Published November 27, 2015
| Version v1
Publication
Open
Genome-Wide Association Mapping for Tomato Volatiles Positively Contributing to Tomato Flavor
Creators
- 1. Ministry of Education of the People's Republic of China
- 2. Northwest A&F University
Description
Tomato volatiles, mainly derived from essential nutrients and health-promoting precursors, affect tomato flavor. Taste volatiles present a major challenge for flavor improvement and quality breeding. In this study, we performed genome-wide association studies (GWAS) to investigate potential chromosome regions associated with the tomato flavor volatiles. We observed significant variation (1200x) among the selected 28 most important volatiles in tomato based on their concentration and odor threshold importance across our sampled accessions. Using 174 tomato accessions, GWAS identified 125 significant associations (P < 0.005) among 182 SSR markers and 28 volatiles (27 volatiles with at least one significant association). Several significant associations were co-localized in previously identified quantitative trait loci (QTL). This result provides new potential candidate loci affecting the metabolism of several volatiles.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تؤثر مواد الطماطم المتطايرة، المشتقة بشكل أساسي من العناصر الغذائية الأساسية والسلائف المعززة للصحة، على نكهة الطماطم. يمثل طعم المواد المتطايرة تحديًا كبيرًا لتحسين النكهة وجودة التكاثر. في هذه الدراسة، أجرينا دراسات ارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) للتحقيق في مناطق الكروموسومات المحتملة المرتبطة بتطاير نكهة الطماطم. لاحظنا تباينًا كبيرًا (1200x) بين أهم 28 مادة متطايرة في الطماطم بناءً على تركيزها وأهمية عتبة الرائحة عبر مدخلاتنا التي تم أخذ عينات منها. باستخدام 174 من ملحقات الطماطم، حددت GWAS 125 ارتباطًا مهمًا (P < 0.005) من بين 182 علامة SSR و 28 مادة متطايرة (27 مادة متطايرة مع ارتباط كبير واحد على الأقل). تم تحديد موقع العديد من الارتباطات المهمة في مواقع السمات الكمية المحددة مسبقًا (QTL). توفر هذه النتيجة مواضع مرشحة محتملة جديدة تؤثر على استقلاب العديد من المواد المتطايرة.Translated Description (French)
Les volatiles de tomate, principalement dérivés de nutriments essentiels et de précurseurs bénéfiques pour la santé, affectent la saveur de la tomate. Les substances volatiles gustatives représentent un défi majeur pour l'amélioration de la saveur et la sélection de qualité. Dans cette étude, nous avons réalisé des études d'association à l'échelle du génome (GWAS) pour étudier les régions chromosomiques potentielles associées aux volatiles de saveur de tomate. Nous avons observé une variation significative (1200x) parmi les 28 volatiles les plus importants sélectionnés dans la tomate en fonction de leur concentration et de l'importance du seuil d'odeur dans nos accessions échantillonnées. À l'aide de 174 accessions de tomates, le GWAS a identifié 125 associations significatives (P < 0,005) parmi 182 marqueurs SSR et 28 volatiles (27 volatiles avec au moins une association significative). Plusieurs associations significatives ont été co-localisées dans des loci de caractères quantitatifs (QTL) précédemment identifiés. Ce résultat fournit de nouveaux loci candidats potentiels affectant le métabolisme de plusieurs volatiles.Translated Description (Spanish)
Los volátiles del tomate, derivados principalmente de nutrientes esenciales y precursores que promueven la salud, afectan el sabor del tomate. Los volátiles de sabor presentan un gran desafío para la mejora del sabor y la mejora de la calidad. En este estudio, realizamos estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) para investigar posibles regiones cromosómicas asociadas con los volátiles del sabor del tomate. Observamos una variación significativa (1200x) entre los 28 volátiles más importantes seleccionados en el tomate en función de su concentración y la importancia del umbral de olor en nuestras muestras. Utilizando 174 accesiones de tomate, GWAS identificó 125 asociaciones significativas (P < 0.005) entre 182 marcadores SSR y 28 volátiles (27 volátiles con al menos una asociación significativa). Varias asociaciones significativas se colocalizaron en loci de rasgos cuantitativos (QTL) previamente identificados. Este resultado proporciona nuevos loci candidatos potenciales que afectan el metabolismo de varios volátiles.Files
pdf.pdf
Files
(2.7 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:67112939e11f6f7ff92ffda6b689dfd9
|
2.7 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- رسم خرائط جمعية الجينوم على مستوى الطماطم المتطايرة التي تساهم بشكل إيجابي في نكهة الطماطم
- Translated title (French)
- Cartographie de l'association à l'échelle du génome pour les volatiles de tomate contribuant positivement à la saveur de la tomate
- Translated title (Spanish)
- Mapeo de asociación de todo el genoma para volátiles de tomate que contribuyen positivamente al sabor del tomate
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2191254860
- DOI
- 10.3389/fpls.2015.01042
References
- https://openalex.org/W1825612778
- https://openalex.org/W1970198682
- https://openalex.org/W1972759209
- https://openalex.org/W1975311288
- https://openalex.org/W1978633627
- https://openalex.org/W1982972154
- https://openalex.org/W1991189546
- https://openalex.org/W1991764377
- https://openalex.org/W1999908343
- https://openalex.org/W2010817678
- https://openalex.org/W2011076339
- https://openalex.org/W2032837557
- https://openalex.org/W2034501578
- https://openalex.org/W2043180423
- https://openalex.org/W2048475167
- https://openalex.org/W2052955098
- https://openalex.org/W2056236241
- https://openalex.org/W2059221781
- https://openalex.org/W2060153519
- https://openalex.org/W2062447470
- https://openalex.org/W2063619118
- https://openalex.org/W2067678855
- https://openalex.org/W2068830737
- https://openalex.org/W2069426323
- https://openalex.org/W2084616473
- https://openalex.org/W2086054578
- https://openalex.org/W2086372521
- https://openalex.org/W2091093885
- https://openalex.org/W2098126593
- https://openalex.org/W2100708386
- https://openalex.org/W2107356656
- https://openalex.org/W2110035718
- https://openalex.org/W2110065044
- https://openalex.org/W2113962376
- https://openalex.org/W2116272744
- https://openalex.org/W2118800489
- https://openalex.org/W2120048512
- https://openalex.org/W2125972459
- https://openalex.org/W2134036574
- https://openalex.org/W2146260091
- https://openalex.org/W2152029476
- https://openalex.org/W2152032275
- https://openalex.org/W2155390244
- https://openalex.org/W2161339576
- https://openalex.org/W2166360158
- https://openalex.org/W2167961554
- https://openalex.org/W2249219263
- https://openalex.org/W2320333540
- https://openalex.org/W2333112814
- https://openalex.org/W4249761286
- https://openalex.org/W4290994157