Published November 21, 2018 | Version v1
Publication Open

Demographic and seasonal characteristics of respiratory pathogens in neonates and infants aged 0 to 12 months in the Central‐East region of Tunisia

Creators

  • 1. University of Sousse
  • 2. Hôpital Farhat Hached
  • 3. University of Monastir
  • 4. Innsbruck Medical University

Description

Background This study aimed to characterize the epidemiology of pathogenic respiratory agents in patients aged 0 to 12 months and hospitalized for acute respiratory infections in Tunisia between 2013 and 2014. Methods A total of 20 pathogens, including viruses, Mycoplasma pneumoniae , and Streptococcus pneumoniae , were detected using molecular sensitive assays, and their associations with the patient's demographic data and season were analyzed. Results Viral infectious agents were found in 449 (87.2%) of 515 specimens. Dual and multiple infectious agents were detected in 31.4% and 18.6% of the samples, respectively. Viral infection was predominant in the pediatric environment (90.8%, P < 0.001), male patients (88.0%), and spring (93.8%). Rhinovirus was the most detected virus (51.8%) followed by respiratory syncytial virus A/B (34.4%), coronavirus group (18.5%), adenovirus (17.9%), and parainfluenza viruses 1‐4 (10.9%). Respiratory Syncytial virus A/B was significantly associated with gender (38.0% male cases vs 28.3% female cases, P = 0.02). Infections by Adenovirus , Bocavirus , and Metapneumovirus A/B increased with increasing age of patients (predominated cases aged 6‐12 months, P < 0.001). S. pneumoniae was detected in 30.9% of th tested samples. In 18.2% of the negative viral infections, only S. pneumoniae was identified. Conclusion A predominance of the rhinovirus infection was observed in this study. Coronavirus subtypes were described for the first time in Tunisia. The observed different pathogenic profiles across age groups could be helpful to avoid the misclassification of patients presenting with ARIs at the triage level when no standardized protocol is available. This study will provide clues for physicians informing decisions regarding preventive strategies and medication in Tunisia.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية تهدف هذه الدراسة إلى توصيف وبائيات العوامل التنفسية المسببة للأمراض لدى المرضى الذين تتراوح أعمارهم بين 0 و 12 شهرًا والذين تم نقلهم إلى المستشفى لعلاج التهابات الجهاز التنفسي الحادة في تونس بين عامي 2013 و 2014. تم اكتشاف ما مجموعه 20 من مسببات الأمراض، بما في ذلك الفيروسات والميكوبلازما الرئوية والعقدية الرئوية ، باستخدام المقايسات الحساسة الجزيئية، وتم تحليل ارتباطها بالبيانات الديموغرافية للمريض وموسمه. النتائج تم العثور على العوامل المعدية الفيروسية في 449 (87.2 ٪) من 515 عينة. تم اكتشاف عوامل معدية مزدوجة ومتعددة في 31.4 ٪ و 18.6 ٪ من العينات، على التوالي. كانت العدوى الفيروسية سائدة في بيئة طب الأطفال (90.8 ٪، P < 0.001)، والمرضى الذكور (88.0 ٪)، والربيع (93.8 ٪). كان الفيروس الأنفي هو الفيروس الأكثر اكتشافًا (51.8 ٪) يليه الفيروس المخلوي التنفسي A/B (34.4 ٪)، ومجموعة الفيروسات التاجية (18.5 ٪)، والفيروس الغدي (17.9 ٪)، وفيروسات الأنفلونزا 1-4 (10.9 ٪). ارتبط الفيروس المخلوي التنفسي A/B بشكل كبير بالجنس (38.0 ٪ من حالات الذكور مقابل 28.3 ٪ من حالات الإناث، P = 0.02). زادت الإصابات بالفيروسات الغدية والفيروسات البوكافية والفيروسات الرئوية A/B مع زيادة عمر المرضى (الحالات السائدة التي تتراوح أعمارهم بين 6 و 12 شهرًا، P < 0.001). تم الكشف عن الالتهاب الرئوي في 30.9 ٪ من العينات المختبرة. في 18.2 ٪ من الالتهابات الفيروسية السلبية، تم تحديد الالتهاب الرئوي فقط. الخلاصة لوحظت غلبة عدوى الفيروس الأنفي في هذه الدراسة. تم وصف الأنواع الفرعية لفيروس كورونا لأول مرة في تونس. يمكن أن تكون الملفات الشخصية المسببة للأمراض المختلفة الملحوظة عبر الفئات العمرية مفيدة لتجنب سوء تصنيف المرضى الذين يعانون من التهابات الجهاز التنفسي الحادة على مستوى الفرز عندما لا يتوفر بروتوكول موحد. ستوفر هذه الدراسة أدلة للأطباء لإبلاغ القرارات المتعلقة بالاستراتيجيات الوقائية والأدوية في تونس.

Translated Description (French)

Contexte Cette étude visait à caractériser l'épidémiologie des agents respiratoires pathogènes chez des patients âgés de 0 à 12 mois et hospitalisés pour des infections respiratoires aiguës en Tunisie entre 2013 et 2014. Méthodes Un total de 20 agents pathogènes, y compris les virus, Mycoplasma pneumoniae et Streptococcus pneumoniae , ont été détectés à l'aide de tests moléculaires sensibles, et leurs associations avec les données démographiques et la saison du patient ont été analysées. Résultats Des agents infectieux viraux ont été trouvés dans 449 (87,2 %) des 515 échantillons. Des agents infectieux doubles et multiples ont été détectés dans 31,4 % et 18,6 % des échantillons, respectivement. L'infection virale était prédominante dans l'environnement pédiatrique (90,8 %, P < 0,001), chez les patients de sexe masculin (88,0 %) et au printemps (93,8 %). Le rhinovirus était le virus le plus détecté (51,8 %), suivi du virus respiratoire syncytial A/B (34,4 %), du groupe des coronavirus (18,5 %), de l'adénovirus (17,9 %) et des virus parainfluenza 1à4 (10,9 %). Le virus respiratoire syncytial A/B était significativement associé au sexe (38,0 % de cas masculins contre 28,3 % de cas féminins, P = 0,02). Les infections par les adénovirus , les bocavirus et les métapneumovirus A/B augmentaient avec l'âge des patients (cas prédominants âgés de 6 à 12 mois, P < 0,001). S. pneumoniae a été détecté dans 30,9 % des échantillons testés. Dans 18,2 % des infections virales négatives, seul S. pneumoniae a été identifié. Conclusion Une prédominance de l'infection rhinovirale a été observée dans cette étude. Des sous-types de coronavirus ont été décrits pour la première fois en Tunisie. Les différents profils pathogènes observés selon les groupes d'âge pourraient être utiles pour éviter la classification erronée des patients présentant des ira au niveau du triage lorsqu'aucun protocole standardisé n'est disponible. Cette étude fournira des indices aux médecins pour éclairer les décisions concernant les stratégies préventives et les médicaments en Tunisie.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes Este estudio tuvo como objetivo caracterizar la epidemiología de los agentes respiratorios patógenos en pacientes de 0 a 12 meses y hospitalizados por infecciones respiratorias agudas en Túnez entre 2013 y 2014. Métodos Se detectaron un total de 20 patógenos, incluidos virus, Mycoplasma pneumoniae y Streptococcus pneumoniae , utilizando ensayos de sensibilidad molecular, y se analizaron sus asociaciones con los datos demográficos y la temporada del paciente. Resultados Se encontraron agentes infecciosos virales en 449 (87,2%) de 515 muestras. Se detectaron agentes infecciosos duales y múltiples en el 31,4% y el 18,6% de las muestras, respectivamente. La infección viral fue predominante en el entorno pediátrico (90.8%, P < 0.001), pacientes masculinos (88.0%) y Spring (93.8%). El rinovirus fue el virus más detectado (51.8%) seguido por el virus respiratorio sincitial A/B (34.4%), el grupo de coronavirus (18.5%), el adenovirus (17.9%) y los virus parainfluenza 1-4 (10.9%). El virus respiratorio sincitial A/B se asoció significativamente con el género (38,0% de casos masculinos frente a 28,3% de casos femeninos, P = 0,02). Las infecciones por Adenovirus , Bocavirus y Metapneumovirus A/B aumentaron con el aumento de la edad de los pacientes (casos predominantes de 6 a 12 meses, P < 0.001). Se detectó S. pneumoniae en el 30,9% de las muestras analizadas. En el 18,2% de las infecciones virales negativas, solo se identificó S. pneumoniae. Conclusión En este estudio se observó un predominio de la infección por rinovirus. Los subtipos de coronavirus se describieron por primera vez en Túnez. Los diferentes perfiles patógenos observados en todos los grupos de edad podrían ser útiles para evitar la clasificación errónea de los pacientes que presentan ira a nivel de triaje cuando no se dispone de un protocolo estandarizado. Este estudio proporcionará pistas para que los médicos informen las decisiones sobre estrategias preventivas y medicamentos en Túnez.

Files

jmv.25347.pdf

Files (16.0 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:dc5494a626ffa02feaeeb6af24b88914
16.0 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الخصائص الديموغرافية والموسمية لمسببات الأمراض التنفسية لدى حديثي الولادة والرضع الذين تتراوح أعمارهم بين 0 و 12 شهرًا في المنطقة الوسطى الشرقية من تونس
Translated title (French)
Caractéristiques démographiques et saisonnières des pathogènes respiratoires chez les nouveau-nés et les nourrissons âgés de 0 à 12 mois dans la région Centre-Est de la Tunisie
Translated title (Spanish)
Características demográficas y estacionales de los patógenos respiratorios en neonatos y lactantes de 0 a 12 meses en la región centrooriental de Túnez

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2897494859
DOI
10.1002/jmv.25347

Is supplement to
https://openalex.org/W2788277189 (Other)
https://openalex.org/W2748952813 (Other)
https://openalex.org/W2151865869 (Other)
https://openalex.org/W2130076355 (Other)
https://openalex.org/W2119695867 (Other)
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2046158694 (Other)
https://openalex.org/W2013243191 (Other)
https://openalex.org/W1993764875 (Other)
https://openalex.org/W1990804418 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Tunisia

References

  • https://openalex.org/W1571666714
  • https://openalex.org/W1967605949
  • https://openalex.org/W1983836038
  • https://openalex.org/W1987723359
  • https://openalex.org/W2013115579
  • https://openalex.org/W2014819850
  • https://openalex.org/W2032584210
  • https://openalex.org/W2062136579
  • https://openalex.org/W2068761525
  • https://openalex.org/W2069601834
  • https://openalex.org/W2076354126
  • https://openalex.org/W2076621303
  • https://openalex.org/W2078268352
  • https://openalex.org/W2087082338
  • https://openalex.org/W2101761016
  • https://openalex.org/W2106275929
  • https://openalex.org/W2106395530
  • https://openalex.org/W2112291086
  • https://openalex.org/W2119632771
  • https://openalex.org/W2120399147
  • https://openalex.org/W2132040950
  • https://openalex.org/W2137407508
  • https://openalex.org/W2143101725
  • https://openalex.org/W2147318483
  • https://openalex.org/W2172042525
  • https://openalex.org/W2233505322
  • https://openalex.org/W2338040574
  • https://openalex.org/W2345914371
  • https://openalex.org/W2518459353
  • https://openalex.org/W2549279051
  • https://openalex.org/W2558063108
  • https://openalex.org/W2575831462
  • https://openalex.org/W2602607363
  • https://openalex.org/W2751014002
  • https://openalex.org/W2766824717