Published December 1, 2016 | Version v1
Publication Open

Note: Tormenta: An open source Python-powered control software for camera based optical microscopy

  • 1. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
  • 2. Fundación Ciencias Exactas y Naturales
  • 3. University of Buenos Aires

Description

Until recently, PC control and synchronization of scientific instruments was only possible through closed-source expensive frameworks like National Instruments' LabVIEW. Nowadays, efficient cost-free alternatives are available in the context of a continuously growing community of open-source software developers. Here, we report on Tormenta, a modular open-source software for the control of camera-based optical microscopes. Tormenta is built on Python, works on multiple operating systems, and includes some key features for fluorescence nanoscopy based on single molecule localization.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

حتى وقت قريب، لم يكن التحكم في الكمبيوتر ومزامنة الأدوات العلمية ممكنًا إلا من خلال أطر مكلفة مغلقة المصدر مثل LabVIEW للأدوات الوطنية. في الوقت الحاضر، تتوفر بدائل فعالة مجانية في سياق مجتمع متزايد باستمرار من مطوري البرمجيات مفتوحة المصدر. هنا، نقدم تقريرًا عن Tormenta، وهو برنامج معياري مفتوح المصدر للتحكم في المجاهر البصرية القائمة على الكاميرا. تم بناء Tormenta على Python، ويعمل على أنظمة تشغيل متعددة، ويتضمن بعض الميزات الرئيسية للتنظير النانوي الفلوري بناءً على توطين جزيء واحد.

Translated Description (French)

Jusqu'à récemment, le contrôle par PC et la synchronisation des instruments scientifiques n'étaient possibles que par le biais de cadres coûteux à source fermée tels que LabVIEW de National Instruments. De nos jours, des alternatives efficaces et gratuites sont disponibles dans le contexte d'une communauté en constante croissance de développeurs de logiciels open source. Ici, nous présentons Tormenta, un logiciel open source modulaire pour le contrôle des microscopes optiques à caméra. Tormenta est construit sur Python, fonctionne sur plusieurs systèmes d'exploitation et comprend certaines fonctionnalités clés pour la nanoscopie par fluorescence basée sur la localisation d'une seule molécule.

Translated Description (Spanish)

Hasta hace poco, el control de PC y la sincronización de instrumentos científicos solo era posible a través de marcos costosos de código cerrado como LabVIEW de National Instruments. Hoy en día, existen alternativas eficientes y gratuitas en el contexto de una comunidad en continuo crecimiento de desarrolladores de software de código abierto. Aquí, informamos sobre Tormenta, un software modular de código abierto para el control de microscopios ópticos basados en cámaras. Tormenta se basa en Python, funciona en múltiples sistemas operativos e incluye algunas características clave para la nanoscopía de fluorescencia basada en la localización de una sola molécula.

Files

CONICET_Digital_Nro.86195c8d-bbfb-4e7f-90ac-bcf7d05192ad_A.pdf.pdf

Files (1.4 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:d6fcfe167c39c97a13e73f28e98cd06d
1.4 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
ملاحظة: Tormenta: برنامج تحكم مفتوح المصدر يعمل بنظام Python للفحص المجهري البصري القائم على الكاميرا
Translated title (French)
Remarque : Tormenta : un logiciel de contrôle open source alimenté par Python pour la microscopie optique basée sur une caméra
Translated title (Spanish)
Nota: Tormenta: Un software de control de código abierto impulsado por Python para microscopía óptica basada en cámara

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2563756885
DOI
10.1063/1.4972392

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Argentina

References

  • https://openalex.org/W1540070193
  • https://openalex.org/W1969103349
  • https://openalex.org/W1981475064
  • https://openalex.org/W1997904982
  • https://openalex.org/W2015404233
  • https://openalex.org/W2021810362
  • https://openalex.org/W2037100030
  • https://openalex.org/W2054455698
  • https://openalex.org/W2066521860
  • https://openalex.org/W2169791141