Published August 6, 2014 | Version v1
Publication Open

A Five-Year Survey of Dematiaceous Fungi in a Tropical Hospital Reveals Potential Opportunistic Species

Creators

  • 1. University Malaya Medical Centre
  • 2. University of Malaya

Description

Dematiaceous fungi (black fungi) are a heterogeneous group of fungi present in diverse environments worldwide. Many species in this group are known to cause allergic reactions and potentially fatal diseases in humans and animals, especially in tropical and subtropical climates. This study represents the first survey of dematiaceous fungi in Malaysia and provides observations on their diversity as well as in vitro response to antifungal drugs. Seventy-five strains isolated from various clinical specimens were identified by morphology as well as an internal transcribed spacer (ITS)-based phylogenetic analysis. The combined molecular and conventional approach enabled the identification of three classes of the Ascomycota phylum and 16 genera, the most common being Cladosporium, Cochliobolus and Neoscytalidium. Several of the species identified have not been associated before with human infections. Among 8 antifungal agents tested, the azoles posaconazole (96%), voriconazole (90.7%), ketoconazole (86.7%) and itraconazole (85.3%) showed in vitro activity (MIC ≤ 1 µg/mL) to the largest number of strains, followed by anidulafungin (89.3%), caspofungin (74.7%) and amphotericin B (70.7%). Fluconazole appeared to be the least effective with only 10.7% of isolates showing in vitro susceptibility. Overall, almost half (45.3%) of the isolates showed reduced susceptibility (MIC >1 µg/mL) to at least one antifungal agent, and three strains (one Pyrenochaeta unguis-hominis and two Nigrospora oryzae) showed potential multidrug resistance.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الفطريات الشيطانية (الفطريات السوداء) هي مجموعة غير متجانسة من الفطريات الموجودة في بيئات متنوعة في جميع أنحاء العالم. ومن المعروف أن العديد من الأنواع في هذه المجموعة تسبب الحساسية والأمراض القاتلة المحتملة في البشر والحيوانات، وخاصة في المناخات الاستوائية وشبه الاستوائية. تمثل هذه الدراسة أول مسح للفطريات الشيطانية في ماليزيا وتقدم ملاحظات حول تنوعها وكذلك الاستجابة المختبرية للأدوية المضادة للفطريات. تم تحديد خمسة وسبعين سلالة معزولة من عينات سريرية مختلفة من خلال علم التشكل بالإضافة إلى فاصل داخلي (ITS)قائم على التحليل الوراثي للسلالات. مكن النهج الجزيئي والتقليدي المشترك من تحديد ثلاث فئات من شعبة Ascomycota و 16 جنسًا، وأكثرها شيوعًا هي Cladosporium و Cochliobolus و Neoscytalidium. العديد من الأنواع التي تم تحديدها لم ترتبط من قبل بالعدوى البشرية. من بين 8 عوامل مضادة للفطريات تم اختبارها، أظهرت الآزول بوساكونازول (96 ٪)، فوريكونازول (90.7 ٪)، كيتوكونازول (86.7 ٪) والإيتراكونازول (85.3 ٪) نشاطًا في المختبر (ميكروغرام ≤ 1 ميكروغرام/مل) إلى أكبر عدد من السلالات، تليها anidulafungin (89.3 ٪)، caspofungin (74.7 ٪) و amphotericin B (70.7 ٪). بدا أن الفلوكونازول هو الأقل فعالية حيث أظهرت 10.7 ٪ فقط من العزلات قابلية في المختبر. بشكل عام، أظهر ما يقرب من نصف (45.3 ٪) العزلات انخفاضًا في الحساسية (الميكروفون >1 ميكروغرام/مل) لعامل مضاد للفطريات واحد على الأقل، وأظهرت ثلاث سلالات (واحدة من Pyrenochaeta unguis - hominis واثنتان من Nigrospora oryzae) مقاومة محتملة للأدوية المتعددة.

Translated Description (French)

Les champignons dématiacés (champignons noirs) sont un groupe hétérogène de champignons présents dans divers environnements à travers le monde. De nombreuses espèces de ce groupe sont connues pour provoquer des réactions allergiques et des maladies potentiellement mortelles chez l'homme et les animaux, en particulier dans les climats tropicaux et subtropicaux. Cette étude représente la première enquête sur les champignons dématiacés en Malaisie et fournit des observations sur leur diversité ainsi que sur la réponse in vitro aux médicaments antifongiques. Soixante-quinze souches isolées à partir de divers échantillons cliniques ont été identifiées par morphologie ainsi que par une analyse phylogénétique interne basée sur l'espaceur transcrit (ITS). L'approche combinée moléculaire et conventionnelle a permis d'identifier trois classes d'Ascomycota phylum et 16 genres, les plus courants étant Cladosporium, Cochliobolus et Neoscytalidium. Plusieurs des espèces identifiées n'ont pas été associées auparavant à des infections humaines. Parmi les 8 agents antifongiques testés, les azoles posaconazole (96 %), voriconazole (90,7 %), kétoconazole (86,7 %) et itraconazole (85,3 %) ont montré une activité in vitro (CMI ≤ 1 µg/mL) pour le plus grand nombre de souches, suivis par l'anidulafungine (89,3 %), la caspofungine (74,7 %) et l'amphotéricine B (70,7 %). Le fluconazole semblait être le moins efficace avec seulement 10,7 % des isolats présentant une sensibilité in vitro. Dans l'ensemble, près de la moitié (45,3 %) des isolats présentaient une sensibilité réduite (CMI >1 µg/mL) à au moins un agent antifongique, et trois souches (une Pyrenochaeta unguis-hominis et deux Nigrospora oryzae) présentaient une multirésistance potentielle.

Translated Description (Spanish)

Los hongos dematiáceos (hongos negros) son un grupo heterogéneo de hongos presentes en diversos ambientes a nivel mundial. Se sabe que muchas especies de este grupo causan reacciones alérgicas y enfermedades potencialmente mortales en humanos y animales, especialmente en climas tropicales y subtropicales. Este estudio representa el primer estudio de hongos dematiáceos en Malasia y proporciona datos sobre su diversidad, así como la respuesta in vitro a los fármacos antifúngicos. Se identificaron setenta y cinco cepas aisladas de varias muestras clínicas por morfología, así como por un análisis filogenético basado en un espaciador transcrito interno (ITS). El enfoque molecular y convencional combinado permitió la identificación de tres clases del filo Ascomycota y 16 géneros, siendo los más comunes Cladosporium, Cochliobolus y Neoscytalidium. Varias de las especies identificadas no se han asociado antes con infecciones humanas. Entre los 8 agentes antifúngicos probados, los azoles posaconazol (96%), voriconazol (90.7%), ketoconazol (86.7%) e itraconazol (85.3%) mostraron actividad in vitro (MIC ≤ 1 µg/mL) al mayor número de cepas, seguidos de anidulafungina (89.3%), caspofungina (74.7%) y anfotericina B (70.7%). El fluconazol pareció ser el menos efectivo, ya que solo el 10,7% de los aislados mostraron susceptibilidad in vitro. En general, casi la mitad (45.3%) de los aislados mostraron una susceptibilidad reducida (MIC >1 µg/mL) a al menos un agente antifúngico, y tres cepas (una Pyrenochaeta unguis-hominis y dos Nigrospora oryzae) mostraron una posible resistencia a múltiples fármacos.

Files

journal.pone.0104352&type=printable.pdf

Files (1.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:94e0f2d0d86910cfe0c42ed6ae05b9c6
1.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
يكشف مسح مدته خمس سنوات لفطريات ديماتياسيوس في مستشفى استوائي عن أنواع انتهازية محتملة
Translated title (French)
Une enquête quinquennale sur les champignons dématiacés dans un hôpital tropical révèle des espèces opportunistes potentielles
Translated title (Spanish)
Un estudio quinquenal de hongos dematiáceos en un hospital tropical revela posibles especies oportunistas

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2031246473
DOI
10.1371/journal.pone.0104352

Is supplement to
https://openalex.org/W3177833122 (Other)
https://openalex.org/W2799470600 (Other)
https://openalex.org/W2492017320 (Other)
https://openalex.org/W2142980872 (Other)
https://openalex.org/W2124352536 (Other)
https://openalex.org/W2108739140 (Other)
https://openalex.org/W2101343997 (Other)
https://openalex.org/W2085086551 (Other)
https://openalex.org/W1968772793 (Other)
https://openalex.org/W1782451125 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malaysia

References

  • https://openalex.org/W1917684547
  • https://openalex.org/W1967720421
  • https://openalex.org/W1973628782
  • https://openalex.org/W1977010307
  • https://openalex.org/W1978498218
  • https://openalex.org/W1982117310
  • https://openalex.org/W1982205662
  • https://openalex.org/W1985726486
  • https://openalex.org/W1997739411
  • https://openalex.org/W2003685921
  • https://openalex.org/W2007602512
  • https://openalex.org/W2010366505
  • https://openalex.org/W2018009271
  • https://openalex.org/W2024183108
  • https://openalex.org/W2025485261
  • https://openalex.org/W2026902845
  • https://openalex.org/W2035457590
  • https://openalex.org/W2041342584
  • https://openalex.org/W2046128713
  • https://openalex.org/W2048444114
  • https://openalex.org/W2049498364
  • https://openalex.org/W2061568194
  • https://openalex.org/W2065440789
  • https://openalex.org/W2067657189
  • https://openalex.org/W2073264262
  • https://openalex.org/W2074949696
  • https://openalex.org/W2081079921
  • https://openalex.org/W2088722621
  • https://openalex.org/W2092665199
  • https://openalex.org/W2103509636
  • https://openalex.org/W2103829186
  • https://openalex.org/W2105376278
  • https://openalex.org/W2107016255
  • https://openalex.org/W2108823380
  • https://openalex.org/W2110375946
  • https://openalex.org/W2111689001
  • https://openalex.org/W2113747995
  • https://openalex.org/W2113994097
  • https://openalex.org/W2117959171
  • https://openalex.org/W2120644786
  • https://openalex.org/W2122933753
  • https://openalex.org/W2128781927
  • https://openalex.org/W2129109667
  • https://openalex.org/W2129129082
  • https://openalex.org/W2129751328
  • https://openalex.org/W2133798991
  • https://openalex.org/W2138186956
  • https://openalex.org/W2139126851
  • https://openalex.org/W2140467714
  • https://openalex.org/W2142556922
  • https://openalex.org/W2146067297
  • https://openalex.org/W2147224863
  • https://openalex.org/W2151035473
  • https://openalex.org/W2161444534
  • https://openalex.org/W2162685906
  • https://openalex.org/W2163438481
  • https://openalex.org/W2163515200
  • https://openalex.org/W2165361704
  • https://openalex.org/W2809335660
  • https://openalex.org/W4240714777
  • https://openalex.org/W4242466237
  • https://openalex.org/W4253340196