Published January 1, 2022 | Version v1
Publication Metadata-only

Stem signatures associating SOX2 antibody helps to define diagnosis and prognosis prediction with esophageal cancer

Creators

  • 1. First Affiliated Hospital of Xi'an Jiaotong University
  • 2. Harbin Veterinary Research Institute
  • 3. First Affiliated Hospital of Jinan University
  • 4. First Hospital of China Medical University
  • 5. Jiangsu Province Hospital
  • 6. Sun Yat-sen University
  • 7. Sun Yat-sen University Cancer Center
  • 8. Beijing Forestry University
  • 9. Nanjing Agricultural University
  • 10. Chinese PLA General Hospital
  • 11. Jilin Medical University
  • 12. Zhejiang University
  • 13. Shanghai Jiao Tong University
  • 14. Tianjin Medical University
  • 15. Tulane University
  • 16. Huazhong University of Science and Technology
  • 17. University of Chinese Academy of Sciences
  • 18. Shantou University
  • 19. Shantou University Medical College
  • 20. Northeast Forestry University
  • 21. Third Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University
  • 22. First Affiliated Hospital of Anhui Medical University
  • 23. Anhui Medical University
  • 24. First Affiliated Hospital of Bengbu Medical College
  • 25. Center for Excellence in Molecular Cell Science
  • 26. Jilin University
  • 27. Fudan University
  • 28. Nanjing Medical University
  • 29. Chinese Academy of Sciences
  • 30. Thomas Jefferson University
  • 31. First Affiliated Hospital of Zhengzhou University
  • 32. University of Mississippi Medical Center
  • 33. Chongqing Medical University
  • 34. Dalian Medical University
  • 35. Second Affiliated Hospital of Chongqing Medical University
  • 36. China Agricultural University
  • 37. Tongji University
  • 38. Peking University First Hospital
  • 39. Peking University
  • 40. Sheng Jing Hospital
  • 41. First Affiliated Hospital of Liaoning Medical University
  • 42. Zhongshan Hospital
  • 43. Sichuan University
  • 44. West China Hospital of Sichuan University
  • 45. Shandong Academy of Sciences

Description

esophageal cancer is one of the deadliest diseases worldwide. Due to the ineffectual screening methods referring to early diagnosis, most people have lost their chance of radical resection when diagnosed with esophageal cancer. This aim of this study was designed to evaluate the latent values of the stem signatures-associated autoantibodies (AABS) in predicting the early diagnosis, and particularly seeking the precise predictive outcomes with sensitive SOX2. We also studied the potential immunotherapeutic targets and prospective long-term prognosis predicators of esophageal cancer. The serum concentrations of selective antibodies were quantitated by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and a total of 203 local cases were enrolled. The TCGA databases were used to analyse distinct expression patterns and prognostic values of related genes. The TIMER database was used to explore the signatures of immune cell infiltration in related genes. The TISIDB database was used to analyse the association between related genes and immune regulators. The stem signatures-associated with antibodies of TP53, PGP9.5, SOX2, and CAGE were highly expressed in esophageal cancer and were negatively correlated with the test group, the diagnostic sensitivity of P53, SOX2, PGP9.5 and CAGE reached to 54.3%, 56.5%, 80.4% and 47.8%, respectively, and the specificity reached 77.7%, 93.6%, 76.4% and 86.6%. Especially in stage I esophageal cancer, the diagnostic sensitivity of SOX2 reached 82.4% with a specificity of 85.4%, which demonstrated good value in early diagnosis. The stem signatures-associated antibodies could be used as an effective indicator in early esophageal cancer diagnosis and could help to precisely predicate survival and prognosis.Key MessagesThe stem signatures-associated immune-antibodies could be used as effective indicators in early diagnosis of esophageal cancer and help to precisely predicate the survival and prognosis.The potential immunotherapeutic targets referring to esophageal cancer are screened and analysed, and the high sensitivity of SOX2 in detecting early esophageal cancer will yield early and effective treatments. The stem signatures-associated immune-antibodies could be used as effective indicators in early diagnosis of esophageal cancer and help to precisely predicate the survival and prognosis. The potential immunotherapeutic targets referring to esophageal cancer are screened and analysed, and the high sensitivity of SOX2 in detecting early esophageal cancer will yield early and effective treatments.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

سرطان المريء هو واحد من أكثر الأمراض المميتة في جميع أنحاء العالم. بسبب طرق الفحص غير الفعالة التي تشير إلى التشخيص المبكر، فقد معظم الناس فرصتهم في الاستئصال الجذري عند تشخيص إصابتهم بسرطان المريء. تم تصميم هذا الهدف من هذه الدراسة لتقييم القيم الكامنة للأجسام المضادة المرتبطة بتواقيع الساق (AABS) في التنبؤ بالتشخيص المبكر، والسعي بشكل خاص للحصول على نتائج تنبؤية دقيقة مع SOX2 الحساسة. كما درسنا الأهداف العلاجية المناعية المحتملة ومؤشرات التشخيص المحتملة على المدى الطويل لسرطان المريء. تم قياس تركيزات الأجسام المضادة الانتقائية في المصل عن طريق المقايسة المناعية المرتبطة بالإنزيم (ELISA)، وتم تسجيل ما مجموعه 203 حالة محلية. تم استخدام قواعد بيانات TCGA لتحليل أنماط التعبير المميزة والقيم التنبؤية للجينات ذات الصلة. تم استخدام قاعدة بيانات المؤقت لاستكشاف تواقيع تسلل الخلايا المناعية في الجينات ذات الصلة. تم استخدام قاعدة بيانات TISIDB لتحليل الارتباط بين الجينات ذات الصلة والمنظمين المناعيين. تم التعبير عن البصمات الجذعية المرتبطة بالأجسام المضادة لـ TP53 و PGP9.5 و Sox2 و Cage بشكل كبير في سرطان المريء وكانت مرتبطة سلبًا بمجموعة الاختبار، ووصلت الحساسية التشخيصية لـ p53 و Sox2 و PGP9.5 و Cage إلى 54.3 ٪ و 56.5 ٪ و 80.4 ٪ و 47.8 ٪ على التوالي، ووصلت الخصوصية إلى 77.7 ٪ و 93.6 ٪ و 76.4 ٪ و 86.6 ٪. خاصة في المرحلة الأولى من سرطان المريء، وصلت الحساسية التشخيصية لـ Sox2 إلى 82.4 ٪ مع خصوصية 85.4 ٪، والتي أظهرت قيمة جيدة في التشخيص المبكر. يمكن استخدام الأجسام المضادة المرتبطة بتواقيع STEM كمؤشر فعال في التشخيص المبكر لسرطان المريء ويمكن أن تساعد في تحديد البقاء والتشخيص بدقة. الرسائل الرئيسية يمكن استخدام الأجسام المضادة المناعية المرتبطة بتواقيع STEM كمؤشرات فعالة في التشخيص المبكر لسرطان المريء وتساعد على تحديد البقاء والتشخيص بدقة. يتم فحص وتحليل أهداف العلاج المناعي المحتملة التي تشير إلى سرطان المريء، وستؤدي الحساسية العالية لـ SOX2 في الكشف عن سرطان المريء المبكر إلى علاجات مبكرة وفعالة. يمكن استخدام الأجسام المضادة المناعية المرتبطة بالتواقيع الجذعية كمؤشرات فعالة في التشخيص المبكر لسرطان المريء وتساعد على تحديد البقاء على قيد الحياة والتشخيص بدقة. يتم فحص وتحليل الأهداف العلاجية المناعية المحتملة التي تشير إلى سرطان المريء، وستؤدي الحساسية العالية لـ SOX2 في الكشف المبكر عن سرطان المريء إلى علاجات مبكرة وفعالة.

Translated Description (French)

le cancer de l'œsophage est l'une des maladies les plus mortelles au monde. En raison des méthodes de dépistage inefficaces faisant référence au diagnostic précoce, la plupart des gens ont perdu leur chance de résection radicale lorsqu'ils ont reçu un diagnostic de cancer de l'œsophage. Cet objectif de cette étude a été conçu pour évaluer les valeurs latentes des auto-anticorps associés aux signatures STEM (AABS) dans la prédiction du diagnostic précoce, et en particulier la recherche des résultats prédictifs précis avec le SOX2 SENSIBLE. Nous avons également étudié les cibles immunothérapeutiques potentielles et les prédicteurs prospectifs du pronostic à long terme du cancer de l'œsophage. Les concentrations sériques d'anticorps sélectifs ont été quantifiées par dosage immuno-enzymatique (ELISA), et un total de 203 cas locaux ont été inclus. Les bases de données TCGA ont été utilisées pour analyser des modèles d'expression distincts et des valeurs pronostiques de gènes apparentés. La base de données TIMER a été utilisée pour explorer les signatures de l'infiltration de cellules immunitaires dans des gènes apparentés. La base de données TISIDB a été utilisée pour analyser l'association entre les gènes apparentés et les régulateurs immunitaires. Les signatures STEM associées aux anticorps de TP53, PGP9.5, SOX2 et CAGE étaient fortement exprimées dans le cancer de l'œsophage et étaient négativement corrélées avec le groupe test, la sensibilité diagnostique de P53, SOX2, PGP9.5 et CAGE atteignait 54,3 %, 56,5 %, 80,4 % et 47,8 %, respectivement, et la spécificité atteignait 77,7 %, 93,6 %, 76,4 % et 86,6 %. En particulier dans le cancer de l'œsophage de stade I, la sensibilité diagnostique de SOX2 a atteint 82,4 % avec une spécificité de 85,4 %, ce qui a démontré une bonne valeur dans le diagnostic précoce. Les anticorps associés aux signatures STEM pourraient être utilisés comme un indicateur efficace dans le diagnostic précoce du cancer de l'œsophage et pourraient aider à prédire avec précision la survie et le pronostic.Messages clésLes anticorps immunitaires associés aux signatures STEM pourraient être utilisés comme indicateurs efficaces dans le diagnostic précoce du cancer de l'œsophage et aider à prédire avec précision la survie et le pronostic.Les cibles immunothérapeutiques potentielles se référant au cancer de l'œsophage sont dépistées et analysées, et la sensibilité élevée de SOX2 dans la détection précoce du cancer de l'œsophage donnera des traitements précoces et efficaces. Les anticorps immunitaires associés aux signatures STEM pourraient être utilisés comme indicateurs efficaces dans le diagnostic précoce du cancer de l'œsophage et aider à prédire avec précision la survie et le pronostic. Les cibles immunothérapeutiques potentielles se référant au cancer de l'œsophage sont dépistées et analysées, et la sensibilité élevée de SOX2 dans la détection précoce du cancer de l'œsophage donnera des traitements précoces et efficaces.

Translated Description (Spanish)

el cáncer de esófago es una de las enfermedades más mortales en todo el mundo. Debido a los métodos de detección ineficaces que se refieren al diagnóstico precoz, la mayoría de las personas han perdido la posibilidad de una resección radical cuando se les diagnostica cáncer de esófago. Este objetivo de este estudio se diseñó para evaluar los valores latentes de los autoanticuerpos asociados a las firmas STEM (AABS) para predecir el diagnóstico precoz y, en particular, para buscar los resultados predictivos precisos con SOX2 sensible. También estudiamos las posibles dianas inmunoterapéuticas y los predictores prospectivos de pronóstico a largo plazo del cáncer de esófago. Las concentraciones séricas de anticuerpos selectivos se cuantificaron mediante ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) y se inscribieron un total de 203 casos locales. Las bases de datos TCGA se utilizaron para analizar distintos patrones de expresión y valores de pronóstico de genes relacionados. La base de datos del TEMPORIZADOR se utilizó para explorar las firmas de infiltración de células inmunitarias en genes relacionados. La base de datos TISIDB se utilizó para analizar la asociación entre genes relacionados y reguladores inmunitarios. Las firmas de STEM asociadas con los anticuerpos de TP53, PGP9.5, SOX2 y CAGE se expresaron altamente en el cáncer de esófago y se correlacionaron negativamente con el grupo de prueba, la sensibilidad diagnóstica de P53, SOX2, PGP9.5 y CAGE alcanzó 54.3%, 56.5%, 80.4% y 47.8%, respectivamente, y la especificidad alcanzó 77.7%, 93.6%, 76.4% y 86.6%. Especialmente en el cáncer de esófago en estadio I, la sensibilidad diagnóstica de SOX2 alcanzó el 82,4% con una especificidad del 85,4%, lo que demostró un buen valor en el diagnóstico precoz. Los anticuerpos asociados a las firmas STEM podrían usarse como un indicador eficaz en el diagnóstico precoz del cáncer de esófago y podrían ayudar a predecir con precisión la supervivencia y el pronóstico. Mensajes claveLos anticuerpos inmunitarios asociados a las firmas STEM podrían usarse como indicadores eficaces en el diagnóstico precoz del cáncer de esófago y ayudar a predecir con precisión la supervivencia y el pronóstico. Las posibles dianas inmunoterapéuticas que se refieren al cáncer de esófago se examinan y analizan, y la alta sensibilidad de SOX2 en la detección temprana del cáncer de esófago producirá tratamientos tempranos y eficaces. Los anticuerpos inmunitarios asociados a las firmas STEM podrían utilizarse como indicadores eficaces en el diagnóstico precoz del cáncer de esófago y ayudar a predecir con precisión la supervivencia y el pronóstico. Se examinan y analizan las posibles dianas inmunoterapéuticas que se refieren al cáncer de esófago, y la alta sensibilidad de SOX2 en la detección temprana del cáncer de esófago producirá tratamientos tempranos y efectivos.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تساعد التوقيعات الجذعية التي تربط الجسم المضاد SOX2 على تحديد التشخيص والتنبؤ بالتنبؤ بسرطان المريء
Translated title (French)
Les signatures de tige associant L'ANTICORPS SOX2 aident à définir le diagnostic et la prédiction du pronostic du cancer de l'œsophage
Translated title (Spanish)
Las firmas STEM que asocian el anticuerpo SOX2 ayudan a definir el diagnóstico y la predicción del pronóstico con el cáncer de esófago

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4394364777
DOI
10.6084/m9.figshare.19524719

Is supplement to
https://openalex.org/W4323566320 (Other)
https://openalex.org/W3032824358 (Other)
https://openalex.org/W2517286276 (Other)
https://openalex.org/W2350028111 (Other)
https://openalex.org/W2124841426 (Other)
https://openalex.org/W2104708641 (Other)
https://openalex.org/W2079777624 (Other)
https://openalex.org/W2060904065 (Other)
https://openalex.org/W1981105533 (Other)
https://openalex.org/W1974365957 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China