Published May 24, 2023 | Version v1
Publication Open

West African Dwarf goat populations of tropical rainforest zone: application of multivariate analysis tools on their characterization using morpho-biometric traits

Creators

  • 1. Federal University of Technology Owerri

Description

This research was carried out to characterize the West African Dwarf (WAD) goats using multivariate approach based on their morpho-biometric traits in the tropical rainforest zone of Nigeria. Data on four physical qualitative traits, six morphology indicators, and nine morphological characters were generated from 279 goats. Descriptive statistics, non-parametric analysis and one-way approach of ANOVA with post hoc tests, discriminant analysis (canonical), principal component analysis (categorical), and regression tree analysis were employed to discern the effects of location and sex on the parameters, as well as characterize the goats. The frequencies of the qualitative traits show black coat color predominated (60.2%) over other coat colors, plain color predominated (75.3%) over other color patterns, straight horns (38.1%) predominate over other horn shape, and beard presence (66.7%) predominated over non-beard presence among the goats in terms of locations and sexes. Location and age were significantly affected on the biometric characters (p<0.05 and p<0.001) with goats from Enugu having higher values than other states, while only head length (HL) was affected significantly by sex (p< 0.05). The morphological indicators were not significantly affected by location and sex (p>0.05 and p>0.001), while age was significant. The discriminant analysis revealed a sparse, non-intermingling populations for the physical traits, biometric characters, and body indices implying they are different distinct populations from each other. Generally, the goat populations could be characterized using heart girth (HG), rump height (RH), and body weight (BW) due to the principal components, while the CHAID and Exhaustive CHAID algorithm analysis revealed BW and HL as the genetic classifiers of the WAD goats, both in terms of locations. Basically, the goats from the 3 locations appeared to be more homogeneous in nature, implying that a deployment of specific complimentary genomics work targeted at future selection and breeding programs to improve their productivity in the tropical rainforest of Nigeria is necessary.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تم إجراء هذا البحث لتوصيف الماعز القزم في غرب إفريقيا (WAD) باستخدام نهج متعدد المتغيرات بناءً على سماتها البيومترية الشكلية في منطقة الغابات الاستوائية المطيرة في نيجيريا. تم الحصول على بيانات عن أربع سمات نوعية جسدية، وستة مؤشرات مورفولوجية، وتسعة شخصيات مورفولوجية من 279 من الماعز. تم استخدام الإحصائيات الوصفية والتحليل غير البارامترية والنهج أحادي الاتجاه لـ ANOVA مع الاختبارات اللاحقة والتحليل التمييزي (الكنسي) وتحليل المكون الرئيسي (الفئوي) وتحليل شجرة الانحدار لتمييز تأثيرات الموقع والجنس على المعلمات، بالإضافة إلى توصيف الماعز. تظهر ترددات السمات النوعية أن لون المعطف الأسود سائد (60.2 ٪) على ألوان المعطف الأخرى، واللون العادي سائد (75.3 ٪) على أنماط الألوان الأخرى، والقرون المستقيمة (38.1 ٪) سائدة على شكل قرن آخر، ووجود اللحية (66.7 ٪) سائد على الوجود غير الملتحي بين الماعز من حيث المواقع والجنسين. تأثر الموقع والعمر بشكل كبير على الأحرف البيومترية (p<0.05 و p<0.001) مع الماعز من إينوغو التي لها قيم أعلى من الدول الأخرى، في حين تأثر طول الرأس فقط (HL) بشكل كبير بالجنس (p< 0.05). لم تتأثر المؤشرات المورفولوجية بشكل كبير بالموقع والجنس (p>0.05 و p>0.001)، في حين كان العمر كبيرًا. كشف التحليل التمييزي عن مجموعات سكانية متفرقة وغير متداخلة للسمات الجسدية والشخصيات البيومترية ومؤشرات الجسم مما يعني أنها مجموعات سكانية مختلفة عن بعضها البعض. بشكل عام، يمكن وصف مجموعات الماعز باستخدام محيط القلب وارتفاع الردف ووزن الجسم بسبب المكونات الرئيسية، في حين كشف تحليل خوارزمية CHAID و CHAID الشامل عن BW و HL كمصنفات وراثية للماعز، سواء من حيث المواقع. في الأساس، بدا أن الماعز من المواقع الثلاثة أكثر تجانسًا في الطبيعة، مما يعني أن نشر علم الجينوم التكميلي المحدد الذي يستهدف برامج الانتقاء والتربية المستقبلية لتحسين إنتاجيتها في الغابات الاستوائية المطيرة في نيجيريا أمر ضروري.

Translated Description (French)

Cette recherche a été réalisée pour caractériser les chèvres naines d'Afrique de l'Ouest (WAD) en utilisant une approche multivariée basée sur leurs traits morpho-biométriques dans la zone de forêt tropicale humide du Nigeria. Des données sur quatre traits qualitatifs physiques, six indicateurs morphologiques et neuf caractères morphologiques ont été générés à partir de 279 chèvres. Des statistiques descriptives, une analyse non paramétrique et une approche unidirectionnelle de l'ANOVA avec des tests post hoc, une analyse discriminante (canonique), une analyse en composantes principales (catégorique) et une analyse de l'arbre de régression ont été utilisées pour discerner les effets de la localisation et du sexe sur les paramètres, ainsi que pour caractériser les chèvres. Les fréquences des traits qualitatifs montrent que la couleur du pelage noir prédomine (60,2 %) sur les autres couleurs de pelage, que la couleur unie prédomine (75,3 %) sur les autres motifs de couleur, que les cornes droites (38,1 %) prédominent sur les autres formes de corne et que la présence de barbe (66,7 %) prédomine sur la présence de non-barbe chez les chèvres en termes d'emplacements et de sexes. L'emplacement et l'âge étaient significativement affectés sur les caractères biométriques (p<0,05 et p<0,001) avec des chèvres d'Enugu ayant des valeurs plus élevées que les autres états, alors que seule la longueur de la tête (HL) était significativement affectée par le sexe (p< 0,05). Les indicateurs morphologiques n'étaient pas significativement affectés par le lieu et le sexe (p>0,05 et p>0,001), tandis que l'âge était significatif. L'analyse discriminante a révélé des populations éparses et non imbriquées pour les traits physiques, les caractères biométriques et les indices corporels, ce qui implique qu'il s'agit de populations distinctes différentes les unes des autres. En général, les populations de chèvres ont pu être caractérisées en utilisant la circonférence du cœur (HG), la hauteur de la croupe (RH) et le poids corporel (BW) en raison des composants principaux, tandis que l'analyse de l'algorithme CHAID et Exhaustive CHAID a révélé que BW et HL étaient les classificateurs génétiques des chèvres WAD, à la fois en termes d'emplacements. Fondamentalement, les chèvres des 3 sites semblaient être de nature plus homogène, ce qui implique qu'un déploiement de travaux de génomique complémentaires spécifiques ciblant les futurs programmes de sélection et d'élevage pour améliorer leur productivité dans la forêt tropicale humide du Nigeria est nécessaire.

Translated Description (Spanish)

Esta investigación se llevó a cabo para caracterizar las cabras enanas de África Occidental (WAD) utilizando un enfoque multivariante basado en sus rasgos morfo-biométricos en la zona de selva tropical de Nigeria. Se generaron datos sobre cuatro rasgos físicos cualitativos, seis indicadores de morfología y nueve caracteres morfológicos de 279 cabras. Se emplearon estadísticas descriptivas, análisis no paramétrico y enfoque unidireccional de ANOVA con pruebas post hoc, análisis discriminante (canónico), análisis de componentes principales (categórico) y análisis de árbol de regresión para discernir los efectos de la ubicación y el sexo en los parámetros, así como caracterizar las cabras. Las frecuencias de los rasgos cualitativos muestran que el color del pelaje negro predominó (60.2%) sobre otros colores de pelaje, el color liso predominó (75.3%) sobre otros patrones de color, los cuernos rectos (38.1%) predominaron sobre otras formas de cuerno y la presencia de barba (66.7%) predominó sobre la presencia de no barba entre las cabras en términos de ubicaciones y sexos. La ubicación y la edad se vieron significativamente afectadas en los caracteres biométricos (p<0.05 y p<0.001) con cabras de Enugu que tenían valores más altos que otros estados, mientras que solo la longitud de la cabeza (HL) se vio afectada significativamente por el sexo (p< 0.05). Los indicadores morfológicos no se vieron afectados significativamente por la ubicación y el sexo (p>0,05 y p>0,001), mientras que la edad fue significativa. El análisis discriminante reveló poblaciones dispersas y no entremezcladas para los rasgos físicos, los caracteres biométricos y los índices corporales, lo que implica que son poblaciones distintas entre sí. En general, las poblaciones de cabras podrían caracterizarse utilizando la circunferencia del corazón (HG), la altura de la grupa (RH) y el peso corporal (BW) debido a los componentes principales, mientras que el CHAID y el análisis exhaustivo del algoritmo CHAID revelaron BW y HL como los clasificadores genéticos de las cabras WAD, ambos en términos de ubicaciones. Básicamente, las cabras de los 3 lugares parecían ser de naturaleza más homogénea, lo que implica que es necesario un despliegue de trabajo genómico complementario específico dirigido a futuros programas de selección y reproducción para mejorar su productividad en la selva tropical de Nigeria.

Files

latest.pdf.pdf

Files (880.4 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:969c0d5f611b725b078902beb2205e5b
880.4 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
مجموعات الماعز القزمة في غرب أفريقيا في منطقة الغابات المطيرة الاستوائية: تطبيق أدوات التحليل متعددة المتغيرات على توصيفها باستخدام السمات المورفولوجية البيومترية
Translated title (French)
Populations de chèvres naines d'Afrique de l'Ouest de la zone de forêt tropicale humide : application d'outils d'analyse multivariée sur leur caractérisation à l'aide de traits morpho-biométriques
Translated title (Spanish)
Poblaciones de cabras enanas de África Occidental de la zona de selva tropical: aplicación de herramientas de análisis multivariante en su caracterización utilizando rasgos morfobiométricos

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4377939773
DOI
10.1007/s11250-023-03641-0

Is supplement to
https://openalex.org/W4245825737 (Other)
https://openalex.org/W3148144326 (Other)
https://openalex.org/W2990639255 (Other)
https://openalex.org/W2916030492 (Other)
https://openalex.org/W2900778301 (Other)
https://openalex.org/W2495860046 (Other)
https://openalex.org/W2382529643 (Other)
https://openalex.org/W2097638743 (Other)
https://openalex.org/W1963798519 (Other)
https://openalex.org/W1427356983 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Nigeria

References

  • https://openalex.org/W1523219640
  • https://openalex.org/W1976169990
  • https://openalex.org/W2030403486
  • https://openalex.org/W2049937253
  • https://openalex.org/W2053031674
  • https://openalex.org/W2071834308
  • https://openalex.org/W2074089469
  • https://openalex.org/W2092616556
  • https://openalex.org/W2093263348
  • https://openalex.org/W2166228037
  • https://openalex.org/W2180696041
  • https://openalex.org/W2341271812
  • https://openalex.org/W2659810692
  • https://openalex.org/W2922421848
  • https://openalex.org/W2964002848
  • https://openalex.org/W2969758442
  • https://openalex.org/W3030086700
  • https://openalex.org/W3100916071
  • https://openalex.org/W3101332120
  • https://openalex.org/W3118329740
  • https://openalex.org/W3137188169
  • https://openalex.org/W3173704486
  • https://openalex.org/W3185971865
  • https://openalex.org/W4282841627