Published January 1, 2022 | Version v1
Publication Metadata-only

The diversity and evolutionary relationships of ticks and tick-borne bacteria in China

Creators

  • 1. Duke University
  • 2. Wuhan Center for Disease Control and Prevention
  • 3. Jilin Medical University
  • 4. Jilin University
  • 5. University of Nebraska–Lincoln
  • 6. Sun Yat-sen University
  • 7. Stanford University
  • 8. China Agricultural University
  • 9. Capital University
  • 10. Capital Medical University
  • 11. Huazhong University of Science and Technology
  • 12. People's Hospital of Xinjiang Uygur Autonomous Region
  • 13. Qingdao University
  • 14. University of Chinese Academy of Sciences
  • 15. Children's Hospital of Fudan University
  • 16. Tianjin Medical University Cancer Institute and Hospital
  • 17. Novartis (United States)
  • 18. Central South University
  • 19. Shenzhen Second People's Hospital
  • 20. Jiangsu Academy of Agricultural Sciences
  • 21. Peking University
  • 22. Peking University Sixth Hospital
  • 23. Shandong Provincial Hospital
  • 24. Oil Crops Research Institute
  • 25. Affiliated Hospital of Southwest Medical University
  • 26. Peking Union Medical College Hospital
  • 27. Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
  • 28. Shenzhen University Health Science Center
  • 29. Oklahoma State University Oklahoma City
  • 30. Fudan University
  • 31. Chinese Academy of Sciences
  • 32. Fafo Foundation
  • 33. Third Xiangya Hospital
  • 34. Sichuan University
  • 35. University of the Sunshine Coast

Description

Phylogenetic tree of tick and tick-associated bacteria in this study. We collected more than 20,000 contemporary and historical (up to 60 years of preservation) tick samples representing a wide range of tick biodiversity across diverse geographic regions in China. Metagenomic sequencing was performed on individual ticks to obtain the complete or near-complete mitochondrial (mt) genome sequences from 46 tick species, among which mitochondrial genomes were revealed for the first time for 23 species. These new mt genomes data greatly expanded the diversity of many tick groups and revealed five cryptic species. Utilizing the same metagenomic sequence data we identified divergent and abundant bacteria in Haemaphysalis, Ixodes, Dermacentor and Carios ticks, including nine species of pathogenetic bacteria and potentially new species within the genus Borrelia. We also used these data to explore the evolutionary relationship between ticks and their associated bacteria, revealing a pattern of long-term co-divergence relationship between ticks and Rickettsia and Coxiella bacteria.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

شجرة النشوء والتطور من القراد والبكتيريا المرتبطة بالقراد في هذه الدراسة. جمعنا أكثر من 20000 عينة معاصرة وتاريخية (تصل إلى 60 عامًا من الحفظ) تمثل مجموعة واسعة من التنوع البيولوجي للقراد عبر مناطق جغرافية متنوعة في الصين. تم إجراء التسلسل الميتاجينومي على القراد الفردي للحصول على تسلسل جينوم الميتوكوندريا الكامل أو شبه الكامل من 46 نوعًا من القراد، من بينها جينومات الميتوكوندريا التي تم الكشف عنها لأول مرة لـ 23 نوعًا. وسعت بيانات جينومات MT الجديدة هذه بشكل كبير من تنوع العديد من مجموعات القراد وكشفت عن خمسة أنواع خفية. باستخدام نفس بيانات التسلسل الميتاجينومي، حددنا البكتيريا المتباينة والوفرة في القراد الدموي، اللبود، ناخس الجلد، وكاريوس، بما في ذلك تسعة أنواع من البكتيريا المسببة للأمراض وأنواع جديدة محتملة داخل جنس البورلية. كما استخدمنا هذه البيانات لاستكشاف العلاقة التطورية بين القراد والبكتيريا المرتبطة بها، وكشفنا عن نمط من علاقة التباعد المشترك طويلة الأجل بين القراد وبكتيريا الريكتسيا وكوكسيلا.

Translated Description (French)

Arbre phylogénétique des bactéries associées aux tiques et aux tiques dans cette étude. Nous avons recueilli plus de 20 000 échantillons de tiques contemporains et historiques (jusqu'à 60 ans de conservation) représentant un large éventail de biodiversité de tiques dans diverses régions géographiques de Chine. Le séquençage métagénomique a été effectué sur des tiques individuelles pour obtenir les séquences complètes ou presque complètes du génome mitochondrial (mt) de 46 espèces de tiques, parmi lesquelles les génomes mitochondriaux ont été révélés pour la première fois pour 23 espèces. Ces nouvelles données sur les génomes mt ont considérablement élargi la diversité de nombreux groupes de tiques et ont révélé cinq espèces cryptiques. En utilisant les mêmes données de séquence métagénomique, nous avons identifié des bactéries divergentes et abondantes chez les tiques Haemaphysalis, Ixodes, Dermacentor et Carios, y compris neuf espèces de bactéries pathogènes et potentiellement de nouvelles espèces du genre Borrelia. Nous avons également utilisé ces données pour explorer la relation évolutive entre les tiques et leurs bactéries associées, révélant un modèle de relation de co-divergence à long terme entre les tiques et les bactéries Rickettsia et Coxiella.

Translated Description (Spanish)

Árbol filogenético de garrapatas y bacterias asociadas a garrapatas en este estudio. Recopilamos más de 20.000 muestras de garrapatas contemporáneas e históricas (hasta 60 años de preservación) que representan una amplia gama de biodiversidad de garrapatas en diversas regiones geográficas de China. La secuenciación metagenómica se realizó en garrapatas individuales para obtener las secuencias del genoma mitocondrial (mt) completas o casi completas de 46 especies de garrapatas, entre las cuales se revelaron genomas mitocondriales por primera vez para 23 especies. Estos nuevos datos de genomas mt ampliaron en gran medida la diversidad de muchos grupos de garrapatas y revelaron cinco especies crípticas. Utilizando los mismos datos de secuencia metagenómica, identificamos bacterias divergentes y abundantes en las garrapatas Haemaphysalis, Ixodes, Dermacentor y Carios, incluidas nueve especies de bacterias patogénicas y especies potencialmente nuevas dentro del género Borrelia. También utilizamos estos datos para explorar la relación evolutiva entre las garrapatas y sus bacterias asociadas, revelando un patrón de relación de codivergencia a largo plazo entre las garrapatas y las bacterias Rickettsia y Coxiella.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التنوع والعلاقات التطورية للقراد والبكتيريا المنقولة بالقراد في الصين
Translated title (French)
La diversité et les relations évolutives des tiques et des bactéries transmises par les tiques en Chine
Translated title (Spanish)
La diversidad y las relaciones evolutivas de las garrapatas y las bacterias transmitidas por garrapatas en China

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4394141420
DOI
10.6084/m9.figshare.19354481.v1

Is supplement to
https://openalex.org/W3193984463 (Other)
https://openalex.org/W2967307657 (Other)
https://openalex.org/W2777390700 (Other)
https://openalex.org/W2749609582 (Other)
https://openalex.org/W2366779182 (Other)
https://openalex.org/W2330070113 (Other)
https://openalex.org/W2132417459 (Other)
https://openalex.org/W2125061774 (Other)
https://openalex.org/W2038445597 (Other)
https://openalex.org/W1935455385 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China