Published March 16, 2021
| Version v1
Publication
Open
Novel and recurrent BRCA1/BRCA2 germline mutations in patients with breast/ovarian cancer: a series from the south of Tunisia
Creators
- 1. Centre of Biotechnology of Sfax
- 2. University of Sfax
- 3. Hopital Universitaire Habib Bourguiba
Description
Abstract Background The incidence of breast cancer (BC) and/or ovarian cancer (OC) is increasing in Tunisia especially in young women and mostly those with family history. However, the spectrum of BRCA mutations remains little explored in Tunisian patients in particular in the southern region. Methods We sequenced the entire coding regions of BRCA1 and BRCA2 genes using next generation sequencing (NGS) in 134 selected patients with BC and/or OC. Results Among the 134 patients, 19 (14.17%) carried pathogenic mutations (10 are BRCA1 mutation carriers and 9 are BRCA2 mutation carriers) that are mainly frameshift index (76.9%). Interestingly, 5 out of the 13 variants (38.46%) were found at least twice in unrelated patients, as the c.1310-1313 delAAGA in BRCA2 and the c.5030_5033 delCTAA that has been identified in 4/98 BC patients and in 3/15 OC patients from unrelated families with strong history of cancer. Besides recurrent mutations, 6 variant (4 in BRCA1 and 2 in BRCA2 ) were not reported previously. Furthermore, 3 unrelated patients carried the VUS c.9976A > T, (K3326*) in BRCA2 exon 27. BRCA carriers correlated significantly with tumor site (p = 0.029) and TNBC cases (p = 0.008). In the groups of patients aged between 31 and 40, and 41–50 years, BRCA1 mutations occurred more frequently in patients with OC than those with BC, and conversely BRCA2 carriers are mostly affected with BC (p = 0.001, and p = 0.044 respectively). Conclusions The overall frequency of the BRCA germline mutations was 14.17% in patients with high risk of breast/ovarian cancer. We identified recurrent mutations as the c.1310_1313 delAAGA in BRCA2 gene and the c.5030_5033 delCTAA in BRCA1 gene that were found in 4% and 20% of familial BC and OC respectively. Our data will contribute in the implementation of genetic counseling and testing for families with high-risk of BC and/or OC.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
خلفية مجردة يتزايد معدل الإصابة بسرطان الثدي و/أو سرطان المبيض في تونس خاصة بين الشابات ومعظمهن ذوات التاريخ العائلي. ومع ذلك، لا يزال طيف طفرات الجين BRCA قليل الاستكشاف في المرضى التونسيين ولا سيما في المنطقة الجنوبية. الطرق قمنا بتسلسل مناطق الترميز بأكملها لجينات BRCA1 و BRCA2 باستخدام تسلسل الجيل التالي (NGS) في 134 مريضًا مختارًا يعانون من BC و/أو OC. النتائج من بين 134 مريضًا، كان 19 (14.17 ٪) يحملون طفرات مسببة للأمراض (10 ناقلات طفرات BRCA1 و 9 ناقلات طفرات BRCA2) وهي بشكل أساسي مؤشر انزياح الإطار (76.9 ٪). ومن المثير للاهتمام، أنه تم العثور على 5 من أصل 13 متغيرًا (38.46 ٪) مرتين على الأقل في مرضى غير ذوي صلة، مثل c.1310-1313 delAAGA في BRCA2 و c.5030_5033 delCTAA التي تم تحديدها في مرضى 4/98 قبل الميلاد وفي 3/15 مرضى OC من عائلات غير ذات صلة لها تاريخ قوي من السرطان. إلى جانب الطفرات المتكررة، لم يتم الإبلاغ عن 6 متغيرات (4 في BRCA1 و 2 في BRCA2) سابقًا. علاوة على ذلك، حمل 3 مرضى غير مرتبطين VUs c.9976A > T، (K3326 *) في BRCA2 exon 27. ترتبط حاملات BRCA بشكل كبير بموقع الورم (p = 0.029) وحالات TNBC (p = 0.008). في مجموعات المرضى الذين تتراوح أعمارهم بين 31 و 40 عامًا، و 41–50 عامًا، حدثت طفرات BRCA1 بشكل متكرر في المرضى الذين يعانون من OC أكثر من أولئك الذين يعانون من BC، وعلى العكس من ذلك تتأثر ناقلات BRCA2 في الغالب بـ BC (p = 0.001، و p = 0.044 على التوالي). الاستنتاجات كان التكرار الإجمالي لطفرات الخط الجرثومي BRCA 14.17 ٪ في المرضى الذين يعانون من ارتفاع خطر الإصابة بسرطان الثدي/المبيض. حددنا الطفرات المتكررة مثل c.1310_1313 delAAGA في جين BRCA2 و c.5030_5033 delCTAA في جين BRCA1 التي تم العثور عليها في 4 ٪ و 20 ٪ من BC و OC العائلي على التوالي. ستساهم بياناتنا في تنفيذ الاستشارات والاختبارات الوراثية للعائلات المعرضة لخطر كبير من BC و/أو OC.Translated Description (French)
Résumé Contexte L'incidence du cancer du sein (CB) et/ou du cancer de l'ovaire (CO) est en augmentation en Tunisie, en particulier chez les jeunes femmes et surtout celles ayant des antécédents familiaux. Cependant, le spectre des mutations BRCA reste peu exploré chez les patients tunisiens en particulier dans la région sud. Méthodes Nous avons séquencé l'ensemble des régions codantes des gènes BRCA1 et BRCA2 en utilisant le séquençage de prochaine génération (NGS) chez 134 patients sélectionnés atteints de BC et/ou OC. Résultats Parmi les 134 patients, 19 (14,17 %) portaient des mutations pathogènes (10 sont porteuses de la mutation BRCA1 et 9 sont porteuses de la mutation BRCA2) qui sont principalement des indices de décalage de cadre (76,9 %). Fait intéressant, 5 des 13 variants (38,46 %) ont été trouvés au moins deux fois chez des patients non apparentés, comme le c.1310-1313 delAAGA dans BRCA2 et le c.5030_5033 delCTAA qui a été identifié chez 4/98 patients BC et chez 3/15 patients OC de familles non apparentées ayant de solides antécédents de cancer. Outre les mutations récurrentes, 6 variants (4 dans BRCA1 et 2 dans BRCA2 ) n'ont pas été rapportés précédemment. De plus, 3 patients non apparentés portaient les VU c.9976A > T, (K3326 *) dans l'exon 27 de BRCA2. Les porteurs de BRCA étaient significativement corrélés avec le site tumoral (p = 0,029) et les cas de CSTN (p = 0,008). Dans les groupes de patients âgés de 31 à 40 ans et de 41 à 50 ans, les mutations BRCA1 sont survenues plus fréquemment chez les patients atteints d'OC que chez ceux atteints de BC, et inversement, les porteurs de BRCA2 sont principalement affectés par BC (p = 0,001 et p = 0,044 respectivement). Conclusions La fréquence globale des mutations germinales BRCA était de 14,17 % chez les patientes présentant un risque élevé de cancer du sein/de l'ovaire. Nous avons identifié des mutations récurrentes comme le c.1310_1313 delAAGA dans le gène BRCA2 et le c.5030_5033 delCTAA dans le gène BRCA1 qui ont été trouvées dans 4% et 20% des BC et OC familiaux respectivement. Nos données contribueront à la mise en œuvre de conseils et de tests génétiques pour les familles à haut risque de BC et/ou OC.Translated Description (Spanish)
Antecedentes abstractos La incidencia de cáncer de mama (BC) y/o cáncer de ovario (OC) está aumentando en Túnez, especialmente en mujeres jóvenes y principalmente en aquellas con antecedentes familiares. Sin embargo, el espectro de mutaciones BRCA sigue siendo poco explorado en pacientes tunecinos, en particular en la región sur. Métodos Secuenciamos las regiones codificantes completas de los genes BRCA1 y BRCA2 utilizando secuenciación de próxima generación (NGS) en 134 pacientes seleccionados con BC y/u OC. Resultados Entre los 134 pacientes, 19 (14,17%) portaban mutaciones patógenas (10 son portadores de la mutación BRCA1 y 9 son portadores de la mutación BRCA2) que son principalmente del índice de desplazamiento del marco (76,9%). Curiosamente, 5 de las 13 variantes (38.46%) se encontraron al menos dos veces en pacientes no relacionados, como el c.1310-1313 delAAGA en BRCA2 y el c.5030_5033 delCTAA que se ha identificado en 4/98 pacientes BC y en 3/15 pacientes OC de familias no relacionadas con fuertes antecedentes de cáncer. Además de las mutaciones recurrentes, no se informaron previamente 6 variantes (4 en BRCA1 y 2 en BRCA2 ). Además, 3 pacientes no relacionados portaron las VU c.9976A > T, (K3326 *) en el exón 27 de BRCA2. Los portadores de BRCA se correlacionaron significativamente con el sitio del tumor (p = 0.029) y los casos de TNBC (p = 0.008). En los grupos de pacientes con edades comprendidas entre 31 y 40 años, y 41–50 años, las mutaciones de BRCA1 ocurrieron con mayor frecuencia en pacientes con OC que en aquellos con BC, y por el contrario los portadores de BRCA2 se ven afectados principalmente con BC (p = 0.001 y p = 0.044 respectivamente). Conclusiones La frecuencia global de las mutaciones de la línea germinal BRCA fue del 14,17% en pacientes con alto riesgo de cáncer de mama/ovario. Identificamos mutaciones recurrentes como c.1310_1313 delAAGA en el gen BRCA2 y c.5030_5033 delCTAA en el gen BRCA1 que se encontraron en el 4% y el 20% de BC y OC familiares, respectivamente. Nuestros datos contribuirán a la implementación de asesoramiento y pruebas genéticas para familias con alto riesgo de BC y/o OC.Files
s12967-021-02772-y.pdf
Files
(1.1 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:c0ae746a8f73446e7a8c1136f791f80f
|
1.1 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- طفرات الخط الجرثومي BRCA1/BRCA2 الجديدة والمتكررة في المرضى الذين يعانون من سرطان الثدي/المبيض: سلسلة من جنوب تونس
- Translated title (French)
- Mutations germinales BRCA1/BRCA2 nouvelles et récurrentes chez des patientes atteintes d'un cancer du sein/ovaire : une série du sud de la Tunisie
- Translated title (Spanish)
- Nuevas y recurrentes mutaciones de la línea germinal BRCA1/BRCA2 en pacientes con cáncer de mama/ovario: una serie del sur de Túnez
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3137822132
- DOI
- 10.1186/s12967-021-02772-y
References
- https://openalex.org/W54468324
- https://openalex.org/W86162437
- https://openalex.org/W277215578
- https://openalex.org/W1661202068
- https://openalex.org/W1951245463
- https://openalex.org/W1980514388
- https://openalex.org/W1980575498
- https://openalex.org/W1991808212
- https://openalex.org/W1993451163
- https://openalex.org/W2021364153
- https://openalex.org/W2024883983
- https://openalex.org/W2051409228
- https://openalex.org/W2064512880
- https://openalex.org/W2086840280
- https://openalex.org/W2097026108
- https://openalex.org/W2106080156
- https://openalex.org/W2110017381
- https://openalex.org/W2118498634
- https://openalex.org/W2126854245
- https://openalex.org/W2135023031
- https://openalex.org/W2143924924
- https://openalex.org/W2150111967
- https://openalex.org/W2157268956
- https://openalex.org/W2162662334
- https://openalex.org/W2165574718
- https://openalex.org/W2165693726
- https://openalex.org/W2193183011
- https://openalex.org/W2268907578
- https://openalex.org/W2319563274
- https://openalex.org/W2337450705
- https://openalex.org/W2340335534
- https://openalex.org/W2402636472
- https://openalex.org/W2426784330
- https://openalex.org/W2560753239
- https://openalex.org/W2621211161
- https://openalex.org/W2725922321
- https://openalex.org/W2786900524
- https://openalex.org/W2789481433
- https://openalex.org/W2792763108
- https://openalex.org/W2805971132
- https://openalex.org/W2943858321
- https://openalex.org/W2949471222
- https://openalex.org/W3025900780
- https://openalex.org/W3035264540
- https://openalex.org/W3075129494
- https://openalex.org/W3084396711
- https://openalex.org/W3093265161
- https://openalex.org/W3097486390
- https://openalex.org/W4210962723
- https://openalex.org/W4249593504