Published July 27, 2023
| Version v1
Publication
Open
Paradigm shift of respiratory viruses causing lower respiratory tract infection in children during COVID-19 pandemic in India
Creators
- 1. Post Graduate Institute of Medical Education and Research
- 2. ICMR-National Institute of Virology
Description
Acute lower respiratory tract infections (ALRTIs) are the commonest cause of mortality in children mostly attributed to respiratory viruses. During the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, the dynamics and transmission of infections changed worldwide due to widespread public health measures. This study aimed to understand the pattern of respiratory viruses associated with ALRTIs in children pre and during COVID-19 pandemic in India.Respiratory samples were collected from ALRTI patients during pre-pandemic period (October 2019 to February 2020; n = 166), Delta (July 2021 to December 2021; n = 78) and Omicron wave (January 2022 to July 2022; n = 111). Samples were screened for Influenza (Inf) A pdmH1N1, InfA H3N2, InfB, respiratory syncytial virus (RSV), human metapneumovirus (hMPV), human bocavirus (hBoV), human rhinovirus (hRV), and parainfluenza virus (PIV-2 and PIV-3) by nucleic acid amplification techniques (NAATs).Significantly higher proportion of children with ALRTIs had virus/es isolated during pre-pandemic period than during mid-pandemic period [78.9% (131/166) vs. 52.9% (100/189); p < 0.001). RSV positivity was significantly higher (51.2%) in pre-pandemic period than 10.3% and 0.9% during the Delta and Omicron waves respectively. No significant difference in positivity rate of Inf A pdmH1N1, Inf A H3N2 and Inf B was seen. The increase in positivity of hRV (39.2% vs 42.3% vs 56.8%) and hBOV (1.2% vs 5.1% vs 9%) was documented in pre-pandemic, delta wave and omicron wave respectively.The COVID-19 pandemic significantly impacted the frequency and pattern of respiratory viruses among hospitalized children with ALRTIs in India.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تعد التهابات الجهاز التنفسي السفلي الحادة (ALRTIs) السبب الأكثر شيوعًا لوفيات الأطفال التي تُعزى في الغالب إلى فيروسات الجهاز التنفسي. خلال جائحة فيروس كورونا 2019 (COVID -19)، تغيرت ديناميكيات العدوى وانتقالها في جميع أنحاء العالم بسبب تدابير الصحة العامة واسعة النطاق. هدفت هذه الدراسة إلى فهم نمط فيروسات الجهاز التنفسي المرتبطة بالتهابات الجهاز التنفسي الحادة لدى الأطفال قبل وأثناء جائحة كوفيد-19 في الهند. تم جمع عينات الجهاز التنفسي من مرضى التهاب الجهاز التنفسي الحادة خلال فترة ما قبل الجائحة (من أكتوبر 2019 إلى فبراير 2020 ؛ العدد = 166)، دلتا (من يوليو 2021 إلى ديسمبر 2021 ؛ العدد = 78) وموجة أوميكرون (من يناير 2022 إلى يوليو 2022 ؛ العدد = 111). تم فحص العينات للأنفلونزا (Inf) A pdmH1N1 و InfA H3N2 و InfB والفيروس المخلوي التنفسي (RSV) والفيروس الرئوي البشري (hMPV) والفيروس البوكافيري البشري (hBoV) والفيروس الأنفي البشري (hRV) وفيروس الأنفلونزا نظير الأنفلونزا (PIV -2 و PIV -3) بواسطة تقنيات تضخيم الأحماض النووية (NAATs). نسبة أعلى بكثير من الأطفال المصابين بـ ALRTIs كان لديهم فيروس/فيروس معزول خلال فترة ما قبل الجائحة مقارنة بفترة منتصف الجائحة [78.9 ٪ (131/166) مقابل 52.9 ٪ (100/189) ؛ ص < 0.001). كانت إيجابية الفيروس المخلوي التنفسي أعلى بكثير (51.2 ٪) في فترة ما قبل الجائحة من 10.3 ٪ و 0.9 ٪ خلال موجتي دلتا وأوميكرون على التوالي. لم يلاحظ أي اختلاف كبير في معدل إيجابية Inf A pdmH1N1 و Inf A H3N2 و Inf B. تم توثيق الزيادة في إيجابية فيروس نقص المناعة البشرية (39.2 ٪ مقابل 42.3 ٪ مقابل 56.8 ٪) وفيروس نقص المناعة البشرية (1.2 ٪ مقابل 5.1 ٪ مقابل 9 ٪) في فترة ما قبل الجائحة وموجة دلتا وموجة أوميكرون على التوالي. أثرت جائحة COVID -19 بشكل كبير على وتيرة ونمط فيروسات الجهاز التنفسي بين الأطفال الذين يعانون من التهاب الجهاز التنفسي الحاد في المستشفيات في الهند.Translated Description (French)
Les infections aiguës des voies respiratoires inférieures (ALRTI) sont la cause la plus fréquente de mortalité chez les enfants, principalement attribuées aux virus respiratoires. Au cours de la pandémie de coronavirus 2019 (COVID-19), la dynamique et la transmission des infections ont changé dans le monde entier en raison de mesures de santé publique généralisées. Cette étude visait à comprendre le schéma des virus respiratoires associés aux ALRTI chez les enfants avant et pendant la pandémie de COVID-19 en Inde. Des échantillons respiratoires ont été prélevés chez des patients ALRTI pendant la période pré-pandémique (octobre 2019 à février 2020 ; n = 166), Delta (juillet 2021 à décembre 2021 ; n = 78) et Omicron Wave (janvier 2022 à juillet 2022 ; n = 111). Des échantillons ont été dépistés pour la grippe (Inf) A pdmH1N1, InfA H3N2, InfB, le virus respiratoire syncytial (RSV), le métapneumovirus humain (hMPV), le bocavirus humain (hBoV), le rhinovirus humain (hRV) et le virus parainfluenza (PIV-2 et PIV-3) par des techniques d'amplification des acides nucléiques (TAAN). Une proportion significativement plus élevée d'enfants atteints d'ALRTI ont eu des virus isolés pendant la période pré-pandémique que pendant la période mi-pandémique [78,9 % (131/166) contre 52,9 % (100/189) ; p < 0,001). La positivité au VRS était significativement plus élevée (51,2 %) pendant la période pré-pandémique que 10,3 % et 0,9 % pendant les vagues Delta et Omicron respectivement. Aucune différence significative dans le taux de positivité de Inf A pdmH1N1, Inf A H3N2 et Inf B n'a été observée. L'augmentation de la positivité du hRV (39,2 % contre 42,3 % contre 56,8 %) et du hBOV (1,2 % contre 5,1 % contre 9 %) a été documentée dans les ondes pré-pandémique, delta et omicron respectivement. La pandémie de COVID-19 a eu un impact significatif sur la fréquence et le schéma des virus respiratoires chez les enfants hospitalisés atteints d'ALRTI en Inde.Translated Description (Spanish)
Las infecciones agudas del tracto respiratorio inferior (ALRTI, por sus siglas en inglés) son la causa más común de mortalidad en niños atribuida principalmente a virus respiratorios. Durante la pandemia de enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), la dinámica y la transmisión de infecciones cambiaron en todo el mundo debido a las medidas de salud pública generalizadas. Este estudio tuvo como objetivo comprender el patrón de virus respiratorios asociados con ALRTI en niños antes y durante la pandemia de COVID-19 en la India. Se recolectaron muestras respiratorias de pacientes con ALRTI durante el período prepandémico (octubre de 2019 a febrero de 2020; n = 166), Delta (julio de 2021 a diciembre de 2021; n = 78) y onda Omicron (enero de 2022 a julio de 2022; n = 111). Las muestras se analizaron para detectar Influenza (Inf) A pdmH1N1, InfA H3N2, InfB, virus sincitial respiratorio (RSV), metapneumovirus humano (hMPV), bocavirus humano (hBoV), rinovirus humano (hRV) y virus de la parainfluenza (PIV-2 y PIV-3) mediante técnicas de amplificación de ácidos nucleicos (NAAT). Una proporción significativamente mayor de niños con ALRTI tuvieron virus aislados durante el período prepandémico que durante el período de pandemia media [78.9% (131/166) vs. 52.9% (100/189); p < 0.001). La positividad del VSR fue significativamente mayor (51,2%) en el período prepandémico que el 10,3% y el 0,9% durante las ondas Delta y Omicron, respectivamente. No se observaron diferencias significativas en la tasa de positividad de Inf A pdmH1N1, Inf A H3N2 e Inf B. El aumento de la positividad del hRV (39,2% frente al 42,3% frente al 56,8%) y el hBOV (1,2% frente al 5,1% frente al 9%) se documentó en la prepandemia, la onda delta y la onda ómicrométrica, respectivamente. La pandemia de COVID-19 afectó significativamente la frecuencia y el patrón de los virus respiratorios entre los niños hospitalizados con ALRTI en la India.Files
3127.pdf
Files
(247 Bytes)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:8d9454ef13408e4adabb0c17ef1f503f
|
247 Bytes | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تحول نموذجي لفيروسات الجهاز التنفسي التي تسبب عدوى الجهاز التنفسي السفلي لدى الأطفال خلال جائحة كوفيد-19 في الهند
- Translated title (French)
- Changement de paradigme des virus respiratoires causant une infection des voies respiratoires inférieures chez les enfants pendant la pandémie de COVID-19 en Inde
- Translated title (Spanish)
- Cambio de paradigma de los virus respiratorios que causan infección del tracto respiratorio inferior en niños durante la pandemia de COVID-19 en la India
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4385291404
- DOI
- 10.3855/jidc.17727