Published April 10, 2023
| Version v1
Publication
Open
Alteration of gut microbiota in wild-borne long-tailed macaques after 1-year being housed in hygienic captivity
Creators
- 1. Chulalongkorn University
- 2. National Science and Technology Development Agency
- 3. National Center for Genetic Engineering and Biotechnology
- 4. Siriraj Hospital
- 5. Mahidol University
Description
Abstract The wild-born long-tailed macaques ( Macaca fascicularis ) were recently recruited and used as breeders for the National Primate Research Center of Thailand, Chulalongkorn University (NPRCT-CU), and changes in their in-depth gut microbiota profiles were investigated. The Oxford Nanopore Technology (ONT) was used to explore full-length 16S rDNA sequences of gut microbiota in animals once captured in their natural habitat and 1-year following translocation and housing in a hygienic environment at NPRCT-CU. Our findings show that the gut microbiota of macaques after 1 year of hygienic housing and programmed diets feeding was altered and reshaped. The prevalent gut bacteria such as Prevotella copri and Faecalibacterium prausnitzii were enriched after translocation, causing the lower alpha diversity. The correlation analysis revealed that Prevotella copri , Phascolarctobacterium succinatutens , and Prevotella stercorea , showed a positive correlation with each other. Significantly enriched pathways in the macaques after translocation included biosynthesis of essential amino acids, fatty acids, polyamine and butanoate. The effects of microbiota change could help macaques to harvest the energy from programmed diets and adapt their gut metabolism. The novel probiotics and microbiota engineering approach could be further developed based on the current findings and should be helpful for captive animal health care management.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تم تجنيد قرود المكاك البرية طويلة الذيل ( Macaca fascicularis ) مؤخرًا واستخدامها كمربين للمركز الوطني لأبحاث الرئيسيات في تايلاند، جامعة شولالونغكورن (NPRCT - CU)، وتم التحقيق في التغييرات في ملامحها الميكروبية المعوية المتعمقة. تم استخدام تقنية أكسفورد نانوبور (ONT) لاستكشاف متواليات الحمض النووي الريبي 16S كاملة الطول من ميكروبات الأمعاء في الحيوانات التي تم التقاطها مرة واحدة في بيئتها الطبيعية وبعد عام واحد من النقل والإسكان في بيئة صحية في NPRCT - CU. تظهر النتائج التي توصلنا إليها أن الميكروبات المعوية لقرود المكاك بعد عام واحد من السكن الصحي وتغذية النظم الغذائية المبرمجة قد تم تغييرها وإعادة تشكيلها. تم إثراء بكتيريا الأمعاء السائدة مثل Prevotella copri و Faecalibacterium prausnitzii بعد النقل، مما تسبب في انخفاض تنوع ألفا. كشف تحليل الارتباط أن Prevotella copri و Phascolarctobacterium succinatutens و Prevotella stercorea أظهرت ارتباطًا إيجابيًا مع بعضها البعض. تضمنت المسارات المخصبة بشكل كبير في قرود المكاك بعد النقل التخليق الحيوي للأحماض الأمينية الأساسية والأحماض الدهنية والبولي أمين والبوتانوات. يمكن أن تساعد تأثيرات تغير الكائنات الحية الدقيقة قرود المكاك على حصاد الطاقة من الأنظمة الغذائية المبرمجة وتكييف عملية التمثيل الغذائي للأمعاء. يمكن تطوير نهج هندسة البروبيوتيك والميكروبات الجديد بناءً على النتائج الحالية ويجب أن يكون مفيدًا لإدارة رعاية صحة الحيوان الأسير.Translated Description (French)
Résumé Les macaques à longue queue ( Macaca fascicularis ) nés dans la nature ont récemment été recrutés et utilisés comme reproducteurs pour le Centre national de recherche sur les primates de Thaïlande, Université Chulalongkorn (NPRCT-CU), et les changements dans leurs profils approfondis de microbiote intestinal ont été étudiés. La technologie Oxford Nanopore (ont) A été utilisée pour explorer les séquences complètes d'ADNr 16S du microbiote intestinal chez les animaux une fois capturés dans leur habitat naturel et 1 an après la translocation et le logement dans un environnement hygiénique à NPRCT-CU. Nos résultats montrent que le microbiote intestinal des macaques après 1 an de logement hygiénique et d'alimentation programmée a été modifié et remodelé. Les bactéries intestinales répandues telles que Prevotella copri et Faecalibacterium prausnitzii ont été enrichies après la translocation, ce qui a entraîné une plus faible diversité alpha. L'analyse de corrélation a révélé que Prevotella copri , Phascolarctobacterium succinatutens et Prevotella stercorea ont montré une corrélation positive entre elles. Les voies significativement enrichies chez les macaques après la translocation comprenaient la biosynthèse des acides aminés essentiels, des acides gras, de la polyamine et du butanoate. Les effets du changement de microbiote pourraient aider les macaques à récolter l'énergie des régimes programmés et à adapter leur métabolisme intestinal. L'approche d'ingénierie des nouveaux probiotiques et du microbiote pourrait être développée davantage sur la base des résultats actuels et devrait être utile pour la gestion des soins de santé des animaux en captivité.Translated Description (Spanish)
Resumen Los macacos de cola larga nacidos en la naturaleza ( Macaca fascicularis ) fueron reclutados recientemente y utilizados como criadores para el Centro Nacional de Investigación de Primates de Tailandia, Universidad de Chulalongkorn (NPRCT-CU), y se investigaron los cambios en sus perfiles de microbiota intestinal en profundidad. La Oxford Nanopore Technology (ONT) se utilizó para explorar secuencias de ADNr 16S de longitud completa de la microbiota intestinal en animales una vez capturados en su hábitat natural y 1 año después de la translocación y el alojamiento en un entorno higiénico en NPRCT-CU. Nuestros hallazgos muestran que la microbiota intestinal de los macacos después de 1 año de alojamiento higiénico y alimentación con dietas programadas se alteró y remodeló. Las bacterias intestinales prevalentes como Prevotella copri y Faecalibacterium prausnitzii se enriquecieron después de la translocación, causando la menor diversidad alfa. El análisis de correlación reveló que Prevotella copri , Phascolarctobacterium succinatutens y Prevotella stercorea mostraron una correlación positiva entre sí. Las vías significativamente enriquecidas en los macacos después de la translocación incluyeron la biosíntesis de aminoácidos esenciales, ácidos grasos, poliamina y butanoato. Los efectos del cambio de la microbiota podrían ayudar a los macacos a recolectar la energía de las dietas programadas y adaptar su metabolismo intestinal. El nuevo enfoque de ingeniería de probióticos y microbiota podría desarrollarse aún más en función de los hallazgos actuales y debería ser útil para la gestión de la atención de la salud animal en cautiverio.Files
s41598-023-33163-6.pdf.pdf
Files
(2.4 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:acca12de37e97d6a115bc3d376b0eec8
|
2.4 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تغيير ميكروبات الأمعاء في قرود المكاك طويلة الذيل التي تنقلها البرية بعد أن تم إيواؤها لمدة عام في الأسر الصحي
- Translated title (French)
- Altération du microbiote intestinal chez les macaques à longue queue d'origine sauvage après 1 an d'hébergement en captivité hygiénique
- Translated title (Spanish)
- Alteración de la microbiota intestinal en macacos silvestres de cola larga después de 1 año en cautiverio higiénico
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4362737791
- DOI
- 10.1038/s41598-023-33163-6
References
- https://openalex.org/W1963562551
- https://openalex.org/W1964572456
- https://openalex.org/W1968105193
- https://openalex.org/W1974252059
- https://openalex.org/W1989802059
- https://openalex.org/W2059510925
- https://openalex.org/W2062852482
- https://openalex.org/W2083999893
- https://openalex.org/W2093832794
- https://openalex.org/W2100587850
- https://openalex.org/W2113977541
- https://openalex.org/W2116346071
- https://openalex.org/W2120712624
- https://openalex.org/W2133856765
- https://openalex.org/W2139941896
- https://openalex.org/W2147826717
- https://openalex.org/W2148901844
- https://openalex.org/W2162416176
- https://openalex.org/W2169364567
- https://openalex.org/W2170664134
- https://openalex.org/W2277566607
- https://openalex.org/W2466454311
- https://openalex.org/W2468194934
- https://openalex.org/W2474000574
- https://openalex.org/W2529812895
- https://openalex.org/W2565692782
- https://openalex.org/W2752197207
- https://openalex.org/W2765195199
- https://openalex.org/W2767624273
- https://openalex.org/W2787902098
- https://openalex.org/W2797908553
- https://openalex.org/W2808669038
- https://openalex.org/W2883984851
- https://openalex.org/W2963276645
- https://openalex.org/W2977870980
- https://openalex.org/W2980278484
- https://openalex.org/W2980981802
- https://openalex.org/W2981614010
- https://openalex.org/W2981695648
- https://openalex.org/W2985711816
- https://openalex.org/W2999175750
- https://openalex.org/W3013091147
- https://openalex.org/W3081733445
- https://openalex.org/W3088083942
- https://openalex.org/W3091350094
- https://openalex.org/W3093800398
- https://openalex.org/W3117246385
- https://openalex.org/W3122742649
- https://openalex.org/W3123501160
- https://openalex.org/W3125609739
- https://openalex.org/W3127288224
- https://openalex.org/W3138098406
- https://openalex.org/W3141892754
- https://openalex.org/W3149913936
- https://openalex.org/W3164378295
- https://openalex.org/W3170837255
- https://openalex.org/W3182994837
- https://openalex.org/W3185359876
- https://openalex.org/W3189450059
- https://openalex.org/W3202037714
- https://openalex.org/W4200523991
- https://openalex.org/W4206634312
- https://openalex.org/W4220932729
- https://openalex.org/W4223495743
- https://openalex.org/W4224868124
- https://openalex.org/W4225400006
- https://openalex.org/W422674854
- https://openalex.org/W4281608729
- https://openalex.org/W4281684729
- https://openalex.org/W4295079851
- https://openalex.org/W888808444