DNA Barcoding Reveals the First Occurrence of Chrysanthemum Leafminer, <em>Chromatomyia syngenesiae</em> Hardy (Diptera: Agromyzidae) in India
- 1. Tamil Nadu Agricultural University
Description
Chrysanthemum is ravaged by numerous agromyzid leafminers. Of which, Chromatomyia syngenesiae Hardy (Diptera: Agromyzidae) is an invasive polyphagous leafminer which causes heavy infestation by mining the green leaf tissue and weakens the plant by reducing the photosynthetic activity that results in unmarketable flowers. Hitherto, no further information is available from India on C. syngenesiae apart from just new record. The present study was undertaken to assess the damage potential and to identify the leafminer species attacking chrysanthemum. In this view, Survey was conducted in chrysanthemum growing polyhouse of Nilgiris, Tamil Nadu, India during 2016 to 2018. The results indicated that the damage potential caused by C. syngenesiae was 75.40 % and 69.00 % in 2016 to 2017 and 2017 to 2018, respectively. The highest parasitization of Diglyphus isaea (Eulophidae: Hymenoptera) Walker on C. syngenesiae was recorded as 18.27 % and 20.80 % in the respective years. In addition, C. syngenesiae and its parasitoid were characterized at molecular level and species specific DNA barcodes using mitochondrial Cytochrome Oxidase I (mtCOI) were developed. BLAST searching of GenBank showed 100 per cent sequence similarity with C. syngenesiae and clearly indicated the presence of C. syngenesiae at Nilgiris, Tamil Nadu, India. The sequences obtained from the present study was submitted to NCBI database as the first entry for species level representation from India and the accession numbers (C. syngenesiae -MN969922 and D. isaea - MN525179) were obtained.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
يتم تدمير الأقحوان من قبل العديد من عمال مناجم أوراق agromyzid. منها، Chromatomyia syngenesiae Hardy (Diptera: Agromyzidae) هو عامل مناجم أوراق متعدد الأكلة غازي يتسبب في الإصابة الشديدة عن طريق تعدين أنسجة الأوراق الخضراء ويضعف النبات عن طريق تقليل نشاط التمثيل الضوئي الذي ينتج عنه أزهار غير قابلة للتسويق. حتى الآن، لا توجد معلومات إضافية متاحة من الهند حول C. syngenesiae باستثناء سجل جديد فقط. تم إجراء هذه الدراسة لتقييم الضرر المحتمل وتحديد أنواع مناجم الأوراق التي تهاجم الأقحوان. في هذا الرأي، تم إجراء مسح في الأقحوان المتنامي في نيلجيريس، تاميل نادو، الهند خلال الفترة من 2016 إلى 2018. أشارت النتائج إلى أن الضرر المحتمل الناجم عن C. syngenesiae كان 75.40 ٪ و 69.00 ٪ في 2016 إلى 2017 و 2017 إلى 2018، على التوالي. تم تسجيل أعلى نسبة تطفل لـ Diglyphus isaea (Eulophidae: Hymenoptera) ووكر على C. syngenesiae بنسبة 18.27 ٪ و 20.80 ٪ في السنوات المعنية. بالإضافة إلى ذلك، تم تمييز C. syngenesiae والطفيلي الخاص به على المستوى الجزيئي وتم تطوير باركود الحمض النووي الخاص بالأنواع باستخدام ميتوكوندريا سيتوكروم أوكسيديز I (mtCOI). أظهر البحث عن الانفجار في GenBank تشابهًا في التسلسل بنسبة 100 في المائة مع C. syngenesiae وأشار بوضوح إلى وجود C. syngenesiae في نيلجيريس، تاميل نادو، الهند. تم تقديم التسلسلات التي تم الحصول عليها من هذه الدراسة إلى قاعدة بيانات NCBI كأول مدخل لتمثيل مستوى الأنواع من الهند وتم الحصول على أرقام الانضمام (C. syngenesiae - MN969922 و D. isaea - MN525179).Translated Description (French)
Le chrysanthème est ravagé par de nombreux éleveurs d'agromyzides. Dont Chromatomyia syngenesiae Hardy (Diptera : Agromyzidae) est une mineuse polyphage invasive qui provoque une forte infestation en extrayant le tissu foliaire vert et affaiblit la plante en réduisant l'activité photosynthétique qui se traduit par des fleurs invendables. Jusqu'à présent, aucune autre information n'est disponible en provenance de l'Inde sur C. syngenesiae, à l'exception d'un nouveau record. La présente étude a été entreprise pour évaluer le potentiel de dommages et pour identifier les espèces de mineuses qui attaquent le chrysanthème. Dans cette optique, une enquête a été menée dans la polyhouse de culture de chrysanthèmes de Nilgiris, Tamil Nadu, Inde, entre 2016 et 2018. Les résultats ont indiqué que le potentiel de dommages causés par C. syngenesiae était de 75,40 % et 69,00 % en 2016-2017 et 2017-2018, respectivement. La parasitation la plus élevée de Diglyphus isaea (Eulophidae : Hymenoptera) Walker sur C. syngenesiae a été enregistrée à 18,27 % et 20,80 % au cours des années respectives. En outre, C. syngenesiae et son parasitoïde ont été caractérisés au niveau moléculaire et des codes-barres d'ADN spécifiques à l'espèce utilisant la cytochrome oxydase I mitochondriale (mtCOI) ont été développés. LA recherche par EXPLOSION de GenBank a montré une similitude de séquence de 100 % avec C. syngenesiae et a clairement indiqué la présence de C. syngenesiae à Nilgiris, Tamil Nadu, Inde. Les séquences obtenues à partir de la présente étude ont été soumises à la base de données NCBI en tant que première entrée pour la représentation au niveau des espèces de l'Inde et les numéros d'accession (C. syngenesiae -MN969922 et D. isaea - MN525179) ont été obtenus.Translated Description (Spanish)
El crisantemo es devastado por numerosos minadores de hojas de agromizida. De los cuales, Chromatomyia syngenesiae Hardy (Diptera: Agromyzidae) es un minador de hojas polífago invasivo que causa una fuerte infestación al extraer el tejido de la hoja verde y debilita la planta al reducir la actividad fotosintética que da como resultado flores no comercializables. Hasta ahora, no hay más información disponible de la India sobre C. syngenesiae aparte de un nuevo registro. El presente estudio se realizó para evaluar el potencial de daño e identificar las especies minadoras de hojas que atacan al crisantemo. En este punto de vista, la encuesta se realizó en el polígono de cultivo de crisantemos de Nilgiris, Tamil Nadu, India, durante 2016 a 2018. Los resultados indicaron que el potencial de daño causado por C. syngenesiae fue de 75.40 % y 69.00 % en 2016 a 2017 y 2017 a 2018, respectivamente. La parasitación más alta de Diglyphus isaea (Eulophidae: Hymenoptera) Walker en C. syngenesiae se registró como 18.27 % y 20.80 % en los años respectivos. Además, C. syngenesiae y su parasitoide se caracterizaron a nivel molecular y se desarrollaron códigos de barras de ADN específicos de la especie utilizando citocromo oxidasa I mitocondrial (mtCOI). LA BÚSQUEDA BLAST de GenBank mostró un 100 por ciento de similitud de secuencia con C. syngenesiae e indicó claramente la presencia de C. syngenesiae en Nilgiris, Tamil Nadu, India. Las secuencias obtenidas del presente estudio se enviaron a la base de datos NCBI como la primera entrada para la representación a nivel de especie de la India y se obtuvieron los números de acceso (C. syngenesiae -MN969922 y D. isaea - MN525179).Files
manuscript.pdf
Files
(380.7 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:41c13e59308b242a214d6439ffc97d1d
|
380.7 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- يكشف الترميز الشريطي للحمض النووي عن أول ظهور لنبات الأقحوان،< em> Chromatomyia syngenesiae</ em> Hardy (Diptera: Agromyzidae) في الهند
- Translated title (French)
- DNA Barcoding Reveals the First Occurrence of Chrysanthemum Leafminer, <em> ;Chromatomyia syngenesiae< ;/em> ; Hardy (Diptera : Agromyzidae) in India
- Translated title (Spanish)
- El código de barras de ADN revela la primera aparición del minador de hojas de crisantemo, < em> Chromatomyia syngenesiae</em> Hardy (Diptera: Agromyzidae) en la India
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4205558052
- DOI
- 10.3390/iece-10569