Published March 30, 2020 | Version v1
Publication Open

The molecular characters and antibiotic resistance of Clostridioides difficile from economic animals in China

Creators

  • 1. National Institute for Communicable Disease Control and Prevention
  • 2. Shandong Academy of Agricultural Sciences
  • 3. Yunnan Center for Disease Control And Prevention

Description

Abstract Background It has been performed worldwidely to explore the potential of animals that might be a reservoir for community associated human infections of Clostridioides difficile . Several genetically undistinguished PCR ribotypes of C. difficile from animals and human have been reported, illustrating potential transmission of C. difficile between them. Pig and calf were considered as the main origins of C. difficile with predominant RT078 and RT033, respectively. As more investigations involved, great diversity of molecular types from pig and calf were reported in Europe, North American and Australia. However, there were quite limited research on C. difficile isolates from meat animals in China, leading to non-comprehensive understanding of molecular epidemiology of C. difficile in China. Results A total of 55 C. difficile were isolated from 953 animal stool samples, within which 51 strains were from newborn dairy calf less than 7 days in Shandong Province. These isolates were divided into 3 STs and 6 RTs, of which ST11/RT126 was predominant type, and responsible for majority antibiotic resistance isolates. All the isolates were resistant to at least one tested antibiotics, however, only two multidrug resistant (MDR) isolates were identified. Furthermore, erythromycin (ERY) and clindamycin (CLI) were the two main resistant antibiotics. None of the isolates were resistant to vancomycin (VAN), metronidazole (MTZ), tetracycline (TET), and rifampin (RIF). Conclusions In this study, we analyzed the prevalence, molecular characters and antibiotic resistance of C. difficile from calf, sheep, chicken, and pig in China. Some unique features were found here: first, RT126 not RT078 were the dominant type from baby calf, and none isolates were got from pig; second, on the whole, isolates from animals display relative lower resistant rate to these 11 tested antibiotics, compared with isolates from human in China in our previous report. Our study helps to deep understanding the situation of C. difficile from economic animals in China, and to further study the potential transmission of C. difficile between meat animals and human.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية مجردة تم إجراؤه في جميع أنحاء العالم لاستكشاف إمكانات الحيوانات التي قد تكون خزانًا للعدوى البشرية المرتبطة بالمجتمع من كلوستريديويدس العسيرة . تم الإبلاغ عن العديد من أنماط تفاعل البوليميراز المتسلسل غير المميزة وراثيًا من المطثية العسيرة من الحيوانات والإنسان، مما يوضح الانتقال المحتمل للمطثية العسيرة بينهما. تم اعتبار الخنزير والعجل كأصول رئيسية للمطثية العسيرة مع RT078 و RT033 السائدة، على التوالي. مع إجراء المزيد من التحقيقات، تم الإبلاغ عن تنوع كبير في الأنواع الجزيئية من الخنزير والعجل في أوروبا وأمريكا الشمالية وأستراليا. ومع ذلك، كانت هناك أبحاث محدودة للغاية حول عزلات المطثية العسيرة عن حيوانات اللحوم في الصين، مما أدى إلى فهم غير شامل لوبائيات المطثية العسيرة الجزيئية في الصين. تم عزل ما مجموعه 55 من براز الحيوانات من 953 عينة، منها 51 سلالة من عجل الألبان حديثي الولادة أقل من 7 أيام في مقاطعة شاندونغ. تم تقسيم هذه العزلات إلى 3 STs و 6 RTs، منها ST11/RT126 كان النوع السائد، والمسؤول عن غالبية عزلات مقاومة المضادات الحيوية. كانت جميع العزلات مقاومة لمضاد حيوي واحد على الأقل تم اختباره، ومع ذلك، تم تحديد اثنين فقط من العزلات المقاومة للأدوية المتعددة. علاوة على ذلك، كان الإريثروميسين (ERY) والكليندامايسين (CLI) هما المضادان الحيويان المقاومان الرئيسيان. لم تكن أي من العزلات مقاومة للفانكومايسين (فان)، ميترونيدازول (متز)، التتراسيكلين (تيت)، وريفامبين (ريف). في هذه الدراسة، قمنا بتحليل انتشار المطثية العسيرة وشخصياتها الجزيئية ومقاومتها للمضادات الحيوية من العجل والأغنام والدجاج والخنازير في الصين. تم العثور على بعض الميزات الفريدة هنا: أولاً، كانت RT126 وليس RT078 هي النوع السائد من عجل الطفل، ولم يتم الحصول على أي عزلات من الخنزير ؛ ثانيًا، على العموم، تظهر العزلات من الحيوانات معدل مقاومة أقل نسبيًا لهذه المضادات الحيوية الـ 11 التي تم اختبارها، مقارنة بالعزلات من الإنسان في الصين في تقريرنا السابق. تساعد دراستنا على فهم عميق لحالة المطثية العسيرة من الحيوانات الاقتصادية في الصين، ومواصلة دراسة الانتقال المحتمل للمطثية العسيرة بين حيوانات اللحوم والإنسان.

Translated Description (French)

Résumé Contexte Il a été réalisé dans le monde entier pour explorer le potentiel des animaux qui pourraient être un réservoir pour les infections humaines associées à la communauté de Clostridioides difficile . Plusieurs ribotypes PCR génétiquement non distingués de C. difficile provenant d'animaux et d'humains ont été rapportés, illustrant une transmission potentielle de C. difficile entre eux. Le porc et le veau ont été considérés comme les principales origines de C. difficile avec une prédominance de RT078 et RT033, respectivement. Au fur et à mesure que d'autres enquêtes ont été menées, une grande diversité de types moléculaires de porc et de veau a été signalée en Europe, en Amérique du Nord et en Australie. Cependant, il y avait assez peu de recherches sur les isolats de C. difficile provenant d'animaux à viande en Chine, ce qui a conduit à une compréhension incomplète de l'épidémiologie moléculaire de C. difficile en Chine. Résultats Un total de 55 C. difficile ont été isolés à partir de 953 échantillons de selles animales, dont 51 souches provenaient de veaux laitiers nouveau-nés de moins de 7 jours dans la province du Shandong. Ces isolats ont été divisés en 3 ST et 6 RT, dont le type ST11/RT126 était prédominant, et responsables de la majorité des isolats de résistance aux antibiotiques. Tous les isolats étaient résistants à au moins un antibiotique testé, cependant, seuls deux isolats multirésistants (MDR) ont été identifiés. De plus, l'érythromycine (ERY) et la clindamycine (CLI) étaient les deux principaux antibiotiques résistants. Aucun des isolats n'était résistant à la vancomycine (VAN), au métronidazole (MTZ), à la tétracycline (TET) et à la rifampicine (RIF). Conclusions Dans cette étude, nous avons analysé la prévalence, les caractères moléculaires et la résistance aux antibiotiques de C. difficile chez les veaux, les moutons, les poulets et les porcs en Chine. Certaines caractéristiques uniques ont été trouvées ici : premièrement, RT126 et non RT078 étaient le type dominant de bébé veau, et aucun isolat n'a été obtenu de porc ; deuxièmement, dans l'ensemble, les isolats d'animaux présentent un taux de résistance relativement plus faible à ces 11 antibiotiques testés, par rapport aux isolats d'humains en Chine dans notre précédent rapport. Notre étude aide à comprendre en profondeur la situation de C. difficile chez les animaux économiques en Chine et à étudier plus en détail la transmission potentielle de C. difficile entre les animaux de boucherie et les humains.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes abstractos Se ha realizado a nivel mundial para explorar el potencial de los animales que podrían ser un reservorio para las infecciones humanas asociadas a la comunidad de Clostridioides difficile . Se han informado varios ribotipos de PCR genéticamente indistinguibles de C. difficile de animales y humanos, lo que ilustra la posible transmisión de C. difficile entre ellos. El cerdo y el ternero se consideraron como los principales orígenes de C. difficile con RT078 y RT033 predominantes, respectivamente. A medida que se realizaron más investigaciones, se informó de una gran diversidad de tipos moleculares de cerdos y terneros en Europa, América del Norte y Australia. Sin embargo, hubo investigaciones bastante limitadas sobre aislados de C. difficile de animales de carne en China, lo que llevó a una comprensión no exhaustiva de la epidemiología molecular de C. difficile en China. Resultados Se aislaron un total de 55 C. difficile de 953 muestras de heces de animales, dentro de las cuales 51 cepas eran de terneros lecheros recién nacidos de menos de 7 días en la provincia de Shandong. Estos aislados se dividieron en 3 ST y 6 RT, de los cuales ST11/RT126 fue el tipo predominante y responsable de la mayoría de los aislados de resistencia a los antibióticos. Todos los aislados eran resistentes a al menos un antibiótico probado, sin embargo, solo se identificaron dos aislados multirresistentes (MDR). Además, la eritromicina (ERY) y la clindamicina (CLI) fueron los dos principales antibióticos resistentes. Ninguno de los aislados fue resistente a vancomicina (VAN), metronidazol (MTZ), tetraciclina (TET) y rifampicina (RIF). Conclusiones En este estudio, analizamos la prevalencia, los caracteres moleculares y la resistencia a los antibióticos de C. difficile de terneros, ovejas, pollos y cerdos en China. Aquí se encontraron algunas características únicas: en primer lugar, RT126 y no RT078 fueron el tipo dominante de ternero bebé, y no se obtuvieron aislados de cerdo; en segundo lugar, en general, los aislados de animales muestran una tasa de resistencia relativamente menor a estos 11 antibióticos probados, en comparación con los aislados de humanos en China en nuestro informe anterior. Nuestro estudio ayuda a comprender en profundidad la situación de C. difficile de animales económicos en China y a estudiar más a fondo la posible transmisión de C. difficile entre animales de carne y humanos.

Files

s12866-020-01757-z.pdf

Files (845.9 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:a41fd16fb6ec49942a290fe46dab0de6
845.9 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الخصائص الجزيئية ومقاومة المضادات الحيوية للكلوستريديويدات العسيرة من الحيوانات الاقتصادية في الصين
Translated title (French)
Les caractères moléculaires et la résistance aux antibiotiques de Clostridioides difficile provenant d'animaux économiques en Chine
Translated title (Spanish)
Los caracteres moleculares y la resistencia a los antibióticos de Clostridioides difficile de animales económicos en China

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3013025731
DOI
10.1186/s12866-020-01757-z

Is supplement to
https://openalex.org/W4290127738 (Other)
https://openalex.org/W4238293403 (Other)
https://openalex.org/W2417071508 (Other)
https://openalex.org/W2404652170 (Other)
https://openalex.org/W2404422412 (Other)
https://openalex.org/W2252883481 (Other)
https://openalex.org/W2064134037 (Other)
https://openalex.org/W1991655813 (Other)
https://openalex.org/W180135687 (Other)
https://openalex.org/W108226660 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1538285042
  • https://openalex.org/W1886308172
  • https://openalex.org/W1967641292
  • https://openalex.org/W1974947229
  • https://openalex.org/W1987806279
  • https://openalex.org/W1988873270
  • https://openalex.org/W1999644200
  • https://openalex.org/W2001007801
  • https://openalex.org/W2017505829
  • https://openalex.org/W2021440497
  • https://openalex.org/W2047993290
  • https://openalex.org/W2053106625
  • https://openalex.org/W2063073516
  • https://openalex.org/W2071054182
  • https://openalex.org/W2083495889
  • https://openalex.org/W2083793985
  • https://openalex.org/W2087520013
  • https://openalex.org/W2097330653
  • https://openalex.org/W2097818540
  • https://openalex.org/W2118195673
  • https://openalex.org/W2122528458
  • https://openalex.org/W2123918417
  • https://openalex.org/W2125343055
  • https://openalex.org/W2127894127
  • https://openalex.org/W2131821874
  • https://openalex.org/W2163501622
  • https://openalex.org/W2201702575
  • https://openalex.org/W2413345600
  • https://openalex.org/W2464112039
  • https://openalex.org/W2465952491
  • https://openalex.org/W2511573436
  • https://openalex.org/W2515419349
  • https://openalex.org/W2547177029
  • https://openalex.org/W2560044415
  • https://openalex.org/W2570844395
  • https://openalex.org/W2755416670
  • https://openalex.org/W2803068086
  • https://openalex.org/W2806643757
  • https://openalex.org/W2917315798
  • https://openalex.org/W2926389368
  • https://openalex.org/W2971388289
  • https://openalex.org/W2982351022
  • https://openalex.org/W2997898377