Published October 1, 2017 | Version v1
Publication Open

Global update on the susceptibility of human influenza viruses to neuraminidase inhibitors, 2015–2016

Creators

  • 1. Centers for Disease Control and Prevention
  • 2. World Health Organization
  • 3. The Francis Crick Institute
  • 4. National Institute for Viral Disease Control and Prevention
  • 5. Chinese Center For Disease Control and Prevention
  • 6. Peter Doherty Institute
  • 7. University of Melbourne
  • 8. Public Health England
  • 9. World Health Organization Regional Office for Europe
  • 10. University of Lisbon
  • 11. National Institute of Health Dr. Ricardo Jorge
  • 12. Fundação Oswaldo Cruz
  • 13. National Institute of Infectious Diseases
  • 14. National Institute for Public Health and the Environment

Description

Four World Health Organization (WHO) Collaborating Centres for Reference and Research on Influenza and one WHO Collaborating Centre for the Surveillance, Epidemiology and Control of Influenza (WHO CCs) assessed antiviral susceptibility of 14,330 influenza A and B viruses collected by WHO-recognized National Influenza Centres (NICs) between May 2015 and May 2016. Neuraminidase (NA) inhibition assay was used to determine 50% inhibitory concentration (IC50) data for NA inhibitors (NAIs) oseltamivir, zanamivir, peramivir and laninamivir. Furthermore, NA sequences from 13,484 influenza viruses were retrieved from public sequence databases and screened for amino acid substitutions (AAS) associated with reduced inhibition (RI) or highly reduced inhibition (HRI) by NAIs. Of the viruses tested by WHO CCs 93% were from three WHO regions: Western Pacific, the Americas and Europe. Approximately 0.8% (n = 113) exhibited either RI or HRI by at least one of four NAIs. As in previous seasons, the most common NA AAS was H275Y in A(H1N1)pdm09 viruses, which confers HRI by oseltamivir and peramivir. Two A(H1N1)pdm09 viruses carried a rare NA AAS, S247R, shown in this study to confer RI/HRI by the four NAIs. The overall frequency of A(H1N1)pdm09 viruses containing NA AAS associated with RI/HRI was approximately 1.8% (125/6915), which is slightly higher than in the previous 2014-15 season (0.5%). Three B/Victoria-lineage viruses contained a new AAS, NA H134N, which conferred HRI by zanamivir and laninamivir, and borderline HRI by peramivir. A single B/Victoria-lineage virus harboured NA G104E, which was associated with HRI by all four NAIs. The overall frequency of RI/HRI phenotype among type B viruses was approximately 0.6% (43/7677), which is lower than that in the previous season. Overall, the vast majority (>99%) of the viruses tested by WHO CCs were susceptible to all four NAIs, showing normal inhibition (NI). Hence, NAIs remain the recommended antivirals for treatment of influenza virus infections. Nevertheless, our data indicate that it is prudent to continue drug susceptibility monitoring using both NAI assay and sequence analysis.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

قامت أربعة مراكز متعاونة مع منظمة الصحة العالمية للمراجع والبحوث المتعلقة بالأنفلونزا ومركز متعاون مع منظمة الصحة العالمية لترصد الأنفلونزا وعلم الأوبئة ومكافحتها (WHO CCs) بتقييم الحساسية المضادة للفيروسات لـ 14,330 فيروسًا من فيروسات الأنفلونزا A و B التي جمعتها المراكز الوطنية للأنفلونزا المعترف بها من قبل منظمة الصحة العالمية (NICs) بين مايو 2015 ومايو 2016. تم استخدام مقايسة تثبيط النورامينيداز (NA) لتحديد بيانات تركيز مثبط 50 ٪ (IC50) لمثبطات NA (NAIs) أوسيلتاميفير، زاناميفير، بيراميفير ولانيناميفير. علاوة على ذلك، تم استرجاع تسلسلات الأنفلونزا من 13,484 فيروس إنفلونزا من قواعد بيانات التسلسل العامة وفحصها بحثًا عن بدائل الأحماض الأمينية (AAS) المرتبطة بالتثبيط المنخفض (RI) أو التثبيط المنخفض للغاية (HRI) من قبل NAIs. من بين الفيروسات التي اختبرتها منظمة الصحة العالمية، كانت 93 ٪ من ثلاث مناطق تابعة لمنظمة الصحة العالمية: غرب المحيط الهادئ والأمريكتين وأوروبا. أظهر ما يقرب من 0.8 ٪ (العدد = 113) إما RI أو HRI من قبل واحد على الأقل من أربعة NAIs. كما هو الحال في المواسم السابقة، كان H275Y الأكثر شيوعًا في فيروسات A(H1N1) pdm09، والتي تمنح HRI عن طريق الأوسيلتاميفير والبيراميفير. حمل فيروسان من النوع A(H1N1) pdm09 نادرًا من النوع NAAS، S247R، كما هو موضح في هذه الدراسة لمنح RI/HRI من قبل NAIs الأربعة. كان التكرار الإجمالي لفيروسات A(H1N1)pdm09 التي تحتوي على AAS المرتبط بـ RI/HRI حوالي 1.8 ٪ (125/6915)، وهو أعلى قليلاً مما كان عليه في موسم 2014-15 السابق (0.5 ٪). احتوت ثلاثة فيروسات من سلالة B/Victoria على AAS جديد، NA H134N، والذي منح HRI بواسطة zanamivir و laninamivir، و HRI الحدودي بواسطة peramivir. كان هناك فيروس واحد من سلالة ب/فيكتوريا يؤوي NA G104E، والذي كان مرتبطًا بمعلومات حقوق الإنسان من قبل جميع NAIs الأربعة. كان التكرار الإجمالي للنمط الظاهري للرجعية/الرجعية بين فيروسات النوع B حوالي 0.6 ٪ (43/7677)، وهو أقل مما كان عليه في الموسم السابق. بشكل عام، كانت الغالبية العظمى (>99 ٪) من الفيروسات التي اختبرتها منظمة الصحة العالمية عرضة لجميع الفيروسات غير المعدية الأربعة، مما يدل على تثبيط طبيعي (NI). وبالتالي، تظل الأدوية المضادة للفيروسات هي الأدوية المضادة للفيروسات الموصى بها لعلاج عدوى فيروس الأنفلونزا. ومع ذلك، تشير بياناتنا إلى أنه من الحكمة مواصلة مراقبة الحساسية للأدوية باستخدام كل من تحليل NAI وتحليل التسلسل.

Translated Description (French)

Quatre centres collaborateurs de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) pour la référence et la recherche sur la grippe et un centre COLLABORATEUR de l'OMS pour la surveillance, l'épidémiologie et le contrôle de la grippe (CC de l'OMS) ONT évalué la sensibilité aux antiviraux de 14 330 virus de la grippe A et B collectés par les centres nationaux de la grippe (CNI) reconnus par l'OMS entre mai 2015 et mai 2016. Le test d'inhibition de la neuraminidase (NA) a été utilisé pour déterminer les données de concentration inhibitrice (IC50) à 50 % pour les inhibiteurs de la NA (NAI) oseltamivir, zanamivir, péramivir et laninamivir. De plus, les séquences NA de 13 484 virus grippaux ont été extraites des bases de données de séquences publiques et criblées pour les substitutions d'acides aminés (AAS) associées à une inhibition réduite (RI) ou à une inhibition fortement réduite (HRI) par les NAI. Parmi les virus testés par les CC de l'OMS, 93 % provenaient de trois régions de l'OMS : le Pacifique occidental, les Amériques et l'Europe. Environ 0,8 % (n = 113) présentaient soit RI soit HRI par au moins l'un des quatre nai. Comme les saisons précédentes, le SAA NA le plus courant était H275Y dans les virus A(H1N1)pdm09, ce qui confère un HRI par l'oseltamivir et le peramivir. Deux virus A(H1N1)pdm09 portaient un NA AAS rare, S247R, montré dans cette étude pour conférer RI/HRI par les quatre NAI. La fréquence globale des virus A(H1N1)pdm09 contenant des NA AAS associés à RI/HRI était d'environ 1,8% (125/6915), ce qui est légèrement supérieur à la saison 2014-15 précédente (0,5%). Trois virus de la lignée B/Victoria contenaient un nouveau SAA, NA H134N, qui conférait un HRI au zanamivir et au laninamivir, et un HRI limite au peramivir. Un seul virus de la lignée B/Victoria abritait NA G104E, qui était associé à HRI par les quatre INA. La fréquence globale du phénotype RI/HRI chez les virus de type B était d'environ 0,6 % (43/7677), ce qui est inférieur à celui de la saison précédente. Dans l'ensemble, la grande majorité (>99 %) des virus testés par LES CC de l'OMS étaient sensibles aux quatre INA, montrant une inhibition normale (IN). Par conséquent, les INA restent les antiviraux recommandés pour le traitement des infections par le virus de la grippe. Néanmoins, nos données indiquent qu'il est prudent de poursuivre la surveillance de la sensibilité aux médicaments en utilisant à la fois le test NAI et l'analyse de séquence.

Translated Description (Spanish)

Cuatro Centros Colaboradores de la Organización Mundial de la Salud (OMS) para la Referencia y la Investigación sobre la Gripe y un Centro Colaborador de la OMS para la Vigilancia, Epidemiología y Control de la Gripe (CC de la OMS) evaluaron la susceptibilidad antiviral de 14.330 virus de la gripe A y B recogidos por los Centros Nacionales de Gripe (NIC) reconocidos por la OMS entre mayo de 2015 y mayo de 2016. Se utilizó el ensayo de inhibición de la neuraminidasa (NA) para determinar los datos de concentración inhibitoria (IC50) del 50% para los inhibidores de NA (Nai) oseltamivir, zanamivir, peramivir y laninamivir. Además, las secuencias de NA de 13,484 virus de la influenza se recuperaron de bases de datos de secuencias públicas y se analizaron para detectar sustituciones de aminoácidos (AAS) asociadas con inhibición reducida (RI) o inhibición altamente reducida (HRI) por Nai. De los virus analizados por LOS CC de la OMS, el 93% procedían de tres regiones de la OMS: Pacífico occidental, América y Europa. Aproximadamente el 0.8% (n = 113) exhibió RI o HRI por al menos uno de los cuatro Nai. Al igual que en temporadas anteriores, el NA AAS más común fue H275Y en los virus A(H1N1)pdm09, que confiere HRI por oseltamivir y peramivir. Dos virus A(H1N1)pdm09 portaron un NA AAS raro, S247R, que se muestra en este estudio para conferir RI/HRI por los cuatro Nai. La frecuencia general de los virus A(H1N1)pdm09 que contienen NA AAS asociados con RI/HRI fue de aproximadamente 1.8% (125/6915), que es ligeramente más alta que en la temporada anterior 2014-15 (0.5%). Tres virus de linaje B/Victoria contenían un nuevo AAS, NA H134N, que confería HRI por zanamivir y laninamivir, y HRI límite por peramivir. Un solo virus de linaje B/Victoria albergó NA G104E, que fue asociado con HRI por los cuatro Nai. La frecuencia general del fenotipo RI/HRI entre los virus de tipo B fue de aproximadamente el 0,6% (43/7677), que es inferior a la de la temporada anterior. En general, la gran mayoría (>99%) de los virus analizados por LOS CC de la OMS fueron susceptibles a los cuatro Nai, mostrando una inhibición normal (NI). Por lo tanto, los Nai siguen siendo los antivirales recomendados para el tratamiento de las infecciones por el virus de la gripe. Sin embargo, nuestros datos indican que es prudente continuar con el monitoreo de la susceptibilidad al fármaco utilizando tanto el ensayo NAI como el análisis de secuencia.

Files

Global%20update%20on%20the%20susceptibility%20of%20human%20influenza%20viruses%20to%20neuraminidase%20inhibitors.pdf.pdf

Files (2.8 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:1629ceced79e7f036561c79c696e810c
2.8 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحديث عالمي حول قابلية فيروسات الأنفلونزا البشرية لمثبطات النورامينيداز، 2015–2016
Translated title (French)
Mise à jour mondiale sur la sensibilité des virus grippaux humains aux inhibiteurs de la neuraminidase, 2015–2016
Translated title (Spanish)
Actualización mundial sobre la susceptibilidad de los virus de la gripe humana a los inhibidores de la neuraminidasa, 2015–2016

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4244378661
DOI
10.1016/j.antiviral.2017.08.004

Is supplement to
https://openalex.org/W4302084829 (Other)
https://openalex.org/W3217119701 (Other)
https://openalex.org/W2669833209 (Other)
https://openalex.org/W2474810061 (Other)
https://openalex.org/W2159382969 (Other)
https://openalex.org/W2132657130 (Other)
https://openalex.org/W2035366758 (Other)
https://openalex.org/W1981898921 (Other)
https://openalex.org/W1971864726 (Other)
https://openalex.org/W1966462939 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W11405168
  • https://openalex.org/W1483512866
  • https://openalex.org/W1965495462
  • https://openalex.org/W1968256827
  • https://openalex.org/W1973503801
  • https://openalex.org/W1976220879
  • https://openalex.org/W1993048391
  • https://openalex.org/W2009951464
  • https://openalex.org/W2012263014
  • https://openalex.org/W2014376786
  • https://openalex.org/W2041753380
  • https://openalex.org/W2051354290
  • https://openalex.org/W2060820177
  • https://openalex.org/W2083174602
  • https://openalex.org/W2094993886
  • https://openalex.org/W2103212730
  • https://openalex.org/W2105246478
  • https://openalex.org/W2108458787
  • https://openalex.org/W2110877864
  • https://openalex.org/W2118218630
  • https://openalex.org/W2119932988
  • https://openalex.org/W2128060816
  • https://openalex.org/W2146917216
  • https://openalex.org/W2152283024
  • https://openalex.org/W2153207056
  • https://openalex.org/W2409649694
  • https://openalex.org/W2431716336
  • https://openalex.org/W2467860584
  • https://openalex.org/W2510409270
  • https://openalex.org/W2593080252
  • https://openalex.org/W2604955951
  • https://openalex.org/W4206096935
  • https://openalex.org/W4212864481
  • https://openalex.org/W4240157333
  • https://openalex.org/W4302444898