Published July 15, 2019
| Version v1
Publication
Open
Genetic homogeneity of Anopheles maculatus in Indonesia and origin of a novel species present in Central Java
Creators
- 1. Vector (United States)
- 2. Laboratoire HydroSciences Montpellier
- 3. Universitas Gadjah Mada
- 4. Eijkman Institute for Molecular Biology
- 5. Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
- 6. Kasetsart University
- 7. Institut d'Électronique et des Systèmes
Description
Anopheles maculatus (s.s.) is an important vector of malaria in Indonesia. Previously it was considered the only member of the Maculatus Group present in Indonesia. A novel species was recently identified in the Kulon Progo District in Central Java. Until recently, few investigations have been conducted looking at An. maculatus genetic diversity in Indonesia, including allopatric island populations. Indonesian An. maculatus (s.l.) samples were collected in several locations in Java, Lesser Sunda Island group, Sumatra and in Kulon Progo (Yogyakarta, central Java) where a novel species has been identified. Samples from a 30-year-old colony of the Kulon Progo population were also included in the analysis. Maximum-likelihood analysis established the phylogenies of the ITS2 (nuclear) and cox1 (mitochondrial) markers. Putative times of separation were based on cox1 genetic distances. Two species of the Maculatus Group are present in Indonesia. The novel sibling species is more closely related to Anopheles dispar than to An. maculatus (s.s.). Anopheles maculatus (s.s.) samples are homogeneous based on the ITS2 sequences. Indonesian samples and An. dispar belong to the same cox1 maternal lineage and differ from all other known members of the Maculatus Group. Divergence time between the different populations found in Java was estimated using an established cox1 mutation rate. A novel species within the Maculatus Group, most closely related to An. dispar, is confirmed present in the Kulon Progo area of Central Java. The divergence of this species from An. maculatus (s.s.) is explained by the stable refugia in the Kulon Progo area during the quaternary period of intense volcanic activity throughout most of Java. This novel species awaits detailed morphological description before applying a formal species name. For the interim, it is proposed that the Kulon Progo population be designated An. maculatus var. menoreh to distinguish it from An. maculatus (s.s.).
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
Anopheles maculatus (SS) هو ناقل مهم للملاريا في إندونيسيا. في السابق كان يعتبر العضو الوحيد في مجموعة ماكولاتوس الموجود في إندونيسيا. تم تحديد نوع جديد مؤخرًا في منطقة كولون بروغو في وسط جاوة. حتى وقت قريب، لم يتم إجراء سوى القليل من التحقيقات التي تبحث في التنوع الجيني لـ An. maculatus في إندونيسيا، بما في ذلك سكان الجزر المتباينة. تم جمع عينات إندونيسية من البقعة الصفراء في عدة مواقع في جاوة ومجموعة جزر سوندا الصغرى وسومطرة وفي كولون بروغو (يوجياكارتا، وسط جاوة) حيث تم تحديد أنواع جديدة. كما تم تضمين عينات من مستعمرة عمرها 30 عامًا من سكان كولون بروغو في التحليل. أثبت تحليل الاحتمالية القصوى تطور علامات ITS2 (النووية) و cox1 (الميتوكوندريا). استندت أوقات الفصل المفترضة إلى المسافات الوراثية لـ cox1. يوجد نوعان من مجموعة ماكولاتوس في إندونيسيا. ترتبط الأنواع الشقيقة الجديدة ارتباطًا وثيقًا بالأنوفيلة المتباينة أكثر من ارتباطها بـ An. maculatus (ss). عينات الأنوفيلة maculatus (ss) متجانسة بناءً على تسلسل ITS2. تنتمي العينات الإندونيسية و An. dispar إلى نفس سلالة الأم Cox1 وتختلف عن جميع الأعضاء المعروفين الآخرين في مجموعة Maculatus. تم تقدير وقت التباعد بين المجموعات المختلفة الموجودة في جاوة باستخدام معدل طفرة cox1 ثابت. تم تأكيد وجود نوع جديد داخل مجموعة Maculatus، يرتبط ارتباطًا وثيقًا بـ An. dispar، في منطقة Kulon Progo في وسط جاوة. يتم تفسير اختلاف هذا النوع عن An. maculatus (ss) من خلال الملجأ المستقر في منطقة كولون بروغو خلال الفترة الرباعية من النشاط البركاني المكثف في معظم أنحاء جاوة. ينتظر هذا النوع الجديد وصفًا مورفولوجيًا مفصلاً قبل تطبيق اسم نوع رسمي. في هذه الأثناء، يُقترح أن يتم تعيين مجموعة كولون بروغو An. maculatus var. menoreh لتمييزها عن An. maculatus (s.S.).Translated Description (French)
Anopheles maculatus (s.s.) est un vecteur important du paludisme en Indonésie. Auparavant, il était considéré comme le seul membre du groupe Maculatus présent en Indonésie. Une nouvelle espèce a récemment été identifiée dans le district de Kulon Progo, dans le centre de Java. Jusqu'à récemment, peu d'enquêtes ont été menées sur la diversité génétique de l'An. maculatus en Indonésie, y compris les populations allopatriques des îles. Des échantillons indonésiens d'An. maculatus (s.l.) ont été prélevés à plusieurs endroits à Java, dans le groupe de la Petite Sonde, à Sumatra et à Kulon Progo (Yogyakarta, centre de Java) où une nouvelle espèce a été identifiée. Des échantillons d'une colonie de la population Kulon Progo âgée de 30 ans ont également été inclus dans l'analyse. L'analyse de vraisemblance maximale a établi les phylogénies des marqueurs ITS2 (nucléaire) et cox1 (mitochondrial). Les temps putatifs de séparation étaient basés sur les distances génétiques cox1. Deux espèces du groupe Maculatus sont présentes en Indonésie. La nouvelle espèce sœur est plus étroitement liée à Anopheles dispar qu'à An. maculatus (s.s.). Les échantillons d'Anopheles maculatus (s.s.) sont homogènes sur la base des séquences ITS2. Les échantillons indonésiens et An. dispar appartiennent à la même lignée maternelle cox1 et diffèrent de tous les autres membres connus du groupe Maculatus. Le temps de divergence entre les différentes populations trouvées en Java a été estimé à l'aide d'un taux de mutation cox1 établi. Une nouvelle espèce au sein du groupe Maculatus, plus étroitement apparentée à An. dispar, est confirmée présente dans la région de Kulon Progo au centre de Java. La divergence de cette espèce par rapport à An. maculatus (s.s.) s'explique par les refuges stables dans la région de Kulon Progo pendant la période quaternaire d'activité volcanique intense dans la majeure partie de Java. Cette nouvelle espèce attend une description morphologique détaillée avant d'appliquer un nom d'espèce formel. Pour l'intérim, il est proposé que la population de Kulon Progo soit désignée An. maculatus var. menoreh pour la distinguer de An. maculatus (s.s.).Translated Description (Spanish)
Anopheles maculatus (s.s.) es un vector importante de la malaria en Indonesia. Anteriormente se consideraba el único miembro del Grupo Maculatus presente en Indonesia. Recientemente se identificó una nueva especie en el distrito de Kulon Progo en Java Central. Hasta hace poco, se han realizado pocas investigaciones sobre la diversidad genética de An. maculatus en Indonesia, incluidas las poblaciones de islas alopátricas. Se recolectaron muestras indonesias de An. maculatus (s.l.) en varios lugares de Java, el grupo de la Isla Menor de la Sonda, Sumatra y en Kulon Progo (Yogyakarta, Java central) donde se ha identificado una nueva especie. También se incluyeron en el análisis muestras de una colonia de 30 años de la población Kulon Progo. El análisis de máxima verosimilitud estableció las filogenias de los marcadores ITS2 (nuclear) y cox1 (mitocondrial). Los tiempos putativos de separación se basaron en las distancias genéticas de cox1. Dos especies del Grupo Maculatus están presentes en Indonesia. La nueva especie hermana está más estrechamente relacionada con Anopheles dispar que con An. maculatus (s.s.). Las muestras de Anopheles maculatus (s.s.) son homogéneas en función de las secuencias de ITS2. Las muestras de Indonesia y An. dispar pertenecen al mismo linaje materno cox1 y difieren de todos los demás miembros conocidos del Grupo Maculatus. El tiempo de divergencia entre las diferentes poblaciones encontradas en Java se estimó utilizando una tasa de mutación de cox1 establecida. Una nueva especie dentro del Grupo Maculatus, más estrechamente relacionada con An. dispar, se confirma presente en el área de Kulon Progo de Java Central. La divergencia de esta especie de An. maculatus (s.s.) se explica por los refugios estables en la zona de Kulon Progo durante el período cuaternario de intensa actividad volcánica en la mayor parte de Java. Esta nueva especie espera una descripción morfológica detallada antes de aplicar un nombre de especie formal. Por el momento, se propone que la población Kulon Progo se designe An. maculatus var. menoreh para distinguirla de An. maculatus (s.s.).Files
s13071-019-3598-1.pdf
Files
(1.6 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:e3a27dc1050b741cf3c451db3c43cf19
|
1.6 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التجانس الوراثي للأنوفيليس ماكولاتوس في إندونيسيا وأصل نوع جديد موجود في وسط جاوة
- Translated title (French)
- Homogénéité génétique d'Anopheles maculatus en Indonésie et origine d'une nouvelle espèce présente dans le centre de Java
- Translated title (Spanish)
- Homogeneidad genética de Anopheles maculatus en Indonesia y origen de una nueva especie presente en Java Central
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2961115519
- DOI
- 10.1186/s13071-019-3598-1
References
- https://openalex.org/W1574132105
- https://openalex.org/W160101472
- https://openalex.org/W1968932277
- https://openalex.org/W1977180944
- https://openalex.org/W1988117836
- https://openalex.org/W2001539691
- https://openalex.org/W2004311590
- https://openalex.org/W2008655567
- https://openalex.org/W2009673514
- https://openalex.org/W2011830580
- https://openalex.org/W2013430677
- https://openalex.org/W2015190302
- https://openalex.org/W2020382384
- https://openalex.org/W2025366922
- https://openalex.org/W2025709436
- https://openalex.org/W2046310373
- https://openalex.org/W2047806156
- https://openalex.org/W2068286350
- https://openalex.org/W2083008979
- https://openalex.org/W2089804680
- https://openalex.org/W2095754097
- https://openalex.org/W2108093250
- https://openalex.org/W2108557413
- https://openalex.org/W2111829771
- https://openalex.org/W2125216761
- https://openalex.org/W2128408957
- https://openalex.org/W2129108102
- https://openalex.org/W2131400772
- https://openalex.org/W2131582941
- https://openalex.org/W2146441651
- https://openalex.org/W2148969881
- https://openalex.org/W2149531726
- https://openalex.org/W2151944509
- https://openalex.org/W2152207030
- https://openalex.org/W2153401803
- https://openalex.org/W2162714623
- https://openalex.org/W2182428352
- https://openalex.org/W2214133878
- https://openalex.org/W2262450859
- https://openalex.org/W2300345361
- https://openalex.org/W2300457038
- https://openalex.org/W2420829768
- https://openalex.org/W2432172254
- https://openalex.org/W2774270220
- https://openalex.org/W2799524357
- https://openalex.org/W2933419141
- https://openalex.org/W8769360
- https://openalex.org/W9798854