Published October 31, 2020 | Version v1
Publication Open

Flea-borne Rickettsia species in fleas, Caldas department, Colombia

Creators

  • 1. Pontificia Universidad Javeriana
  • 2. Universidad Nacional de Colombia
  • 3. University of Caldas
  • 4. The University of Texas Medical Branch at Galveston

Description

Rickettsioses are zoonotic diseases caused by pathogenic bacteria of the genus Rickettsia and transmitted to man by means of arthropod vectors such as ticks, fleas, mites and lice. Historically, Caldas Department has reported a significant number of cases of murine typhus to the Colombian national health surveillance system, and consequent studies of flea-borne rickettsiosis identified the circulation of Rickettsia typhi and Rickettsia felis in multiple municipalities. Our aim was to genotype species of Rickettsia detected in fleas collected from domestic and wild mammals in Caldas.Flea samples were taken by convenience sampling from dogs, cats and wild mammals (rodents and marsupials) in 26 municipalities. Specimens were classified by current taxonomic keys and pooled for DNA extraction and molecular screening for Rickettsia spp. by PCR amplification of gltA, htrA and sca5 genes. Positive samples were genotyped by enzyme digestion (htrA) and sequencing.A total of 1388 flea samples were collected. Rickettsia DNA was amplified in 818 (gltA), 883 (htrA) and 424 (sca5) flea pools. Alignment analysis with available Rickettsia DNA sequences showed greater similarity with R. asembonensis (gltA) and with R. felis (sca5 and htrA). Restriction pattern was compatible with R. felis. R. typhi was not identified.The present study confirms the presence and high prevalence of R. asembonensis and R. felis in fleas from domestic and wild animals in different municipalities from Caldas Department.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الريكتسيات هي أمراض حيوانية المنشأ تسببها البكتيريا المسببة للأمراض من جنس الريكتسيا وتنتقل إلى الإنسان عن طريق ناقلات المفصليات مثل القراد والبراغيث والعث والقمل. من الناحية التاريخية، أبلغت إدارة كالداس عن عدد كبير من حالات التيفوس الفأري إلى نظام المراقبة الصحية الوطني الكولومبي، وحددت الدراسات اللاحقة لداء الريكتسيات الذي تنقله البراغيث دوران ريكتسيا التيفي وريكيتسيا فيليس في بلديات متعددة. كان هدفنا هو نمذجة أنواع الريكتسيا التي تم اكتشافها في البراغيث التي تم جمعها من الثدييات المنزلية والبرية في كالداس. تم أخذ عينات من البراغيث عن طريق أخذ عينات مريحة من الكلاب والقطط والثدييات البرية (القوارض والجرابيات) في 26 بلدية. تم تصنيف العينات بواسطة مفاتيح التصنيف الحالية وتجميعها لاستخراج الحمض النووي والفحص الجزيئي لـ Rickettsia spp. عن طريق تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لجينات gltA و htrA و sca5. تم تنميط العينات الإيجابية عن طريق هضم الإنزيم (htrA) والتسلسل. تم جمع ما مجموعه 1388 عينة من البراغيث. تم تضخيم الحمض النووي للريكيتسيا في برك البراغيث 818 (gltA) و 883 (htrA) و 424 (sca5). أظهر تحليل المحاذاة مع تسلسلات الحمض النووي Rickettsia المتاحة تشابهًا أكبر مع R. asembonensis (gltA) ومع R. felis (sca5 و htrA). كان نمط التقييد متوافقًا مع R. felis. لم يتم تحديد R. typhi. تؤكد هذه الدراسة وجود وارتفاع معدل انتشار R. asembonensis و R. felis في البراغيث من الحيوانات الأليفة والبرية في بلديات مختلفة من مقاطعة كالداس.

Translated Description (French)

Les rickettsioses sont des maladies zoonotiques causées par des bactéries pathogènes du genre Rickettsia et transmises à l'homme au moyen de vecteurs arthropodes tels que les tiques, les puces, les acariens et les poux. Historiquement, le département de Caldas a signalé un nombre important de cas de typhus murin au système national de surveillance de la santé colombien, et des études ultérieures sur la rickettsiose à puces ont identifié la circulation de Rickettsia typhi et Rickettsia felis dans plusieurs municipalités. Notre objectif était de génotyper les espèces de Rickettsia détectées chez les puces prélevées sur des mammifères domestiques et sauvages à Caldas. Des échantillons de puces ont été prélevés par échantillonnage de commodité sur des chiens, des chats et des mammifères sauvages (rongeurs et marsupiaux) dans 26 municipalités. Les échantillons ont été classés selon les clés taxonomiques actuelles et regroupés pour l'extraction de l'ADN et le dépistage moléculaire de Rickettsia spp. par amplification PCR des gènes gltA, htrA et sca5. Des échantillons positifs ont été génotypés par digestion enzymatique (htrA) et séquençage. Un total de 1388 échantillons de puces ont été prélevés. L'ADN de Rickettsia a été amplifié dans 818 pools de puces (gltA), 883 pools de puces (htrA) et 424 pools de puces (sca5). L'analyse de l'alignement avec les séquences d'ADN de Rickettsia disponibles a montré une plus grande similitude avec R. asembonensis (gltA) et avec R. felis (sca5 et htrA). Le modèle de restriction était compatible avec R. felis. R. typhi n'a pas été identifié. La présente étude confirme la présence et la prévalence élevée de R. asembonensis et R. felis chez les puces d'animaux domestiques et sauvages dans différentes municipalités du département de Caldas.

Translated Description (Spanish)

Las rickettsiosis son enfermedades zoonóticas causadas por bacterias patógenas del género Rickettsia y transmitidas al hombre por medio de vectores artrópodos como garrapatas, pulgas, ácaros y piojos. Históricamente, el Departamento de Caldas ha informado un número significativo de casos de tifus murino al sistema nacional de vigilancia de la salud de Colombia, y los estudios posteriores de rickettsiosis transmitida por pulgas identificaron la circulación de Rickettsia typhi y Rickettsia felis en múltiples municipios. Nuestro objetivo fue genotipar especies de Rickettsia detectadas en pulgas recolectadas de mamíferos domésticos y silvestres en Caldas. Se tomaron muestras de pulgas por muestreo de conveniencia de perros, gatos y mamíferos silvestres (roedores y marsupiales) en 26 municipios. Los especímenes se clasificaron según las claves taxonómicas actuales y se agruparon para la extracción de ADN y el cribado molecular de Rickettsia spp. mediante amplificación por PCR de los genes gltA, htrA y sca5. Las muestras positivas se genotipificaron mediante digestión enzimática (htrA) y secuenciación. Se recogieron un total de 1388 muestras de pulgas. El ADN de Rickettsia se amplificó en grupos de pulgas 818 (gltA), 883 (htrA) y 424 (sca5). El análisis de alineación con las secuencias de ADN de Rickettsia disponibles mostró una mayor similitud con R. asembonensis (gltA) y con R. felis (sca5 y htrA). El patrón de restricción era compatible con R. felis. No se identificó R. typhi.El presente estudio confirma la presencia y alta prevalencia de R. asembonensis y R. felis en pulgas de animales domésticos y silvestres en diferentes municipios del departamento de Caldas.

Files

2370.pdf

Files (250 Bytes)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:a996f9ee999e32785748b9ffd44fbbd1
250 Bytes
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
أنواع الريكتسيا التي تنقلها البراغيث في البراغيث، قسم كالداس، كولومبيا
Translated title (French)
Espèces de Rickettsia transmises par les puces dans les puces, département de Caldas, Colombie
Translated title (Spanish)
Especie de Rickettsia transmitida por pulgas en pulgas, departamento de Caldas, Colombia

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3101093076
DOI
10.3855/jidc.12524

Is supplement to
https://openalex.org/W3189652396 (Other)
https://openalex.org/W3101093076 (Other)
https://openalex.org/W3025026637 (Other)
https://openalex.org/W2991641610 (Other)
https://openalex.org/W2990222360 (Other)
https://openalex.org/W2748952813 (Other)
https://openalex.org/W2590642108 (Other)
https://openalex.org/W2365170305 (Other)
https://openalex.org/W2181681567 (Other)
https://openalex.org/W2029683637 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Colombia