Published February 1, 2024
| Version v1
Publication
Draft genome sequence data of the endophytic actinobacterium Streptomyces justiciae WPN32, a potential bioactive compounds producer
Creators
- 1. Chulabhorn Graduate Institute
- 2. Suranaree University of Technology
Description
Streptomyces justiciae WPN32 is an endophytic actinobacterium isolated from the rhizosphere of turmeric field soil at the Botanical Garden of Suranaree University of Technology (Nakhon Ratchasima Province, Thailand). Here we present the draft genome sequence of S. justiciae WPN32. It was sequenced on the Illumina NextSeq 550 sequencer. The draft genome consisted of 123 contigs with a total size of 9,832,147 base pairs, an N50 of 237,572 base pairs and a GC content of 70.87%. The dDDH between WPN32 and Streptomyces justiciae 3R004T was 80.1%, identifying the strain as Streptomyces justiciae. The data presented here may aid microbial taxonomy, comparative genomics and identification of gene clusters associated with the synthesis of bioactive compounds. The draft genome sequence data has been deposited at NCBI under Bioproject accession number PRJNA680432.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
Streptomyces justiciae WPN32 هي بكتيريا شعاعية باطنية معزولة عن جذمور تربة حقل الكركم في الحديقة النباتية لجامعة سوراناري للتكنولوجيا (مقاطعة ناخون راتشاسيما، تايلاند). نقدم هنا مسودة تسلسل الجينوم لـ S. justiciae WPN32. تم تسلسلها على تسلسل Illumina NextSeq 550. تألف مشروع الجينوم من 123 زوجًا متجاورًا بحجم إجمالي قدره 9,832,147 زوجًا قاعديًا، و N50 من 237,572 زوجًا قاعديًا ومحتوى GC بنسبة 70.87 ٪. كان dDH بين WPN32 و Streptomyces justiciae 3R004T 80.1 ٪، مما حدد السلالة على أنها Streptomyces justiciae. قد تساعد البيانات المقدمة هنا في التصنيف الميكروبي وعلم الجينوم المقارن وتحديد مجموعات الجينات المرتبطة بتوليف المركبات النشطة بيولوجيًا. تم إيداع مسودة بيانات تسلسل الجينوم في NCBI تحت رقم انضمام المشروع الحيوي PRJNA680432.Translated Description (French)
Streptomyces justiciae WPN32 est une actinobactérie endophyte isolée de la rhizosphère du sol des champs de curcuma au Jardin botanique de l'Université de technologie de Suranaree (province de Nakhon Ratchasima, Thaïlande). Nous présentons ici le projet de séquence génomique de S. justiciae WPN32. Il a été séquencé sur le séquenceur Illumina NextSeq 550. Le projet de génome était composé de 123 contigs avec une taille totale de 9 832 147 paires de bases, un N50 de 237 572 paires de bases et une teneur en GC de 70,87 %. Le dDDH entre WPN32 et Streptomyces justiciae 3R004T était de 80,1%, identifiant la souche comme Streptomyces justiciae. Les données présentées ici peuvent aider à la taxonomie microbienne, à la génomique comparative et à l'identification de groupes de gènes associés à la synthèse de composés bioactifs. Le projet de données de séquence génomique a été déposé au NCBI sous le numéro d'accès au Bioproject PRJNA680432.Translated Description (Spanish)
Streptomyces justiciae WPN32 es una actinobacteria endofítica aislada de la rizosfera del suelo del campo de cúrcuma en el Jardín Botánico de la Universidad Tecnológica de Suranaree (Provincia de Nakhon Ratchasima, Tailandia). Aquí presentamos el borrador de la secuencia del genoma de S. justiciae WPN32. Se secuenció en el secuenciador Illumina NextSeq 550. El borrador del genoma consistió en 123 cóntigos con un tamaño total de 9,832,147 pares de bases, un N50 de 237,572 pares de bases y un contenido de GC de 70.87%. El dDDH entre WPN32 y Streptomyces justiciae 3R004T fue del 80,1%, identificando la cepa como Streptomyces justiciae. Los datos presentados aquí pueden ayudar a la taxonomía microbiana, la genómica comparativa y la identificación de grupos de genes asociados con la síntesis de compuestos bioactivos. El borrador de los datos de la secuencia del genoma se ha depositado en el NCBI con el número de acceso de Bioproject PRJNA680432.Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- مسودة بيانات تسلسل الجينوم للبكتيريا الشعاعية الداخلية Streptomyces justiciae WPN32، وهي منتج محتمل للمركبات النشطة بيولوجيًا
- Translated title (French)
- Projet de données de séquence génomique de l'actinobactérie endophytique Streptomyces justiciae WPN32, un producteur potentiel de composés bioactifs
- Translated title (Spanish)
- Borrador de datos de la secuencia del genoma de la actinobacteria endofítica Streptomyces justiciae WPN32, un posible productor de compuestos bioactivos
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4389010924
- DOI
- 10.1016/j.dib.2023.109844
References
- https://openalex.org/W1518954201
- https://openalex.org/W2112364185
- https://openalex.org/W2143263718
- https://openalex.org/W2470052926
- https://openalex.org/W2520977336
- https://openalex.org/W2598066557
- https://openalex.org/W2808352813
- https://openalex.org/W2908678317
- https://openalex.org/W2946204549
- https://openalex.org/W2952167528
- https://openalex.org/W3202947517
- https://openalex.org/W4206653523
- https://openalex.org/W4368358469