Published April 30, 2022 | Version v1
Publication Open

Comparative field study of Rapid-Antigen Detection (RAD) with Multiplex Real Time-PCR for COVID-19 diagnosis

Creators

  • 1. University of Haripur
  • 2. University of the Punjab
  • 3. University of Management and Technology
  • 4. International Islamic University, Islamabad
  • 5. Institute of Biomedical and Genetic Engineering

Description

RT-PCR is a gold standard test for the diagnosis of SARS-CoV2 (Covid-19) infection; however, it is an expensive, time consuming and technical demanding technique. Rapid antigen detection immunoassay (RAD) is cost-effective, quick as well as can be performed and interpreted easily. The rapid diagnosis of COVID-19 patients is essential to reduce cost and control the disease spread; however, the real world data of these tests must be validated with RT-PCR before they can be used at large scale. The objective of this study was to determine the sensitivity and specificity of PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid test device (Abbot) with multiplex RT-PCR. METHODS: A total of n=3509 samples were tested for SARS-CoV-2 RAD and RT-PCR at Institute of Biomedical and Genetic Engineering, Islamabad. The rapid antigen tests were performed by PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid test device (Abbott) and compared with RT-PCR performed on Thermo Fisher (ABI) Quant Studio 5 using CDC 2019-nCoV RT-PCR protocol. RESULTS: Total (n=3509), n=458 (7.60%) samples were reported positive by rapid antigen out of which n= 445 RT-PCR positive (13 false positive by rapid antigen), n=3051 (92.4%) were negative. True antigen negative tests n= 3051) were repeated with RT-PCR among these, n=25 were observed RT-PCR positive (rapid antigen false negative). The threshold cycle (CT) for the RT-PCR tests of these samples was >30. CONCLUSION: PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid test devices (Abbott) showed a sensitivity ratio 94.6% compared to RT-PCR. The PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid test device (Abbott) is reliable and can be used for screening and isolation of positive patients from the population.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

RT - PCR هو اختبار قياسي ذهبي لتشخيص عدوى SARS - CoV2 (Covid -19) ؛ ومع ذلك، فهي تقنية مكلفة وتستغرق وقتًا طويلاً وتقنية صعبة. المقايسة المناعية للكشف السريع عن المستضدات (RAD) فعالة من حيث التكلفة وسريعة ويمكن إجراؤها وتفسيرها بسهولة. يعد التشخيص السريع لمرضى كوفيد-19 أمرًا ضروريًا لتقليل التكلفة والسيطرة على انتشار المرض ؛ ومع ذلك، يجب التحقق من صحة بيانات العالم الحقيقي لهذه الاختبارات باستخدام RT - PCR قبل استخدامها على نطاق واسع. كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد حساسية وخصوصية جهاز اختبار PanbioTMCOVID -19 Ag - Rapid (Abbot) مع RT - PCR متعدد الإرسال. الطرق: تم اختبار ما مجموعه n=3509 عينة لـ SARS - CoV -2 RAD و RT - PCR في معهد الهندسة الطبية الحيوية والوراثية، إسلام أباد. تم إجراء اختبارات المستضد السريع بواسطة جهاز اختبار PanbioTMCOVID -19 Ag - Rapid (Abbott) ومقارنتها مع RT - PCR الذي تم إجراؤه على Thermo Fisher (ABI) Quant Studio 5 باستخدام بروتوكول CDC 2019 - nCoV RT - PCR. النتائج: تم الإبلاغ عن إجمالي (n=3509)، n=458 (7.60 ٪) عينة إيجابية بواسطة المستضد السريع منها n= 445 RT - PCR إيجابية (13 إيجابية خاطئة بواسطة المستضد السريع)، n=3051 (92.4 ٪) كانت سلبية. تم تكرار الاختبارات السلبية للمستضد الحقيقي n= 3051) مع RT - PCR من بين هؤلاء، n=25 لوحظ RT - PCR إيجابي (مستضد سريع سلبي كاذب). كانت دورة العتبة (CT) لاختبارات RT - PCR لهذه العينات أكبر من 30. الاستنتاج: أظهرت أجهزة اختبار PanbioTMCOVID -19 Ag - Rapid (Abbott) نسبة حساسية 94.6 ٪ مقارنة بـ RT - PCR. جهاز اختبار PanbioTMCOVID -19 Ag - Rapid (ABBOTT) موثوق به ويمكن استخدامه لفحص وعزل المرضى الإيجابيين من السكان.

Translated Description (French)

La RT-PCR est un test de référence pour le diagnostic de l'infection par le SRAS-CoV2 (Covid-19) ; cependant, il s'agit d'une technique coûteuse, longue et techniquement exigeante. Le test immunologique de détection rapide des antigènes (RAD) est rentable, rapide et peut être effectué et interprété facilement. Le diagnostic rapide des patients atteints de COVID-19 est essentiel pour réduire les coûts et contrôler la propagation de la maladie ; cependant, les données réelles de ces tests doivent être validées par RT-PCR avant de pouvoir être utilisées à grande échelle. L'objectif de cette étude était de déterminer la sensibilité et la spécificité du dispositif de test PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid (Abbot) avec RT-PCR multiplex. MÉTHODES : Un total de n=3509 échantillons ont été testés pour SARS-CoV-2 RAD et RT-PCR à l'Institut de génie biomédical et génétique, Islamabad. Les tests antigéniques rapides ont été réalisés par le dispositif de test Ag-Rapid PanbioTMCOVID-19 (Abbott) et comparés à la RT-PCR réalisée sur Thermo Fisher (ABI) Quant Studio 5 en utilisant le protocole CDC 2019-nCoV RT-PCR. RÉSULTATS : Total (n=3509), n=458 (7,60 %) échantillons ont été déclarés positifs par antigène rapide dont n= 445 RT-PCR positifs (13 faux positifs par antigène rapide), n=3051 (92,4 %) étaient négatifs. Les vrais tests antigéniques négatifs n= 3051) ont été répétés avec RT-PCR parmi ceux-ci, n=25 ont été observés RT-PCR positif (antigène rapide faux négatif). Le cycle seuil (CT) pour les tests RT-PCR de ces échantillons était >30. CONCLUSION : LES appareils de test PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid (Abbott) ont montré un rapport de sensibilité de 94,6 % par rapport à la RT-PCR. Le dispositif de test PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid (Abbott) est fiable et peut être utilisé pour le dépistage et l'isolement des patients positifs de la population.

Translated Description (Spanish)

La RT-PCR es una prueba estándar de oro para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV2 (Covid-19); sin embargo, es una técnica costosa, lenta y exigente desde el punto de vista técnico. El inmunoensayo rápido de detección de antígenos (RAD) es rentable, rápido y se puede realizar e interpretar fácilmente. El diagnóstico rápido de los pacientes con COVID-19 es esencial para reducir el costo y controlar la propagación de la enfermedad; sin embargo, los datos del mundo real de estas pruebas deben validarse con RT-PCR antes de que puedan usarse a gran escala. El objetivo de este estudio fue determinar la sensibilidad y especificidad del dispositivo de prueba PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid (Abbot) con RT-PCR multiplex. MÉTODOS: Se analizaron un total de n=3509 muestras para SARS-CoV-2 RAD y RT-PCR en el Instituto de Ingeniería Biomédica y Genética, Islamabad. Las pruebas rápidas de antígeno se realizaron con el dispositivo de prueba PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid (Abbott) y se compararon con la RT-PCR realizada en Thermo Fisher (Abi) Quant Studio 5 utilizando el protocolo de RT-PCR CDC 2019-nCoV. RESULTADOS: Total (n=3509), n=458 (7.60%) muestras se informaron positivas por antígeno rápido de las cuales n= 445 RT-PCR positivas (13 falsos positivos por antígeno rápido), n=3051 (92.4%) fueron negativas. Las pruebas de antígeno verdadero negativo n= 3051) se repitieron con RT-PCR entre estas, n=25 se observaron RT-PCR positivo (antígeno rápido falso negativo). El ciclo umbral (TC) para las pruebas de RT-PCR de estas muestras fue >30. CONCLUSIÓN: LOS dispositivos de prueba PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid (Abbott) mostraron una relación de sensibilidad del 94,6% en comparación con la RT-PCR. El dispositivo de prueba PanbioTMCOVID-19 Ag-Rapid (Abbott) es confiable y se puede utilizar para la detección y el aislamiento de pacientes positivos de la población.

Files

372.pdf

Files (1.0 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:ad33ca7de207c868e0bf6c1a4c1b0811
1.0 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
دراسة ميدانية مقارنة للكشف السريع عن المستضد (RAD) مع Multlex Real Time - PCR لتشخيص COVID -19
Translated title (French)
Étude comparative sur le terrain de la détection rapide de l'antigène (RAD) avec la PCR multiplexe en temps réel pour le diagnostic de la COVID-19
Translated title (Spanish)
Estudio de campo comparativo de detección rápida de antígenos (RAD) con PCR múltiple en tiempo real para el diagnóstico de COVID-19

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4225151883
DOI
10.54393/pbmj.v5i4.397

Is supplement to
https://openalex.org/W2358067027 (Other)
https://openalex.org/W2244500906 (Other)
https://openalex.org/W2139880656 (Other)
https://openalex.org/W2067397386 (Other)
https://openalex.org/W2051621631 (Other)
https://openalex.org/W2024080387 (Other)
https://openalex.org/W1995983526 (Other)
https://openalex.org/W1972800817 (Other)
https://openalex.org/W169075148 (Other)
https://openalex.org/W1542206233 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Pakistan

References

  • https://openalex.org/W2306794997
  • https://openalex.org/W3006961006
  • https://openalex.org/W3010223921
  • https://openalex.org/W3014281460
  • https://openalex.org/W3020838251
  • https://openalex.org/W3025084258
  • https://openalex.org/W3025837085
  • https://openalex.org/W3033241206
  • https://openalex.org/W3033661606
  • https://openalex.org/W3093357954
  • https://openalex.org/W3104350068
  • https://openalex.org/W3105868609
  • https://openalex.org/W3111216988
  • https://openalex.org/W3120052220
  • https://openalex.org/W3126832702
  • https://openalex.org/W3198484897
  • https://openalex.org/W3203364866
  • https://openalex.org/W3205414824
  • https://openalex.org/W4205914348
  • https://openalex.org/W4220766638
  • https://openalex.org/W4221114722