In vitro identification of CACN1h 9 axonal SNP in epileptic patients
Creators
- 1. Centre of Excellence in Molecular Biology
- 2. University of the Punjab
- 3. Bahria University
- 4. Balochistan University of Information Technology, Engineering and Management Sciences
- 5. University of Lahore
- 6. University of Central Punjab
- 7. University of Veterinary and Animal Sciences
Description
Childhood absence epilepsy (CAE) is an autosomal dominant disorder and a heterogeneous familial condition in which family members express absence seizures initially and then show multiple phenotypes of myoclonic epilepsy, including partial or absence seizures and generalized tonic conic seizures. Multiple types of genetic mutations are involved in epilespy. This study was aimed at investigating the coding regions of CACNA1H gene for analyzing the mutations involved in epilepsy. Blood samples of mutually unrelated true representatives of CAE were collected from the psychiatry department of various hospitals in Lahore. DNA was extracted using the standard protocol and the amplification of the CACNA1H region was achieved with specially designed primers. Later on, the analysis of the results was carried out via the sequencing of target fragments. Sequences were analyzed using the BioEdit software and then aligned with the help of the ClustalW2 software. A series of 12 unrelated patients with CAE were screened for mutations in the CACNA1H gene. No mutation was found in exon 9a. As already reported, mutations in the exonic sequence of CACNA1H gene were found in 5 out of 14 CAE patients. These changes were observed in a PCR fragment amplified by primer 2 in the region of the 9th exon. Subsequent analysis of these fragments identified transition mutations (2025G>A) in exon 9. To conclude, there is a need to explore the site of the gene along with other gene mutations causing epilepsy in the local population of Punjab, Pakistan. It will help to develop genetic counseling strategies, gene therapies, and prenatal diagnostic procedures for the said population.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
صرع غياب الطفولة (CAE) هو اضطراب صبغي جسدي سائد وحالة عائلية غير متجانسة يعبر فيها أفراد الأسرة عن نوبات غياب في البداية ثم يظهرون أنماطًا ظاهرية متعددة من الصرع الرمعي العضلي، بما في ذلك النوبات الجزئية أو الغيابية والنوبات المخروطية التوترية المعممة. وتشارك أنواع متعددة من الطفرات الجينية في داء الشعيرات. كانت هذه الدراسة تهدف إلى التحقيق في مناطق الترميز لجين CACNA1H لتحليل الطفرات التي ينطوي عليها الصرع. تم جمع عينات دم لممثلي CAE الحقيقيين غير المرتبطين ببعضهم البعض من قسم الطب النفسي في مستشفيات مختلفة في لاهور. تم استخراج الحمض النووي باستخدام البروتوكول القياسي وتم تحقيق تضخيم منطقة CACNA1H باستخدام مواد أولية مصممة خصيصًا. في وقت لاحق، تم تحليل النتائج من خلال تسلسل الشظايا المستهدفة. تم تحليل التسلسلات باستخدام برنامج BioEdit ثم تم محاذاتها بمساعدة برنامج ClustalW2. تم فحص سلسلة من 12 مريضًا غير مرتبطين بـ CAE بحثًا عن طفرات في جين CACNA1H. لم يتم العثور على طفرة في الإكسون 9 أ. كما ذكرنا سابقًا، تم العثور على طفرات في التسلسل الخارجي لجين CACNA1H في 5 من أصل 14 مريضًا بـ CAE. ولوحظت هذه التغيرات في شظية تفاعل البوليميراز المتسلسل التي تضخمت بواسطة التمهيدي 2 في منطقة الإكسون التاسع. حدد التحليل اللاحق لهذه الشظايا طفرات انتقالية (2025G>A) في إكسون 9. في الختام، هناك حاجة لاستكشاف موقع الجين جنبًا إلى جنب مع الطفرات الجينية الأخرى التي تسبب الصرع لدى السكان المحليين في البنجاب، باكستان. وسوف يساعد على تطوير استراتيجيات المشورة الوراثية، والعلاجات الجينية، وإجراءات التشخيص قبل الولادة للسكان المذكورين.Translated Description (French)
L'épilepsie d'absence chez l'enfant (IAE) est un trouble autosomique dominant et une affection familiale hétérogène dans laquelle les membres de la famille expriment d'abord des crises d'absence, puis présentent plusieurs phénotypes d'épilepsie myoclonique, y compris des crises partielles ou d'absence et des crises toniques coniques généralisées. Plusieurs types de mutations génétiques sont impliqués dans l'épilepsie. Cette étude visait à étudier les régions codantes du gène CACNA1H pour analyser les mutations impliquées dans l'épilepsie. Des échantillons de sang de véritables représentants de CAE non apparentés ont été prélevés au service de psychiatrie de divers hôpitaux de Lahore. L'ADN a été extrait en utilisant le protocole standard et l'amplification de la région CACNA1H a été réalisée avec des amorces spécialement conçues. Plus tard, l'analyse des résultats a été réalisée via le séquençage des fragments cibles. Les séquences ont été analysées à l'aide du logiciel BioEdit puis alignées à l'aide du logiciel ClustalW2. Une série de 12 patients non apparentés atteints d'IAO ont été dépistés pour des mutations du gène CACNA1H. Aucune mutation n'a été trouvée dans l'exon 9a. Comme déjà rapporté, des mutations dans la séquence exonique du gène CACNA1H ont été trouvées chez 5 patients sur 14 atteints d'EIO. Ces modifications ont été observées dans un fragment PCR amplifié par l'amorce 2 au niveau du 9ème exon. L'analyse ultérieure de ces fragments a permis d'identifier des mutations de transition (2025G >A) dans l'exon 9. Pour conclure, il est nécessaire d'explorer le site du gène ainsi que d'autres mutations génétiques causant l'épilepsie dans la population locale du Pendjab, au Pakistan. Il aidera à développer des stratégies de conseil génétique, des thérapies géniques et des procédures de diagnostic prénatal pour ladite population.Translated Description (Spanish)
La epilepsia de ausencia infantil (cae) es un trastorno autosómico dominante y una afección familiar heterogénea en la que los miembros de la familia expresan convulsiones de ausencia inicialmente y luego muestran múltiples fenotipos de epilepsia mioclónica, incluidas convulsiones parciales o de ausencia y convulsiones cónicas tónicas generalizadas. En la epilespía intervienen múltiples tipos de mutaciones genéticas. Este estudio tuvo como objetivo investigar las regiones codificantes del gen CACNA1H para analizar las mutaciones implicadas en la epilepsia. Se recolectaron muestras de sangre de representantes verdaderos mutuamente no relacionados de cae del departamento de psiquiatría de varios hospitales en Lahore. El ADN se extrajo utilizando el protocolo estándar y la amplificación de la región CACNA1H se logró con cebadores especialmente diseñados. Posteriormente, se llevó a cabo el análisis de los resultados a través de la secuenciación de fragmentos diana. Las secuencias se analizaron utilizando el software BioEdit y luego se alinearon con la ayuda del software ClustalW2. Se examinó una serie de 12 pacientes no relacionados con cae para detectar mutaciones en el gen CACNA1H. No se encontró mutación en el exón 9a. Como ya se informó, se encontraron mutaciones en la secuencia exónica del gen CACNA1H en 5 de 14 pacientes con cae. Estos cambios se observaron en un fragmento de PCR amplificado por el cebador 2 en la región del 9º exón. El análisis posterior de estos fragmentos identificó mutaciones de transición (2025G>A) en el exón 9. Para concluir, es necesario explorar el sitio del gen junto con otras mutaciones genéticas que causan epilepsia en la población local de Punjab, Pakistán. Ayudará a desarrollar estrategias de asesoramiento genético, terapias génicas y procedimientos de diagnóstico prenatal para dicha población.Files
693.pdf
Files
(1.9 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:871b84c3b17f2e2781734b06544a1c28
|
1.9 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- في المختبر تحديد CACN1h 9 محور عصبي SNP في مرضى الصرع
- Translated title (French)
- Identification in vitro de CACN1h 9 axonal SNP chez les patients épileptiques
- Translated title (Spanish)
- Identificación in vitro del SNP axonal CACN1h 9 en pacientes epilépticos
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3200683335
- DOI
- 10.32350/bsr.0302.05