Published August 1, 2018 | Version v1
Publication Open

Phylogenetic relationships within the Opisthorchis viverrini species complex with specific analysis of O. viverrini sensu lato from Sakon Nakhon, Thailand by mitochondrial and nuclear DNA sequencing

Creators

  • 1. Khon Kaen University
  • 2. Prince of Songkla University
  • 3. Natural History Museum
  • 4. London Centre for Neglected Tropical Disease Research
  • 5. Imperial College London
  • 6. Royal Veterinary College
  • 7. University of London
  • 8. Mahasarakham University
  • 9. Wellcome Centre for Molecular Parasitology
  • 10. University of Glasgow
  • 11. Karlsruhe Institute of Technology

Description

The liver fluke Opisthorchis viverrini sensu lato causes serious public-health problems in Northeast Thailand and Southeast Asian countries. A hypothesis has been proposed that O. viverrini represents a species complex with varying levels of genetic differentiation in Thailand and Lao PDR. This study aimed to clarify whether O. viverrini populations can be genetically divided into separate taxa. We collected O. viverrini s.l. from eight different locations in Lao PDR and Thailand. The results of nad1, cox1, CF-int6, Pm-int9, ITS2 and 28S rDNA sequence analysis revealed that sub-structuring occurred between the eight populations. We found that O. viverrini s.l. from Sakon Nakhon (SK), Thailand, shows significant genetic differentiation (P < .05) from all other isolates from different localities in Thailand and Lao PDR. This was supported by haplotype and phylogenetic tree analyses in which the SK isolate was separated from all other isolates. This suggests that O. viverrini s.l. from SK is a cryptic species. The data, however, also confirm the association between genetic groups of O. viverrini s.l. and specific wetland systems, and raise important questions regarding the epidemiological significance of these genetic differences.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تسبب ضربة الكبد Opisthorchis viverrini sensu lato مشاكل صحية عامة خطيرة في شمال شرق تايلاند ودول جنوب شرق آسيا. تم اقتراح فرضية مفادها أن O. viverrini يمثل مجمعًا للأنواع بمستويات متفاوتة من التمايز الجيني في تايلاند وجمهورية لاو الديمقراطية الشعبية. تهدف هذه الدراسة إلى توضيح ما إذا كان يمكن تقسيم مجموعات O. viverrini وراثيًا إلى أصناف منفصلة. جمعنا O. viverrini s.l. من ثمانية مواقع مختلفة في جمهورية لاو الديمقراطية الشعبية وتايلاند. كشفت نتائج تحليل تسلسل NAD1 و cox1 و CF - int6 و Pm - int9 و ITS2 و 28S rDNA أن الهيكلة الفرعية حدثت بين المجموعات السكانية الثمانية. وجدنا أن O. viverrini s.l. من Sakon Nakhon (SK)، تايلاند، تظهر تمايزًا وراثيًا كبيرًا (P < .05) من جميع العزلات الأخرى من مواقع مختلفة في تايلاند وجمهورية لاو الديمقراطية الشعبية. تم دعم ذلك من خلال تحليلات النمط الفرداني والشجرة التطورية التي تم فيها فصل عزل SK عن جميع العزلات الأخرى. هذا يشير إلى أن O. viverrini s.l. من SK هو نوع خفي. ومع ذلك، تؤكد البيانات أيضًا الارتباط بين المجموعات الجينية لـ O. viverrini s.l. وأنظمة الأراضي الرطبة المحددة، وتثير أسئلة مهمة فيما يتعلق بالأهمية الوبائية لهذه الاختلافات الجينية.

Translated Description (French)

La douve du foie Opisthorchis viverrini sensu lato cause de graves problèmes de santé publique dans le nord-est de la Thaïlande et les pays d'Asie du Sud-Est. Une hypothèse a été proposée selon laquelle O. viverrini représente un complexe d'espèces avec différents niveaux de différenciation génétique en Thaïlande et en RDP lao. Cette étude visait à clarifier si les populations d'O. viverrini peuvent être génétiquement divisées en taxons distincts. Nous avons collecté O. viverrini s.l. dans huit endroits différents en RDP lao et en Thaïlande. Les résultats de l'analyse des séquences d'ADNr NAD1, cox1, CF-int6, Pm-int9, ITS2 et 28S ont révélé que la sous-structuration s'est produite entre les huit populations. Nous avons constaté que O. viverrini s.l. de Sakon Nakhon (SK), en Thaïlande, présente une différenciation génétique significative (P < 0,05) de tous les autres isolats de différentes localités en Thaïlande et en RDP lao. Cela a été confirmé par des analyses d'haplotypes et d'arbres phylogénétiques dans lesquelles l'isolat SK a été séparé de tous les autres isolats. Cela suggère que O. viverrini s.l. de SK est une espèce cryptique. Les données, cependant, confirment également l'association entre les groupes génétiques de O. viverrini s.l. et les systèmes de zones humides spécifiques, et soulèvent d'importantes questions concernant la signification épidémiologique de ces différences génétiques.

Translated Description (Spanish)

La aleta hepática Opisthorchis viverrini sensu lato causa graves problemas de salud pública en el noreste de Tailandia y en los países del sudeste asiático. Se ha propuesto la hipótesis de que O. viverrini representa un complejo de especies con diferentes niveles de diferenciación genética en Tailandia y la República Democrática Popular Lao. Este estudio tuvo como objetivo aclarar si las poblaciones de O. viverrini se pueden dividir genéticamente en taxones separados. Recopilamos O. viverrini s.l. de ocho ubicaciones diferentes en la República Democrática Popular Lao y Tailandia. Los resultados del análisis de secuencias de ADNr NAD1, cox1, CF-int6, Pm-int9, ITS2 y 28S revelaron que se produjo una subestructuración entre las ocho poblaciones. Encontramos que O. viverrini s.l. de Sakon Nakhon (SK), Tailandia, muestra una diferenciación genética significativa (P < .05) de todos los demás aislados de diferentes localidades de Tailandia y la República Democrática Popular Lao. Esto fue respaldado por análisis de haplotipos y árboles filogenéticos en los que el aislado de SK se separó de todos los demás aislados. Esto sugiere que O. viverrini s.l. de SK es una especie críptica. Los datos, sin embargo, también confirman la asociación entre grupos genéticos de O. viverrini s.l. y sistemas específicos de humedales, y plantean preguntas importantes sobre la importancia epidemiológica de estas diferencias genéticas.

Files

2024%20Smith%20Et%20Al%20ESC%20Tenocytes%20Inflammation.pdf.pdf

Files (3.0 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:29bf382231c892ad1e69825a6f1f2e70
3.0 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
العلاقات الوراثية داخل مجمع أنواع Opisthorchis viverrini مع تحليل محدد لـ O. viverrini sensu lato من ساكون ناخون، تايلاند من خلال تسلسل الحمض النووي الميتوكوندري والنووي
Translated title (French)
Relations phylogénétiques au sein du complexe d'espèces Opisthorchis viverrini avec analyse spécifique de O. viverrini sensu lato de Sakon Nakhon, Thaïlande par séquençage de l'ADN mitochondrial et nucléaire
Translated title (Spanish)
Relaciones filogenéticas dentro del complejo de especies de Opisthorchis viverrini con análisis específico de O. viverrini sensu lato de Sakon Nakhon, Tailandia, mediante secuenciación de ADN mitocondrial y nuclear

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2800705239
DOI
10.1016/j.meegid.2018.04.022

Is supplement to
https://openalex.org/W4306825000 (Other)
https://openalex.org/W4280555941 (Other)
https://openalex.org/W3095034468 (Other)
https://openalex.org/W2901485205 (Other)
https://openalex.org/W2166172387 (Other)
https://openalex.org/W2141211553 (Other)
https://openalex.org/W2014187527 (Other)
https://openalex.org/W1985071501 (Other)
https://openalex.org/W1979344712 (Other)
https://openalex.org/W11827192 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1550568565
  • https://openalex.org/W1915986356
  • https://openalex.org/W1919772617
  • https://openalex.org/W1980699060
  • https://openalex.org/W1980958317
  • https://openalex.org/W2010729496
  • https://openalex.org/W2015687414
  • https://openalex.org/W2017317609
  • https://openalex.org/W2023471806
  • https://openalex.org/W2024553729
  • https://openalex.org/W2025115583
  • https://openalex.org/W2029972205
  • https://openalex.org/W2061244340
  • https://openalex.org/W2063023278
  • https://openalex.org/W2076244798
  • https://openalex.org/W2076539250
  • https://openalex.org/W2076639621
  • https://openalex.org/W2077449693
  • https://openalex.org/W2087473380
  • https://openalex.org/W2102150443
  • https://openalex.org/W2104622205
  • https://openalex.org/W2109946530
  • https://openalex.org/W2127337001
  • https://openalex.org/W2132632499
  • https://openalex.org/W2140343890
  • https://openalex.org/W2149694408
  • https://openalex.org/W2151755911
  • https://openalex.org/W2159731247
  • https://openalex.org/W2326233420
  • https://openalex.org/W2335074011
  • https://openalex.org/W2415970548
  • https://openalex.org/W4300580318