Peer Review #1 of "Snake venomics of Bothrops punctatus, a semiarboreal pitviper species from Antioquia, Colombia (v0.1)"
- 1. Rede de Química e Tecnologia
- 2. Universidad de Antioquia
- 3. Universidad de Costa Rica
Description
Snake venomics of Bothrops punctatus, a semi-arboreal pitviper species from Antioquia, ColombiaBothrops punctatus is an endangered, semi-arboreal pitviper species distributed in Panamá, Colombia, and Ecuador, whose venom is poorly characterized.In the present work, the protein composition of this venom was profiled using the 'snake venomics' analytical strategy.Decomplexation of the crude venom by RP-HPLC and SDS-PAGE, followed by tandem mass spectrometry of tryptic digests, showed that it consists of proteins assigned to at least nine snake toxin families.Metalloproteinases are predominant in this secretion (41.5% of the total proteins), followed by C-type lectin/lectin-like proteins (16.7%), bradykinin-potentiating peptides (10.7%), phospholipases A2 (9.3%), serine proteinases (5.4%), disintegrins (3.8%), L-amino acid oxidases (3.1%), vascular endothelial growth factors (1.7%), and cysteine-rich secretory proteins (1.2%).Altogether, 6.6% of the proteins were not identified.In vitro, the venom exhibited proteolytic, phospholipase A2, and L-amino acid oxidase activities, as well as angiotensin-converting enzyme (ACE)-inhibitory activity, in agreement with the obtained proteomic profile.Cytotoxic activity on murine C2C12 myoblasts was negative, suggesting that the majority of venom phospholipases A2 likely belong to the acidic type, which often lack major toxic effects.The protein composition of B. punctatus venom shows a good correlation with toxic activities here and previously reported, and adds further data in support of the wide diversity of strategies that have evolved in snake venoms to subdue prey, as increasingly being revealed by proteomic analyses.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
سموم الثعبان المنقط، وهو نوع من الثعابين شبه الشاطئية من أنتيوكيا، كولومبيا. الثعابين المنقطية هي أنواع من الثعابين شبه الشاطئية المهددة بالانقراض، موزعة في بنما وكولومبيا والإكوادور، والتي يتميز سمها بشكل سيئ. في العمل الحالي، تم تحديد تكوين البروتين لهذا السم باستخدام الاستراتيجية التحليلية "لسموم الثعابين". أظهر تعقيد السم الخام بواسطة RP - HPLC و SDS - PAGE، متبوعًا بقياس الطيف الكتلي الترادفي لهضمات التريبتيك، أنه يتكون من بروتينات مخصصة لتسع عائلات على الأقل من سموم الثعابين. تسود البروتينات الفلزية في هذا الإفراز (41.5 ٪ من إجمالي البروتينات)، تليها بروتينات من النوع C/بروتينات تشبه الليكتين (16.7 ٪)، الببتيدات المحفزة للبراديكينين (10.7 ٪)، إنزيمات الفوسفوليباز A2 (9.3 ٪)، بروتينات السيرين (5.4 ٪)، التفكك (3.8 ٪)، أكسدة الأحماض الأمينية L (3.1 ٪)، عوامل نمو بطانة الأوعية الدموية (1.7 ٪)، والبروتينات الإفرازية الغنية بالسيستين (1.2 ٪). إجمالًا، لم يتم تحديد 6.6 ٪ من البروتينات. في المختبر، أظهر السم أنشطة بروتينية، فوسفوليباز A2، وأكسدة الأحماض الأمينية L، بالإضافة إلى نشاط مثبط للإنزيم المحول للأنجيوتنسين (ACE)، بالاتفاق مع الملف البروتيني الذي تم الحصول عليه. كان النشاط السام للخلايا على الأرومات العضلية C2C12 الفئران سلبيًا، مما يشير إلى أن غالبية إنزيمات الفوسفوليباز A2 من المحتمل أن تنتمي إلى إلى النوع الحمضي، الذي غالبًا ما يفتقر إلى تأثيرات سامة كبيرة. يُظهر تكوين البروتين لسم B. punctatus ارتباطًا جيدًا بالأنشطة السامة هنا والتي تم الإبلاغ عنها سابقًا، ويضيف المزيد من البيانات لدعم التنوع الواسع في الاستراتيجيات التي تطورت في سموم الثعابين لإخضاع الفريسة، كما يتضح بشكل متزايد من خلال التحليلات البروتينية.Translated Description (French)
Le venin de serpent de Bothrops punctatus, une espèce de pitviper semi-arboréale d'Antioquia, en Colombie.Bothrops punctatus est une espèce de pitviper semi-arboréale en voie de disparition distribuée au Panama, en Colombie et en Équateur, dont le venin est mal caractérisé.Dans le présent travail, la composition protéique de ce venin a été profilée à l'aide de la stratégie analytique « venomique du serpent ».La décomplexation du venin brut par RP-HPLC et SDS-PAGE, suivie d'une spectrométrie de masse en tandem de digestes tryptiques, a montré qu'il se compose de protéines affectées à au moins neuf familles de toxines de serpent. Les métalloprotéinases sont prédominantes dans cette sécrétion (41,5 % des protéines totales), suivies de protéines de type lectine/de type lectine (16,7 %), les peptides potentialisant la bradykinine (10,7 %), les phospholipases A2 (9,3 %), les sérine protéinases (5,4 %), les désintégrines (3,8 %), les L-aminoacides oxydases (3,1 %), les facteurs de croissance endothéliaux vasculaires (1,7 %) et les protéines sécrétoires riches en cystéine (1,2 %). Au total, 6,6 % des protéines n'ont pas été identifiées. In vitro, le venin présentait des activités protéolytiques, phospholipase A2 et L-aminoacide oxydase, ainsi qu'une activité inhibitrice de l'enzyme de conversion de l'angiotensine (ECA), en accord avec le profil protéomique obtenu. L'activité cytotoxique sur les myoblastes C2C12 murins était négative, ce qui suggère que la majorité des phospholipases A2 venom appartiennent probablement au type acide, qui manque souvent d'effets toxiques majeurs. La composition protéique du venin de B. punctatus montre une bonne corrélation avec les activités toxiques rapportées ici et précédemment, et ajoute des données supplémentaires à l'appui de la grande diversité de stratégies qui ont évolué dans les venins de serpents pour maîtriser les proies, comme le révèlent de plus en plus les analyses protéomiques.Translated Description (Spanish)
La venómica de serpientes de Bothrops punctatus, una especie de pitviper semiarbóreo de Antioquia, ColombiaBothrops punctatus es una especie de pitviper semiarbóreo en peligro de extinción distribuida en Panamá, Colombia y Ecuador, cuyo veneno está mal caracterizado. En el presente trabajo, la composición proteica de este veneno se perfiló utilizando la estrategia analítica 'venómica de serpientes'. La descomplejación del veneno crudo por RP-HPLC y SDS-PAGE, seguida de espectrometría de masas en tándem de digestiones trípticas, mostró que consiste en proteínas asignadas a al menos nueve familias de toxinas de serpientes. Las metaloproteinasas son predominantes en esta secreción (41.5% de las proteínas totales), seguidas de lectina de tipo C/proteínas similares a lectina (16.7%), péptidos potenciadores de bradiquinina (10.7%), fosfolipasas A2 (9.3%), serina proteinasas (5.4%), desintegrinas (3.8%), L-aminoácido oxidasas (3.1%), factores de crecimiento endotelial vascular (1.7%) y proteínas secretoras ricas en cisteína (1.2%). En conjunto, no se identificaron el 6.6% de las proteínas. En vitro, el veneno exhibió actividades proteolíticas, fosfolipasa A2 y L-aminoácido oxidasa, así como actividad inhibidora de la enzima convertidora de angiotensina (ECA), de acuerdo con el perfil proteómico obtenido. La actividad citotóxica en mioblastos C2C12 murinos fue negativa, lo que sugiere que la mayoría de las fosfolipasas A2 de veneno probablemente pertenecen al tipo ácido, que a menudo carecen de efectos tóxicos importantes. La composición proteica del veneno de B. punctatus muestra una buena correlación con las actividades tóxicas aquí y previamente informadas, y agrega más datos en apoyo de la amplia diversidad de estrategias que han evolucionado en los venenos de serpientes para someter a las presas, como lo revelan cada vez más los análisis proteómicos.Files
submission.pdf
Files
(656.5 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:fcfde45e802160e9509fbb683675db4e
|
656.5 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- مراجعة الأقران رقم1 لـ "سموم الثعابين من بوثروبس بونكتاتوس، وهو نوع من أفعى الحفرة شبه الشمالية من أنتيوكيا، كولومبيا (v0.1 )"
- Translated title (French)
- Examen par les pairs n °1 de "Snake venomics of Bothrops punctatus, a semiarboreal pitviper species from Antioquia, Colombia (v0.1)"
- Translated title (Spanish)
- Revisión por pares #1 de "Snake venomics of Bothrops punctatus, a semiarboreal pitviper species from Antioquia, Colombia (v0.1)"
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4254247306
- DOI
- 10.7287/peerj.246v0.1/reviews/1