Published June 29, 2021 | Version v1
Publication Open

Genotyping of Helicobacter pylori Virulence Genes cagA and vacA: Regional and National Study

Creators

  • 1. Suez Canal University
  • 2. Sohag University

Description

Helicobacter pylori (H. pylori) plays a crucial role in the pathogenesis of gastritis, peptic ulcer, and gastric cancer. The presence of pathogenicity islands (PAI) genes contributes to the pathogenesis of many gastrointestinal disorders. Cytotoxin-associated gene A (cagA) and vacuolating cytotoxin gene (vacA) are the most known virulence genes in H. pylori. So, our aim was to study H. pylori virulence genes' role in gastric disorders pathogenesis. Our study included 150 adult patients who suffered dyspeptic symptoms and were referred to the GIT endoscopy unit. Gastric biopsies were attained for rapid urease test (RUT) and histopathological examination, and multiplex PCR technique for detection of virulence genes was performed. It was found that 100 specimens were (RUT) positive, of which sixty samples (60%) were PCR positive for H. pylori ureC gene. The vacA and cagA genes were identified in 61.6% and 53% of H. pylori strains, respectively. Only 5 cases were vacA-positive and cagA-negative. The most virulent vacA s1 allele existed in 56.6% of cases. Out of the 60 H. pylori strains, 66% had at least one virulence gene and 34% did not show any virulence gene. H. pylori infection showed significant increase with age. H. pylori are prevalent amid dyspeptic patients in our region. The main genotype combinations were vacA+/cagA+ of s1m1 genotype and they were frequently associated with peptic ulcer diseases, gastritis, and gastroesophageal reflux disease.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تلعب البكتيريا الملوية البوابية (H. pylori) دورًا حاسمًا في التسبب في التهاب المعدة والقرحة الهضمية وسرطان المعدة. يساهم وجود جينات الجزر المسببة للأمراض (PAI) في التسبب في العديد من اضطرابات الجهاز الهضمي. الجين المرتبط بالسموم الخلوية A (cagA) وجين السموم الخلوية المفرغة (vacA) هما أكثر جينات الفوعة المعروفة في H. pylori. لذلك، كان هدفنا هو دراسة دور جينات فوعة الملوية البوابية في التسبب في اضطرابات المعدة. شملت دراستنا 150 مريضًا بالغًا عانوا من أعراض عسر الهضم وتمت إحالتهم إلى وحدة التنظير الهضمي. تم الحصول على خزعات المعدة لاختبار اليورياز السريع (RUT) والفحص النسيجي المرضي، وتم إجراء تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل متعددة الإرسال للكشف عن جينات الفوعة. وجد أن 100 عينة كانت (شبق) إيجابية، منها ستون عينة (60 ٪) كانت إيجابية لـ PCR لجين H. pylori ureC. تم تحديد جينات vacA و cagA في 61.6 ٪ و 53 ٪ من سلالات H. pylori، على التوالي. 5 حالات فقط كانت خالية من A - إيجابية و cagA - سلبية. كان أليل VacA s1 الأكثر ضراوة موجودًا في 56.6 ٪ من الحالات. من بين 60 سلالة من الملوية البوابية، كان لدى 66 ٪ جين واحد على الأقل من الفوعة و 34 ٪ لم تظهر أي جين من الفوعة. أظهرت عدوى الملوية البوابية زيادة كبيرة مع تقدم العمر. الملوية البوابية منتشرة بين مرضى عسر الهضم في منطقتنا. كانت تركيبات النمط الجيني الرئيسية هيvacA +/ cagA+ من النمط الجيني s1m1 وكانت مرتبطة في كثير من الأحيان بأمراض القرحة الهضمية والتهاب المعدة ومرض الارتجاع المعدي المريئي.

Translated Description (French)

Helicobacter pylori (H. pylori) joue un rôle crucial dans la pathogenèse de la gastrite, de l'ulcère gastroduodénal et du cancer gastrique. La présence de gènes d'îlots de pathogénicité (PAI) contribue à la pathogénèse de nombreux troubles gastro-intestinaux. Le gène A associé à la cytotoxine (cagA) et le gène vacuolisant de la cytotoxine (vacA) sont les gènes de virulence les plus connus chez H. pylori. Notre objectif était donc d'étudier le rôle des gènes de virulence de H. pylori dans la pathogenèse des troubles gastriques. Notre étude a inclus 150 patients adultes qui souffraient de symptômes dyspeptiques et ont été référés à l'unité d'endoscopie GIT. Des biopsies gastriques ont été réalisées pour un test rapide d'uréase (RUT) et un examen histopathologique, et une technique de PCR multiplexe pour la détection des gènes de virulence a été réalisée. Il a été constaté que 100 échantillons étaient (RUT) positifs, dont soixante échantillons (60%) étaient positifs à la PCR pour le gène ureC de H. pylori. Les gènes vacA et cagA ont été identifiés dans 61,6 % et 53 % des souches de H. pylori, respectivement. Seuls 5 cas étaient vacA-positifs et cagA-négatifs. L'allèle vacA s1 le plus virulent existait dans 56,6 % des cas. Sur les 60 souches de H. pylori, 66% avaient au moins un gène de virulence et 34% ne présentaient aucun gène de virulence. L'infection à H. pylori a montré une augmentation significative avec l'âge. H. pylori est répandu chez les patients dyspeptiques de notre région. Les principales combinaisons de génotypes étaient vacA+/cagA+ du génotype s1m1 et elles étaient fréquemment associées à des ulcères gastro-duodénaux, à la gastrite et au reflux gastro-œsophagien.

Translated Description (Spanish)

Helicobacter pylori (H. pylori) desempeña un papel crucial en la patogénesis de la gastritis, la úlcera péptica y el cáncer gástrico. La presencia de genes de islas de patogenicidad (PAI) contribuye a la patogénesis de muchos trastornos gastrointestinales. El gen A asociado a citotoxina (cagA) y el gen de citotoxina vacuolizante (vacA) son los genes de virulencia más conocidos en H. pylori. Por lo tanto, nuestro objetivo fue estudiar el papel de los genes de virulencia de H. pylori en la patogénesis de los trastornos gástricos. Nuestro estudio incluyó a 150 pacientes adultos que sufrieron síntomas dispépticos y fueron remitidos a la unidad de endoscopia GIT. Se obtuvieron biopsias gástricas para la prueba rápida de ureasa (RUT) y el examen histopatológico, y se realizó una técnica de PCR múltiplex para la detección de genes de virulencia. Se encontró que 100 especímenes eran (RUT) positivos, de los cuales sesenta muestras (60%) eran PCR positivas para el gen ureC de H. pylori. Los genes vacA y cagA se identificaron en el 61,6% y el 53% de las cepas de H. pylori, respectivamente. Solo 5 casos fueron positivos para vacA y negativos para cagA. El alelo vacA s1 más virulento existía en el 56,6% de los casos. De las 60 cepas de H. pylori, el 66% tenía al menos un gen de virulencia y el 34% no mostró ningún gen de virulencia. La infección por H. pylori mostró un aumento significativo con la edad. H. pylori son prevalentes entre los pacientes dispépticos en nuestra región. Las principales combinaciones de genotipos fueron vacA+/cagA+ del genotipo s1m1 y se asociaron con frecuencia con enfermedades de úlcera péptica, gastritis y enfermedad por reflujo gastroesofágico.

Files

5540560.pdf.pdf

Files (16.0 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:5a455c6bf9698aa3fd9c6f7626fe4162
16.0 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التنميط الجيني للجراثيم الملوية البوابية الفوعة الجينات cagA و vacA: دراسة إقليمية ووطنية
Translated title (French)
Génotypage des gènes de virulence cagA et vacA d'Helicobacter pylori : étude régionale et nationale
Translated title (Spanish)
Genotipado de los genes de virulencia de Helicobacter pylori cagA y vacA: estudio regional y nacional

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3173841085
DOI
10.1155/2021/5540560

Is supplement to
https://openalex.org/W2461555070 (Other)
https://openalex.org/W2432001943 (Other)
https://openalex.org/W224634855 (Other)
https://openalex.org/W2199827864 (Other)
https://openalex.org/W2155785827 (Other)
https://openalex.org/W2051614380 (Other)
https://openalex.org/W2034701357 (Other)
https://openalex.org/W1980013376 (Other)
https://openalex.org/W1884500355 (Other)
https://openalex.org/W1126326153 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1621166403
  • https://openalex.org/W1980259406
  • https://openalex.org/W1981880879
  • https://openalex.org/W1996520021
  • https://openalex.org/W2018729915
  • https://openalex.org/W2020782207
  • https://openalex.org/W2027646592
  • https://openalex.org/W2055243636
  • https://openalex.org/W2061861410
  • https://openalex.org/W2063121433
  • https://openalex.org/W2071631398
  • https://openalex.org/W2094764267
  • https://openalex.org/W2106672018
  • https://openalex.org/W2114798556
  • https://openalex.org/W2122178491
  • https://openalex.org/W2124793583
  • https://openalex.org/W2131697616
  • https://openalex.org/W2136287933
  • https://openalex.org/W2171606925
  • https://openalex.org/W2410501579
  • https://openalex.org/W2521058715
  • https://openalex.org/W2763597855
  • https://openalex.org/W2789590037
  • https://openalex.org/W2792934812
  • https://openalex.org/W2941165800
  • https://openalex.org/W2948387191