Published March 13, 2012 | Version v1
Publication Open

Prevalence of pulmonary TB and spoligotype pattern of Mycobacterium tuberculosis among TB suspects in a rural community in Southwest Ethiopia

  • 1. Jimma University
  • 2. University of Antwerp
  • 3. Instituut voor Tropische Geneeskunde
  • 4. Armauer Hansen Research Institute

Description

In Ethiopia where there is no strong surveillance system and state of the art diagnostic facilities are limited, the real burden of tuberculosis (TB) is not well known. We conducted a community based survey to estimate the prevalence of pulmonary TB and spoligotype pattern of the Mycobacterium tuberculosis isolates in Southwest Ethiopia. A total of 30040 adults in 10882 households were screened for pulmonary TB in Gilgel Gibe field research centre in Southwest Ethiopia. A total of 482 TB suspects were identified and smear microscopy and culture was done for 428 TB suspects. Counseling and testing for HIV/AIDS was done for all TB suspects. Spoligotyping was done to characterize the Mycobacterium tuberculosis isolates. Majority of the TB suspects were females (60.7%) and non-literates (83.6%). Using smear microscopy, a total of 5 new and 4 old cases of pulmonary TB cases were identified making the prevalence of TB 30 per 100,000. However, using the culture method, we identified 17 new cases with a prevalence of 76.1 per 100,000. There were 4.3 undiagnosed pulmonary TB cases for every TB case who was diagnosed through the passive case detection mechanism in the health facility. Eleven isolates (64.7%) belonged to the six previously known spoligotypes: T, Haarlem and Central-Asian (CAS). Six new spoligotype patterns of Mycobacterium tuberculosis, not present in the international database (SpolDB4) were identified. None of the rural residents was HIV infected and only 5 (5.5%) of the urban TB suspects were positive for HIV. The prevalence of TB in the rural community of Southwest Ethiopia is low. There are large numbers of undiagnosed TB cases in the community. However, the number of sputum smear-positive cases was very low and therefore the risk of transmitting the infection to others may be limited. Active case finding through health extension workers in the community can improve the low case detection rate in Ethiopia. A large scale study on the genotyping of Mycobacterium tuberculosis in Ethiopia is crucial to understand transmission dynamics, identification of drug resistant strains and design preventive strategies.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

في إثيوبيا حيث لا يوجد نظام مراقبة قوي ومرافق التشخيص الحديثة محدودة، فإن العبء الحقيقي للسل غير معروف جيدًا. أجرينا دراسة استقصائية مجتمعية لتقدير مدى انتشار السل الرئوي ونمط القولون العصبي لعزل المتفطرة السلية في جنوب غرب إثيوبيا. تم فحص ما مجموعه 30040 بالغًا في 10882 أسرة بحثًا عن السل الرئوي في مركز جلجل جيبي للبحوث الميدانية في جنوب غرب إثيوبيا. تم تحديد ما مجموعه 482 مشتبهًا في إصابتهم بالسل وتم إجراء الفحص المجهري للمسحة والمزرعة لـ 428 مشتبهًا في إصابتهم بالسل. تم تقديم المشورة واختبار فيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز لجميع المشتبه في إصابتهم بالسل. تم إجراء التنميط المجوف لتمييز عزلات المتفطرة السلية. وكانت غالبية المشتبه في إصابتهم بالسل من الإناث (60.7 ٪) وغير الأميين (83.6 ٪). باستخدام الفحص المجهري للمسحة، تم تحديد ما مجموعه 5 حالات جديدة و 4 حالات قديمة من حالات السل الرئوي مما يجعل معدل انتشار السل 30 لكل 100000. ومع ذلك، باستخدام طريقة الاستزراع، حددنا 17 حالة جديدة بمعدل انتشار 76.1 لكل 100000. كان هناك 4.3 حالة سل رئوي غير مشخصة لكل حالة سل تم تشخيصها من خلال آلية الكشف عن الحالات السلبية في المرفق الصحي. ينتمي أحد عشر عزلًا (64.7 ٪) إلى الأنماط الستة المعروفة سابقًا: T و Haarlem و Central - Asian (CAS). تم تحديد ستة أنماط جديدة لمرض المتفطرة السلية، غير موجودة في قاعدة البيانات الدولية (SpolDB4). لم يكن أي من سكان الريف مصابًا بفيروس نقص المناعة البشرية وكان 5 فقط (5.5 ٪) من المشتبه في إصابتهم بالسل في المناطق الحضرية مصابين بفيروس نقص المناعة البشرية. انتشار السل في المجتمع الريفي في جنوب غرب إثيوبيا منخفض. هناك أعداد كبيرة من حالات السل غير المشخصة في المجتمع. ومع ذلك، كان عدد الحالات الإيجابية للبلغم منخفضًا جدًا، وبالتالي قد يكون خطر نقل العدوى إلى الآخرين محدودًا. يمكن أن يؤدي اكتشاف الحالات النشطة من خلال العاملين في مجال الإرشاد الصحي في المجتمع إلى تحسين انخفاض معدل اكتشاف الحالات في إثيوبيا. تعد دراسة واسعة النطاق حول التنميط الجيني لمرض المتفطرة السلية في إثيوبيا أمرًا بالغ الأهمية لفهم ديناميكيات الانتقال وتحديد السلالات المقاومة للأدوية وتصميم استراتيجيات وقائية.

Translated Description (French)

En Éthiopie, où il n'existe pas de système de surveillance solide et où les installations de diagnostic de pointe sont limitées, le fardeau réel de la tuberculose (TB) n'est pas bien connu. Nous avons mené une enquête communautaire pour estimer la prévalence de la tuberculose pulmonaire et le modèle de spoligotype des isolats de Mycobacterium tuberculosis dans le sud-ouest de l'Éthiopie. Un total de 30040 adultes dans 10882 ménages ont été dépistés pour la tuberculose pulmonaire dans le centre de recherche sur le terrain Gilgel Gibe dans le sud-ouest de l'Éthiopie. Au total, 482 suspects de tuberculose ont été identifiés et une microscopie et une culture de frottis ont été effectuées pour 428 suspects de tuberculose. Des conseils et des tests de dépistage du VIH/sida ont été effectués pour tous les suspects de tuberculose. Le spoligotypage a été effectué pour caractériser les isolats de Mycobacterium tuberculosis. La majorité des suspects de tuberculose étaient des femmes (60,7 %) et des non-alphabètes (83,6 %). À l'aide de la microscopie à frottis, un total de 5 nouveaux et 4 anciens cas de tuberculose pulmonaire ont été identifiés, ce qui fait que la prévalence de la tuberculose est de 30 pour 100 000. Cependant, en utilisant la méthode de culture, nous avons identifié 17 nouveaux cas avec une prévalence de 76,1 pour 100 000. Il y avait 4,3 cas de tuberculose pulmonaire non diagnostiqués pour chaque cas de tuberculose diagnostiqué par le mécanisme de détection passive des cas dans l'établissement de santé. Onze isolats (64,7 %) appartenaient aux six spoligotypes précédemment connus : T, Haarlem et Asie centrale (cas). Six nouveaux patrons de spoligotypes de Mycobacterium tuberculosis, non présents dans la base de données internationale (SpolDB4) ont été identifiés. Aucun des résidents ruraux n'était infecté par le VIH et seulement 5 (5,5 %) des suspects de tuberculose urbaine étaient séropositifs. La prévalence de la tuberculose dans la communauté rurale du sud-ouest de l'Éthiopie est faible. Il existe un grand nombre de cas de tuberculose non diagnostiqués dans la communauté. Cependant, le nombre de cas positifs au frottis d'expectoration était très faible et, par conséquent, le risque de transmission de l'infection à d'autres personnes peut être limité. La recherche active des cas par le biais d'agents de vulgarisation sanitaire dans la communauté peut améliorer le faible taux de détection des cas en Éthiopie. Une étude à grande échelle sur le génotypage de Mycobacterium tuberculosis en Éthiopie est cruciale pour comprendre la dynamique de transmission, identifier les souches résistantes aux médicaments et concevoir des stratégies préventives.

Translated Description (Spanish)

En Etiopía, donde no existe un sistema de vigilancia sólido y las instalaciones de diagnóstico de vanguardia son limitadas, la carga real de la tuberculosis (TB) no es bien conocida. Realizamos una encuesta basada en la comunidad para estimar la prevalencia de TB pulmonar y el patrón de espoligotipo de los aislados de Mycobacterium tuberculosis en el suroeste de Etiopía. Un total de 30040 adultos en 10882 hogares fueron examinados para detectar TB pulmonar en el centro de investigación de campo Gilgel Gibe en el suroeste de Etiopía. Se identificaron un total de 482 sospechosos de TB y se realizó una microscopía de frotis y un cultivo para 428 sospechosos de TB. Se realizó asesoramiento y pruebas de VIH/SIDA para todos los sospechosos de tuberculosis. El espoligotipado se realizó para caracterizar los aislados de Mycobacterium tuberculosis. La mayoría de los sospechosos de tuberculosis eran mujeres (60,7%) y analfabetos (83,6%). Usando microscopía de frotis, se identificaron un total de 5 casos nuevos y 4 casos antiguos de TB pulmonar, lo que hace que la prevalencia de TB sea de 30 por cada 100.000. Sin embargo, utilizando el método de cultivo, identificamos 17 nuevos casos con una prevalencia de 76,1 por 100.000. Hubo 4.3 casos de TB pulmonar no diagnosticados por cada caso de TB que se diagnosticó a través del mecanismo de detección pasiva de casos en el centro de salud. Once aislados (64,7%) pertenecían a los seis espoligotipos previamente conocidos: T, Haarlem y Asia Central (CAS). Se identificaron seis nuevos patrones de espoligotipo de Mycobacterium tuberculosis, no presentes en la base de datos internacional (SpolDB4). Ninguno de los residentes rurales estaba infectado por el VIH y solo 5 (5,5%) de los sospechosos de tuberculosis urbana dieron positivo para el VIH. La prevalencia de TB en la comunidad rural del suroeste de Etiopía es baja. Hay un gran número de casos de TB no diagnosticados en la comunidad. Sin embargo, el número de casos positivos para el frotis de esputo fue muy bajo y, por lo tanto, el riesgo de transmitir la infección a otros puede ser limitado. La detección activa de casos a través de los trabajadores de extensión sanitaria de la comunidad puede mejorar la baja tasa de detección de casos en Etiopía. Un estudio a gran escala sobre la genotipificación de Mycobacterium tuberculosis en Etiopía es crucial para comprender la dinámica de transmisión, la identificación de cepas resistentes a los medicamentos y el diseño de estrategias preventivas.

Files

1471-2334-12-54.pdf

Files (630.6 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:44a7b9b24ff7cbe1dbb72a04e4810028
630.6 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
انتشار السل الرئوي ونمط النمط السنجابي لمرض المتفطرة السلية بين المشتبه في إصابتهم بالسل في مجتمع ريفي في جنوب غرب إثيوبيا
Translated title (French)
Prévalence de la tuberculose pulmonaire et modèle de spoligotype de Mycobacterium tuberculosis chez les suspects de tuberculose dans une communauté rurale du sud-ouest de l'Éthiopie
Translated title (Spanish)
Prevalencia de TB pulmonar y patrón de espoligotipo de Mycobacterium tuberculosis entre sospechosos de TB en una comunidad rural en el suroeste de Etiopía

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2010080663
DOI
10.1186/1471-2334-12-54

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Ethiopia

References

  • https://openalex.org/W1966340693
  • https://openalex.org/W1997214761
  • https://openalex.org/W2007433526
  • https://openalex.org/W2013153552
  • https://openalex.org/W2096162460
  • https://openalex.org/W2100887397
  • https://openalex.org/W2126672627
  • https://openalex.org/W2128107754
  • https://openalex.org/W2134558351
  • https://openalex.org/W2147707033
  • https://openalex.org/W2154753506
  • https://openalex.org/W2159515734
  • https://openalex.org/W2166137292