Published September 1, 2023 | Version v1
Publication Open

Gut microbiota profile and the influence of nutritional status on bacterial distribution in diabetic and healthy Tunisian subjects

Creators

  • 1. Institut Pasteur de Tunis
  • 2. Tunis El Manar University
  • 3. Institut Pasteur
  • 4. Inserm
  • 5. Institut National de Nutrition et de Technologie Alimentaire
  • 6. National Institute of Applied Science and Technology
  • 7. University of Carthage
  • 8. Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses
  • 9. Collège de France

Description

Abstract Gut microbiota plays a key role in the regulation of metabolism and immunity. We investigated the profile of gut microbiota and the impact of dietary intake on gut bacterial distribution in diabetic and healthy Tunisian subjects, aiming to identify a dysbiotic condition, hence opening the way to restore eubiosis and facilitate return to health. In the present research, we enrolled 10 type 1 diabetic (T1D), 10 type 2 diabetic (T2D) patients and 13 healthy (H) subjects. Illumina Miseq technology was used to sequence V3-V4 hypervariable regions of bacterial 16SrRNA gene. Data were analyzed referring to QIIME 2 pipeline. RStudio software was used to explore the role of nutrition in gut bacterial distribution. At the phylum level, we identified an imbalanced gut microbiota composition in diabetic patients marked by a decrease in the proportion of Firmicutes and an increase in the abundance of Bacteroidetes compared with H subjects. We observed higher amounts of Fusobacteria and a decline in the levels of TM7 phyla in T1D patients compared with H subjects. However, we revealed a decrease in the proportions of Verrucomicrobia in T2D patients compared with H subjects. At the genus level, T2D subjects were more affected by gut microbiota alteration, showing a reduction in the relative abundance of Faecalibacterium, Akkermansia, Clostridium, Blautia and Oscillibacter, whereas T1D group shows a decrease in the proportion of Blautia. The gut bacteria distribution was mainly affected by fats and carbohydrates consumption. Gut microbiota composition was altered in Tunisian diabetic patients and affected by dietary habits.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تلعب بكتيريا الأمعاء المجردة دورًا رئيسيًا في تنظيم عملية التمثيل الغذائي والمناعة. قمنا بالتحقيق في ملامح ميكروبات الأمعاء وتأثير المدخول الغذائي على توزيع بكتيريا الأمعاء في الأشخاص التونسيين المصابين بالسكري والأصحاء، بهدف تحديد حالة ديسبيوتيك، وبالتالي فتح الطريق لاستعادة اليوبيوسيس وتسهيل العودة إلى الصحة. في البحث الحالي، سجلنا 10 مرضى سكري من النوع 1 (T1D)، و 10 مرضى سكري من النوع 2 (T2D) و 13 مشاركًا أصحاء (H). تم استخدام تقنية Illumina Miseq لتسلسل المناطق ذات المتغيرات الفائقة V3 - V4 من جين 16SrRNA البكتيري. تم تحليل البيانات بالإشارة إلى خط أنابيب QIIME 2. تم استخدام برنامج RStudio لاستكشاف دور التغذية في توزيع بكتيريا الأمعاء. على مستوى الشعبة، حددنا تكوينًا غير متوازن لميكروبات الأمعاء في مرضى السكري يتميز بانخفاض في نسبة الفيرميكوت وزيادة في وفرة العناكب مقارنة بأشخاص H. لاحظنا كميات أعلى من البكتيريا المغزلية وانخفاض في مستويات TM7 في مرضى T1D مقارنة مع الخاضعين للعلاج H. ومع ذلك، كشفنا عن انخفاض في نسب الثؤلول الميكروبي في مرضى T2D مقارنة بمواضيع H. على مستوى الجنس، تأثر المشاركون في T2D بشكل أكبر بتغيير الميكروبات المعوية، مما يدل على انخفاض في الوفرة النسبية للبكتيريا البرازية و Akkermansia و Clostridium و Blautia و Oscillibacter، في حين أن مجموعة T1D تظهر انخفاضًا في نسبة Blautia. تأثر توزيع بكتيريا الأمعاء بشكل أساسي باستهلاك الدهون والكربوهيدرات. تم تغيير تركيبة الميكروبات المعوية في مرضى السكري التونسيين وتأثرت بالعادات الغذائية.

Translated Description (French)

Résumé Le microbiote intestinal joue un rôle clé dans la régulation du métabolisme et de l'immunité. Nous avons étudié le profil du microbiote intestinal et l'impact de l'apport alimentaire sur la distribution bactérienne intestinale chez des sujets tunisiens diabétiques et en bonne santé, dans le but d'identifier une affection dysbiotique, ouvrant ainsi la voie à la restauration de l'eubiose et facilitant le retour à la santé. Dans la présente recherche, nous avons recruté 10 patients diabétiques de type 1 (DT1), 10 patients diabétiques de type 2 (DT2) et 13 sujets sains (H). La technologie Illumina Miseq a été utilisée pour séquencer les régions hypervariables V3-V4 du gène 16SrRNA bactérien. Les données ont été analysées en se référant au pipeline QIIME 2. Le logiciel RStudio a été utilisé pour explorer le rôle de la nutrition dans la distribution bactérienne intestinale. Au niveau du phylum, nous avons identifié un déséquilibre de la composition du microbiote intestinal chez les patients diabétiques marqué par une diminution de la proportion de Firmicutes et une augmentation de l'abondance de Bacteroidetes par rapport aux sujets H. Nous avons observé des quantités plus élevées de Fusobactéries et une diminution des niveaux de phylums TM7 chez les patients atteints de DT1 par rapport aux sujets H. Cependant, nous avons révélé une diminution des proportions de verrucomicrobies chez les patients atteints de DT2 par rapport aux sujets H. Au niveau du genre, les sujets atteints de DT2 étaient plus affectés par l'altération du microbiote intestinal, montrant une réduction de l'abondance relative de Faecalibacterium, Akkermansia, Clostridium, Blautia et Oscillibacter, tandis que le groupe DT1 montre une diminution de la proportion de Blautia. La distribution des bactéries intestinales était principalement affectée par la consommation de graisses et de glucides. La composition du microbiote intestinal a été modifiée chez les patients tunisiens diabétiques et affectée par les habitudes alimentaires.

Translated Description (Spanish)

Resumen La microbiota intestinal juega un papel clave en la regulación del metabolismo y la inmunidad. Investigamos el perfil de la microbiota intestinal y el impacto de la ingesta dietética en la distribución bacteriana intestinal en sujetos tunecinos diabéticos y sanos, con el objetivo de identificar una afección disbiótica, abriendo así el camino para restaurar la eubiosis y facilitar el retorno a la salud. En la presente investigación, inscribimos a 10 pacientes diabéticos tipo 1 (DT1), 10 pacientes diabéticos tipo 2 (DT2) y 13 sujetos sanos (H). Se utilizó la tecnología Illumina Miseq para secuenciar las regiones hipervariables V3-V4 del gen 16SrRNA bacteriano. Los datos se analizaron en referencia a la tubería QIIME 2. Se utilizó el software RStudio para explorar el papel de la nutrición en la distribución bacteriana intestinal. A nivel de filo, identificamos una composición desequilibrada de la microbiota intestinal en pacientes diabéticos marcada por una disminución en la proporción de Firmicutes y un aumento en la abundancia de Bacteroidetes en comparación con los sujetos H. Observamos mayores cantidades de Fusobacteria y una disminución en los niveles de TM7 phyla en pacientes con DT1 en comparación con los sujetos H. Sin embargo, revelamos una disminución en las proporciones de Verrucomicrobia en pacientes con DT2 en comparación con los sujetos H. A nivel de género, los sujetos con DT2 se vieron más afectados por la alteración de la microbiota intestinal, mostrando una reducción en la abundancia relativa de Faecalibacterium, Akkermansia, Clostridium, Blautia y Oscillibacter, mientras que el grupo con DT1 muestra una disminución en la proporción de Blautia. La distribución de las bacterias intestinales se vio afectada principalmente por el consumo de grasas y carbohidratos. La composición de la microbiota intestinal se alteró en pacientes diabéticos tunecinos y se vio afectada por los hábitos dietéticos.

Files

bsr-2022-0803.pdf.pdf

Files (93 Bytes)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:b0d506893d4802090edf1644f5f082cd
93 Bytes
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
صورة الجراثيم المعوية وتأثير الحالة التغذوية على التوزيع البكتيري في الأشخاص التونسيين المصابين بالسكري والأصحاء
Translated title (French)
Profil du microbiote intestinal et influence de l'état nutritionnel sur la distribution bactérienne chez les sujets tunisiens diabétiques et en bonne santé
Translated title (Spanish)
Perfil de la microbiota intestinal e influencia del estado nutricional en la distribución bacteriana en sujetos tunecinos diabéticos y sanos

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4386462086
DOI
10.1042/bsr20220803

Is supplement to
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2119695867 (Other)
https://openalex.org/W2130076355 (Other)
https://openalex.org/W1990804418 (Other)
https://openalex.org/W1993764875 (Other)
https://openalex.org/W2046158694 (Other)
https://openalex.org/W2788277189 (Other)
https://openalex.org/W2013243191 (Other)
https://openalex.org/W2151865869 (Other)
https://openalex.org/W2117258802 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Tunisia

References

  • https://openalex.org/W1442075714
  • https://openalex.org/W2044710940
  • https://openalex.org/W2113882071
  • https://openalex.org/W2141691140
  • https://openalex.org/W2192643966
  • https://openalex.org/W2405863207
  • https://openalex.org/W2531986144
  • https://openalex.org/W2562582244
  • https://openalex.org/W2588579982
  • https://openalex.org/W2594389980
  • https://openalex.org/W2749743535
  • https://openalex.org/W2749822530
  • https://openalex.org/W2789495752
  • https://openalex.org/W2800609088
  • https://openalex.org/W2807066489
  • https://openalex.org/W2809403187
  • https://openalex.org/W2893014892
  • https://openalex.org/W2917203974
  • https://openalex.org/W2947981214
  • https://openalex.org/W2980184245
  • https://openalex.org/W2998420978
  • https://openalex.org/W3146002984
  • https://openalex.org/W3163838745
  • https://openalex.org/W3191188917
  • https://openalex.org/W3192503388
  • https://openalex.org/W4200026682
  • https://openalex.org/W4200415894