Antiviral drug resistance in Cuban children infected with HIV‐1
Creators
- 1. Instituto de Medicina Tropical "Pedro Kourí"
- 2. Rega Institute for Medical Research
Description
Between 1986 and 2011, 100 children have been diagnosed with HIV‐1 in Cuba. 38 have acquired HIV‐1 by vertical transmission, 6 by blood transfusion and 56 by sexual contacts (teenager). Currently, AZT/D4T + 3TC + NVP/KALETRA are available for the treatment of pediatric patients. The aim of the study was to monitor the subtype distribution and emergence of drug resistance in pediatric HIV‐1 infections. Plasma from 46 HIV‐1‐infected children were collected from November 2005 to November 2011, subsequently extracted, amplified and sequenced. Phylogenetic analysis was performed using Mega 4 (Neighbour joining, Kimura 2). The CPR tool v6.0 (WHO list 2009) was used to interpret transmitted drug resistance (TDR). In addition, acquired drug resistance was interpreted according to HIVdb v6.1.1. Experiments were successful for 28 samples from 20 patients (5 patients with multiple samples). At the moment of analysis, 17 children were receiving ART. The median age at diagnosis was 1.9 years, whereas the median age at sampling was 4.5 years. Ten children were male (50%), 16 (80%) were infected by vertical transmission, 1 by blood transfusion (5%) and 3 by sexual route (15%). The subtypes were CRF18_cpx (25%), CRF19_cpx (25%), B (20%), CRF20_BG (10%), G (10%), CRF24_BG (5%) and C (5%). 82.3% of the children who were receiving ART at sampling (14/17) displayed at least one drug resistance mutation. The most common NRTI and NNRT mutations were: M184V (55.5%), T215FY (16.6%) and K70R (16.6%); and K103NS (61.1%) and G190A (22.0%). In contrast, only one PI mutation, L90M (5.5%), was observed. 5.8% of these children displayed single NRTI class resistance, 17.4% single NNRTI class resistance, 59% double NRTI + NNRTI class resistance and 5.8% triple NRTI + NNRTI + PI class resistance. According to HIVdb, NRTI, NNRTI and PI resistance was present in respectively 42.8%, 58.7% and 8.08% of the treated children. High‐level NVP and EFV resistance was observed in 76.5% and 58.8%, respectively. 35.2% displayed already low‐level resistance to ETR/RPV. For NRTI, high‐level resistance to 3TC/FTC was detected in 50%. High‐level resistance to NFV was detected in only one sample. No NNRTI TDR was observed, while one patient displayed PI TDR (L90M) and another NRTI TDR (D67N, T215S and K219Q) (2/11) (18.1%). At this moment, insufficient data is available whether resistance is associated with TDR, poor adherence to treatment or poor efficacy of ART regimens in use. The present study reinforces the usefulness of resistance tests for the correct management of ART.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
بين عامي 1986 و 2011، تم تشخيص 100 طفل بفيروس نقص المناعة البشرية -1 في كوبا. أصيب 38 طفلاً بفيروس نقص المناعة البشرية -1 عن طريق الانتقال الرأسي، و 6 عن طريق نقل الدم و 56 عن طريق الاتصال الجنسي (مراهق). حاليًا، يتوفر AZT/d4T + 3TC + NVP/KALETRA لعلاج مرضى الأطفال. كان الهدف من الدراسة هو مراقبة توزيع النوع الفرعي وظهور مقاومة الأدوية في حالات عدوى فيروس نقص المناعة البشرية لدى الأطفال. تم جمع البلازما من 46 طفلاً مصابًا بفيروس نقص المناعة البشرية من نوفمبر 2005 إلى نوفمبر 2011، ثم تم استخراجها وتضخيمها وتسلسلها لاحقًا. تم إجراء التحليل الوراثي باستخدام ميجا 4 (انضمام الجار، كيمورا 2). تم استخدام أداة الإنعاش القلبي الرئوي الإصدار 6.0 (قائمة منظمة الصحة العالمية 2009) لتفسير مقاومة الأدوية المنقولة (TDR). بالإضافة إلى ذلك، تم تفسير مقاومة الأدوية المكتسبة وفقًا لـ HIVdb v6.1.1. كانت التجارب ناجحة على 28 عينة من 20 مريضًا (5 مرضى لديهم عينات متعددة). في لحظة التحليل، كان 17 طفلاً يتلقون العلاج المضاد للفيروسات القهقرية. كان متوسط العمر عند التشخيص 1.9 سنة، في حين كان متوسط العمر عند أخذ العينات 4.5 سنة. عشرة أطفال ذكور (50 ٪)، 16 (80 ٪) أصيبوا عن طريق الانتقال الرأسي، 1 عن طريق نقل الدم (5 ٪) و 3 عن طريق الاتصال الجنسي (15 ٪). كانت الأنواع الفرعية هي CRF18_cpx (25 ٪)، CRF19_cpx (25 ٪)، B (20 ٪)، CRF20_BG (10 ٪)، G (10 ٪)، CRF24_BG (5 ٪) و C (5 ٪). أظهر 82.3 ٪ من الأطفال الذين كانوا يتلقون العلاج المضاد للفيروسات القهقرية عند أخذ العينات (14/17) طفرة واحدة على الأقل في مقاومة الأدوية. كانت طفرات NRTI و NNRT الأكثر شيوعًا هي: M184V (55.5 ٪)، T215FY (16.6 ٪) و K70R (16.6 ٪) ؛ و K103NS (61.1 ٪) و G190A (22.0 ٪). في المقابل، لوحظت طفرة PI واحدة فقط، L90M (5.5 ٪). أظهر 5.8 ٪ من هؤلاء الأطفال مقاومة واحدة لفئة NRTI، و 17.4 ٪ مقاومة واحدة لفئة NNRTI، و 59 ٪ مقاومة مزدوجة لفئة NRTI + NNRTI و 5.8 ٪ مقاومة ثلاثية لفئة NRTI + NNRTI + PI. وفقًا لـ HIVdb، كانت مقاومة NRTI و NNRTI و PI موجودة في 42.8 ٪ و 58.7 ٪ و 8.08 ٪ على التوالي من الأطفال المعالجين. لوحظت مقاومة NVP و EFV عاليةالمستوى في 76.5 ٪ و 58.8 ٪ على التوالي. أظهر 35.2 ٪ مقاومة منخفضةالمستوى بالفعل لـ ETR/RPV. بالنسبة لـ NRTI، تم اكتشاف مقاومة عاليةالمستوى لـ 3TC/FTC بنسبة 50 ٪. تم اكتشاف مقاومة عاليةالمستوى لـ NFV في عينة واحدة فقط. لم يتم ملاحظة أي NNRTI TDR، بينما أظهر أحد المرضى PI TDR (L90M) و NRTI TDR آخر (D67N، T215S و K219Q) (2/11) (18.1 ٪). في هذه اللحظة، لا تتوفر بيانات كافية عما إذا كانت المقاومة مرتبطة بتقارير TDR أو ضعف الالتزام بالعلاج أو ضعف فعالية أنظمة العلاج المضاد للفيروسات القهقرية المستخدمة. تعزز هذه الدراسة فائدة اختبارات المقاومة للإدارة الصحيحة للفن.Translated Description (French)
Entre 1986 et 2011, 100 enfants ont reçu un diagnostic de VIH‐1 à Cuba. 38 ont contracté le VIH‐1 par transmission verticale, 6 par transfusion sanguine et 56 par contacts sexuels (adolescent). Actuellement, AZT/D4T + 3TC + NVP/KALETRA sont disponibles pour le traitement des patients pédiatriques. L'objectif de l'étude était de surveiller la distribution des sous-types et l'émergence de la résistance aux médicaments dans les infections pédiatriques par le VIH-1. Le plasma de 46 enfants infectés par le VIH-1 a été prélevé de novembre 2005 à novembre 2011, puis extrait, amplifié et séquencé. L'analyse phylogénétique a été réalisée à l'aide de Mega 4 (Neighbour joining, Kimura 2). L'outil de RCP v6.0 (liste OMS 2009) a été utilisé pour interpréter la pharmacorésistance transmise (TDR). De plus, la pharmacorésistance acquise a été interprétée selon HIVdb v6.1.1. Les expériences ont été couronnées de succès pour 28 échantillons provenant de 20 patients (5 patients avec plusieurs échantillons). Au moment de l'analyse, 17 enfants recevaient un traitement antirétroviral. L'âge médian au moment du diagnostic était de 1,9 an, alors que l'âge médian au moment de l'échantillonnage était de 4,5 ans. Dix enfants étaient de sexe masculin (50 %), 16 (80 %) ont été infectés par transmission verticale, 1 par transfusion sanguine (5 %) et 3 par voie sexuelle (15 %). Les sous-types étaient CRF18_cpx (25 %), CRF19_cpx (25 %), B (20 %), CRF20_BG (10 %), G (10 %), CRF24_BG (5 %) et C (5 %). 82,3 % des enfants qui recevaient un traitement antirétroviral au moment de L'échantillonnage (14/17) présentaient au moins une mutation de résistance aux médicaments. Les mutations NRTI et NNRT les plus courantes étaient : M184V (55,5 %), T215FY (16,6 %) et K70R (16,6 %) ; et K103NS (61,1 %) et G190A (22,0 %). En revanche, une seule mutation PI, L90M (5,5 %), a été observée. 5,8 % de ces enfants présentaient une résistance de classe INTI unique, 17,4 % une résistance de classe INNTI unique, 59 % une résistance de classe double INTI + INNTI et 5,8 % une résistance de classe triple INTI + INNTI + PI. Selon le VIHdb, les INTI, les INNTI et la résistance aux IP étaient présents chez respectivement 42,8 %, 58,7 % et 8,08 % des enfants traités. Desniveaux élevés de résistance à la NVP et à l'EFV ont été observés chez 76,5% et 58,8%, respectivement. 35,2% présentaient déjà une faible résistance à l'ETR/RPV. Pour les INTI, une résistance élevée au 3TC/FTC a été détectée dans 50 % des cas. Une résistance de hautniveau au NFV a été détectée dans un seul échantillon. Aucun TDR INNTI n'a été observé, tandis qu'un patient présentait un TDR PI (L90M) et un autre un TDR INTI (D67N, T215S et K219Q) (2/11) (18,1 %). À l'heure actuelle, les données disponibles sont insuffisantes, que la résistance soit associée au TDR, à une mauvaise observance du traitement ou à une faible efficacité des schémas thérapeutiques antirétroviraux utilisés. La présente étude renforce l'utilité des tests de résistance pour la gestion correcte de LA TAR.Translated Description (Spanish)
Entre 1986 y 2011, 100 niños han sido diagnosticados con VIH-1 en Cuba. 38 han adquirido el VIH-1 por transmisión vertical, 6 por transfusión de sangre y 56 por contactos sexuales (adolescente). Actualmente, AZT/D4T + 3TC + NVP/KALETRA están disponibles para el tratamiento de pacientes pediátricos. El objetivo del estudio fue monitorear la distribución de subtipos y la aparición de resistencia a los medicamentos en infecciones pediátricas por VIH-1. El plasma de 46 niños infectados por el VIH-1 se recolectó de noviembre de 2005 a noviembre de 2011, posteriormente se extrajo, amplificó y secuenció. El análisis filogenético se realizó utilizando Mega 4 (Unión de vecinos, Kimura 2). La herramienta de RCP v6.0 (lista de la OMS 2009) se utilizó para interpretar la resistencia transmitida a los medicamentos (TDR). Además, la resistencia adquirida a los medicamentos se interpretó de acuerdo con HIVdb v6.1.1. Los experimentos fueron exitosos para 28 muestras de 20 pacientes (5 pacientes con múltiples muestras). En el momento del análisis, 17 niños estaban recibiendo tratamiento antirretroviral. La mediana de edad en el momento del diagnóstico fue de 1,9 años, mientras que la mediana de edad en el momento del muestreo fue de 4,5 años. Diez niños eran varones (50%), 16 (80%) estaban infectados por transmisión vertical, 1 por transfusión de sangre (5%) y 3 por vía sexual (15%). Los subtipos fueron CRF18_cpx (25%), CRF19_cpx (25%), B (20%), CRF20_BG (10%), G (10%), CRF24_BG (5%) y C (5%). El 82,3% de los niños que estaban recibiendo tar en el muestreo (14/17) mostraron al menos una mutación de resistencia a fármacos. Las mutaciones NRTI y NNRT más comunes fueron: M184V (55.5%), T215FY (16.6%) y K70R (16.6%); y K103NS (61.1%) y G190A (22.0%). Por el contrario, solo se observó una mutación de PI, L90M (5,5%). El 5,8% de estos niños mostraron resistencia de clase NRTI única, el 17,4% resistencia de clase NNRTI única, el 59% resistencia de clase NRTI + NNRTI doble y el 5,8% resistencia de clase NRTI + NNRTI + PI triple. Según HIVdb, la resistencia a NRTI, NNRTI e PI estuvo presente en el 42,8%, 58,7% y 8,08%, respectivamente, de los niños tratados. Se observó resistencia a NVP y EFV de alto nivel en 76.5% y 58.8%, respectivamente. El 35.2% mostró resistencia de bajo nivel a ETR/RPV. Para NRTI, se detectó resistencia de altonivel a 3TC/FTC en 50%. Se detectó resistencia de altonivel a NFV en una sola muestra. No se observó NNRTI TDR, mientras que un paciente mostró PI TDR (L90M) y otro NRTI TDR (D67N, T215S y K219Q) (2/11) (18.1%). En este momento, no se dispone de datos suficientes sobre si la resistencia está asociada con la TDR, la mala adherencia al tratamiento o la mala eficacia de los regímenes de TAR en uso. El presente estudio refuerza la utilidad de las pruebas de resistencia para el correcto manejo del tar.Files
IAS.15.6.18186.pdf
Files
(16.0 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:b6feb4e9abdbe3c9b3373df07efa93d2
|
16.0 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- مقاومة الأدوية المضادة للفيروسات لدى الأطفال الكوبيين المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية -1
- Translated title (French)
- Résistance aux médicaments antiviraux chez les enfants cubains infectés par le VIH‐1
- Translated title (Spanish)
- Resistencia a los medicamentos antivirales en niños cubanos infectados con VIH‐1
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2006417760
- DOI
- 10.7448/ias.15.6.18186