Published March 23, 2022 | Version v1
Publication Open

Association of Vitamin D Gene Polymorphisms With HCV Infection Outcome

Creators

  • 1. Mansoura University
  • 2. Delta University for Science and Technology

Description

Background: Vitamin D derivatives and their receptor (VDR) are immune-response modulators in many diseases including malignancies, metabolic conditions, and infections. We hypothesized that one or more variants of VDR single nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with hepatocellular carcinoma (HCC) in hepatitis C virus (HCV) cirrhotic patients. Materials and Methods: A total of 861 subjects were recruited and classified as spontaneous viral clearance (SVC, n = 127), chronic hepatic cirrhosis (CHC, n = 392), and HCC (n = 342). Standard routine laboratory tests were performed and clinical features noted. All individuals were genotyped for seven SNPs spanning the VDR using real-time PCR. Results: Genotype frequencies of SNPs rs7970376, rs11568820, rs4516035, rs2228570 (Fok1), rs1544410 (Bsm-1), and rs731236 (Taq1), but not rs739837, were variously altered in CHC and HCC compared with SVC, and in HCC compared to CHC (all p < 0.001). The most powerful was rs7970376, which brought an OR (95% CI) of 7.14 (4.64-10.98) for HCC compared to SVC (p = 0.001). The carriage of the AGTAC haplotype of five SNPs were linked to CHC compared to SVC at OR 2.88 [95% CI 1.2-6.9] (p = 0.017) and with HCC compared to CHC at OR 1.54 [95% CI = 1.04-2.27 (p = 0.031). Conclusion: SNPs in VDR may have a potential role in the outcomes of patients with HCV infection. VDR SNPs; rs7970376, rs11568820, rs4516035, rs2228570 (Fok1), rs1544410 (Bsm-1), and rs731236 (Taq1) could be used as molecular markers to predict the risk of HCC.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

معلومات أساسية: مشتقات فيتامين (د) ومستقبلاتها (VDR) هي مُعدِلات للاستجابة المناعية في العديد من الأمراض بما في ذلك الأورام الخبيثة والحالات الأيضية والالتهابات. افترضنا أن واحدًا أو أكثر من متغيرات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) المرتبطة بسرطان الخلايا الكبدية (HCC) في مرضى تليف الكبد لفيروس الالتهاب الكبدي الوبائي (HCV). المواد والطرق: تم تجنيد ما مجموعه 861 شخصًا وتصنيفهم على أنهم تصفية فيروسية تلقائية (SVC، n = 127)، وتليف الكبد المزمن (CHC، n = 392)، و HCC (n = 342). تم إجراء الاختبارات المعملية الروتينية القياسية ولوحظت السمات السريرية. تم تنميط جميع الأفراد وراثيًا لسبعة SNPs تمتد عبر VDR باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي. النتائج: تم تغيير ترددات النمط الجيني لـ SNPs rs7970376 و rs11568820 و rs4516035 و rs2228570 (Fok1) و rs1544410 (Bsm -1) و rs731236 (Taq1)، ولكن ليس rs739837، بشكل مختلف في CHC و HCC مقارنة بـ SVC، وفي HCC مقارنة بـ CHC (الكل p < 0.001). كان الأكثر قوة هو rs7970376، الذي جلب OR (95 ٪ CI) من 7.14 (4.64-10.98) لـ HCC مقارنة بـ SVC (p = 0.001). تم ربط نقل النمط الفردي AGTAC لخمسة SNPs بـ CHC مقارنة بـ SVC عند OR 2.88 [95 ٪ CI 1.2-6.9] (p = 0.017) ومع HCC مقارنة بـ CHC عند OR 1.54 [95 ٪ CI = 1.04-2.27 (p = 0.031). الاستنتاج: قد يكون لـ SNPs في VDR دور محتمل في نتائج المرضى الذين يعانون من عدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي. يمكن استخدام VDR SNPs ؛ rs7970376، rs11568820، rs4516035، rs2228570 (Fok1)، rs1544410 (Bsm -1)، و rs731236 (Taq1) كعلامات جزيئية للتنبؤ بمخاطر HCC.

Translated Description (French)

Contexte : Les dérivés de la vitamine D et leur récepteur (VDR) sont des modulateurs de la réponse immunitaire dans de nombreuses maladies, notamment les tumeurs malignes, les affections métaboliques et les infections. Nous avons émis l'hypothèse qu'une ou plusieurs variantes des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) du VDR sont associées au carcinome hépatocellulaire (CHC) chez les patients cirrhotiques du virus de l'hépatite C (VHC). Matériels et méthodes : Un total de 861 sujets ont été recrutés et classés comme clairance virale spontanée (SVC, n = 127), cirrhose hépatique chronique (CHC, n = 392) et CHC (n = 342). Des tests de laboratoire de routine standard ont été effectués et des caractéristiques cliniques ont été notées. Tous les individus ont été génotypés pour sept SNP couvrant le VDR en utilisant la PCR en temps réel. Résultats : Les fréquences génotypiques des SNP rs7970376, rs11568820, rs4516035, rs2228570 (Fok1), rs1544410 (Bsm-1) et rs731236 (Taq1), mais pas rs739837, ont été diversement modifiées dans le CHC et le CHC par rapport au SVC, et dans le HCC par rapport au CHC (tous p < 0,001). Le plus puissant était rs7970376, qui a apporté un RC (IC à 95 %) de 7,14 (4,64-10,98) pour le CHC par rapport à la CVS (p = 0,001). Le portage de l'haplotype AGTAC de cinq SNP était lié au CHC par rapport au SVC à 2,88 [IC à 95 % 1,2-6,9] (p = 0,017) et au HCC par rapport au CHC à 1,54 [IC à 95 % = 1,04-2,27 (p = 0,031). Conclusion : les SNP dans le VDR peuvent avoir un rôle potentiel dans les résultats des patients infectés par le VHC. Les SNP VDR ; rs7970376, rs11568820, rs4516035, rs2228570 (Fok1), rs1544410 (Bsm-1) et rs731236 (Taq1) pourraient être utilisés comme marqueurs moléculaires pour prédire le risque de CHC.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes: Los derivados de la vitamina D y su receptor (VDR) son moduladores de la respuesta inmunitaria en muchas enfermedades, incluidas neoplasias malignas, afecciones metabólicas e infecciones. Planteamos la hipótesis de que una o más variantes de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) de VDR están asociadas con el carcinoma hepatocelular (CHC) en pacientes cirróticos con el virus de la hepatitis C (VHC). Materiales y métodos: Se reclutaron un total de 861 sujetos y se clasificaron como depuración viral espontánea (SVC, n = 127), cirrosis hepática crónica (CHC, n = 392) y CHC (n = 342). Se realizaron pruebas de laboratorio de rutina estándar y se anotaron las características clínicas. Todos los individuos fueron genotipados para siete SNP que abarcan el VDR utilizando PCR en tiempo real. Resultados: Las frecuencias genotípicas de los SNP rs7970376, rs11568820, rs4516035, rs2228570 (Fok1), rs1544410 (Bsm-1) y rs731236 (Taq1), pero no rs739837, se alteraron de diversas maneras en CHC y HCC en comparación con SVC, y en HCC en comparación con CHC (todos p < 0.001). El más potente fue rs7970376, que trajo un OR (IC del 95%) de 7.14 (4.64-10.98) para HCC en comparación con SVC (p = 0.001). El transporte del haplotipo AGTAC de cinco SNP se relacionó con CHC en comparación con SVC en OR 2.88 [IC 95% 1.2-6.9] (p = 0.017) y con HCC en comparación con CHC en OR 1.54 [IC 95% = 1.04-2.27 (p = 0.031). Conclusión: los SNP en VDR pueden tener un papel potencial en los resultados de los pacientes con infección por VHC. Los SNP de VDR; rs7970376, rs11568820, rs4516035, rs2228570 (Fok1), rs1544410 (Bsm-1) y rs731236 (Taq1) podrían usarse como marcadores moleculares para predecir el riesgo de CHC.

Files

pdf.pdf

Files (682.9 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:3932c8333e658615d5e24e2e03ef7d8c
682.9 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
ارتباط تعدد الأشكال الجينية لفيتامين (د) بنتيجة الإصابة بفيروس التهاب الكبد الوبائي سي
Translated title (French)
Association des polymorphismes du gène de la vitamine D avec les résultats de l'infection par le VHC
Translated title (Spanish)
Asociación de los polimorfismos génicos de la vitamina D con el resultado de la infección por VHC

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4280650277
DOI
10.3389/bjbs.2021.10237

Is supplement to
https://openalex.org/W4308058546 (Other)
https://openalex.org/W3030449887 (Other)
https://openalex.org/W3028879088 (Other)
https://openalex.org/W3024276532 (Other)
https://openalex.org/W2809093067 (Other)
https://openalex.org/W2766588635 (Other)
https://openalex.org/W2749843055 (Other)
https://openalex.org/W2351739771 (Other)
https://openalex.org/W2103207355 (Other)
https://openalex.org/W2008626862 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1588037850
  • https://openalex.org/W1978394408
  • https://openalex.org/W1978748811
  • https://openalex.org/W1979658848
  • https://openalex.org/W1993095463
  • https://openalex.org/W1997168359
  • https://openalex.org/W2015624008
  • https://openalex.org/W2016420388
  • https://openalex.org/W2024518734
  • https://openalex.org/W2045671327
  • https://openalex.org/W2048252956
  • https://openalex.org/W2061743943
  • https://openalex.org/W2076353670
  • https://openalex.org/W2082928414
  • https://openalex.org/W2085572587
  • https://openalex.org/W2118068422
  • https://openalex.org/W2131037984
  • https://openalex.org/W2141474556
  • https://openalex.org/W2167660203
  • https://openalex.org/W2277004004
  • https://openalex.org/W2292840950
  • https://openalex.org/W2534504284
  • https://openalex.org/W2570832918
  • https://openalex.org/W2585369299
  • https://openalex.org/W2734899823
  • https://openalex.org/W2775769278
  • https://openalex.org/W2893576832
  • https://openalex.org/W2897712900
  • https://openalex.org/W2926856379
  • https://openalex.org/W2980462258
  • https://openalex.org/W2987159879
  • https://openalex.org/W2993674593
  • https://openalex.org/W2995175017
  • https://openalex.org/W3004916415
  • https://openalex.org/W3087429147
  • https://openalex.org/W3103313234
  • https://openalex.org/W3107498091
  • https://openalex.org/W3158432292
  • https://openalex.org/W6672571