Published September 15, 2016 | Version v1
Publication Open

Cosavirus, Salivirus and Bufavirus in Diarrheal Tunisian Infants

Creators

  • 1. Centre Hospitalier Universitaire Dijon Bourgogne
  • 2. University of Monastir
  • 3. Hospital Fatuma Bourguiba Monastir
  • 4. Laboratoire National de Référence
  • 5. Procédés Alimentaires et Microbiologiques
  • 6. University of Burgundy

Description

Three newly discovered viruses have been recently described in diarrheal patients: Cosavirus (CosV) and Salivirus (SalV), two picornaviruses, and Bufavirus (BuV), a parvovirus. The detection rate and the role of these viruses remain to be established in acute gastroenteritis (AGE) in diarrheal Tunisian infants. From October 2010 through March 2012, stool samples were collected from 203 children <5 years-old suffering from AGE and attending the Children's Hospital in Monastir, Tunisia. All samples were screened for CosV, SalV and BuV as well as for norovirus (NoV) and group A rotavirus (RVA) by molecular biology. Positive samples for the three screened viruses were also tested for astrovirus, sapovirus, adenovirus, and Aichi virus, then genotyped when technically feasible. During the study period, 11 (5.4%) samples were positive for one of the three investigated viruses: 2 (1.0%) CosV-A10, 7 (3.5%) SalV-A1 and 2 (1.0%) BuV-1, whereas 71 (35.0%) children were infected with NoV and 50 (24.6%) with RVA. No mixed infections involving the three viruses were found, but multiple infections with up to 4 classic enteric viruses were found in all cases. Although these viruses are suspected to be responsible for AGE in children, our data showed that this association was uncertain since all infected children also presented infections with several enteric viruses, suggesting here potential water-borne transmission. Therefore, further studies with large cohorts of healthy and diarrheal children will be needed to evaluate their clinical role in AGE.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تم وصف ثلاثة فيروسات مكتشفة حديثًا في مرضى الإسهال: كوسافيروس (Cosavirus) وفيروس اللعاب (SalV)، واثنين من فيروسات البيكورنا، وفيروس البوفا (BuV)، وهو فيروس صغير. لا يزال يتعين تحديد معدل الكشف ودور هذه الفيروسات في التهاب المعدة والأمعاء الحاد (العمر) عند الرضع التونسيين المصابين بالإسهال. من أكتوبر 2010 حتى مارس 2012، تم جمع عينات البراز من 203 أطفال تقل أعمارهم عن 5 سنوات يعانون من العمر ويذهبون إلى مستشفى الأطفال في المنستير، تونس. تم فحص جميع العينات لـ CosV و SalV و BuV بالإضافة إلى نوروفيروس (NOV) وفيروس الروتا من المجموعة أ (RVA) بواسطة البيولوجيا الجزيئية. كما تم اختبار العينات الإيجابية للفيروسات الثلاثة التي تم فحصها بحثًا عن الفيروسات النجمية وفيروس سابوفيروس والفيروس الغدي وفيروس آيتشي، ثم تم تصنيفها جينيًا عندما يكون ذلك ممكنًا من الناحية الفنية. خلال فترة الدراسة، كانت 11 عينة (5.4 ٪) إيجابية لواحد من الفيروسات الثلاثة التي تم التحقيق فيها: 2 (1.0 ٪) CosV - A10، 7 (3.5 ٪) SalV - A1 و 2 (1.0 ٪) BuV -1، في حين أصيب 71 (35.0 ٪) من الأطفال بـ NOV و 50 (24.6 ٪) بـ RVA. لم يتم العثور على عدوى مختلطة تشمل الفيروسات الثلاثة، ولكن تم العثور على عدوى متعددة مع ما يصل إلى 4 فيروسات معوية كلاسيكية في جميع الحالات. على الرغم من الاشتباه في أن هذه الفيروسات مسؤولة عن العمر عند الأطفال، إلا أن بياناتنا أظهرت أن هذا الارتباط غير مؤكد لأن جميع الأطفال المصابين أظهروا أيضًا عدوى بالعديد من الفيروسات المعوية، مما يشير هنا إلى انتقال محتمل للمياه. لذلك، ستكون هناك حاجة إلى مزيد من الدراسات مع مجموعات كبيرة من الأطفال الأصحاء والذين يعانون من الإسهال لتقييم دورهم السريري في العمر.

Translated Description (French)

Trois virus nouvellement découverts ont été récemment décrits chez des patients diarrhéiques : le Cosavirus (CosV) et le Salivirus (SalV), deux picornavirus, et le Bufavirus (BuV), un parvovirus. Le taux de détection et le rôle de ces virus restent à établir dans la gastro-entérite aiguë (AGE) chez les nourrissons diarrhéiques tunisiens. D'octobre 2010 à mars 2012, des échantillons de selles ont été prélevés sur 203 enfants de moins de 5 ans souffrant de troubles de l'ÂGE et fréquentant l'hôpital pour enfants de Monastir, en Tunisie. Tous les échantillons ont été dépistés pour CosV, SalV et BuV ainsi que pour le norovirus (NoV) et le rotavirus du groupe A (RVA) par biologie moléculaire. Des échantillons positifs pour les trois virus sélectionnés ont également été testés pour les astrovirus, les sapovirus, les adénovirus et le virus Aichi, puis génotypés lorsque cela était techniquement possible. Au cours de la période d'étude, 11 (5,4 %) échantillons étaient positifs pour l'un des trois virus étudiés : 2 (1,0 %) CosV-A10, 7 (3,5 %) SalV-A1 et 2 (1,0 %) BuV-1, tandis que 71 (35,0 %) enfants étaient infectés par NoV et 50 (24,6 %) par RVA. Aucune infection mixte impliquant les trois virus n'a été trouvée, mais des infections multiples avec jusqu'à 4 virus entériques classiques ont été trouvées dans tous les cas. Bien que ces virus soient soupçonnés d'être responsables de l'ÂGE chez les enfants, nos données ont montré que cette association était incertaine puisque tous les enfants infectés présentaient également des infections avec plusieurs virus entériques, suggérant ici une transmission potentielle par l'eau. Par conséquent, d'autres études avec de grandes cohortes d'enfants en bonne santé et diarrhéiques seront nécessaires pour évaluer leur rôle clinique dans L'ÂGE.

Translated Description (Spanish)

Recientemente se han descrito tres virus recién descubiertos en pacientes con diarrea: Cosavirus (CosV) y Salivirus (SalV), dos picornavirus, y Bufavirus (BuV), un parvovirus. La tasa de detección y el papel de estos virus aún no se han establecido en la gastroenteritis aguda (AGE) en bebés tunecinos diarreicos. Desde octubre de 2010 hasta marzo de 2012, se recogieron muestras de heces de 203 niños <5 años de EDAD que asistían al Hospital Infantil de Monastir, Túnez. Todas las muestras se analizaron para CosV, SalV y BuV, así como para norovirus (NoV) y rotavirus del grupo A (RVA) por biología molecular. Las muestras positivas para los tres virus examinados también se analizaron para detectar astrovirus, sapovirus, adenovirus y virus de Aichi, y luego se genotiparon cuando fue técnicamente factible. Durante el período de estudio, 11 (5.4%) muestras fueron positivas para uno de los tres virus investigados: 2 (1.0%) CosV-A10, 7 (3.5%) SalV-A1 y 2 (1.0%) BuV-1, mientras que 71 (35.0%) niños fueron infectados con NoV y 50 (24.6%) con RVA. No se encontraron infecciones mixtas que involucraran a los tres virus, pero se encontraron múltiples infecciones con hasta 4 virus entéricos clásicos en todos los casos. Aunque se sospecha que estos virus son responsables de la EDAD en los niños, nuestros datos mostraron que esta asociación era incierta, ya que todos los niños infectados también presentaban infecciones con varios virus entéricos, lo que sugiere aquí una posible transmisión por el agua. Por lo tanto, se necesitarán más estudios con grandes cohortes de niños sanos y diarreicos para evaluar su papel clínico en la EDAD.

Files

journal.pone.0162255&type=printable.pdf

Files (2.5 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:e838e9d50061dabdf3ecbf447770b604
2.5 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
فيروس كوسافيروس وفيروس اللعاب وفيروس بوفا عند الرضع التونسيين المصابين بالإسهال
Translated title (French)
Cosavirus, Salivirus et Bufavirus chez les nourrissons tunisiens diarrhéiques
Translated title (Spanish)
Cosavirus, salivirus y bufavirus en bebés tunecinos con diarrea

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2519169969
DOI
10.1371/journal.pone.0162255

Is supplement to
https://openalex.org/W2381813062 (Other)
https://openalex.org/W68210362 (Other)
https://openalex.org/W2291751056 (Other)
https://openalex.org/W1985492332 (Other)
https://openalex.org/W4380202245 (Other)
https://openalex.org/W2509553142 (Other)
https://openalex.org/W3123772664 (Other)
https://openalex.org/W2530418131 (Other)
https://openalex.org/W2126506961 (Other)
https://openalex.org/W1537587510 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Tunisia

References

  • https://openalex.org/W297534896
  • https://openalex.org/W1146770569
  • https://openalex.org/W1581228859
  • https://openalex.org/W1926035648
  • https://openalex.org/W1952903862
  • https://openalex.org/W1964772572
  • https://openalex.org/W1970318225
  • https://openalex.org/W1975813954
  • https://openalex.org/W1976930064
  • https://openalex.org/W1998203907
  • https://openalex.org/W2010358187
  • https://openalex.org/W2017410528
  • https://openalex.org/W2055548630
  • https://openalex.org/W2057313878
  • https://openalex.org/W2075126975
  • https://openalex.org/W2095897227
  • https://openalex.org/W2106104808
  • https://openalex.org/W2110143296
  • https://openalex.org/W2114511152
  • https://openalex.org/W2117395272
  • https://openalex.org/W2117943561
  • https://openalex.org/W2118644831
  • https://openalex.org/W2127491282
  • https://openalex.org/W2130201099
  • https://openalex.org/W2132926880
  • https://openalex.org/W2133317098
  • https://openalex.org/W2136969516
  • https://openalex.org/W2148551427
  • https://openalex.org/W2150417877
  • https://openalex.org/W2152207030
  • https://openalex.org/W2155220962
  • https://openalex.org/W2157282701
  • https://openalex.org/W2160300661
  • https://openalex.org/W2308992892
  • https://openalex.org/W2410356197