Published March 28, 2022
| Version v1
Publication
Open
Single-cell transcriptomic analysis suggests two molecularly distinct subtypes of intrahepatic cholangiocarcinoma
Creators
-
Guohe Song1, 2
-
Yang Shi3
-
Ling Meng4, 5
-
Jiaqiang Ma1, 2
-
Siyuan Huang6, 3
-
Juan Zhang1, 2
-
Yingcheng Wu1, 2
-
Jiaxin Li6, 3
-
Youpei Lin1, 2
-
Shenghong Yang1, 2
-
Dongning Rao1, 2
- Yifei Cheng1, 2
-
Jian Lin1
-
Shuyi Ji1
-
Yuming Liu1, 2
-
Shan Jiang4, 5
-
Xiaoliang Wang2, 1
-
Shu Zhang1, 2
-
Ai–Wu Ke1, 2
-
Xiaoying Wang1, 2
-
Yang Cao7
-
Yuan Ji8, 2, 1, 9
-
Jian Zhou1
-
Jia Fan1
-
Xiaoming Zhang4, 5
-
Ruibin Xi3
-
Qiang Gao1, 2
- 1. Fudan University
- 2. Zhongshan Hospital
- 3. Peking University
- 4. Institut Pasteur of Shanghai
- 5. Chinese Academy of Sciences
- 6. Center for Life Sciences
- 7. Central South University
- 8. The First Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University
- 9. Sun Yat-sen University
Description
Abstract Intrahepatic cholangiocarcinoma (iCCA) is a highly heterogeneous cancer with limited understanding of its classification and tumor microenvironment. Here, by performing single-cell RNA sequencing on 144,878 cells from 14 pairs of iCCA tumors and non-tumor liver tissues, we find that S100P and SPP1 are two markers for iCCA perihilar large duct type (iCCA phl ) and peripheral small duct type (iCCA pps ). S100P + SPP1− iCCA phl has significantly reduced levels of infiltrating CD4 + T cells, CD56 + NK cells, and increased CCL18 + macrophages and PD1 + CD8 + T cells compared to S100P-SPP1 + iCCA pps . The transcription factor CREB3L1 is identified to regulate the S100P expression and promote tumor cell invasion. S100P-SPP1 + iCCA pps has significantly more SPP1 + macrophage infiltration, less aggressiveness and better survival than S100P + SPP1− iCCA phl . Moreover, S100P-SPP1 + iCCA pps harbors tumor cells at different status of differentiation, such as ALB + hepatocyte differentiation and ID3+ stemness. Our study extends the understanding of the diversity of tumor cells in iCCA.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
سرطان الأوعية الصفراوية داخل الكبد (iCCA) هو سرطان غير متجانس للغاية مع فهم محدود لتصنيفه والبيئة الدقيقة للورم. هنا، من خلال إجراء تسلسل الحمض النووي الريبي أحادي الخلية على 144،878 خلية من 14 زوجًا من أورام iCCA وأنسجة الكبد غير الورمية، نجد أن S100P و SPP1 هما علامتان لنوع القناة الكبيرة المحيطة بـ iCCA (iCCA phl) ونوع القناة الصغيرة الطرفية (iCCA pps ). يحتوي S100P +SPP1 - iCCA phl على مستويات منخفضة بشكل كبير من تسلل خلايا CD4 + T وخلايا CD56 + NK وزيادة الخلايا البلعمية CCL18 + وخلايا PD1 + CD8 + T مقارنة بـ S100P - SPP1 + iCCA pps . تم تحديد عامل النسخ CREB3L1 لتنظيم تعبير S100P وتعزيز غزو الخلايا السرطانية. يحتوي S100P - SPP1 + iCCA على تسلل أكبر بكثير من SPP1 + البلاعم، وأقل عدوانية وبقاء أفضل من S100P + SPP1- iCCA phl . علاوة على ذلك، فإن S100P - SPP1 + iCCA PPS تؤوي الخلايا السرطانية في حالة مختلفة من التمايز، مثل تمايز الخلايا الكبدية ALB + وتمايزID3 +. توسع دراستنا من فهم تنوع الخلايا السرطانية في iCCA.Translated Description (French)
Résumé Le cholangiocarcinome intrahépatique (CCI) est un cancer très hétérogène avec une compréhension limitée de sa classification et de son microenvironnement tumoral. Ici, en effectuant le séquençage de l'ARN unicellulaire sur 144 878 cellules de 14 paires de tumeurs iCCA et de tissus hépatiques non tumoraux, nous constatons que S100P et SPP1 sont deux marqueurs du type de grand canal périhilaire iCCA (iCCA phl ) et du type de petit canal périphérique (iCCA pps ). S100P + SPP1− iCCA phl a des niveaux significativement réduits de lymphocytes T CD4 + infiltrants, de lymphocytes NK CD56 + et une augmentation des macrophages CCL18 + et des lymphocytes T PD1 + CD8 + par rapport à S100P-SPP1 + iCCA pps . Le facteur de transcription CREB3L1 est identifié pour réguler l'expression de S100P et favoriser l'invasion des cellules tumorales. S100P-SPP1 + iCCA pps a significativement plus d'infiltration de macrophages SPP1 +, moins d'agressivité et une meilleure survie que S100P + SPP1− iCCA phl . De plus, S100P-SPP1 + iCCA pps héberge des cellules tumorales à différents états de différenciation, tels que la différenciation des hépatocytes Alb + et la souche ID3+. Notre étude étend la compréhension de la diversité des cellules tumorales dans l'iCCA.Translated Description (Spanish)
Resumen El colangiocarcinoma intrahepático (iCCA) es un cáncer altamente heterogéneo con una comprensión limitada de su clasificación y microambiente tumoral. Aquí, al realizar la secuenciación de ARN unicelular en 144,878 células de 14 pares de tumores iCCA y tejidos hepáticos no tumorales, encontramos que S100P y SPP1 son dos marcadores para el tipo de conducto grande perihilar iCCA (iCCA phl ) y el tipo de conducto pequeño periférico (iCCA pps ). S100P + SPP1− iCCA phl tiene niveles significativamente reducidos de células T CD4 + infiltrantes, células NK CD56 + y aumento de macrófagos CCL18 + y células T PD1 + CD8 + en comparación con S100P-SPP1 + iCCA pps . El factor de transcripción CREB3L1 se identifica para regular la expresión de S100P y promover la invasión de células tumorales. S100P-SPP1 + iCCA pps tiene significativamente más infiltración de macrófagos SPP1 +, menos agresividad y mejor supervivencia que S100P + SPP1− iCCA phl . Además, S100P-SPP1 + iCCA pps alberga células tumorales en diferentes estados de diferenciación, como la diferenciación de hepatocitos ALB + y la talloidad ID3+. Nuestro estudio amplía la comprensión de la diversidad de células tumorales en iCCA.Files
s41467-022-29164-0.pdf.pdf
Files
(4.8 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:7d4545ccb86bde9a24e2a8a5741f619b
|
4.8 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- يشير التحليل النصي أحادي الخلية إلى نوعين فرعيين متميزين جزيئيًا من سرطان الأوعية الصفراوية داخل الكبد
- Translated title (French)
- L'analyse transcriptomique unicellulaire suggère deux sous-types de cholangiocarcinome intrahépatique distincts sur le plan moléculaire
- Translated title (Spanish)
- El análisis transcriptómico unicelular sugiere dos subtipos molecularmente distintos de colangiocarcinoma intrahepático
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4220750490
- DOI
- 10.1038/s41467-022-29164-0
References
- https://openalex.org/W1898334680
- https://openalex.org/W1982350066
- https://openalex.org/W1994919628
- https://openalex.org/W2001165015
- https://openalex.org/W2007086626
- https://openalex.org/W2022875135
- https://openalex.org/W2029854125
- https://openalex.org/W2035618305
- https://openalex.org/W2041346020
- https://openalex.org/W2047312823
- https://openalex.org/W2051404522
- https://openalex.org/W2059634098
- https://openalex.org/W2065121554
- https://openalex.org/W2103441770
- https://openalex.org/W2112938192
- https://openalex.org/W2114104545
- https://openalex.org/W2145115817
- https://openalex.org/W2154974159
- https://openalex.org/W2332292689
- https://openalex.org/W2405513305
- https://openalex.org/W2413215169
- https://openalex.org/W2473709326
- https://openalex.org/W2616922646
- https://openalex.org/W2625391050
- https://openalex.org/W2724543993
- https://openalex.org/W2745824859
- https://openalex.org/W2747877289
- https://openalex.org/W2757884195
- https://openalex.org/W2777366754
- https://openalex.org/W2792707531
- https://openalex.org/W2801387495
- https://openalex.org/W2810097927
- https://openalex.org/W2817838603
- https://openalex.org/W2900169075
- https://openalex.org/W2901515128
- https://openalex.org/W2904300980
- https://openalex.org/W2907514116
- https://openalex.org/W2920983014
- https://openalex.org/W2943192796
- https://openalex.org/W2945946815
- https://openalex.org/W2949177718
- https://openalex.org/W2953151710
- https://openalex.org/W2955417896
- https://openalex.org/W2969593942
- https://openalex.org/W2978708928
- https://openalex.org/W2988464219
- https://openalex.org/W2990250467
- https://openalex.org/W2992156287
- https://openalex.org/W2997215171
- https://openalex.org/W3016360824
- https://openalex.org/W3021988909
- https://openalex.org/W3033473768
- https://openalex.org/W3038632482
- https://openalex.org/W3039360174
- https://openalex.org/W3042561617
- https://openalex.org/W3088941414
- https://openalex.org/W3092537029
- https://openalex.org/W3098088607
- https://openalex.org/W3101588621
- https://openalex.org/W3103673074
- https://openalex.org/W3107074894
- https://openalex.org/W3112241151
- https://openalex.org/W3146815249
- https://openalex.org/W3175283754