Published May 29, 2019
| Version v1
Publication
Open
Somatic Mutations Profile of a Young Patient With Metastatic Urothelial Carcinoma Reveals Mutations in Genes Involved in Ion Channels
Creators
- 1. Institute of Bioinformatics
- 2. Manipal Academy of Higher Education
- 3. SciGenom Labs (India)
- 4. Institute of Post Graduate Medical Education and Research
- 5. Post Graduate Institute of Medical Education and Research
Description
Background: Urothelial carcinoma is the most common malignancy of the bladder and is primarily considered as a disease of the elderly. Studies that address bladder tumor occurrence in young age groups are rare. Case Presentation: A 19-year-old male presented with a gross total painless hematuria. A histology after biopsy revealed a high-grade transitional cell carcinoma with lymph node metastasis. The patient succumbed to the disease on day 72 of the treatment. Here, we used whole-exome sequencing of a paired tumor-normal sample to identify the somatic mutations and the possible targets of treatment. Result: We predicted eight potential driver mutations (TP53 p.V157L, RB1 c.1498+1G>T, MED23 p.L1127P, CTNND1 p.S713C, NSD1 p.P2212A, MED17 p.G556V, DPYD p.Q814K, and SPEN p.S1078*). In addition, we predicted deleterious mutations in genes involved in the ion channels (CACNA1S p.E1581K, CACNG1 p.P71T, CACNG8 p.G404W, GRIN2B p.A1096T, KCNC1 p.G16V, KCNH4 p.E874K, KCNK9 p.R131S, P2RX7 p.A296D, and SCN8A p.R558H). Conclusions: Most likely, mutations in genes involved in ion channels may be responsible for the aggressive behavior of a tumor. Ion channels are the second largest class of drug targets, and may thus serve as a putative potential therapeutic target in advanced stage urothelial carcinoma.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
خلفية: سرطان الظهارة البولية هو الورم الخبيث الأكثر شيوعًا في المثانة ويعتبر في المقام الأول مرضًا لكبار السن. الدراسات التي تعالج حدوث ورم المثانة في الفئات العمرية الصغيرة نادرة. عرض الحالة: ذكر يبلغ من العمر 19 عامًا يعاني من إجمالي بيلة دموية غير مؤلمة. كشفت الأنسجة بعد الخزعة عن سرطان الخلايا الانتقالية عالي الدرجة مع ورم خبيث في العقدة الليمفاوية. استسلم المريض للمرض في اليوم 72 من العلاج. هنا، استخدمنا تسلسل الجسم الكامل لعينة طبيعية من الورم المقترنة لتحديد الطفرات الجسدية والأهداف المحتملة للعلاج. النتيجة: توقعنا ثماني طفرات محركة محتملة (TP53 p.V157L, RB1 c.1498+1G>T, MED23 p.L1127P, CTNND1 p.S713C, NSD1 p.P2212A, MED17 p.G556V, DPYD p.Q814K, and SPENp.S1078 *). بالإضافة إلى ذلك، توقعنا طفرات ضارة في الجينات المشاركة في القنوات الأيونية (CACNA1S p.E1581K، CACNG1 p.P71T، CACNG8 p.G404W، GRIN2B p.A1096T، KCNC1 p.G16V، KCNH4 p.E874K، KCNK9 p.R131S، P2RX7 p.A296D، و SCN8A p.R558H). الاستنتاجات: على الأرجح، قد تكون الطفرات في الجينات المشاركة في القنوات الأيونية مسؤولة عن السلوك العدواني للورم. القنوات الأيونية هي ثاني أكبر فئة من الأهداف الدوائية، وبالتالي قد تكون بمثابة هدف علاجي محتمل مفترض في سرطان الظهارة البولية في المرحلة المتقدمة.Translated Description (French)
Contexte : Le carcinome urothélial est la tumeur maligne la plus fréquente de la vessie et est principalement considéré comme une maladie des personnes âgées. Les études portant sur la survenue de tumeurs de la vessie chez les jeunes groupes d'âge sont rares. Présentation de cas : Un homme de 19 ans a présenté une hématurie totale indolore. Une histologie après biopsie a révélé un carcinome à cellules transitionnelles de haut grade avec métastase ganglionnaire. Le patient a succombé à la maladie au jour 72 du traitement. Ici, nous avons utilisé le séquençage de l'exome entier d'un échantillon apparié tumeur-normal pour identifier les mutations somatiques et les cibles possibles du traitement. Résultat : Nous avons prédit huit mutations pilotes potentielles (TP53 p.V157L, RB1c.1498+1G >T, MED23 p.L1127P, CTNND1 p.S713C, NSD1 p.P2212A, MED17 p.G556V, DPYD p.Q814K et SPEN p.S1078*). En outre, nous avons prédit des mutations délétères dans les gènes impliqués dans les canaux ioniques (CACNA1S p.E1581K, CACNG1 p.P71T, CACNG8 p.G404W, GRIN2B p.A1096T, KCNC1 p.G16V, KCNH4 p.E874K, KCNK9 p.R131S, P2RX7 p.A296D et SCN8A p.R558H). Conclusions : Très probablement, les mutations dans les gènes impliqués dans les canaux ioniques peuvent être responsables du comportement agressif d'une tumeur. Les canaux ioniques sont la deuxième plus grande classe de cibles médicamenteuses et peuvent donc servir de cible thérapeutique potentielle dans le carcinome urothélial à un stade avancé.Translated Description (Spanish)
Antecedentes: El carcinoma urotelial es la neoplasia maligna más común de la vejiga y se considera principalmente como una enfermedad de los ancianos. Los estudios que abordan la aparición de tumores de vejiga en grupos de edad jóvenes son raros. Presentación del caso: Un varón de 19 años presentó una hematuria bruta total indolora. Una histología después de la biopsia reveló un carcinoma de células de transición de alto grado con metástasis en los ganglios linfáticos. El paciente sucumbió a la enfermedad el día 72 del tratamiento. Aquí, utilizamos la secuenciación del exoma completo de una muestra pareada de tumor normal para identificar las mutaciones somáticas y las posibles dianas de tratamiento. Resultado: Predijimos ocho posibles mutaciones impulsoras (TP53 p.V157L, Rb1 c.1498+1G>T, MED23 p.L1127P, CTNND1 p.S713C, NSD1 p.P2212A, MED17 p.G556V, DPYD p.Q814K y SPEN p.S1078*). Además, predijimos mutaciones perjudiciales en genes implicados en los canales iónicos (CACNA1S p.E1581K, CACNG1 p.P71T, CACNG8 p.G404W, GRIN2B p.A1096T, KCNC1 p.G16V, KCNH4 p.E874K, KCNK9 p.R131S, P2RX7 p.A296D y SCN8A p.R558H). Conclusiones: Lo más probable es que las mutaciones en los genes implicados en los canales iónicos puedan ser responsables del comportamiento agresivo de un tumor. Los canales iónicos son la segunda clase más grande de dianas farmacológicas y, por lo tanto, pueden servir como una posible diana terapéutica potencial en el carcinoma urotelial en estadio avanzado.Files
pdf.pdf
Files
(2.6 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:aee9caa25b945829f3c2ee7b7e97e93f
|
2.6 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- ملف الطفرات الجسدية لمريض شاب مصاب بسرطان الظهارة البولية النقيلي يكشف عن طفرات في الجينات المشاركة في القنوات الأيونية
- Translated title (French)
- Le profil de mutations somatiques d'un jeune patient atteint de carcinome urothélial métastatique révèle des mutations dans les gènes impliqués dans les canaux ioniques
- Translated title (Spanish)
- El perfil de mutaciones somáticas de un paciente joven con carcinoma urotelial metastásico revela mutaciones en los genes implicados en los canales iónicos
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2947027762
- DOI
- 10.3389/fonc.2019.00435
References
- https://openalex.org/W1994212972
- https://openalex.org/W2005834781
- https://openalex.org/W2007171479
- https://openalex.org/W2012510232
- https://openalex.org/W2020136264
- https://openalex.org/W2021564846
- https://openalex.org/W2031505811
- https://openalex.org/W2044433401
- https://openalex.org/W2051292461
- https://openalex.org/W2159602317
- https://openalex.org/W2166236894
- https://openalex.org/W2253928581
- https://openalex.org/W2309867285
- https://openalex.org/W2325546739
- https://openalex.org/W2424071106
- https://openalex.org/W2461367843
- https://openalex.org/W2464326057
- https://openalex.org/W2509409534
- https://openalex.org/W2529009673
- https://openalex.org/W2534924637
- https://openalex.org/W2558667699
- https://openalex.org/W2568942716
- https://openalex.org/W2623594350
- https://openalex.org/W2633470271
- https://openalex.org/W2763708922
- https://openalex.org/W2785885120
- https://openalex.org/W2794563454
- https://openalex.org/W2795263449
- https://openalex.org/W2905236402
- https://openalex.org/W2949492942
- https://openalex.org/W4249567557
- https://openalex.org/W81098990