Published September 29, 2017 | Version v1
Publication Open

Characterization of Anaplasma ovis strains using the major surface protein 1a repeat sequences

Creators

  • 1. Lanzhou Veterinary Research Institute
  • 2. Chinese Academy of Agricultural Sciences

Description

Anaplasma ovis is one of the tick-transmitted pathogens of small ruminants. It causes ovine anaplasmosis and widely distributed in the world. In contrast to extensive worldwide genetic diversity of A. marginale and A. phagocytophilum, there are few reports on the classification of A. ovis strains. This study was conducted to investigate the occurrence and characterize A. ovis strains from goats and sheep from 12 provinces in China. The occurrence of A. ovis DNA was tested in 552 goats and sheep, by PCR based on the msp4 gene. Positive samples were used for the amplification of the msp1a gene of A. ovis. The Msp1a amino acid repeats were further identified and used for the characterization of A. ovis strains. The results showed that 79 (14.3%) goats and sheep were positive for A. ovis. The infection rates of A. ovis among different study sites ranged from 0 to 100%, and were significantly higher in sheep (26.6%, 45/169) than in goats (8.9%, 34/383) (χ 2 = 21.403, df = 1, P < 0.001). The msp4 gene sequences of these isolates were 99.8–100% identical to each other, and they represented two sequence types. Forty-four partial msp1a gene sequences containing the repeat sequences were obtained from A. ovis-positive samples. After translation to amino acid sequences, 24 Msp1a repeats with 33 to 47 amino acids, which corresponded to 19 genotypes of A. ovis, were recognized in goats and sheep in China. Anaplasma ovis is widely distributed in the investigated geographical regions. The msp4 gene of A. ovis had high sequence identity and was unable to be used to discriminate different strains. The Msp1a could be used as a genetic marker for characterizing A. ovis, and 19 genotypes of A. ovis were recognized in domestic small ruminants in China. The present study revealed, for the first time, the genetic diversity of A. ovis based on the analyses of Msp1a amino acid repeats.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

Anaplasma ovis هي واحدة من مسببات الأمراض التي تنتقل عن طريق القراد من المجترات الصغيرة. يسبب داء الكشمش الغنمي وينتشر على نطاق واسع في العالم. على النقيض من التنوع الجيني الواسع في جميع أنحاء العالم لـ A. marginale و A. phagocytophilum، هناك عدد قليل من التقارير حول تصنيف سلالات A. ovis. أجريت هذه الدراسة للتحقيق في حدوث وتوصيف سلالات الغنم من الماعز والأغنام من 12 مقاطعة في الصين. تم اختبار حدوث A. ovis DNA في 552 من الماعز والأغنام، بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل بناءً على جين msp4. تم استخدام عينات إيجابية لتضخيم جين msp1a من A. ovis. تم تحديد تكرارات الأحماض الأمينية Msp1a واستخدامها لتوصيف سلالات A. ovis. أظهرت النتائج أن 79 (14.3 ٪) من الماعز والأغنام كانت إيجابية لـ A. ovis. تراوحت معدلات الإصابة بـ A. Ovis بين مواقع الدراسة المختلفة من 0 إلى 100 ٪، وكانت أعلى بكثير في الأغنام (26.6 ٪، 45/169) من الماعز (8.9 ٪، 34/383) (χ 2 = 21.403، df = 1، P < 0.001). كانت تسلسلات جين msp4 لهذه العزلات متطابقة بنسبة 99.8-100 ٪ مع بعضها البعض، وكانت تمثل نوعين من التسلسل. تم الحصول على أربعة وأربعين تسلسلًا جينيًا msp1a جزئيًا يحتوي على التسلسلات المتكررة من عينات A. ovis - positive. بعد الانتقال إلى تسلسلات الأحماض الأمينية، تم التعرف على 24 Msp1a تتكرر مع 33 إلى 47 من الأحماض الأمينية، والتي تتوافق مع 19 نمطًا وراثيًا من A. ovis، في الماعز والأغنام في الصين. يتم توزيع أنابلازما الغنم على نطاق واسع في المناطق الجغرافية التي تم التحقيق فيها. كان لجين msp4 من A. ovis هوية تسلسل عالية ولم يكن من الممكن استخدامه لتمييز سلالات مختلفة. يمكن استخدام Msp1a كعلامة وراثية لتوصيف A. ovis، وتم التعرف على 19 نمطًا وراثيًا من A. ovis في المجترات الصغيرة المحلية في الصين. كشفت الدراسة الحالية، لأول مرة، عن التنوع الجيني لـ A. ovis بناءً على تحليلات الأحماض الأمينية Msp1a المتكررة.

Translated Description (French)

Anaplasma ovis est l'un des agents pathogènes transmis par les tiques chez les petits ruminants. Il provoque l'anaplasmose ovine et est largement répandu dans le monde. Contrairement à la grande diversité génétique mondiale d'A. marginale et d'A. phagocytophilum, il existe peu de rapports sur la classification des souches d'A. ovis. Cette étude a été menée pour étudier l'occurrence et caractériser les souches d'A. ovis provenant de chèvres et de moutons de 12 provinces de Chine. L'occurrence de l'ADN d'A. ovis a été testée chez 552 chèvres et moutons, par PCR basée sur le gène msp4. Des échantillons positifs ont été utilisés pour l'amplification du gène msp1a d'A. ovis. Les répétitions d'acides aminés Msp1a ont ensuite été identifiées et utilisées pour la caractérisation des souches d'A. ovis. Les résultats ont montré que 79 (14,3%) chèvres et moutons étaient positifs pour A. ovis. Les taux d'infection d'A. ovis entre les différents sites de l'étude variaient de 0 à 100 % et étaient significativement plus élevés chez les ovins (26,6 %, 45/169) que chez les caprins (8,9 %, 34/383) (χ 2 = 21,403, df = 1, P < 0,001). Les séquences du gène msp4 de ces isolats étaient identiques entre 99,8 et 100 %, et elles représentaient deux types de séquences. Quarante-quatre séquences partielles du gène msp1a contenant les séquences répétées ont été obtenues à partir d'échantillons positifs pour A. ovis. Après traduction en séquences d'acides aminés, 24 répétitions de Msp1a avec 33 à 47 acides aminés, correspondant à 19 génotypes d'A. ovis, ont été reconnues chez les chèvres et les moutons en Chine. Anaplasma ovis est largement distribué dans les régions géographiques étudiées. Le gène msp4 d'A. ovis avait une identité de séquence élevée et ne pouvait pas être utilisé pour discriminer différentes souches. Le Msp1a pourrait être utilisé comme marqueur génétique pour caractériser A. ovis, et 19 génotypes d'A. ovis ont été reconnus chez les petits ruminants domestiques en Chine. La présente étude a révélé, pour la première fois, la diversité génétique d'A. ovis sur la base des analyses des répétitions d'acides aminés Msp1a.

Translated Description (Spanish)

Anaplasma ovis es uno de los patógenos transmitidos por garrapatas de pequeños rumiantes. Causa anaplasmosis ovina y está ampliamente distribuida en el mundo. En contraste con la amplia diversidad genética mundial de A. marginale y A. phagocytophilum, hay pocos informes sobre la clasificación de las cepas de A. ovis. Este estudio se realizó para investigar la aparición y caracterizar las cepas de A. ovis de cabras y ovejas de 12 provincias de China. La aparición de ADN de A. ovis se probó en 552 cabras y ovejas, mediante PCR basada en el gen msp4. Se utilizaron muestras positivas para la amplificación del gen msp1a de A. ovis. Las repeticiones de aminoácidos de Msp1a se identificaron adicionalmente y se utilizaron para la caracterización de cepas de A. ovis. Los resultados mostraron que 79 (14,3%) cabras y ovejas dieron positivo para A. ovis. Las tasas de infección de A. ovis entre los diferentes sitios de estudio oscilaron entre 0 y 100%, y fueron significativamente más altas en ovejas (26.6%, 45/169) que en cabras (8.9%, 34/383) (χ 2 = 21.403, df = 1, P < 0.001). Las secuencias del gen msp4 de estos aislados eran 99.8-100% idénticas entre sí, y representaban dos tipos de secuencias. Cuarenta y cuatro secuencias parciales del gen msp1a que contienen las secuencias de repetición se obtuvieron de muestras positivas para A. ovis. Después de la traducción a secuencias de aminoácidos, se reconocieron 24 repeticiones de Msp1a con 33 a 47 aminoácidos, que correspondían a 19 genotipos de A. ovis, en cabras y ovejas en China. Anaplasma ovis está ampliamente distribuida en las regiones geográficas investigadas. El gen msp4 de A. ovis tenía una alta identidad de secuencia y no se pudo utilizar para discriminar diferentes cepas. El Msp1a podría usarse como marcador genético para caracterizar A. ovis, y se reconocieron 19 genotipos de A. ovis en pequeños rumiantes domésticos en China. El presente estudio reveló, por primera vez, la diversidad genética de A. ovis basada en los análisis de repeticiones de aminoácidos de Msp1a.

Files

s13071-017-2363-6.pdf

Files (784.5 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:710edbfdfb06f2841aa4d8b8b17b05f1
784.5 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
توصيف سلالات أنابلازما الغنم باستخدام البروتين السطحي الرئيسي 1 أ تكرار التسلسلات
Translated title (French)
Caractérisation des souches d'Anaplasma ovis à l'aide des principales séquences répétées de la protéine de surface 1a
Translated title (Spanish)
Caracterización de cepas de Anaplasma ovis utilizando las principales secuencias de repetición de la proteína de superficie 1a

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2758215769
DOI
10.1186/s13071-017-2363-6

Is supplement to
https://openalex.org/W4254925464 (Other)
https://openalex.org/W331913107 (Other)
https://openalex.org/W3124533506 (Other)
https://openalex.org/W2992997014 (Other)
https://openalex.org/W2790585847 (Other)
https://openalex.org/W2399288630 (Other)
https://openalex.org/W2170324379 (Other)
https://openalex.org/W2169455587 (Other)
https://openalex.org/W2016035275 (Other)
https://openalex.org/W1964948995 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1956842074
  • https://openalex.org/W1969443505
  • https://openalex.org/W1990690755
  • https://openalex.org/W1998926649
  • https://openalex.org/W2026124461
  • https://openalex.org/W2027078427
  • https://openalex.org/W2027558100
  • https://openalex.org/W2028247302
  • https://openalex.org/W2041804860
  • https://openalex.org/W2050863386
  • https://openalex.org/W2065730802
  • https://openalex.org/W2071746964
  • https://openalex.org/W2081574858
  • https://openalex.org/W2091039424
  • https://openalex.org/W2095480531
  • https://openalex.org/W2104001535
  • https://openalex.org/W2104319838
  • https://openalex.org/W2107847466
  • https://openalex.org/W2114672742
  • https://openalex.org/W2121490627
  • https://openalex.org/W2123735523
  • https://openalex.org/W2127851542
  • https://openalex.org/W2131184698
  • https://openalex.org/W2134730305
  • https://openalex.org/W2168640157
  • https://openalex.org/W2241258390
  • https://openalex.org/W2314481069
  • https://openalex.org/W2319010814
  • https://openalex.org/W2405746548
  • https://openalex.org/W2495137084
  • https://openalex.org/W2513841829
  • https://openalex.org/W2560576522
  • https://openalex.org/W2582104246