Published January 22, 2019 | Version v1
Publication Open

Novel deleterious mutation in MYO7A, TH and EVC2 in two Pakistani brothers with familial deafness

Creators

  • 1. Khyber Medical University
  • 2. Hayatabad Medical Complex

Description

In Pakistan, 74% of consanguineous marriages are among the first cousins. Continuity of consanguineous marriages over generations increases the risk of recessive diseases such as deafness. The objective of this study was to investigate genetic origin of Pakistani deaf brothers with parents of consanguineous marriage.DNA was extracted from the blood through Qiagen kit. Paired-end sequencing library was prepared according to protocol of Illumina's TruSight Rapid Capture kit and TruSight Inherited Disease Panel. Library was normalized and used for Next Generation Sequencing through MiSeq. NGS data were analyzed using various bioinformatics tools.Both brothers were found to have novel deleterious mutation in MYO7A (c.2476G>A) while the younger brother had additional novel deleterious mutation in TH (c.43C>T) and EVC2 (c.2614C>T) genes.It is concluded that in addition to novel mutations in MYO7A, TH and EVC2, the CDH23 and GJB2 can also be responsible for deafness in the family with consanguineous marriages.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

في باكستان، 74 ٪ من زيجات الأقارب هي من بين أبناء العمومة الأوائل. يزيد استمرار زواج الأقارب عبر الأجيال من خطر الإصابة بأمراض متنحية مثل الصمم. كان الهدف من هذه الدراسة هو التحقيق في الأصل الجيني للأخوة الباكستانيين الصم مع والدي زواج الأقارب. تم استخراج الحمض النووي من الدم من خلال مجموعة Qiagen. تم إعداد مكتبة التسلسل المقترنة وفقًا لبروتوكول مجموعة التقاط TruSight السريع من Illumina ولوحة الأمراض الموروثة من TruSight. تم تطبيع المكتبة واستخدامها لتسلسل الجيل التالي من خلال MiSeq. تم تحليل بيانات الجيل التالي لتحديد التسلسل باستخدام أدوات المعلوماتية الحيوية المختلفة. وجد أن كلا الأخوين لديهما طفرة ضارة جديدة في MYO7A (c.2476G >A) بينما كان لدى الأخ الأصغر طفرة ضارة جديدة إضافية في جينات TH (c.43C >T) و EVC2 (c.2614C > T). تم استنتاج أنه بالإضافة إلى الطفرات الجديدة في MYO7A و TH و EVC2، يمكن أن يكون CDH23 و GJB2 مسؤولاً أيضًا عن الصمم في الأسرة مع زواج الأقارب.

Translated Description (French)

Au Pakistan, 74 % des mariages consanguins font partie des cousins germains. La continuité des mariages consanguins au fil des générations augmente le risque de maladies récessives telles que la surdité. L'objectif de cette étude était d'étudier l'origine génétique des frères sourds pakistanais avec des parents de mariage consanguin. L'ADN a été extrait du sang par le biais du kit Qiagen. La bibliothèque de séquençage à deux extrémités a été préparée selon le protocole du kit TruSight Rapid Capture d'Illumina et du TruSight Inherited Disease Panel. La bibliothèque a été normalisée et utilisée pour le séquençage de nouvelle génération via MiSeq. Les données NGS ont été analysées à l'aide de divers outils bioinformatiques. Les deux frères se sont avérés avoir une nouvelle mutation délétère dans MYO7A (c.2476G >A) tandis que le frère cadet avait une nouvelle mutation délétère supplémentaire dans les gènes TH (c.43C >T) et EVC2 (c.2614C > T). Il est conclu qu'en plus des nouvelles mutations dans MYO7A, TH et EVC2, le CDH23 et GJB2 peuvent également être responsables de la surdité dans la famille avec des mariages consanguins.

Translated Description (Spanish)

En Pakistán, el 74% de los matrimonios consanguíneos se encuentran entre los primos hermanos. La continuidad de los matrimonios consanguíneos a lo largo de las generaciones aumenta el riesgo de enfermedades recesivas como la sordera. El objetivo de este estudio fue investigar el origen genético de los hermanos sordos paquistaníes con padres de matrimonio consanguíneo. El ADN se extrajo de la sangre a través del kit Qiagen. La biblioteca de secuenciación de extremos emparejados se preparó de acuerdo con el protocolo del kit TruSight Rapid Capture de Illumina y el panel de enfermedades hereditarias TruSight. La biblioteca se normalizó y se utilizó para la secuenciación de próxima generación a través de MiSeq. Los datos de NGS se analizaron utilizando varias herramientas bioinformáticas. Se encontró que ambos hermanos tenían una mutación perjudicial novedosa en MYO7A (c.2476G >A), mientras que el hermano menor tenía una mutación perjudicial novedosa adicional en los genes TH (c.43C >T) y EVC2 (c.2614C > T). Se concluye que, además de las mutaciones novedosas en MYO7A, TH y EVC2, CDH23 y GJB2 también pueden ser responsables de la sordera en la familia con matrimonios consanguíneos.

Files

45.pdf

Files (393.7 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:c8e5cac9ec5b64734ee66474162e078f
393.7 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
طفرة ضارة جديدة في MYO7A و TH و EVC2 لدى شقيقين باكستانيين مصابين بالصمم العائلي
Translated title (French)
Nouvelle mutation délétère de MYO7A, TH et EVC2 chez deux frères pakistanais atteints de surdité familiale
Translated title (Spanish)
Novedosa mutación deletérea en MYO7A, TH y EVC2 en dos hermanos paquistaníes con sordera familiar

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2906280323
DOI
10.12669/pjms.35.1.98

Is supplement to
https://openalex.org/W4248335502 (Other)
https://openalex.org/W4242033079 (Other)
https://openalex.org/W3089098955 (Other)
https://openalex.org/W2396837573 (Other)
https://openalex.org/W2374885828 (Other)
https://openalex.org/W2355785511 (Other)
https://openalex.org/W2282764689 (Other)
https://openalex.org/W2255493058 (Other)
https://openalex.org/W2132377455 (Other)
https://openalex.org/W148594992 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Pakistan

References

  • https://openalex.org/W1496613889
  • https://openalex.org/W151092247
  • https://openalex.org/W1537643935
  • https://openalex.org/W1972313263
  • https://openalex.org/W1979506865
  • https://openalex.org/W1984425391
  • https://openalex.org/W1999480413
  • https://openalex.org/W2007940844
  • https://openalex.org/W2010595044
  • https://openalex.org/W2029168550
  • https://openalex.org/W2054509832
  • https://openalex.org/W2068976379
  • https://openalex.org/W2069431647
  • https://openalex.org/W2071126289
  • https://openalex.org/W2072821165
  • https://openalex.org/W208044923
  • https://openalex.org/W2114929889
  • https://openalex.org/W2119868169
  • https://openalex.org/W2138261854
  • https://openalex.org/W2142154935
  • https://openalex.org/W2149358259
  • https://openalex.org/W2162569984
  • https://openalex.org/W2188404863
  • https://openalex.org/W2345436957
  • https://openalex.org/W2346751063
  • https://openalex.org/W2775902012
  • https://openalex.org/W4294236173