Published February 14, 2023
| Version v1
Publication
Open
First report of environmental isolation of Cryptococcus spp. from Boyacá - Colombia
Creators
- 1. Pedagogical and Technological University of Colombia
- 2. Pontificia Universidad Javeriana
- 3. Instituto Nacional de Salud
- 4. University of Boyaca
Description
Abstract Background The Cryptococcus genus comprises more than 80 species, of which C. neoformans and C. gattii are the leading cause of cryptococcosis. The distribution of C. gattii and C. neoformans complex has been extensively studied and widely reported globally. Other species such as C. albidus , C. laurentii , and C. flavescens have been reported as pathogenic yeast. Since there are no reports of environmental isolation in the Boyacá region (Colombia), this study aimed to isolate and characterize the species of Cryptococcus from pigeon feces, eucalyptus, and olive trees distributed in the municipalities of Tunja and Ricaute Alto. Results The environmental data was recovered, and the isolations obtained were identified by microscopy, biochemical test, MALDI-TOF, RFLP of the URA5 gene, and sequencing of the ITS and LSU gene. For the 93 pigeon dropping samples collected in Tunja, 23 corresponded to C. neoformans , 3 to C. saitoi , 2 C. albidus and 1 to C. laurentii . Of the 1188 samples collected from olive trees, 17 (1.43%) positive samples were identified as C. gattii (4), C. neoformans var. grubii (2), C. laurentii (3), C. albidus (2), C. saitoi (5) and C. flavescens (1). Likewise, specimens of C. neoformans var. grubii presented molecular type VNI and molecular type VNII; for C. gattii the molecular types found were VGIII and VGIV. Conclusions Therefore, it can be concluded that the species of Cryptococcus genus, are present in the environment of Boyacá, and show a predilection for climate conditions that are typical of this region.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
خلفية مجردة يتكون جنس المكورات الخفية من أكثر من 80 نوعًا، منها C. neoformans و C. gattii هما السبب الرئيسي للمكورات الخفية. تمت دراسة توزيع مركب C. gattii و C. neoformans على نطاق واسع وتم الإبلاغ عنه على نطاق واسع على مستوى العالم. تم الإبلاغ عن أنواع أخرى مثل C. albidus و C. laurentii و C. flavescens كخميرة ممرضة. نظرًا لعدم وجود تقارير عن العزلة البيئية في منطقة بوياكا (كولومبيا)، تهدف هذه الدراسة إلى عزل وتوصيف أنواع المكورات الخفية من براز الحمام وأشجار الأوكالبتوس وأشجار الزيتون الموزعة في بلديات تونجا وألتو ريكاوت. النتائج تم استرداد البيانات البيئية، وتم تحديد العزلات التي تم الحصول عليها عن طريق الفحص المجهري، والاختبار الكيميائي الحيوي، و MALDI - TOF، و RFLP لجين URA5، وتسلسل جين ITS و LSU. بالنسبة لعينات إسقاط الحمام البالغ عددها 93 التي تم جمعها في تونجا، كان 23 منها متوافقًا مع C. neoformans و 3 إلى C. saitoi و 2 C. albidus و 1 إلى C. laurentii . من بين 1188 عينة تم جمعها من أشجار الزيتون، تم تحديد 17 عينة إيجابية (1.43 ٪) على أنها C. gattii (4)، C. neoformans var. grubii (2)، C. laurentii (3)، C. albidus (2)، C. saitoi (5) و C. flavescens (1). وبالمثل، قدمت عينات من C. neoformans var. grubii النوع الجزيئي VNI والنوع الجزيئي VNII ؛ بالنسبة لـ C. gattii، كانت الأنواع الجزيئية الموجودة هي VGIII و VGIV. الاستنتاجات لذلك، يمكن الاستنتاج أن أنواع جنس المكورات الخفية، موجودة في بيئة بوياكا، وتظهر ميلًا للظروف المناخية النموذجية لهذه المنطقة.Translated Description (French)
Résumé Contexte Le genre Cryptococcus comprend plus de 80 espèces, dont C. neoformans et C. gattii sont la principale cause de cryptococcose. La distribution du complexe C. gattii et C. neoformans a été largement étudiée et largement rapportée dans le monde entier. D'autres espèces telles que C. albidus , C. laurentii et C. flavescens ont été signalées comme étant des levures pathogènes. Comme il n'y a pas de rapports d'isolement environnemental dans la région de Boyacá (Colombie), cette étude visait à isoler et à caractériser les espèces de Cryptococcus des excréments de pigeons, d'eucalyptus et d'oliviers distribués dans les municipalités de Tunja et Ricaute Alto. Résultats Les données environnementales ont été récupérées, et les isolations obtenues ont été identifiées par microscopie, test biochimique, MALDI-TOF, RFLP du gène URA5, et séquençage du gène ITS et LSU. Pour les 93 échantillons de dépôt de pigeons prélevés à Tunja, 23 correspondaient à C. neoformans , 3 à C. saitoi , 2 à C. albidus et 1 à C. laurentii . Sur les 1188 échantillons prélevés sur des oliviers, 17 (1,43%) échantillons positifs ont été identifiés comme étant C. gattii (4), C. neoformans var. grubii (2), C. laurentii (3), C. albidus (2), C. saitoi (5) et C. flavescens (1). De même, les spécimens de C. neoformans var. grubii présentaient un type moléculaire VNI et un type moléculaire VNII ; pour C. gattii, les types moléculaires trouvés étaient VGIII et VGIV. Conclusions Par conséquent, on peut conclure que les espèces du genre Cryptococcus sont présentes dans l'environnement de Boyacá et montrent une prédilection pour les conditions climatiques typiques de cette région.Translated Description (Spanish)
Antecedentes abstractos El género Cryptococcus comprende más de 80 especies, de las cuales C. neoformans y C. gattii son la principal causa de criptococosis. La distribución del complejo C. gattii y C. neoformans ha sido ampliamente estudiada y ampliamente informada a nivel mundial. Otras especies como C. albidus , C. laurentii y C. flavescens han sido reportadas como levaduras patógenas. Dado que no existen reportes de aislamiento ambiental en la región de Boyacá (Colombia), este estudio tuvo como objetivo aislar y caracterizar las especies de Cryptococcus a partir de heces de palomas, eucaliptos y olivos distribuidos en los municipios de Tunja y Ricaute Alto. Resultados Se recuperaron los datos ambientales y se identificaron los aislamientos obtenidos mediante microscopía, prueba bioquímica, MALDI-TOF, RFLP del gen URA5 y secuenciación del gen ITS y LSU. Para las 93 muestras de caída de palomas recolectadas en Tunja, 23 correspondieron a C. neoformans , 3 a C. saitoi , 2 a C. albidus y 1 a C. laurentii . De las 1188 muestras recogidas de olivos, 17 (1,43%) muestras positivas fueron identificadas como C. gattii (4), C. neoformans var. grubii (2), C. laurentii (3), C. albidus (2), C. saitoi (5) y C. flavescens (1). Asimismo, los especímenes de C. neoformans var. grubii presentaron VNI de tipo molecular y VNII de tipo molecular; para C. gattii los tipos moleculares encontrados fueron VGIII y VGIV. Conclusiones Por lo tanto, se puede concluir que las especies del género Cryptococcus, están presentes en el ambiente de Boyacá, y muestran una predilección por las condiciones climáticas que son típicas de esta región.Files
latest.pdf.pdf
Files
(2.0 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:bf5c85253510f603a0783581540e4505
|
2.0 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التقرير الأول عن العزلة البيئية للكريبتوكوكس من بوياكا - كولومبيا
- Translated title (French)
- Premier rapport d'isolement environnemental de Cryptococcus spp. de Boyacá - Colombie
- Translated title (Spanish)
- Primer reporte de aislamiento ambiental de Cryptococcus spp. de Boyacá - Colombia
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4320724857
- DOI
- 10.21203/rs.3.rs-2350693/v2
References
- https://openalex.org/W1483005112
- https://openalex.org/W1837184489
- https://openalex.org/W1964444162
- https://openalex.org/W1975228887
- https://openalex.org/W1982009255
- https://openalex.org/W1983948068
- https://openalex.org/W1988318103
- https://openalex.org/W1996936752
- https://openalex.org/W1997386711
- https://openalex.org/W2008392955
- https://openalex.org/W2014858900
- https://openalex.org/W2018552263
- https://openalex.org/W2020653983
- https://openalex.org/W2026602415
- https://openalex.org/W2027523503
- https://openalex.org/W2031678657
- https://openalex.org/W2033613215
- https://openalex.org/W2034709416
- https://openalex.org/W2056253420
- https://openalex.org/W2057187003
- https://openalex.org/W2061057386
- https://openalex.org/W2068512571
- https://openalex.org/W2091494430
- https://openalex.org/W2095908222
- https://openalex.org/W2105272521
- https://openalex.org/W2111453104
- https://openalex.org/W2111965387
- https://openalex.org/W2115445096
- https://openalex.org/W2116706689
- https://openalex.org/W2122283460
- https://openalex.org/W2126223959
- https://openalex.org/W2127145634
- https://openalex.org/W2129591879
- https://openalex.org/W2131264071
- https://openalex.org/W2133322215
- https://openalex.org/W2137596136
- https://openalex.org/W2156920613
- https://openalex.org/W2157318380
- https://openalex.org/W2161004182
- https://openalex.org/W2168233410
- https://openalex.org/W2169420175
- https://openalex.org/W2170101928
- https://openalex.org/W2370311300
- https://openalex.org/W2515146415
- https://openalex.org/W2576825974
- https://openalex.org/W2606125859
- https://openalex.org/W2609326071
- https://openalex.org/W2611697423
- https://openalex.org/W2771133670
- https://openalex.org/W2790214534
- https://openalex.org/W2894006996
- https://openalex.org/W2921245961
- https://openalex.org/W2949575876
- https://openalex.org/W2958677919
- https://openalex.org/W2965995018
- https://openalex.org/W2997627718
- https://openalex.org/W3032399514
- https://openalex.org/W3164872179
- https://openalex.org/W4210875411
- https://openalex.org/W4242292696
- https://openalex.org/W4248525957
- https://openalex.org/W4300459735
- https://openalex.org/W4320801063
- https://openalex.org/W4320801064
- https://openalex.org/W4320801075
- https://openalex.org/W4320801083