Published July 9, 2020
| Version v1
Publication
Open
IDEAL, the Infectious Diseases of East African Livestock project open access database and biobank
Creators
- 1. Roslin Institute
- 2. University of Edinburgh
- 3. Washington State University
- 4. University of Pretoria
- 5. African Union Interafrican Bureau for Animal Resources
- 6. International Livestock Research Institute
Description
Abstract The Infectious Diseases of East African Livestock (IDEAL) project was a longitudinal cohort study of calf health which was conducted in Western Kenya between 2007–2010. A total of 548 East African shorthorn zebu calves were recruited at birth and followed at least every 5 weeks during the first year of life. Comprehensive clinical and epidemiological data, blood and tissue samples were collected at every visit. These samples were screened for over 100 different pathogens or infectious exposures, using a range of diagnostic methods. This manuscript describes this comprehensive dataset and bio-repository, and how to access it through a single online site ( http://data.ctlgh.org/ideal/ ). This provides extensive filtering and searching capabilities. These data are useful to illustrate outcomes of multiple infections on health, investigate patterns of morbidity and mortality due to parasite infections, and to study genotypic determinants of immunity and disease.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
كان مشروع الأمراض المعدية للثروة الحيوانية في شرق إفريقيا (IDEAL) عبارة عن دراسة جماعية طولية لصحة ربلة الساق أجريت في غرب كينيا بين عامي 2007–2010. تم تجنيد ما مجموعه 548 من عجول زيبو قصيرة القرن في شرق إفريقيا عند الولادة ومتابعتها كل 5 أسابيع على الأقل خلال السنة الأولى من الحياة. تم جمع بيانات سريرية ووبائية شاملة وعينات من الدم والأنسجة في كل زيارة. تم فحص هذه العينات لأكثر من 100 من مسببات الأمراض المختلفة أو التعرضات المعدية، باستخدام مجموعة من طرق التشخيص. تصف هذه المخطوطة مجموعة البيانات الشاملة هذه والمستودع الحيوي، وكيفية الوصول إليها من خلال موقع واحد على الإنترنت ( http://data.ctlgh.org/ideal/ ). يوفر هذا إمكانات تصفية وبحث واسعة النطاق. هذه البيانات مفيدة لتوضيح نتائج الالتهابات المتعددة على الصحة، والتحقيق في أنماط الاعتلال والوفيات بسبب الالتهابات الطفيلية، ودراسة محددات النمط الجيني للمناعة والمرض.Translated Description (French)
Résumé Le projet IDEAL (Infectious Diseases of East African Livestock) était une étude longitudinale de cohorte sur la santé des veaux qui a été menée dans l'ouest du Kenya entre 2007 et 2010. Au total, 548 veaux zébus à cornes courtes d'Afrique de l'Est ont été recrutés à la naissance et suivis au moins toutes les 5 semaines au cours de la première année de vie. Des données cliniques et épidémiologiques complètes, des échantillons de sang et de tissus ont été collectés à chaque visite. Ces échantillons ont été dépistés pour plus de 100 agents pathogènes ou expositions infectieuses différents, en utilisant une gamme de méthodes de diagnostic. Ce manuscrit décrit cet ensemble complet de données et de bio-référentiels, et comment y accéder via un seul site en ligne ( http://data.ctlgh.org/ideal/ ). Cela fournit des capacités de filtrage et de recherche étendues. Ces données sont utiles pour illustrer les résultats de multiples infections sur la santé, étudier les schémas de morbidité et de mortalité dus aux infections parasitaires et étudier les déterminants génotypiques de l'immunité et de la maladie.Translated Description (Spanish)
Resumen El proyecto The Infectious Diseases of East African Livestock (IDEAL) fue un estudio de cohorte longitudinal de la salud de los terneros que se llevó a cabo en el oeste de Kenia entre 2007–2010. Se reclutaron un total de 548 terneros cebu de espino corto de África Oriental al nacer y se les dio seguimiento al menos cada 5 semanas durante el primer año de vida. En cada visita se recogieron datos clínicos y epidemiológicos completos, muestras de sangre y tejidos. Estas muestras se analizaron para detectar más de 100 patógenos diferentes o exposiciones infecciosas, utilizando una variedad de métodos de diagnóstico. Este manuscrito describe este completo conjunto de datos y biorrepositorio, y cómo acceder a él a través de un único sitio en línea ( http://data.ctlgh.org/ideal/ ). Esto proporciona amplias capacidades de filtrado y búsqueda. Estos datos son útiles para ilustrar los resultados de múltiples infecciones en la salud, investigar patrones de morbilidad y mortalidad debido a infecciones parasitarias y estudiar los determinantes genotípicos de la inmunidad y la enfermedad.Files
s41597-020-0559-7.pdf.pdf
Files
(2.2 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:de57c4c693e94f2ac9410cff48c9a7a6
|
2.2 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- IDEAL، مشروع قاعدة بيانات الوصول المفتوح للأمراض المعدية في شرق إفريقيا والبنك الحيوي
- Translated title (French)
- IDEAL, la base de données et la biobanque en libre accès du projet Maladies infectieuses du bétail d'Afrique de l'Est
- Translated title (Spanish)
- IDEAL, la base de datos y el biobanco de acceso abierto del proyecto Infectious Diseases of East African Livestock
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3041668649
- DOI
- 10.1038/s41597-020-0559-7
References
- https://openalex.org/W2011918626
- https://openalex.org/W2021763268
- https://openalex.org/W2114099295
- https://openalex.org/W2119522672
- https://openalex.org/W2157475700
- https://openalex.org/W3005749827