Published August 31, 2018 | Version v1
Publication Open

Analysis of amino acid motif of penicillin-binding proteins 1a, 2b, and 2x in invasive Streptococcus pneumoniae nonsusceptible to penicillin isolated from pediatric patients in Casablanca, Morocco

Creators

  • 1. Université Mohammed VI des Sciences de la Santé
  • 2. Centre Hospitalier Universitaire Ibn Rochd
  • 3. University of Hassan II Casablanca
  • 4. Institut Pasteur du Maroc
  • 5. Université Sultan Moulay Slimane

Description

This study aimed to investigate the nature of the amino acid motifs found in PBPs of Streptococcus pneumoniae isolates in invasive diseases from pediatric patients at Casablanca, Morocco. Five penicillin-susceptible (PSSP), ten penicillin-intermediate (PISP), and fifteen penicillin-resistant S. pneumoniae (PRSP) were studied by PCR–RFLP and DNA sequencing of the pbp1a, − 2b, and − 2x genes. There were no changes in the conserved motifs of PBP1a, PBP2b and PBP2x for PSSP strains. Substitution close to PBP1a conserved motifs were found in all PRSP isolates and six/five PISP. Analysis of PBP2b showed that all but one of the 10 PISP strains and all PRSP had substitutions. Substitution close to PBP2x motifs showed that all but three of the 10 PISP strains and all PRSP had substitutions in tow conserved motifs. A total of 6, 11 and 10 genotypes were found after analysis of pbp1a, pbp2b, and pbp2x, respectively. The penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae isolated in Casablanca share most amino acid substitutions of those reported worldwide, but they occurred among pneumococci with low level resistance to b-lactams.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

هدفت هذه الدراسة إلى التحقيق في طبيعة زخارف الأحماض الأمينية الموجودة في PBPs لعزل المكورات العقدية الرئوية في الأمراض الغازية من مرضى الأطفال في الدار البيضاء، المغرب. تمت دراسة خمسة من الجينات الحساسة للبنسلين (PSSP)، وعشرة من الجينات الوسيطة للبنسلين (PISP)، وخمسة عشر من الجينات الرئوية المقاومة للبنسلين (PRSP) من خلال PCR - RFLP وتسلسل الحمض النووي لجينات pbp1a و − 2b و − 2x. لم تكن هناك تغييرات في الزخارف المحفوظة لـ PBP1a و PBP2b و PBP2x لسلالات PSSP. تم العثور على استبدال قريب من الزخارف المحفوظة PBP1a في جميع عزلات ورقة استراتيجية الحد من الفقر وستة/خمسة PISP. أظهر تحليل PBP2b أن جميع سلالات PISP العشرة وجميع أوراق استراتيجية الحد من الفقر باستثناء واحدة لها بدائل. أظهر الاستبدال بالقرب من زخارف PBP2x أن جميع سلالات PISP العشرة وجميع أوراق استراتيجية الحد من الفقر باستثناء ثلاثة منها كانت لها بدائل في الزخارف المحفوظة بالسحب. تم العثور على ما مجموعه 6 و 11 و 10 أنماط وراثية بعد تحليل pbp1a و pbp2b و pbp2x على التوالي. تشترك S. pneumoniae غير الحساسة للبنسلين المعزولة في الدار البيضاء في معظم بدائل الأحماض الأمينية لتلك المبلغ عنها في جميع أنحاء العالم، لكنها حدثت بين المكورات الرئوية ذات المقاومة المنخفضة لمستوى b - lactams.

Translated Description (French)

Cette étude visait à étudier la nature des motifs d'acides aminés trouvés dans les PBP des isolats de Streptococcus pneumoniae dans les maladies invasives de patients pédiatriques à Casablanca, au Maroc. Cinq S. pneumoniae sensibles à la pénicilline (PSSP), dix S. pneumoniae intermédiaires à la pénicilline (PISP) et quinze S. pneumoniae résistants à la pénicilline (PRSP) ont été étudiés par PCR–RFLP et séquençage de l'ADN des gènes pbp1a, − 2b et − 2x. Il n'y a eu aucun changement dans les motifs conservés de PBP1a, PBP2b et PBP2x pour les souches PSSP. Une substitution proche des motifs conservés PBP1a a été trouvée dans tous les isolats PRSP et six/cinq PISP. L'analyse de PBP2b a montré que toutes les souches de PISP, sauf une, et tous les PRSP avaient des substitutions. Une substitution proche des motifs PBP2x a montré que toutes les 10 souches PISP et tous les PRSP sauf trois avaient des substitutions dans les motifs TOW conservés. Un total de 6, 11 et 10 génotypes ont été trouvés après analyse de pbp1a, pbp2b et pbp2x, respectivement. Les S. pneumoniae non sensibles à la pénicilline isolés à Casablanca partagent la plupart des substitutions d'acides aminés rapportées dans le monde, mais elles sont survenues chez des pneumocoques présentant une faible résistance aux b-lactames.

Translated Description (Spanish)

Este estudio tuvo como objetivo investigar la naturaleza de los motivos de aminoácidos encontrados en PBP de aislados de Streptococcus pneumoniae en enfermedades invasivas de pacientes pediátricos en Casablanca, Marruecos. Se estudiaron cinco S. pneumoniae susceptibles a la penicilina (PSSP), diez intermedios de penicilina (PISP) y quince resistentes a la penicilina (PRSP) mediante PCR–RFLP y secuenciación de ADN de los genes pbp1a, -2b y -2x. No hubo cambios en los motivos conservados de PBP1a, PBP2b y PBP2x para las cepas PSSP. Se encontraron sustituciones cercanas a los motivos conservados de PBP1a en todos los aislados de PRSP y seis/cinco PISP. El análisis de PBP2b mostró que todas menos una de las 10 cepas PISP y todas las PRSP tenían sustituciones. La sustitución cercana a los motivos PBP2x mostró que todas menos tres de las 10 cepas PISP y todas las PRSP tenían sustituciones en los motivos conservados de estopa. Se encontraron un total de 6, 11 y 10 genotipos después del análisis de pbp1a, pbp2b y pbp2x, respectivamente. Las S. pneumoniae no susceptibles a la penicilina aisladas en Casablanca comparten la mayoría de las sustituciones de aminoácidos de las informadas en todo el mundo, pero ocurrieron entre neumococos con bajo nivel de resistencia a las b-lactamas.

Files

s13104-018-3719-5.pdf.pdf

Files (1.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:9c878228d3266309e78a5c8a692db692
1.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحليل عزر الأحماض الأمينية لبروتينات ربط البنسلين 1a و 2b و 2x في العقدية الرئوية الغازية غير المعرضة للبنسلين المعزولة من مرضى الأطفال في الدار البيضاء، المغرب
Translated title (French)
Analyse du motif d'acides aminés des protéines de liaison à la pénicilline 1a, 2b et 2x dans les Streptococcus pneumoniae invasifs non sensibles à la pénicilline isolés de patients pédiatriques à Casablanca, Maroc
Translated title (Spanish)
Análisis del motivo de aminoácidos de las proteínas de unión a penicilina 1a, 2b y 2x en Streptococcus pneumoniae invasivo no susceptible a la penicilina aislado de pacientes pediátricos en Casablanca, Marruecos

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2889370170
DOI
10.1186/s13104-018-3719-5

Is supplement to
https://openalex.org/W2395116299 (Other)
https://openalex.org/W2258797978 (Other)
https://openalex.org/W2168171333 (Other)
https://openalex.org/W2137110239 (Other)
https://openalex.org/W2125229513 (Other)
https://openalex.org/W2091078308 (Other)
https://openalex.org/W2071988704 (Other)
https://openalex.org/W2017369909 (Other)
https://openalex.org/W1991833505 (Other)
https://openalex.org/W1852497695 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Morocco

References

  • https://openalex.org/W1599358043
  • https://openalex.org/W1973021820
  • https://openalex.org/W2003048630
  • https://openalex.org/W2018380906
  • https://openalex.org/W2022899044
  • https://openalex.org/W2097991427
  • https://openalex.org/W2106383972
  • https://openalex.org/W2111516721
  • https://openalex.org/W2120704894
  • https://openalex.org/W2138076396
  • https://openalex.org/W2138859748
  • https://openalex.org/W2143391752
  • https://openalex.org/W2152585568
  • https://openalex.org/W2154843561
  • https://openalex.org/W2163398380
  • https://openalex.org/W2171484038
  • https://openalex.org/W2297825547
  • https://openalex.org/W2342279548
  • https://openalex.org/W2604420917
  • https://openalex.org/W4300582216