Published August 16, 2021
| Version v1
Publication
Open
Molecular Characterization and Demographic Study on Infectious Bursal Disease Virus in Faisalabad District
Creators
- 1. University of Agriculture Faisalabad
- 2. Taif University
Description
The re-emergence of virulent strains of the Infectious Bursal Disease Virus (IBDV) leads to significant economic losses of poultry industry in Pakistan during last few years. This disease causes the infection of bursa, which leads to major immune losses. A total number of 30 samples from five IBD outbreaks during the period of 2019–20 were collected from different areas of Faisalabad district, Pakistan and assayed by targeting the IBD virus VP2 region through RT-PCR. Among all the outbreaks, almost 80% of poultry birds were found positive for the IBDV. The bursa tissues were collected from the infected birds and histopathological examination of samples revealed severe lymphocytic depletion, infiltration of inflammatory cells, and necrosis of the bursa of Fabricius (BF). Positive samples were subjected to re-isolation and molecular characterization of IBDV. The Pakistan IBDV genes were subjected to DNA sequencing to determine the virus nucleotide sequences. The sequences of 100 Serotype-I IBDVs showing nearest homology were compared and identified with the study sequence. The construction of the phylogenetic tree for nucleotide sequences was accomplished by the neighbor-joining method in MEGA-6 with reference strains. The VP2 segment reassortment of IBDVs carrying segment A were identified as one important type of circulating strains in Pakistan. The findings indicated the molecular features of the Pakistan IBDV strains playing a role in the evolution of new strains of the virus, which will contribute to the vaccine selection and effective prevention of the disease.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تؤدي عودة ظهور السلالات الخبيثة من فيروس الجراب المعدي (IBDV) إلى خسائر اقتصادية كبيرة في صناعة الدواجن في باكستان خلال السنوات القليلة الماضية. يسبب هذا المرض عدوى الجراب، مما يؤدي إلى خسائر مناعية كبيرة. تم جمع ما مجموعه 30 عينة من خمس حالات تفشي مرض التهاب الأمعاء خلال الفترة 2019-2020 من مناطق مختلفة من منطقة فيصل أباد في باكستان وتم فحصها من خلال استهداف منطقة فيروس التهاب الأمعاء VP2 من خلال RT - PCR. من بين جميع حالات التفشي، تم العثور على ما يقرب من 80 ٪ من الطيور الداجنة إيجابية للعدوى بفيروس نقص المناعة البشرية. تم جمع أنسجة الجراب من الطيور المصابة وكشف الفحص النسيجي المرضي للعينات عن نضوب شديد في الخلايا الليمفاوية، وتسلل الخلايا الالتهابية، ونخر جراب فابريكيوس (BF). تم إخضاع العينات الإيجابية لإعادة العزل والتوصيف الجزيئي لـ IBDV. خضعت جينات فيروس نقص المناعة البشرية (IBDV) الباكستانية لتسلسل الحمض النووي (DNA) لتحديد تسلسل النيوكليوتيدات الفيروسية. تمت مقارنة تسلسلات 100 نوع من أنواع فيروس نقص المناعة البشرية من النمط المصلي الأول التي تظهر أقرب تماثل وتم تحديدها مع تسلسل الدراسة. تم إنجاز بناء شجرة تطور السلالات لتسلسلات النيوكليوتيدات من خلال طريقة الانضمام إلى الجيران في MEGA -6 مع السلالات المرجعية. تم تحديد إعادة تشكيل شريحة VP2 من IBDVs التي تحمل الجزء A كنوع مهم من السلالات المتداولة في باكستان. أشارت النتائج إلى أن السمات الجزيئية لسلالات فيروس التهاب الكبد الوبائي (IBDV) الباكستاني تلعب دورًا في تطور سلالات جديدة من الفيروس، مما سيسهم في اختيار اللقاح والوقاية الفعالة من المرض.Translated Description (French)
La réapparition de souches virulentes du virus de la bursite infectieuse (IBDV) entraîne des pertes économiques importantes pour l'industrie avicole au Pakistan au cours des dernières années. Cette maladie provoque l'infection de la bourse, ce qui entraîne des pertes immunitaires majeures. Un nombre total de 30 échantillons provenant de cinq foyers de MICI au cours de la période 2019-2020 ont été prélevés dans différentes zones du district de Faisalabad, au Pakistan, et dosés en ciblant la région VP2 du virus de la MICI par RT-PCR. Parmi toutes les flambées, près de 80 % des volailles ont été déclarées positives pour l'IBDV. Les tissus de la bourse ont été prélevés sur les oiseaux infectés et l'examen histopathologique des échantillons a révélé une déplétion lymphocytaire sévère, une infiltration de cellules inflammatoires et une nécrose de la bourse de Fabricius (BF). Les échantillons positifs ont été soumis à une ré-isolation et à une caractérisation moléculaire de l'IBDV. Les gènes IBDV du Pakistan ont été soumis à un séquençage de l'ADN pour déterminer les séquences nucléotidiques du virus. Les séquences de 100 IBDV de sérotype I présentant l'homologie la plus proche ont été comparées et identifiées avec la séquence de l'étude. La construction de l'arbre phylogénétique pour les séquences nucléotidiques a été réalisée par la méthode de jointure voisine dans MEGA-6 avec des souches de référence. Le réassortiment du segment VP2 des IBDV porteurs du segment A a été identifié comme un type important de souches circulantes au Pakistan. Les résultats ont indiqué les caractéristiques moléculaires des souches d'IBDV pakistanaises jouant un rôle dans l'évolution de nouvelles souches du virus, ce qui contribuera à la sélection du vaccin et à la prévention efficace de la maladie.Translated Description (Spanish)
La reaparición de cepas virulentas del Virus de la Enfermedad Bursal Infecciosa (IBDV) conduce a pérdidas económicas significativas de la industria avícola en Pakistán durante los últimos años. Esta enfermedad causa la infección de la bursa, lo que conduce a importantes pérdidas inmunes. Se recolectaron un total de 30 muestras de cinco brotes de EII durante el período de 2019–20 de diferentes áreas del distrito de Faisalabad, Pakistán, y se analizaron apuntando a la región VP2 del virus de la EII a través de RT-PCR. Entre todos los brotes, casi el 80% de las aves de corral dieron positivo para el IBDV. Los tejidos de la bursa se recolectaron de las aves infectadas y el examen histopatológico de las muestras reveló un agotamiento linfocítico severo, infiltración de células inflamatorias y necrosis de la bursa de Fabricius (BF). Las muestras positivas se sometieron a reaislamiento y caracterización molecular del IBDV. Los genes del IBDV de Pakistán se sometieron a secuenciación de ADN para determinar las secuencias de nucleótidos del virus. Las secuencias de 100 IBDV de serotipo I que muestran la homología más cercana se compararon e identificaron con la secuencia de estudio. La construcción del árbol filogenético para las secuencias de nucleótidos se realizó mediante el método de unión de vecinos en MEGA-6 con cepas de referencia. El reordenamiento del segmento VP2 de los IBDV que portan el segmento A se identificó como un tipo importante de cepas circulantes en Pakistán. Los hallazgos indicaron las características moleculares de las cepas del IBDV de Pakistán que desempeñan un papel en la evolución de nuevas cepas del virus, lo que contribuirá a la selección de vacunas y a la prevención efectiva de la enfermedad.Files
journal.pone.0254605&type=printable.pdf
Files
(2.4 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:cabfbbe94a74d246a81b928c338f82f4
|
2.4 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التوصيف الجزيئي والدراسة الديموغرافية لفيروسات الجراب المعدية في منطقة فيصل آباد
- Translated title (French)
- Caractérisation moléculaire et étude démographique sur le virus de la bursite infectieuse dans le district de Faisalabad
- Translated title (Spanish)
- Caracterización molecular y estudio demográfico sobre el virus infeccioso de la enfermedad bursal en el distrito de Faisalabad
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3195768689
- DOI
- 10.1371/journal.pone.0254605
References
- https://openalex.org/W1974457417
- https://openalex.org/W1984097035
- https://openalex.org/W1993714306
- https://openalex.org/W2004007806
- https://openalex.org/W2024607571
- https://openalex.org/W2035884663
- https://openalex.org/W2045507680
- https://openalex.org/W2061266439
- https://openalex.org/W2070143528
- https://openalex.org/W2074462158
- https://openalex.org/W2080201031
- https://openalex.org/W2095936155
- https://openalex.org/W2127716417
- https://openalex.org/W2128333688
- https://openalex.org/W2132632499
- https://openalex.org/W2174316968
- https://openalex.org/W2174419983
- https://openalex.org/W2342187987
- https://openalex.org/W2561148964
- https://openalex.org/W2605696180
- https://openalex.org/W2896043706
- https://openalex.org/W2910819020
- https://openalex.org/W2997383326
- https://openalex.org/W4387322190