Species Diversity of Trichoderma Associated With Soil In The Zoige Alpine Wetland of Southwest China
Creators
- 1. Sichuan Agricultural University
- 2. Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences
Description
Abstract Background: The Zoige alpine wetland is one of the most important wetlands in China because of its complex natural environment, abundant ecological resources, and unique climatic conditions. The ecology of soil fungi is poorly understood, and recent comprehensive reports on Trichoderma are not available for any region, including the Zoige alpine wetland ecological region in China. Our results may be used as a reference for a greater understanding of soil microorganism at various ecological regions, ecological rehabilitation and reconstruction and as microbial resources. Results: One hundred soil samples were collected from different soil types and soil layers in Zoige alpine wetland ecological regions in 2013. Using the traditional suspension plating method, a total of 80 Trichoderma strains were isolated. After a preliminary classification of morphological characteristics and the genes glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase ( gpd ), 57 strains were representatively selected and eventually identified as seven species via phylogenetic analyses of multilocus sequences based on the genes transcription elongation factor 1 alpha ( tef1 ), encoding RNA polymerase II subunit B ( rpb2 ) and ATP citrate lyase ( acl1 ). Among them, Trichoderma harzianum was the dominant species and had the highest isolation frequency (23%) in this zone, while Trichoderma polysporum and Trichoderma pyramidale were rare species, with isolation frequencies of less than 1%. Conclusions: Our detailed morphological observation and molecular phylogenetic analyses support the recognition of Trichoderma zoigense was described for the first time as a new species.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
خلفية مجردة: تعد الأراضي الرطبة في جبال الألب في زويج واحدة من أهم الأراضي الرطبة في الصين بسبب بيئتها الطبيعية المعقدة ومواردها البيئية الوفيرة وظروفها المناخية الفريدة. بيئة فطريات التربة غير مفهومة جيدًا، والتقارير الشاملة الأخيرة عن التريكوديرما غير متاحة لأي منطقة، بما في ذلك منطقة زويجي للأراضي الرطبة في جبال الألب في الصين. يمكن استخدام نتائجنا كمرجع لفهم أكبر للكائنات الحية الدقيقة في التربة في مختلف المناطق البيئية، وإعادة التأهيل البيئي وإعادة الإعمار وكموارد ميكروبية. النتائج: تم جمع مائة عينة من التربة من أنواع مختلفة من التربة وطبقات التربة في المناطق الإيكولوجية للأراضي الرطبة في جبال الألب في عام 2013. باستخدام طريقة الطلاء المعلق التقليدية، تم عزل ما مجموعه 80 سلالة من سلالات الجلد المشعرة. بعد التصنيف الأولي للخصائص المورفولوجية وجينات جليسيرالديهايد-3 -فوسفات نازعة الهيدروجين ( gpd )، تم اختيار 57 سلالة بشكل تمثيلي وتم تحديدها في النهاية على أنها سبعة أنواع من خلال التحليلات الوراثية للتسلسلات متعددة البؤر بناءً على عامل استطالة نسخ الجينات 1 ألفا (tef1)، وترميز وحدة بوليميراز الحمض النووي الريبي 2 الفرعية B (rpb2) و ATP سيترات الليز ( acl1 ). من بينها، كان Trichoderma harzianum هو النوع السائد وكان له أعلى تردد عزل (23 ٪) في هذه المنطقة، في حين أن Trichoderma polysporum و Trichoderma pyramidale كانا نوعين نادرين، مع ترددات عزل أقل من 1 ٪. الاستنتاجات: تدعم ملاحظتنا المورفولوجية التفصيلية وتحليلات تطور السلالات الجزيئية الاعتراف بالشعرة الحيوانية لأول مرة كنوع جديد.Translated Description (French)
Résumé Contexte : La zone humide alpine de Zoige est l'une des zones humides les plus importantes de Chine en raison de son environnement naturel complexe, de ses ressources écologiques abondantes et de ses conditions climatiques uniques. L'écologie des champignons du sol est mal comprise, et des rapports complets récents sur Trichoderma ne sont disponibles pour aucune région, y compris la région écologique des zones humides alpines de Zoige en Chine. Nos résultats peuvent être utilisés comme référence pour une meilleure compréhension des micro-organismes du sol dans diverses régions écologiques, de la réhabilitation et de la reconstruction écologiques et comme ressources microbiennes. Résultats : Une centaine d'échantillons de sol ont été prélevés sur différents types de sol et couches de sol dans les régions écologiques des zones humides alpines de Zoige en 2013. En utilisant la méthode traditionnelle de placage en suspension, un total de 80 souches de Trichoderma ont été isolées. Après une classification préliminaire des caractéristiques morphologiques et des gènes glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase ( gpd ), 57 souches ont été sélectionnées de manière représentative et finalement identifiées comme sept espèces par des analyses phylogénétiques de séquences multilocales basées sur le facteur d'élongation de transcription des gènes 1 alpha ( tef1 ), codant pour la sous-unité B de l'ARN polymérase II ( rpb2 ) et l'ATP citrate lyase ( acl1 ). Parmi eux, Trichoderma harzianum était l'espèce dominante et avait la fréquence d'isolement la plus élevée (23%) dans cette zone, tandis que Trichoderma polysporum et Trichoderma pyramidale étaient des espèces rares, avec des fréquences d'isolement inférieures à 1%. Conclusions : Notre observation morphologique détaillée et nos analyses phylogénétiques moléculaires soutiennent la reconnaissance de Trichoderma zoigense a été décrite pour la première fois comme une nouvelle espèce.Translated Description (Spanish)
Resumen Antecedentes: El humedal alpino de Zoige es uno de los humedales más importantes de China debido a su complejo entorno natural, abundantes recursos ecológicos y condiciones climáticas únicas. La ecología de los hongos del suelo es poco conocida, y los informes exhaustivos recientes sobre Trichoderma no están disponibles para ninguna región, incluida la región ecológica del humedal alpino de Zoige en China. Nuestros resultados pueden utilizarse como referencia para una mayor comprensión de los microorganismos del suelo en diversas regiones ecológicas, la rehabilitación y reconstrucción ecológica y como recursos microbianos. Resultados: Se recolectaron cien muestras de suelo de diferentes tipos de suelo y capas de suelo en regiones ecológicas de humedales alpinos de Zoige en 2013. Usando el método tradicional de siembra en placas en suspensión, se aislaron un total de 80 cepas de Trichoderma. Después de una clasificación preliminar de las características morfológicas y los genes gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa ( gpd ), se seleccionaron representativamente 57 cepas y finalmente se identificaron como siete especies mediante análisis filogenéticos de secuencias multilocus basados en los genes del factor de elongación de la transcripción 1 alfa ( tef1 ), que codifica la subunidad B de la ARN polimerasa II ( rpb2 ) y la ATP citrato liasa ( acl1 ). Entre ellas, Trichoderma harzianum fue la especie dominante y tuvo la mayor frecuencia de aislamiento (23%) en esta zona, mientras que Trichoderma polysporum y Trichoderma pyramidale fueron especies raras, con frecuencias de aislamiento inferiores al 1%. Conclusiones: Nuestros análisis morfológicos y filogenéticos moleculares detallados respaldan el reconocimiento de que Trichoderma zoigense se describió por primera vez como una nueva especie.Files
latest.pdf.pdf
Files
(2.9 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:ff2748895c984ce641d03b2fe95be936
|
2.9 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تنوع أنواع المشعرات الجلدية المرتبطة بالتربة في الأراضي الرطبة في جبال الألب في جنوب غرب الصين
- Translated title (French)
- Diversité des espèces de Trichoderma associées au sol dans la zone humide alpine de Zoige, dans le sud-ouest de la Chine
- Translated title (Spanish)
- Diversidad de especies de tricoderma asociada con el suelo en el humedal alpino de Zoige, en el suroeste de China
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3199954275
- DOI
- 10.21203/rs.3.rs-882568/v1