Prevalence and associated risk factors of peste des petits ruminants in selected districts of the northern border region of Pakistan
- 1. Southwest Minzu University
- 2. Allama Iqbal Open University
- 3. Lanzhou Veterinary Research Institute
Description
Abstract Background Peste des Petits Ruminants (PPR) is a world organization for animal health (WOAH) notifiable and economically important transboundary, highly communicable viral disease of small ruminants. PPR virus (PPRV) belongs to the genus Morbillivirus of the family Paramyxoviridae . Aim The present cross-sectional epidemiological investigation was accomplished to estimate the apparent prevalence and identify the risk factors linked with peste des petits ruminants (PPR) in the previously neglected northern border regions of Pakistan. Method A total of 1300 samples (serum = 328; swabs = 972) from 150 flocks/herds were compiled from sheep ( n = 324), goats ( n = 328), cattle ( n = 324), and buffaloes ( n = 324) during 2020–2021 and tested using ELISA for detection of viral antibody in sera or antigen in swabs. Results An overall apparent prevalence of 38.7% (504 samples) and an estimated true prevalence (calculated by the Rogan and Gladen estimator) of 41.0% (95% CI, 38.0–44 were recorded in the target regions. The highest apparent prevalence of 53.4% (85 samples) and the true prevalence of 57.0%, 95% Confidence Interval (CI) were documented in the Gilgit district and the lowest apparent prevalence of 53 (25.1%) and the true prevalence of 26.0%, 95% Confidence Interval (CI), 19.0–33.0) was reported in the Swat district. A questionnaire was designed to collect data about associated risk factors that were put into a univariable logistic regression to decrease the non-essential assumed risk dynamics with a P-value of 0.25. ArcGIS, 10.8.1 was used to design hotspot maps and MedCalc's online statistical software was used to calculate Odds Ratio (OR). Some of the risk factors significantly different ( P < 0.05) in the multivariable logistic regression were flock/herd size, farming methods, nomadic animal movement, and outbreaks of PPR. The odds of large-sized flocks/herds were 1.7 (OR = 1.79; 95% Confidence Interval (CI) = 0.034–91.80%) times more likely to be positive than small-sized. The odds of transhumance and nomadic systems were 1.1 (OR = 1.15; 95% Confidence Interval (CI) = 0.022–58.64%) and 1.0 (OR = 1.02; 95% Confidence Interval (CI) = 0.020–51.97%) times more associated to be positive than sedentary and mixed farming systems, respectively. The odds of nomadic animal movement in the area was 0.7 (OR = 0.57; 95% Confidence Interval (CI) = 0.014–38.06%) times more associated to be positive than in areas where no nomadic movement was observed. In addition, the odds of an outbreak of PPR in the area were 1.0 (OR = 1.00; 95% Confidence Interval (CI) = 0.018–46.73%) times more associated to be positive than in areas where no outbreak of PPR was observed. Conclusions It was concluded that many northern regions considered endemic for PPR, large and small ruminants are kept and reared together making numerous chances for virus transmission dynamic, so a big threats of disease spread exist in the region. The results of the present study would contribute to the global goal of controlling and eradicating PPR by 2030.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
نبذة مختصرة مرض المجترات الصغيرة (PPR) هو منظمة عالمية لصحة الحيوان (WOAH) يمكن الإبلاغ عنه ومهم اقتصاديًا، وهو مرض فيروسي شديد العدوى وعابر للحدود يصيب المجترات الصغيرة. ينتمي فيروس طاعون المجترات الصغيرة (PPRV) إلى جنس Morbillivirus من عائلة Paramyxoviridae . الهدف تم إجراء التحقيق الوبائي المستعرض الحالي لتقدير الانتشار الظاهر وتحديد عوامل الخطر المرتبطة بطاعون المجترات الصغيرة في المناطق الحدودية الشمالية المهملة سابقًا في باكستان. الطريقة تم تجميع ما مجموعه 1300 عينة (المصل = 328 ؛ المسحات = 972) من 150 قطيعًا/قطيعًا من الأغنام ( العدد = 324) والماعز ( العدد = 328) والماشية ( العدد = 324) والجاموس ( العدد = 324) خلال الفترة 2020–2021 وتم اختبارها باستخدام ELISA للكشف عن الأجسام المضادة الفيروسية في الأمصال أو المستضد في المسحات. النتائج تم تسجيل انتشار ظاهري عام بنسبة 38.7 ٪ (504 عينة) وانتشار حقيقي تقديري (تم حسابه بواسطة مقدر روغان وغلادين) بنسبة 41.0 ٪ (95 ٪ CI، 38.0-44 في المناطق المستهدفة. تم توثيق أعلى معدل انتشار ظاهر بنسبة 53.4 ٪ (85 عينة) والانتشار الحقيقي بنسبة 57.0 ٪، وفاصل الثقة بنسبة 95 ٪ (CI) في منطقة جيلجيت وأدنى معدل انتشار ظاهر بنسبة 53 (25.1 ٪) وتم الإبلاغ عن الانتشار الحقيقي بنسبة 26.0 ٪، وفاصل الثقة بنسبة 95 ٪ (CI)، و 19.0-33.0) في منطقة سوات. تم تصميم استبيان لجمع بيانات حول عوامل الخطر المرتبطة التي تم وضعها في انحدار لوجستي أحادي المتغير لتقليل ديناميكيات المخاطر المفترضة غير الأساسية بقيمة P تبلغ 0.25. تم استخدام ArcGIS، 10.8.1 لتصميم خرائط النقاط الساخنة وتم استخدام برنامج MedCalc الإحصائي عبر الإنترنت لحساب نسبة الاحتمالات (OR). كانت بعض عوامل الخطر المختلفة بشكل كبير ( P < 0.05) في الانحدار اللوجستي متعدد المتغيرات هي حجم القطيع/القطيع، وطرق الزراعة، وحركة الحيوانات البدوية، وتفشي طاعون المجترات الصغيرة. كانت احتمالات القطعان/القطعان كبيرة الحجم 1.7 (OR = 1.79 ؛ 95 ٪ فترة الثقة (CI) = 0.034-91.80 ٪) أكثر عرضة لتكون إيجابية من صغيرة الحجم. كانت احتمالات الانتقال والأنظمة البدوية 1.1 (OR = 1.15 ؛ 95 ٪ فترة الثقة (CI) = 0.022-58.64 ٪) و 1.0 (OR = 1.02 ؛ 95 ٪ فترة الثقة (CI) = 0.020-51.97 ٪) أكثر ارتباطًا بأنها إيجابية من أنظمة الزراعة المستقرة والمختلطة، على التوالي. كانت احتمالات حركة الحيوانات البدوية في المنطقة 0.7 (OR = 0.57 ؛ 95 ٪ فاصل الثقة (CI) = 0.014-38.06 ٪) أكثر ارتباطًا بأنها إيجابية من المناطق التي لم تلاحظ فيها حركة بدوية. بالإضافة إلى ذلك، كانت احتمالات تفشي طاعون المجترات الصغيرة في المنطقة 1.0 (OR = 1.00 ؛ 95 ٪ فترة الثقة (CI) = 0.018-46.73 ٪) أكثر ارتباطًا بأنها إيجابية مما كانت عليه في المناطق التي لم يلاحظ فيها تفشي طاعون المجترات الصغيرة. تم التوصل إلى استنتاج مفاده أن العديد من المناطق الشمالية التي تعتبر متوطنة لمرض طاعون المجترات الصغيرة، يتم الاحتفاظ بالمجترات الكبيرة والصغيرة وتربيتها معًا مما يجعل العديد من فرص انتقال الفيروس ديناميكية، لذلك توجد تهديدات كبيرة بانتشار المرض في المنطقة. ستساهم نتائج هذه الدراسة في تحقيق الهدف العالمي المتمثل في السيطرة على طاعون المجترات الصغيرة والقضاء عليه بحلول عام 2030.Translated Description (French)
Résumé Contexte Peste des Petits Ruminants (PPR) est une organisation mondiale pour la santé animale (WOAH) à déclaration obligatoire et économiquement importante, maladie virale transfrontière hautement transmissible des petits ruminants. Le virus PPR (PPRV) appartient au genre Morbillivirus de la famille des Paramyxoviridae . Objectif La présente enquête épidémiologique transversale a été réalisée pour estimer la prévalence apparente et identifier les facteurs de risque liés à la peste des petits ruminants (PPR) dans les régions frontalières du nord du Pakistan précédemment négligées. Méthode Un total de 1 300 échantillons (sérum = 328 ; écouvillons = 972) provenant de 150 troupeaux ont été compilés à partir de moutons ( n = 324), de chèvres ( n = 328), de bovins ( n = 324) et de buffles ( n = 324) au cours de la période 2020–2021 et testés à l'aide d'ELISA pour la détection d'anticorps viraux dans les sérums ou d'antigènes dans les écouvillons. Résultats Une prévalence apparente globale de 38,7 % (504 échantillons) et une prévalence réelle estimée (calculée par l'estimateur de Rogan et Gladen) de 41,0 % (IC à 95 %, 38,0-44) ont été enregistrées dans les régions cibles. La prévalence apparente la plus élevée de 53,4 % (85 échantillons) et la prévalence réelle de 57,0 %, intervalle de confiance (IC) à 95 % ont été documentées dans le district de Gilgit et la prévalence apparente la plus faible de 53 (25,1 %) et la prévalence réelle de 26,0 %, intervalle de confiance (IC) à 95 %, 19,0-33,0) a été signalée dans le district de Swat. Un questionnaire a été conçu pour collecter des données sur les facteurs de risque associés qui ont été soumis à une régression logistique univariable afin de réduire la dynamique des risques supposés non essentiels avec une valeur P de 0,25. ArcGIS, 10.8.1 a été utilisé pour concevoir des cartes de points chauds et le logiciel statistique en ligne de MedCalc a été utilisé pour calculer le Odds Ratio (OR). Certains des facteurs de risque significativement différents ( P < 0,05) dans la régression logistique multivariable étaient la taille du troupeau/troupeau, les méthodes d'élevage, les mouvements d'animaux nomades et les épidémies de PPR. Les probabilités de troupeaux de grande taille étaient 1,7 fois (RC = 1,79 ; intervalle de confiance (IC) à 95 % = 0,034-91,80 %) plus susceptibles d'être positifs que les troupeaux de petite taille. Les probabilités de transhumance et de systèmes nomades étaient 1,1 (RC = 1,15 ; intervalle de confiance (IC) à 95 % = 0,022-58,64 %) et 1,0 (RC = 1,02 ; intervalle de confiance (IC) à 95 % = 0,020-51,97 %) fois plus associées pour être positives que les systèmes d'agriculture sédentaire et mixte, respectivement. La probabilité de mouvements d'animaux nomades dans la région était de 0,7 (RC = 0,57 ; intervalle de confiance (IC) à 95 % = 0,014-38,06 %) fois plus élevée que dans les régions où aucun mouvement nomade n'a été observé. De plus, la probabilité d'une éclosion de PPR dans la région était de 1,0 (RC = 1,00 ; intervalle de confiance (IC) à 95 % = 0,018-46,73 %) fois plus élevée que dans les régions où aucune éclosion de PPR n'a été observée. Conclusions Il a été conclu que de nombreuses régions du nord considérées comme endémiques pour la PPR, les grands et les petits ruminants sont gardés et élevés ensemble, ce qui crée de nombreuses chances de transmission dynamique du virus, de sorte qu'il existe de grandes menaces de propagation de la maladie dans la région. Les résultats de la présente étude contribueraient à l'objectif mondial de contrôle et d'éradication de la PPR d'ici 2030.Translated Description (Spanish)
Resumen Antecedentes La Peste des Petits Ruminants (PPR) es una organización mundial para la salud animal (WOAH) de notificación obligatoria y de importancia económica transfronteriza, enfermedad viral altamente transmisible de los pequeños rumiantes. El virus PPR (PPRV) pertenece al género Morbillivirus de la familia Paramyxoviridae . Objetivo La presente investigación epidemiológica transversal se realizó para estimar la prevalencia aparente e identificar los factores de riesgo relacionados con la peste de los pequeños rumiantes (PPR) en las regiones fronterizas del norte de Pakistán previamente descuidadas. Método Se recopilaron un total de 1300 muestras (suero = 328; hisopos = 972) de 150 rebaños/manadas de ovejas ( n = 324), cabras ( n = 328), ganado ( n = 324) y búfalos ( n = 324) durante 2020–2021 y se probaron utilizando ELISA para la detección de anticuerpos virales en sueros o antígenos en hisopos. Resultados Se registró una prevalencia aparente general del 38,7% (504 muestras) y una prevalencia real estimada (calculada por el estimador de Rogan y Gladen) del 41,0% (IC del 95%, 38,0-44 en las regiones objetivo. La prevalencia aparente más alta de 53.4% (85 muestras) y la prevalencia real de 57.0%, 95% Intervalo de Confianza (IC) se documentaron en el distrito de Gilgit y la prevalencia aparente más baja de 53 (25.1%) y la prevalencia real de 26.0%, 95% Intervalo de Confianza (IC), 19.0–33.0) se informó en el distrito de Swat. Se diseñó un cuestionario para recopilar datos sobre los factores de riesgo asociados que se pusieron en una regresión logística univariable para disminuir la dinámica de riesgo asumida no esencial con un valor P de 0.25. ArcGIS, 10.8.1 se utilizó para diseñar mapas de puntos de acceso y el software estadístico en línea de MedCalc se utilizó para calcular el Odds Ratio (OR). Algunos de los factores de riesgo significativamente diferentes ( P < 0.05) en la regresión logística multivariable fueron el tamaño del rebaño/manada, los métodos de cría, el movimiento de animales nómadas y los brotes de PPR. Las probabilidades de rebaños/manadas de gran tamaño fueron 1.7 (OR = 1.79; Intervalo de confianza (IC) del 95% = 0.034-91.80%) veces más probabilidades de ser positivas que las de tamaño pequeño. Las probabilidades de trashumancia y sistemas nómadas fueron 1.1 (OR = 1.15; Intervalo de confianza (IC) del 95% = 0.022–58.64%) y 1.0 (OR = 1.02; Intervalo de confianza (IC) del 95% = 0.020–51.97%) veces más asociadas a ser positivos que los sistemas agrícolas sedentarios y mixtos, respectivamente. Las probabilidades de movimiento de animales nómadas en el área fueron 0.7 (OR = 0.57; Intervalo de confianza (IC) del 95% = 0.014-38.06%) veces más asociadas a ser positivas que en áreas donde no se observó movimiento nómada. Además, las probabilidades de un brote de PPR en el área fueron 1.0 (OR = 1.00; Intervalo de confianza (IC) del 95% = 0.018-46.73%) veces más asociadas a ser positivas que en las áreas donde no se observó ningún brote de PPR. Conclusiones Se concluyó que muchas regiones del norte consideradas endémicas para la PPR, los rumiantes grandes y pequeños se mantienen y crían juntos, lo que hace que haya numerosas posibilidades de transmisión dinámica del virus, por lo que existen grandes amenazas de propagación de enfermedades en la región. Los resultados del presente estudio contribuirían al objetivo global de controlar y erradicar la PPR para 2030.Files
s12917-024-04033-8.pdf
Files
(1.9 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:e418ebb117e0865f5681e499d8442fda
|
1.9 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- انتشار وباء المجترات الصغيرة وعوامل الخطر المرتبطة به في مناطق مختارة من منطقة الحدود الشمالية لباكستان
- Translated title (French)
- Prévalence et facteurs de risque associés de la peste des petits ruminants dans certains districts de la région frontalière nord du Pakistan
- Translated title (Spanish)
- Prevalencia y factores de riesgo asociados de la peste de los pequeños rumiantes en distritos seleccionados de la región fronteriza norte de Pakistán
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4398782616
- DOI
- 10.1186/s12917-024-04033-8
References
- https://openalex.org/W1499069114
- https://openalex.org/W1940591976
- https://openalex.org/W1988603753
- https://openalex.org/W1992868448
- https://openalex.org/W1996213870
- https://openalex.org/W2026126538
- https://openalex.org/W2027495138
- https://openalex.org/W2058475957
- https://openalex.org/W2095414481
- https://openalex.org/W2101153087
- https://openalex.org/W2183578682
- https://openalex.org/W2271596670
- https://openalex.org/W2473294541
- https://openalex.org/W2539793491
- https://openalex.org/W2743581979
- https://openalex.org/W2803412611
- https://openalex.org/W2946933504
- https://openalex.org/W2984262149
- https://openalex.org/W3035444822
- https://openalex.org/W3086999586
- https://openalex.org/W3199277769
- https://openalex.org/W4205950720
- https://openalex.org/W4240316425
- https://openalex.org/W4286702834