Published November 24, 2014 | Version v1
Publication Open

Comparative genomic analysis of Mycobacterium iranicum UM_TJL against representative mycobacterial species suggests its environmental origin

  • 1. University Malaya Medical Centre
  • 2. University of Malaya

Description

Abstract Mycobacterium iranicum is a newly reported mycobacterial species. We present the first comparative study of M. iranicum UM_TJL and other mycobacteria. We found M. iranicum to have a close genetic association with environmental mycobacteria infrequently associated with human infections. Nonetheless, UM_TJL is also equipped with many virulence genes (some of which appear to be the consequence of transduction-related gene transfer) that have been identified in established human pathogens. Taken all together, our data suggest that M. iranicum is an environmental bacterium adapted for pathogenicity in the human host. This comparative study provides important clues and forms the basis for future functional studies on this mycobacterium.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

المتفطرة الإيرانية هي نوع من البكتيريا الفطرية التي تم الإبلاغ عنها حديثًا. نقدم أول دراسة مقارنة لـ M. iranicum UM_TJL وغيرها من المتفطرات. وجدنا أن M. iranicum يرتبط ارتباطًا وراثيًا وثيقًا بالبكتيريا الفطرية البيئية التي نادراً ما ترتبط بالعدوى البشرية. ومع ذلك، فإن UM_TJL مجهز أيضًا بالعديد من جينات الفوعة (يبدو أن بعضها نتيجة لنقل الجينات المتعلقة بالتناقل) التي تم تحديدها في مسببات الأمراض البشرية الثابتة. تشير بياناتنا مجتمعة إلى أن M. iranicum هي بكتيريا بيئية متكيفة مع الإمراض في المضيف البشري. توفر هذه الدراسة المقارنة أدلة مهمة وتشكل الأساس للدراسات الوظيفية المستقبلية حول هذه المتفطرة.

Translated Description (French)

Résumé Mycobacterium iranicum est une espèce mycobactérienne nouvellement signalée. Nous présentons la première étude comparative de M. iranicum UM_TJL et d'autres mycobactéries. Nous avons constaté que M. iranicum avait une association génétique étroite avec des mycobactéries environnementales rarement associées à des infections humaines. Néanmoins, UM_TJL est également équipé de nombreux gènes de virulence (dont certains semblent être la conséquence d'un transfert de gène lié à la transduction) qui ont été identifiés chez des agents pathogènes humains établis. Dans l'ensemble, nos données suggèrent que M. iranicum est une bactérie environnementale adaptée à la pathogénicité chez l'hôte humain. Cette étude comparative fournit des indices importants et constitue la base de futures études fonctionnelles sur cette mycobactérie.

Translated Description (Spanish)

Resumen Mycobacterium iranicum es una especie micobacteriana recientemente reportada. Presentamos el primer estudio comparativo de M. iranicum UM_TJL y otras micobacterias. Encontramos que M. iranicum tiene una estrecha asociación genética con micobacterias ambientales infrecuentemente asociadas con infecciones humanas. No obstante, UM_TJL también está equipado con muchos genes de virulencia (algunos de los cuales parecen ser la consecuencia de la transferencia de genes relacionada con la transducción) que se han identificado en patógenos humanos establecidos. En conjunto, nuestros datos sugieren que M. iranicum es una bacteria ambiental adaptada para la patogenicidad en el huésped humano. Este estudio comparativo proporciona pistas importantes y constituye la base para futuros estudios funcionales sobre esta micobacteria.

Files

srep07169.pdf.pdf

Files (1.9 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:ffb0faa9da21ac92cae18fe2bb04074c
1.9 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
يشير التحليل الجيني المقارن للمتفطرة الإيرانية UM_TJL ضد الأنواع المتفطرة التمثيلية إلى أصلها البيئي
Translated title (French)
L'analyse génomique comparative de Mycobacterium iranicum UM_TJL par rapport à des espèces mycobactériennes représentatives suggère son origine environnementale
Translated title (Spanish)
El análisis genómico comparativo de Mycobacterium iranicum UM_TJL contra especies micobacterianas representativas sugiere su origen ambiental

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2085459011
DOI
10.1038/srep07169

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malaysia

References

  • https://openalex.org/W1511692770
  • https://openalex.org/W1553112231
  • https://openalex.org/W1826845577
  • https://openalex.org/W1986507368
  • https://openalex.org/W1990843049
  • https://openalex.org/W1994144563
  • https://openalex.org/W1995753988
  • https://openalex.org/W2004548026
  • https://openalex.org/W2014101418
  • https://openalex.org/W2017446249
  • https://openalex.org/W2018063523
  • https://openalex.org/W2024398218
  • https://openalex.org/W2031611770
  • https://openalex.org/W2034876099
  • https://openalex.org/W2037809088
  • https://openalex.org/W2045114886
  • https://openalex.org/W2051584259
  • https://openalex.org/W2052726906
  • https://openalex.org/W2057617333
  • https://openalex.org/W2065151455
  • https://openalex.org/W2072967720
  • https://openalex.org/W2095624846
  • https://openalex.org/W2101220662
  • https://openalex.org/W2121621283
  • https://openalex.org/W2121695290
  • https://openalex.org/W2122148522
  • https://openalex.org/W2129267752
  • https://openalex.org/W2129978006
  • https://openalex.org/W2132001120
  • https://openalex.org/W2134375163
  • https://openalex.org/W2138814691
  • https://openalex.org/W2139627484
  • https://openalex.org/W2140163059
  • https://openalex.org/W2153303660
  • https://openalex.org/W2158714788
  • https://openalex.org/W2160378127
  • https://openalex.org/W2161590682
  • https://openalex.org/W2163014180
  • https://openalex.org/W2169501784
  • https://openalex.org/W2171165139
  • https://openalex.org/W2171988145
  • https://openalex.org/W2416528027
  • https://openalex.org/W4254403024