديد أهداف miRNA من خلال دمج ملفات تعريف تعبير miRNA مع ملفات تعريف تعبير miRNA للعينات المتطابقة (البيانات غير المنشورة). تم اختيار اثنين من miRNAs للتحقق من قبل RT - qPCR (miR -150-5 p و miR -4430). تم التعبير عن ما مجموعه 1791 و 8 miRNAs بشكل مفرط وناقص التعبير، على التوالي في MM مقارنة بعناصر التحكم (تغيير الطي ≥2.0 ؛ p < 0.05). كشف التحليل التكاملي miRNA - mRNA عن علاقة عكسية بين 5 جينات مستهدفة مفترضة (RAD54L و CCNA2 و CYSLTR2 و RASGRF2 و HKDC1) و 15 miRNAs (p < 0.05). وتشارك معظم miRNAs التي يتم التعبير عنها بشكل مختلف في البقاء على قيد الحياة والانتشار والهجرة والغزو ومقاومة الأدوية في MM. لم يتم وصف بعضها بالاقتران مع MM (miR -33a و miR -9 و miR -211). ومن المثير للاهتمام أن نتائجنا كشفت عن 2 miRNAs، والتي ترتبط ارتباطًا وثيقًا بتمايز الخلايا البائية (miR -150 و miR -125b). لأول مرة، نقترح أن miR -150 قد يكون منظمًا سلبيًا محتملاً لجينين للتحكم في دورة الخلايا الحرجة، RAD54L و CCNA2، في حين أن miR -125b من المحتمل أن يستهدف بروتينات إشارات RAS و CysLT، وهما RASGRF2 و CYSLTR2، على التوالي. عززت هذه الدراسة فهمنا لبيولوجيا أمراض MM وفتحت طرقًا جديدة للبحث المستقبلي في تكوين النخاع الشوكي.

Translated Description (French)

Les changements épigénétiques sont apparus comme des causes clés du développement et de la progression du myélome multiple (MM). Dans cette étude, un profilage global de l'expression des microARN (miARN) a été effectué pour 27 MM (19 spécimens et 8 lignées cellulaires) et 3 témoins normaux par microréseau. Les cibles des miARN ont été identifiées en intégrant les profils d'expression des miARN aux profils d'expression des ARNm des échantillons appariés (données non publiées). Deux miARN ont été sélectionnés pour vérification par RT-qPCR (miR-150-5p et miR-4430). Au total, 1791 et 8 miARN ont été surexprimés et sous-exprimés, respectivement dans le MM par rapport aux témoins (changement de pli ≥2,0 ; p < 0,05). L'analyse intégrative miARN-ARNm a révélé une corrélation inverse entre 5 gènes cibles présumés (RAD54L, CCNA2, CYSLTR2, RASGRF2 et HKDC1) et 15 miARN (p < 0,05). La plupart des miARN exprimés de manière différentielle sont impliqués dans la survie, la prolifération, la migration, l'invasion et la résistance aux médicaments dans le MM. Certains n'ont jamais été décrits en association avec le MM (miR-33a, miR-9 et miR-211). Fait intéressant, nos résultats ont révélé 2 miARN, qui sont étroitement liés à la différenciation des cellules B (miR-150 et miR-125b). Pour la première fois, nous suggérons que miR-150 pourrait être un régulateur négatif potentiel pour deux gènes critiques de contrôle du cycle cellulaire, RAD54L et CCNA2, alors que miR-125b cible potentiellement les protéines de signalisation RAS et CysLT, à savoir RASGRF2 et CYSLTR2, respectivement. Cette étude a amélioré notre compréhension de la pathobiologie du MM et ouvre de nouvelles voies pour de futures recherches en myélomagénèse.

Translated Description (Spanish)

Los cambios epigenéticos han surgido como causas clave en el desarrollo y la progresión del mieloma múltiple (MM). En este estudio, se realizó un perfil de expresión global de microARN (miARN) para 27 MM (19 especímenes y 8 líneas celulares) y 3 controles normales por micromatriz. Las dianas de miARN se identificaron integrando los perfiles de expresión de miARN con los perfiles de expresión de ARNm de las muestras emparejadas (datos no publicados). Se seleccionaron dos miARN para la verificación mediante RT-qPCR (miR-150-5p y miR-4430). Un total de 1791 y 8 miARN se sobreexpresaron y subexpresaron, respectivamente, en MM en comparación con los controles (cambio en veces ≥2.0; p < 0.05). El análisis integrador de miARN-mARN reveló una correlación inversa entre 5 supuestos genes diana (RAD54L, CCNA2, CYSLTR2, RASGRF2 y HKDC1) y 15 miARN (p < 0.05). La mayoría de los miARN expresados diferencialmente están involucrados en la supervivencia, proliferación, migración, invasión y resistencia a los medicamentos en MM. Algunos nunca se han descrito en asociación con MM (miR-33a, miR-9 y miR-211). Curiosamente, nuestros resultados revelaron 2 miARN, que están estrechamente relacionados con la diferenciación de células B (miR-150 y miR-125b). Por primera vez, sugerimos que miR-150 podría ser un posible regulador negativo para dos genes críticos de control del ciclo celular, RAD54L y CCNA2, mientras que miR-125b se dirige potencialmente a las proteínas de señalización RAS y CysLT, a saber, RASGRF2 y CYSLTR2, respectivamente. Este estudio ha mejorado nuestra comprensión de la patobiología del MM y abre nuevas vías para futuras investigaciones en mielomagénesis.

Files

10.1007%2Fs13258-017-0518-7.pdf.pdf

Files (771.2 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:2d7f701c78045c0883c4028bf1ba56ff
771.2 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
أنماط تعبير MicroRNA والتنبؤ المستهدف في تطور الورم النقوي المتعدد والأورام الخبيثة
Translated title (French)
Modèles d'expression du microARN et prédiction de la cible dans le développement et la malignité du myélome multiple
Translated title (Spanish)
Patrones de expresión de microARN y predicción de dianas en el desarrollo de mieloma múltiple y neoplasia maligna

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2586414198
DOI
10.1007/s13258-017-0518-7

Is supplement to
https://openalex.org/W3138028456 (Other)
https://openalex.org/W2796636403 (Other)
https://openalex.org/W2767847608 (Other)
https://openalex.org/W2223549427 (Other)
https://openalex.org/W2183420549 (Other)
https://openalex.org/W2160802685 (Other)
https://openalex.org/W2081507994 (Other)
https://openalex.org/W2039699813 (Other)
https://openalex.org/W2015700328 (Other)
https://openalex.org/W1972696957 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malaysia

References

  • https://openalex.org/W1481278115
  • https://openalex.org/W1964358980
  • https://openalex.org/W1966098047
  • https://openalex.org/W1989259853
  • https://openalex.org/W1990130829
  • https://openalex.org/W1993469143
  • https://openalex.org/W1997054509
  • https://openalex.org/W1999508205
  • https://openalex.org/W2006704637
  • https://openalex.org/W2010180766
  • https://openalex.org/W2013310179
  • https://openalex.org/W2023234211
  • https://openalex.org/W2024704386
  • https://openalex.org/W2025140294
  • https://openalex.org/W2035367710
  • https://openalex.org/W2042748226
  • https://openalex.org/W2048270152
  • https://openalex.org/W2049702532
  • https://openalex.org/W2049907435
  • https://openalex.org/W2052825822
  • https://openalex.org/W2061235757
  • https://openalex.org/W2067881481
  • https://openalex.org/W2069004357
  • https://openalex.org/W2072559448
  • https://openalex.org/W2073423022
  • https://openalex.org/W2075106626
  • https://openalex.org/W2080245613
  • https://openalex.org/W2088474788
  • https://openalex.org/W2089595052
  • https://openalex.org/W2094636384
  • https://openalex.org/W2096497783
  • https://openalex.org/W2105488327
  • https://openalex.org/W2109578585
  • https://openalex.org/W2111471857
  • https://openalex.org/W2116619860
  • https://openalex.org/W2118985891
  • https://openalex.org/W2119823095
  • https://openalex.org/W2121457306
  • https://openalex.org/W2121464313
  • https://openalex.org/W2125600180
  • https://openalex.org/W2126474922
  • https://openalex.org/W2127096655
  • https://openalex.org/W2133959309
  • https://openalex.org/W2134823129
  • https://openalex.org/W2136178187
  • https://openalex.org/W2138781403
  • https://openalex.org/W2140725884
  • https://openalex.org/W2146483998
  • https://openalex.org/W2147773801
  • https://openalex.org/W2152545206
  • https://openalex.org/W2154811915
  • https://openalex.org/W2159114387
  • https://openalex.org/W2163007050
  • https://openalex.org/W2164847390
  • https://openalex.org/W2164853398
  • https://openalex.org/W2170387305
  • https://openalex.org/W2171435111
  • https://openalex.org/W2425854306
  • https://openalex.org/W2557390939
  • https://openalex.org/W63410511
  • https://openalex.org/W824709387