Published April 29, 2021 | Version v1
Publication Open

Nontuberculous mycobacteria in China: incidence and antimicrobial resistance spectrum from a nationwide survey

Creators

  • 1. Chinese Center For Disease Control and Prevention
  • 2. Beijing Hospital
  • 3. National Institute for Communicable Disease Control and Prevention

Description

Abstract Background Information on the prevalence and resistance spectrum of nontuberculous mycobacteria (NTM) in China is mainly based on regional or local data. To estimate the proportion of NTM cases in China, a national survey of NTM pulmonary disease was carried out based on acid-fast positive sputum samples collected in 2013. Methods Sputum samples collected from enrolled presumptive cases in 72 nationwide tuberculosis surveillance sites from the 31 provinces in the mainland of China were cultured using L-J medium at the National tuberculosis reference laboratory (NTRL). MALDI-TOF MS identified the species of re-cultured strains, and minimal inhibitory concentrations (MICs) were determined to evaluate the drug susceptibility of NTM isolates. Data analysis used statistical software SPSS version 22.0 for Windows statistical package. Results Of 4917 mycobacterial isolates cultured, 6.4% [317/4917, 95% confidence interval ( CI ) 5.8%–7.2%] were confirmed as NTM, among which 7.7% (287/3709, 95% CI 6.9%–8.6%) were from the southern region. In inland and coastal China, 87.7% (95% CI 78.7%–93.2%) and 50.0% (95% CI 43.7%–56.3%) of isolates, respectively, were slow-growing mycobacteria (SGM), with the remaining rapid growing mycobacteria (RGM). A total of 29 species were detected, Mycobacterium abscessus had higher clarithromycin-inducible resistance rates than M. massiliense (65.67% vs 2.22%). M. kansasii presented lower resistance rates in linezolid and moxifloxacin than M. avium-intracellulare complex (3.23% vs 66.67%, 0 vs 47.22%) and other SGM (3.23% vs 38%, 0 vs 26%). Conclusions More NTM pulmonary disease was observed in the south and coastal China ( P < 0.01). SGM was widely distributed, and more RGM are present in southern and coastal China ( P < 0.01). The antimicrobial resistance spectrum of different NTM species was significantly different and accurate species identification would be facilitated to NTM pulmonary disease treatment.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تستند المعلومات الأساسية المجردة حول انتشار ومقاومة طيف البكتيريا المتفطرة غير السُلّية (NTM) في الصين بشكل أساسي إلى البيانات الإقليمية أو المحلية. ولتقدير نسبة حالات الإصابة بالأمراض الرئوية غير المعدية في الصين، تم إجراء مسح وطني للأمراض الرئوية غير المعدية بناءً على عينات البلغم الإيجابية السريعة الحمضية التي تم جمعها في عام 2013. تم استزراع عينات البلغم التي تم جمعها من الحالات الافتراضية المسجلة في 72 موقعًا لمراقبة السل على مستوى البلاد من 31 مقاطعة في البر الرئيسي للصين باستخدام وسيط LJ في المختبر المرجعي الوطني للسل (NTRL). حددت MALDI - TOF MS أنواع السلالات المعاد زراعتها، وتم تحديد الحد الأدنى من التركيزات المثبطة (MICs) لتقييم قابلية الأدوية لعزلات NTM. استخدم تحليل البيانات البرنامج الإحصائي SPSS الإصدار 22.0 للحزمة الإحصائية لنظام التشغيل Windows. نتائج 4917 من العزلات الفطرية المستزرعة، تم تأكيد 6.4 ٪ [317/4917، 95 ٪ فاصل ثقة ( CI ) 5.8 ٪-7.2 ٪] على أنها NTM، من بينها 7.7 ٪ (287/3709، 95 ٪ CI 6.9 ٪ -8.6 ٪) من المنطقة الجنوبية. في الصين الداخلية والساحلية، 87.7 ٪ (95 ٪ CI 78.7 ٪ -93.2 ٪) و 50.0 ٪ (95 ٪ CI 43.7 ٪-56.3 ٪) من العزلات، على التوالي، كانت بكتيريا متفطرة بطيئة النمو (SGM)، مع ما تبقى من بكتيريا متفطرة سريعة النمو (RGM). تم اكتشاف ما مجموعه 29 نوعًا، وكان لدى المتفطرة الخراجية معدلات مقاومة محرضة بالكلاريثروميسين أعلى من M. Massiliense (65.67 ٪ مقابل 2.22 ٪). قدم إم كانساسي معدلات مقاومة أقل في لينزوليد وموكسيفلوكساسين مقارنة بمركب إم أفيوم داخل السليلار (3.23 ٪ مقابل 66.67 ٪، 0 مقابل 47.22 ٪) وغيرها من SGM (3.23 ٪ مقابل 38 ٪، 0 مقابل 26 ٪). الاستنتاجات لوحظ المزيد من الأمراض الرئوية غير الانتقالية في جنوب الصين وساحلها ( P < 0.01). تم توزيع SGM على نطاق واسع، ويوجد المزيد من RGM في جنوب الصين وساحلها ( P < 0.01). كان طيف مقاومة مضادات الميكروبات لمختلف أنواع الطرق غير التقليدية مختلفًا بشكل كبير وسيتم تسهيل التحديد الدقيق للأنواع لعلاج الأمراض الرئوية.

Translated Description (French)

Résumé Contexte Les informations sur la prévalence et le spectre de résistance des mycobactéries non tuberculeuses (MNT) en Chine sont principalement basées sur des données régionales ou locales. Pour estimer la proportion de cas de MNT en Chine, une enquête nationale sur les maladies pulmonaires dues aux MNT a été réalisée sur la base d'échantillons d'expectorations positives acido-rapides prélevés en 2013. Méthodes Des échantillons d'expectorations prélevés sur des cas présumés inclus dans 72 sites de surveillance de la tuberculose à l'échelle nationale dans les 31 provinces de la partie continentale de la Chine ont été cultivés à l'aide de milieu L-J au laboratoire national de référence pour la tuberculose (NTRL). MALDI-TOF MS a identifié les espèces de souches re-cultivées, et des concentrations minimales inhibitrices (CMI) ont été déterminées pour évaluer la sensibilité aux médicaments des isolats de NTM. L'analyse des données a utilisé le logiciel statistique SPSS version 22.0 pour le package statistique Windows. Résultats Sur 4917 isolats de mycobactéries cultivés, 6,4 % [317/4917, intervalle de confiance ( IC ) à 95 % 5,8 %-7,2 %] ont été confirmés comme MNT, dont 7,7 % (287/3709, IC à 95 % 6,9 % -8,6 %) provenaient de la région sud. En Chine intérieure et côtière, 87,7 % (IC à 95 % 78,7 %-93,2 %) et 50,0 % (IC à 95 % 43,7 % -56,3 %) des isolats, respectivement, étaient des mycobactéries à croissance lente (SGM), les autres mycobactéries à croissance rapide (RGM). Au total, 29 espèces ont été détectées, Mycobacterium abscessus avait des taux de résistance inductibles par la clarithromycine plus élevés que M. massiliense (65,67 % contre 2,22 %). M. kansasii présentait des taux de résistance au linézolide et à la moxifloxacine inférieurs à ceux du complexe M. avium-intracellulare (3,23 % contre 66,67 %, 0 contre 47,22 %) et des autres SGM (3,23 % contre 38 %, 0 contre 26 %). Conclusions Plus de maladies pulmonaires NTM ont été observées dans le sud et le littoral de la Chine ( P < 0,01). La MGS a été largement distribuée et davantage de MGR sont présentes dans le sud et le littoral de la Chine ( P < 0,01). Le spectre de résistance aux antimicrobiens des différentes espèces de MNT était significativement différent et l'identification précise des espèces serait facilitée par le traitement des maladies pulmonaires par MNT.

Translated Description (Spanish)

Resumen Antecedentes La información sobre la prevalencia y el espectro de resistencia de las micobacterias no tuberculosas (MNT) en China se basa principalmente en datos regionales o locales. Para estimar la proporción de casos de MNT en China, se llevó a cabo una encuesta nacional de enfermedad pulmonar por MNT basada en muestras de esputo positivas acidorresistentes recogidas en 2013. Métodos Las muestras de esputo recolectadas de casos presuntos inscritos en 72 sitios de vigilancia de tuberculosis a nivel nacional de las 31 provincias de la parte continental de China se cultivaron utilizando medio L-J en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis (NTRL). MALDI-TOF MS identificó las especies de cepas re-cultivadas, y se determinaron las concentraciones inhibidoras mínimas (MIC) para evaluar la susceptibilidad al fármaco de los aislados de NTM. El análisis de datos utilizó el software estadístico SPSS versión 22.0 para el paquete estadístico de Windows. Resultados De 4917 aislados de micobacterias cultivados, el 6.4% [317/4917, intervalo de confianza ( IC ) del 95% 5.8%–7.2%] se confirmaron como NTM, entre los cuales el 7.7% (287/3709, IC del 95% 6.9%–8.6%) eran de la región sur. En China continental y costera, el 87.7% (IC 95% 78.7% -93.2%) y el 50.0% (IC 95% 43.7% -56.3%) de los aislados, respectivamente, fueron micobacterias de crecimiento lento (SGM), y las micobacterias de crecimiento rápido (RGM) restantes. Se detectaron un total de 29 especies, Mycobacterium abscessus tuvo tasas de resistencia inducible por claritromicina más altas que M. massiliense (65.67% vs 2.22%). M. kansasii presentó menores tasas de resistencia en linezolid y moxifloxacino que el complejo M. avium-intracellulare (3.23% vs 66.67%, 0 vs 47.22%) y otros SGM (3.23% vs 38%, 0 vs 26%). Conclusiones Se observó más enfermedad pulmonar MNT en el sur y la costa de China ( P < 0,01). La SGM se distribuyó ampliamente y hay más RGM presentes en el sur y la costa de China ( P < 0,01). El espectro de resistencia antimicrobiana de las diferentes especies de NTM fue significativamente diferente y se facilitaría la identificación precisa de las especies para el tratamiento de la enfermedad pulmonar de NTM.

Files

s40249-021-00844-1.pdf

Files (1.4 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:51296b8b8b808090131a9a1f47ea61bb
1.4 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
البكتيريا المتفطرة غير السالبة في الصين: طيف الإصابة ومقاومة مضادات الميكروبات من مسح وطني
Translated title (French)
Mycobactéries non tuberculeuses en Chine : incidence et spectre de résistance aux antimicrobiens à partir d'une enquête nationale
Translated title (Spanish)
Micobacterias no tuberculosas en China: incidencia y espectro de resistencia antimicrobiana de una encuesta nacional

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3128378232
DOI
10.1186/s40249-021-00844-1

Is supplement to
https://openalex.org/W4253738305 (Other)
https://openalex.org/W3133215096 (Other)
https://openalex.org/W3096412920 (Other)
https://openalex.org/W3046968067 (Other)
https://openalex.org/W2523815039 (Other)
https://openalex.org/W2329847590 (Other)
https://openalex.org/W2115778202 (Other)
https://openalex.org/W2113545019 (Other)
https://openalex.org/W2111510578 (Other)
https://openalex.org/W2105123842 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1977881210
  • https://openalex.org/W2026061583
  • https://openalex.org/W2028611465
  • https://openalex.org/W2034067646
  • https://openalex.org/W2046209527
  • https://openalex.org/W2053748082
  • https://openalex.org/W2054599038
  • https://openalex.org/W2075023109
  • https://openalex.org/W2102849529
  • https://openalex.org/W2142135213
  • https://openalex.org/W2155570658
  • https://openalex.org/W2301582324
  • https://openalex.org/W2395599755
  • https://openalex.org/W2400611817
  • https://openalex.org/W2527815999
  • https://openalex.org/W2591681146
  • https://openalex.org/W2608651537
  • https://openalex.org/W2754446119
  • https://openalex.org/W2765596162
  • https://openalex.org/W2770318071
  • https://openalex.org/W2789681693
  • https://openalex.org/W2808615100
  • https://openalex.org/W2889006619
  • https://openalex.org/W2901972975
  • https://openalex.org/W2971962492
  • https://openalex.org/W3045532883