Published January 1, 2022 | Version v1
Publication Metadata-only

Additional file 3 of Single-cell transcriptomic and chromatin accessibility analyses of dairy cattle peripheral blood mononuclear cells and their responses to lipopolysaccharide

Creators

  • 1. University of Maryland, College Park
  • 2. China Agricultural University
  • 3. Jiangnan University
  • 4. Guangxi University for Nationalities
  • 5. Shandong Academy of Agricultural Sciences
  • 6. Beltsville Agricultural Research Center
  • 7. Agricultural Research Service - Northeast Area
  • 8. Jiangxi Agricultural University
  • 9. Peking University
  • 10. Peking University Cancer Hospital
  • 11. Shandong Provincial QianFoShan Hospital
  • 12. Research Institute of Tropical Forestry
  • 13. University of Chinese Academy of Sciences
  • 14. Xishuangbanna Tropical Botanical Garden
  • 15. Fudan University
  • 16. University of Edinburgh
  • 17. United States Department of Agriculture

Description

Additional file 3: Table S10. Differentially expressed genes with each cell cluster between CO and T1 identified by edgeR. Table S11. Differentially expressed genes with each cell cluster between CO and T2 identified by edgeR. Table S12. Differentially expressed genes with each cell cluster between CO and T3 identified by edgeR. Table S13. Differentially expressed genes with each cell cluster between T1 and T2 identified by edgeR. Table S14. Differentially expressed genes with each cell cluster between T1 and T3 identified by edgeR. Table S15. Differentially expressed genes with each cell cluster between T2 and T3 identified by edgeR. Table S16. Human and cattle PBMC cell type annotation under three resolutions using Azimuth.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ملف إضافي 3: الجدول S10. تم تحديد الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي مع كل مجموعة خلايا بين أول أكسيد الكربون و T1 بواسطة EDGER. الجدول S11. الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي مع كل مجموعة خلايا بين CO و T2 المحددة بواسطة EDGER. الجدول S12. الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي مع كل مجموعة خلايا بين CO و T3 المحددة بواسطة EDGER. الجدول S13. الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي مع كل مجموعة خلايا بين T1 و T2 المحددة بواسطة EDGER. الجدول S14. الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي مع كل مجموعة خلايا بين T1 و T3 المحددة بواسطة edgeR. الجدول S15. الجينات المعبر عنها بشكل تفاضلي مع كل مجموعة خلايا بين T2 و T3 المحددة بواسطة edgeR. الجدول S16. شرح نوع خلية PBMC البشرية والماشية بموجب ثلاثة قرارات باستخدام السمت.

Translated Description (French)

Dossier complémentaire 3 : Tableau S10. Gènes exprimés de manière différentielle avec chaque groupe de cellules entre CO et T1 identifiés par edgeR. Tableau S11. Gènes exprimés différemment avec chaque cluster cellulaire entre CO et T2 identifiés par edgeR. Tableau S12. Gènes exprimés différemment avec chaque cluster cellulaire entre CO et T3 identifiés par edgeR. Tableau S13. Gènes exprimés différemment avec chaque cluster cellulaire entre T1 et T2 identifié par edgeR. Table S14. Differential expressed genes with each cell cluster between T1 and T3 identified by edgeR. Table S15. Differential expressed genes with each cell cluster between T2 and T3 identified by edgeR. Tableau S16. Annotation du type de cellule PBMC humain et bovin sous trois résolutions utilisant Azimut.

Translated Description (Spanish)

Expediente adicional 3: Tabla S10. Genes expresados diferencialmente con cada grupo de células entre CO y T1 identificados por edgeR. Tabla S11. Genes expresados diferencialmente con cada grupo de células entre CO y T2 identificados por edgeR. Tabla S12. Genes expresados diferencialmente con cada grupo de células entre CO y T3 identificados por edgeR. Tabla S13. Genes expresados diferencialmente con cada grupo de células entre T1 y T2 identificados por edgeR. Tabla S14. Genes expresados diferencialmente con cada grupo de células entre T1 y T3 identificados por edgeR. Tabla S15. Genes expresados diferencialmente con cada grupo de células entre T2 y T3 identificados por edgeR. Tabla S16. Anotación del tipo de célula PBMC humana y bovina bajo tres resoluciones utilizando Azimut.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
ملف إضافي 3 من تحليلات إمكانية الوصول النصية أحادية الخلية والكروماتين للخلايا أحادية النواة في الدم المحيطي للأبقار الحلوب واستجاباتها لعديد السكاريد الدهني
Translated title (French)
Dossier supplémentaire 3 des analyses de transcriptomique unicellulaire et d'accessibilité à la chromatine des cellules mononucléées du sang périphérique des bovins laitiers et de leurs réponses aux lipopolysaccharides
Translated title (Spanish)
Archivo adicional 3 de Análisis de accesibilidad transcriptómica y de cromatina unicelular de células mononucleares de sangre periférica de ganado lechero y sus respuestas a lipopolisacáridos

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4394137192
DOI
10.6084/m9.figshare.19695939

Is supplement to
https://openalex.org/W4388386498 (Other)
https://openalex.org/W4286930115 (Other)
https://openalex.org/W4224115270 (Other)
https://openalex.org/W3004891660 (Other)
https://openalex.org/W2969540308 (Other)
https://openalex.org/W2399513595 (Other)
https://openalex.org/W2318823989 (Other)
https://openalex.org/W2087562989 (Other)
https://openalex.org/W2073641733 (Other)
https://openalex.org/W2036495427 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China