Identification of a novel linear B-cell epitope using a monoclonal antibody against the carboxy terminus of the canine distemper virus nucleoprotein and sequence analysis of the identified epitope in different CDV isolates
Creators
- 1. Institute of Special Animal and Plant Sciences
- 2. Chinese Academy of Agricultural Sciences
- 3. Jilin University
Description
The Nucleoprotein (NP) is the most abundant and highly immunogenic protein in canine distemper virus (CDV), playing an important role in CDV viral replication and assembly. In this study, a specific monoclonal antibody, named C8, was produced against the NP protein C terminal (amino acids 401–523). A linear N protein epitope was identified by subjecting a series of partially overlapping synthesized peptides to enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) analysis.The results indicated that 444GDKYPIHFNDER455 was the minimal linear epitope that could be recognized by mAb C8. Sequence alignments demonstrated that this linear epitope is less conserved among three CDV genotypes. We next analyzed the level of conservation of the defined epitope in19 Chinese CDV clinical isolates, and it has one site variation in amino acid among these CDV isolations. 2 isolates have the amino acid mutations F451L, while one has P448Ssubstitution.Phylogenetic analysis showed the two isolates with F451Lsubstitution had a closer relationship in a virulent strain ZJ-7, so the epitope may be a significant tag associated with virus virulence. This collection of mAb along with defined linear epitope may provide useful reagents for investigations of NP protein function and the development of CDV specific diagnostics.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
البروتين النووي (NP) هو البروتين الأكثر وفرة ومولدًا للمناعة في فيروس ديستيمبير للكلاب (CDV)، ويلعب دورًا مهمًا في التكاثر والتجمع الفيروسي لفيروس سي دي في. في هذه الدراسة، تم إنتاج جسم مضاد أحادي النسيلة محدد، يسمى C8، ضد طرف البروتين NP C (الأحماض الأمينية 401–523). تم تحديد حاتمة بروتينية خطية من خلال إخضاع سلسلة من الببتيدات المركبة المتداخلة جزئيًا لتحليل مقايسة الامتصاص المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA). أشارت النتائج إلى أن 444GDKYPIHFNDER455 كان الحد الأدنى من الحاتمة الخطية التي يمكن التعرف عليها بواسطة MAB C8. أظهرت محاذاة التسلسل أن هذه الحاتمة الخطية أقل حفظًا بين ثلاثة أنماط جينية لفيروس سي دي. قمنا بعد ذلك بتحليل مستوى الحفاظ على الحاتمة المحددة في 19 عزلات سريرية صينية لفيروس الورم الحليمي المزمن، ولها اختلاف موقع واحد في الأحماض الأمينية بين عزلات فيروس الورم الحليمي المزمن هذه. 2 تحتوي العزلات على طفرات الأحماض الأمينية F451L، بينما يحتوي أحدها على استبدال P448S. أظهر التحليل التطوري أن المعزولين مع استبدال F451L لهما علاقة أوثق في سلالة خبيثة ZJ -7، لذلك قد تكون الحاتمة علامة مهمة مرتبطة بالفيروس الفيروسي. قد توفر هذه المجموعة من MAB جنبًا إلى جنب مع حاتمة خطية محددة كواشف مفيدة لفحص وظيفة بروتين NP وتطوير تشخيصات محددة لـ CDV.Translated Description (French)
La nucléoprotéine (NP) est la protéine la plus abondante et hautement immunogène du virus de la maladie de Carré (CDV) canin, jouant un rôle important dans la réplication et l'assemblage du virus CDV. Dans cette étude, un anticorps monoclonal spécifique, nommé C8, a été produit contre la protéine C terminale NP (acides aminés 401–523). Un épitope linéaire de la protéine N a été identifié en soumettant une série de peptides synthétisés se chevauchant partiellement à une analyse ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay). Les résultats ont indiqué que 444GDKYPIHFNDER455 était l'épitope linéaire minimal qui pouvait être reconnu par le mAb C8. Les alignements de séquences ont démontré que cet épitope linéaire est moins conservé parmi trois génotypes de CDV. Nous avons ensuite analysé le niveau de conservation de l'épitope défini dans 19 isolats cliniques de CDV chinois, et il a une variation de site dans les acides aminés parmi ces isolats de CDV. 2 isolats ont les mutations d'acides aminés F451L, tandis que l'un a la substitution P448S. L'analyse phylogénétique a montré que les deux isolats avec la substitution F451L avaient une relation plus étroite dans une souche virulente ZJ-7, de sorte que l'épitope peut être une étiquette significative associée à la virulence du virus. Cette collection de mAb ainsi que l'épitope linéaire défini peuvent fournir des réactifs utiles pour les investigations de la fonction de la protéine NP et le développement de diagnostics spécifiques du CDV.Translated Description (Spanish)
La nucleoproteína (NP) es la proteína más abundante y altamente inmunogénica en el virus del moquillo canino (CDV), desempeñando un papel importante en la replicación y ensamblaje viral del CDV. En este estudio, se produjo un anticuerpo monoclonal específico, denominado C8, contra la proteína NP C terminal (aminoácidos 401–523). Se identificó un epítopo de proteína N lineal sometiendo una serie de péptidos sintetizados parcialmente superpuestos a un análisis de ensayo de inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA). Los resultados indicaron que 444GDKYPIHFNDER455 era el epítopo lineal mínimo que podía ser reconocido por el mAb C8. Los alineamientos de secuencias demostraron que este epítopo lineal está menos conservado entre tres genotipos de CDV. A continuación, analizamos el nivel de conservación del epítopo definido en 19 aislados clínicos de CDV chinos, y tiene una variación de sitio en aminoácidos entre estos aislados de CDV. 2 aislados tienen las mutaciones de aminoácidos F451L, mientras que uno tiene sustitución P448S. El análisis filogenético mostró que los dos aislados con sustitución F451L tenían una relación más estrecha en una cepa virulenta ZJ-7, por lo que el epítopo puede ser una etiqueta significativa asociada con la virulencia del virus. Esta colección de mAb junto con el epítopo lineal definido puede proporcionar reactivos útiles para las investigaciones de la función de la proteína NP y el desarrollo de diagnósticos específicos de CDV.Files
s12985-017-0858-6.pdf
Files
(1.3 MB)
Name | Size | Download all |
---|---|---|
md5:93eae37b6b22befb60a42aa3f4ca75a8
|
1.3 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تحديد حاتمة الخلية البائية الخطية الجديدة باستخدام جسم مضاد أحادي النسيلة ضد الطرف الكربوكسي للبروتين النووي لفيروس تمزق الكلاب وتحليل تسلسل الحاتمة المحددة في عزلات CDV المختلفة
- Translated title (French)
- Identification d'un nouvel épitope linéaire de lymphocytes B à l'aide d'un anticorps monoclonal contre la terminaison carboxy de la nucléoprotéine du virus de la maladie de Carré canine et analyse de séquence de l'épitope identifié dans différents isolats de CDV
- Translated title (Spanish)
- Identificación de un nuevo epítopo de células B lineales utilizando un anticuerpo monoclonal contra el extremo carboxilo de la nucleoproteína del virus del moquillo canino y análisis de la secuencia del epítopo identificado en diferentes aislados de CDV
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2759411725
- DOI
- 10.1186/s12985-017-0858-6
References
- https://openalex.org/W1851354563
- https://openalex.org/W1975759605
- https://openalex.org/W1977876916
- https://openalex.org/W1987134040
- https://openalex.org/W2014398332
- https://openalex.org/W2044065149
- https://openalex.org/W2059427803
- https://openalex.org/W2060182031
- https://openalex.org/W2061815804
- https://openalex.org/W2102603770
- https://openalex.org/W2111214358
- https://openalex.org/W2115297471
- https://openalex.org/W2119874688
- https://openalex.org/W2122101032
- https://openalex.org/W2146955857
- https://openalex.org/W2155201844
- https://openalex.org/W3152248238