Published December 18, 2010 | Version v1
Publication Open

Identification and characterization of Curcuma comosa Roxb., phytoestrogens-producing plant, using AFLP markers and morphological characteristics

Creators

  • 1. Kasetsart University

Description

Waan chak modlook' (Curcuma comosa Roxb.) is an important medicinal plant of Thailand, but the high similarity in morphological characteristics observed among Curcuma spp.may cause confusion in its utilization.The amplified fragment length polymorphism (AFLP) marker was used to identify and elucidate the phylogenetic relationships among 97 accessions of 'Waan chak modlook' collected throughout Thailand.Nine AFLP primer combinations generated a total of 202 bands, of which, 158 bands were polymorphic, with an average of 17.56 bands per primer pair.Pairwise similarity estimated between all samples ranged from 0.39 to 1.00 with an average of 0.67.The phylogenetic tree derived from AFLP data showed that the 'Waan chak modlook' accessions were divided into five clusters.Based on morphological characterizations, all samples could be assigned to four species: Curcuma sp.; Curcuma latifolia Rosc.; Curcuma elata Roxb.; and C. comosa.The results indicated that there were other Curcuma species that were misused as C. comosa.The DNA fingerprint data along with the morphological data provided the keys for the accurate identification of C. comosa from the other three related species.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

Waan chak modlook ' (Curcuma comosa Roxb.) هو نبات طبي مهم في تايلاند، ولكن التشابه الكبير في الخصائص المورفولوجية التي لوحظت بين Curcuma spp.may قد يسبب ارتباكًا في استخدامه. تم استخدام علامة تعدد أشكال طول الشظية المضخمة (AFLP) لتحديد وتوضيح العلاقات الوراثية بين 97 ملحقًا من "Waan chak modlook" التي تم جمعها في جميع أنحاء تايلاند. أسفرت تسعة تركيبات تمهيدية لـ AFLP عن ما مجموعه 202 نطاق، منها 158 نطاقًا متعدد الأشكال، بمتوسط 17.56 نطاقًا لكل زوج تمهيدي. وتراوح التشابه الزوجي المقدر بين جميع العينات من 0.39 إلى 1.00 بمتوسط 0.67. أظهرت شجرة التطور المستمدة من بيانات AFLP أن ملحقات "Waan chak modlook" تم تقسيمها إلى خمس مجموعات. بناءً على الخصائص المورفولوجية، يمكن تخصيص جميع العينات لأربعة أنواع: Curcuma sp.; Curcuma latifolia Rosc.; Curcuma elata Roxb.; و C. comosa. أشارت النتائج إلى وجود أنواع أخرى من الكركم أسيء استخدامها على أنها C. comosa. وفرت بيانات بصمات الحمض النووي جنبًا إلى جنب مع البيانات المورفولوجية مفاتيح التحديد الدقيق لـ C. comosa من الأنواع الثلاثة الأخرى ذات الصلة.

Translated Description (French)

Le marqueur de polymorphisme de longueur de fragment amplifié (AFLP) a été utilisé pour identifier et élucider les relations phylogénétiques entre 97 accessions de 'Waan chak modlook' collectées dans toute la Thaïlande. Neuf combinaisons d'amorces AFLP ont généré un total de 202 bandes, dont 158 bandes polymorphes, avec une moyenne de 17,56 bandes par paire d'amorces. La similarité par paire estimée entre tous les échantillons variait de 0,39 à 1,00 avec une moyenne de 0,67. L'arbre phylogénétique dérivé des données AFLP a montré que les accessions de 'Waan chak modlook' ont été divisées en cinq groupes. Sur la base de caractérisations morphologiques, tous les échantillons ont pu être attribués à quatre espèces : Curcuma sp.; Curcuma latifolia Rosc. ; Curcuma elata Roxb. ; et C. comosa.Les résultats ont indiqué qu'il y avait d'autres espèces de Curcuma qui ont été mal utilisées comme C. comosa.Les données d'empreintes digitales d'ADN ainsi que les données morphologiques ont fourni les clés pour l'identification précise de C. comosa des trois autres espèces apparentées.

Translated Description (Spanish)

Waan chak modlook ' (Curcuma comosa Roxb.) es una planta medicinal importante de Tailandia, pero la alta similitud en las características morfológicas observadas entre Curcuma spp. puede causar confusión en su utilización. El marcador de polimorfismo de longitud de fragmento amplificado (AFLP) se utilizó para identificar y dilucidar las relaciones filogenéticas entre 97 accesiones de 'Waan chak modlook ' recopiladas en Tailandia. Nueve combinaciones de cebadores AFLP generaron un total de 202 bandas, de las cuales, 158 bandas eran polimórficas, con un promedio de 17.56 bandas por par de cebadores. La similitud por pares estimada entre todas las muestras varió de 0.39 a 1.00 con un promedio de 0.67. El árbol filogenético derivado de los datos de AFLP mostró que las accesiones de'Waan chak modlook 'se dividieron en cinco grupos. Basándose en las caracterizaciones morfológicas, todas las muestras se pudieron asignar a cuatro especies: Curcuma sp.; Curcuma latifolia Rosc.; Curcuma elata Roxb.; y C. comosa. Los resultados indicaron que había otras especies de Curcuma que fueron mal utilizadas como C. comosa. Los datos de huellas dactilares de ADN junto con los datos morfológicos proporcionaron las claves para la identificación precisa de C. comosa de las otras tres especies relacionadas.

Files

7A91C1A22319.pdf.pdf

Files (827.8 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:3a34c1efac1226035b89d5ee89e78bb1
827.8 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحديد وتوصيف نبات كركم كوموسا روكسب، النبات المنتج للإستروجين النباتي، باستخدام علامات AFLP والخصائص المورفولوجية
Translated title (French)
Identification et caractérisation de Curcuma comosa Roxb., plante productrice de phytoestrogènes, à l'aide de marqueurs AFLP et de caractéristiques morphologiques
Translated title (Spanish)
Identificación y caracterización de Curcuma comosa Roxb., planta productora de fitoestrógenos, utilizando marcadores AFLP y características morfológicas

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2126069485
DOI
10.5897/jmpr09.381

Is supplement to
https://openalex.org/W4299436283 (Other)
https://openalex.org/W3012975333 (Other)
https://openalex.org/W2782478092 (Other)
https://openalex.org/W2761738154 (Other)
https://openalex.org/W2382157181 (Other)
https://openalex.org/W2379690847 (Other)
https://openalex.org/W2360635038 (Other)
https://openalex.org/W2350414399 (Other)
https://openalex.org/W2026347785 (Other)
https://openalex.org/W1760410099 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1592529931
  • https://openalex.org/W1979629418
  • https://openalex.org/W1989590705
  • https://openalex.org/W2034435648
  • https://openalex.org/W2043652943
  • https://openalex.org/W2046167616
  • https://openalex.org/W2062708892
  • https://openalex.org/W2069148870
  • https://openalex.org/W2070739926
  • https://openalex.org/W2072839858
  • https://openalex.org/W2083834391
  • https://openalex.org/W2104043339
  • https://openalex.org/W2161863335
  • https://openalex.org/W2250077582