Published November 4, 2011 | Version v1
Publication Open

Antimicrobial resistance and virulence genes of non-typhoidal Salmonella isolates in The Gambia and Senegal

  • 1. International Trypanotolerance Centre
  • 2. Medical Research Council
  • 3. Instituut voor Tropische Geneeskunde
  • 4. University of Antwerp

Description

Introduction: The prevalence of virulence genes in non-typhoidal Salmonella (NTS) and its association with commonly used antibiotics in West Africa is unknown. Methodology: We tested 185 NTS isolates from children, animals, and food products for the presence of twelve virulence genes by PCR. Ten of the virulence genes tested belonged to the five Salmonella pathogenicity islands implicated in its pathogenesis. Results: Ten of twelve virulence genes except sopE and pefA were present in at least 70% of the isolates tested; sopE and pefA were observed in 33% and 44% of the isolates, respectively. The most prevalent gene was invA (99.5%), which is an invasion gene conserved within the Salmonella enterica. pipD and sopB genes, which were associated with serovar Enteritidis, were detected in 92.4% and 94.1% of isolates respectively. S. Istanbul and S. Javiana, which were isolated from chicken-serving restaurants, carried all the virulence genes of the five pathogenicity islands. There was significant association between sopB, sitC, orfLC, pipD and pefA virulence genes and resistance to commonly used antibiotics in Senegal and The Gambia, namely amoxicillin, ticarcillin, trimethoprim plus sulfamethoxazole, tetracycline, trimethoprim, spectinomycin, streptomycin, sulfonamides and nitrofurantoin. Conclusions: This study shows that virulence genes are present in NTS strains isolated from various sources. The significant association between some virulence genes and antibiotic resistance may have important implications with regard to the spread and persistence of resistance and virulence genes in Salmonella and to the prudent use of antimicrobial agents in humans and animals in West Africa.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

مقدمة: انتشار جينات الفوعة في السالمونيلا غير التيفية (NTS) وارتباطها بالمضادات الحيوية شائعة الاستخدام في غرب أفريقيا غير معروف. المنهجية: اختبرنا 185 من عزلات NTS من الأطفال والحيوانات والمنتجات الغذائية لوجود اثني عشر جينًا ضارًا بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل. تنتمي عشرة من جينات الفوعة التي تم اختبارها إلى جزر السالمونيلا الخمس المسببة للأمراض المتورطة في التسبب في المرض. النتائج: كانت عشرة من أصل اثني عشر جينًا من جينات الفوعة باستثناء sopE و pefA موجودة في 70 ٪ على الأقل من العزلات التي تم اختبارها ؛ لوحظت sopE و pefA في 33 ٪ و 44 ٪ من العزلات، على التوالي. كان الجين الأكثر انتشارًا هو INVA (99.5 ٪)، وهو جين غزو محفوظ داخل السالمونيلا المعوية. تم اكتشاف جينات pipD و sopB، المرتبطة بالتهاب الأمعاء المصلي، في 92.4 ٪ و 94.1 ٪ من العزلات على التوالي. S. اسطنبول و S. خافيانا، التي كانت معزولة عن المطاعم التي تقدم الدجاج، حملت جميع جينات الفوعة للجزر الخمس المسببة للأمراض. كان هناك ارتباط كبير بين جينات الفوعة sopB و sitC و orfLC و pipD و pefA ومقاومة المضادات الحيوية الشائعة الاستخدام في السنغال وغامبيا، وهي أموكسيسيلين وتيكارسيلين وتريميثوبريم بالإضافة إلى سلفاميثوكسازول وتتراسيكلين وتريميثوبريم وسبكتينوميسين وستربتوميسين وسلفوناميدات ونيتروفورانتوين. الاستنتاجات: تظهر هذه الدراسة أن جينات الفوعة موجودة في سلالات NTS المعزولة عن مصادر مختلفة. قد يكون للارتباط الكبير بين بعض جينات الفوعة ومقاومة المضادات الحيوية آثار مهمة فيما يتعلق بانتشار واستمرار جينات المقاومة والفوعة في السالمونيلا والاستخدام الحكيم للعوامل المضادة للميكروبات في البشر والحيوانات في غرب أفريقيا.

Translated Description (French)

Introduction : La prévalence des gènes de virulence chez les salmonelles non typhoïdiennes (NTS) et son association avec les antibiotiques couramment utilisés en Afrique de l'Ouest est inconnue. Méthodologie : Nous avons testé 185 isolats de NTS provenant d'enfants, d'animaux et de produits alimentaires pour la présence de douze gènes de virulence par PCR. Dix des gènes de virulence testés appartenaient aux cinq îlots de pathogénicité de Salmonella impliqués dans sa pathogenèse. Résultats : Dix des douze gènes de virulence, à l'exception du sopE et du pefA, étaient présents dans au moins 70 % des isolats testés ; le sopE et le pefA ont été observés dans 33 % et 44 % des isolats, respectivement. Le gène le plus répandu était invA (99,5 %), qui est un gène d'invasion conservé dans les gènes de Salmonella enterica. pipD et sopB, qui étaient associés au sérovar Enteritidis, ont été détectés dans 92,4 % et 94,1 % des isolats respectivement. S. Istanbul et S. Javiana, isolées dans des restaurants servant du poulet, portaient tous les gènes de virulence des cinq îles de pathogénicité. Il y avait une association significative entre les gènes de virulence sopB, sitC, orfLC, pipD et pefA et la résistance aux antibiotiques couramment utilisés au Sénégal et en Gambie, à savoir l'amoxicilline, la ticarcilline, le triméthoprime plus le sulfaméthoxazole, la tétracycline, le triméthoprime, la spectinomycine, la streptomycine, les sulfamides et la nitrofurantoïne. Conclusions : Cette étude montre que les gènes de virulence sont présents dans les souches NTS isolées à partir de diverses sources. L'association significative entre certains gènes de virulence et la résistance aux antibiotiques peut avoir des implications importantes en ce qui concerne la propagation et la persistance des gènes de résistance et de virulence chez Salmonella et l'utilisation prudente des agents antimicrobiens chez les humains et les animaux en Afrique de l'Ouest.

Translated Description (Spanish)

Introducción: Se desconoce la prevalencia de genes de virulencia en Salmonella no tifoidea (NTS) y su asociación con antibióticos de uso común en África Occidental. Metodología: Probamos 185 aislados de NTS de niños, animales y productos alimenticios para detectar la presencia de doce genes de virulencia por PCR. Diez de los genes de virulencia analizados pertenecían a las cinco islas de patogenicidad de Salmonella implicadas en su patogénesis. Resultados: Diez de los doce genes de virulencia excepto sopE y pefA estaban presentes en al menos el 70% de los aislados probados; sopE y pefA se observaron en el 33% y el 44% de los aislados, respectivamente. El gen más prevalente fue invA (99,5%), que es un gen de invasión conservado dentro de la Salmonella enterica. Los genes pipD y sopB, que se asociaron con el serovar Enteritidis, se detectaron en el 92,4% y el 94,1% de los aislados, respectivamente. S. Istanbul y S. Javiana, que se aislaron de restaurantes de pollo, portaban todos los genes de virulencia de las cinco islas de patogenicidad. Hubo una asociación significativa entre los genes de virulencia sopB, sitC, orfLC, pipD y pefA y la resistencia a los antibióticos de uso común en Senegal y Gambia, a saber, amoxicilina, ticarcilina, trimetoprim más sulfametoxazol, tetraciclina, trimetoprim, espectinomicina, estreptomicina, sulfonamidas y nitrofurantoína. Conclusiones: Este estudio muestra que los genes de virulencia están presentes en cepas de NTS aisladas de diversas fuentes. La asociación significativa entre algunos genes de virulencia y la resistencia a los antibióticos puede tener implicaciones importantes con respecto a la propagación y persistencia de los genes de resistencia y virulencia en Salmonella y al uso prudente de agentes antimicrobianos en humanos y animales en África occidental.

Files

625.pdf

Files (249 Bytes)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:585e45b3b3574e1cd83b86f8e183e74e
249 Bytes
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
مقاومة مضادات الميكروبات وجينات الفوعة لعزلات السالمونيلا غير التيفية في غامبيا والسنغال
Translated title (French)
Gènes de résistance aux antimicrobiens et de virulence d'isolats non typhoïdiens de Salmonella en Gambie et au Sénégal
Translated title (Spanish)
Genes de resistencia y virulencia antimicrobiana de aislados de Salmonella no tifoidea en Gambia y Senegal

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2152428490
DOI
10.3855/jidc.1512

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Gambia

References

  • https://openalex.org/W1416035846
  • https://openalex.org/W1485047028
  • https://openalex.org/W1997892009
  • https://openalex.org/W2004690000
  • https://openalex.org/W2004886366
  • https://openalex.org/W2020977179
  • https://openalex.org/W2034519228
  • https://openalex.org/W2046193812
  • https://openalex.org/W2050947647
  • https://openalex.org/W2055673523
  • https://openalex.org/W2055862784
  • https://openalex.org/W2055948862
  • https://openalex.org/W2074879055
  • https://openalex.org/W2074969464
  • https://openalex.org/W2080549630
  • https://openalex.org/W2088250818
  • https://openalex.org/W2109433105
  • https://openalex.org/W2111376973
  • https://openalex.org/W2132682438
  • https://openalex.org/W2149999650
  • https://openalex.org/W2160316962
  • https://openalex.org/W2165227097
  • https://openalex.org/W2171283724
  • https://openalex.org/W2231327310
  • https://openalex.org/W2260017570
  • https://openalex.org/W2274987590
  • https://openalex.org/W2330187761