Published October 4, 2022
| Version v1
Publication
Open
The diagnosis of leptospirosis complicated by pulmonary tuberculosis complemented by metagenomic next-generation sequencing: A case report
Creators
- 1. Wenzhou Medical University
- 2. Wenzhou Central Hospital
- 3. Chinese Center For Disease Control and Prevention
- 4. National Institute for Communicable Disease Control and Prevention
- 5. Institute of Biophysics
- 6. Chinese Academy of Sciences
Description
Leptospirosis is a zoonotic infection caused by the pathogenic Leptospira. Leptospirosis is transmitted mainly through contact with contaminated rivers, lakes, or animals carrying Leptospira. Human leptospirosis has a wide range of non-specific clinical manifestations ranging from fever, hypotension, and myalgia to multi-organ dysfunction, which severely hampers the timely clinical diagnosis and treatment of leptospirosis. Therefore, there is an urgent clinical need for an efficient strategy/method that can be used for the accurate diagnosis of leptospirosis, especially in critically ill patients. Here, we report a case of a 75-year-old male patient with clinical presentation of fever, cough, and diarrhea. Initial laboratory tests and a computed tomography (CT) scan of the chest suggested only tuberculosis. The patient was finally diagnosed with pulmonary tuberculosis (PTB) combined with leptospirosis by sputum Xpert MTB RIF, epidemiological investigations, and delayed serological testing. Furthermore, through metagenomic next-generation sequencing (mNGS) of clinical samples of cerebrospinal fluid (CSF), urine, plasma and sputum, the causative pathogens were identified as Mycobacterium tuberculosis complex and Leptospira spp. With specific treatment for both leptospirosis and tuberculosis, and associated supportive care (e.g., hemodialysis), the patient showed a good prognosis. This case report suggests that mNGS can generate a useful complement to conventional pathogenic diagnostic methods through more detailed etiological screening (i.e., at the level of species or species complex).
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
داء البريميات هو عدوى حيوانية المنشأ تسببها البريميات المسببة للأمراض. ينتقل داء البريميات بشكل رئيسي من خلال ملامسة الأنهار أو البحيرات أو الحيوانات الملوثة التي تحمل البريميات. يحتوي داء البريميات البشري على مجموعة واسعة من المظاهر السريرية غير المحددة التي تتراوح من الحمى وانخفاض ضغط الدم والألم العضلي إلى خلل وظيفي متعدد الأعضاء، مما يعوق بشدة التشخيص السريري في الوقت المناسب وعلاج داء البريميات. لذلك، هناك حاجة سريرية ملحة لاستراتيجية/طريقة فعالة يمكن استخدامها للتشخيص الدقيق لداء البريميات، خاصة في المرضى الذين يعانون من أمراض خطيرة. هنا، نبلغ عن حالة مريض ذكر يبلغ من العمر 75 عامًا يعاني من عرض سريري للحمى والسعال والإسهال. تشير الفحوصات المخبرية الأولية والتصوير المقطعي المحوسب (CT) للصدر إلى مرض السل فقط. تم تشخيص المريضة أخيرًا بالسل الرئوي (PTB) جنبًا إلى جنب مع داء البريميات بواسطة البلغم Xpert MTB RIF، والتحقيقات الوبائية، وتأخر الاختبار المصلي. علاوة على ذلك، من خلال تسلسل الجيل التالي من الميتاجينوم (mNGS) للعينات السريرية للسائل النخاعي (CSF) والبول والبلازما والبلغم، تم تحديد مسببات الأمراض المسببة على أنها مركب السل المتفطرة و Leptospira spp. مع العلاج المحدد لكل من داء البريميات والسل، والرعاية الداعمة المرتبطة به (على سبيل المثال، غسيل الكلى)، أظهر المريض تشخيصًا جيدًا. يشير تقرير الحالة هذا إلى أن الحلول الجينية الوطنية المتعددة الأطراف يمكن أن تولد مكملاً مفيداً لطرق التشخيص المسببة للأمراض التقليدية من خلال فحص مسببات أكثر تفصيلاً (أي على مستوى الأنواع أو مجمع الأنواع).Translated Description (French)
La leptospirose est une infection zoonotique causée par le Leptospira pathogène. La leptospirose se transmet principalement par contact avec des rivières, des lacs ou des animaux contaminés porteurs de Leptospira. La leptospirose humaine présente un large éventail de manifestations cliniques non spécifiques allant de la fièvre, de l'hypotension et de la myalgie à un dysfonctionnement multiviscéral, ce qui entrave gravement le diagnostic clinique et le traitement de la leptospirose en temps opportun. Par conséquent, il existe un besoin clinique urgent d'une stratégie/méthode efficace pouvant être utilisée pour le diagnostic précis de la leptospirose, en particulier chez les patients gravement malades. Ici, nous rapportons le cas d'un patient masculin de 75 ans présentant un tableau clinique de fièvre, de toux et de diarrhée. Les premiers tests de laboratoire et une tomodensitométrie de la poitrine ne suggéraient que la tuberculose. Le patient a finalement été diagnostiqué avec une tuberculose pulmonaire (PTB) associée à une leptospirose par expectoration Xpert MTB RIF, des investigations épidémiologiques et des tests sérologiques retardés. De plus, grâce au séquençage métagénomique de nouvelle génération (mNGS) d'échantillons cliniques de liquide céphalo-rachidien (LCR), d'urine, de plasma et d'expectorations, les agents pathogènes responsables ont été identifiés comme étant le complexe Mycobacterium tuberculosis et Leptospira spp. Avec un traitement spécifique pour la leptospirose et la tuberculose, et les soins de soutien associés (par exemple, l'hémodialyse), le patient a montré un bon pronostic. Ce rapport de cas suggère que le mNGS peut générer un complément utile aux méthodes diagnostiques pathogènes conventionnelles grâce à un dépistage étiologique plus détaillé (c'est-à-dire au niveau des espèces ou des complexes d'espèces).Translated Description (Spanish)
La leptospirosis es una infección zoonótica causada por la Leptospira patógena. La leptospirosis se transmite principalmente a través del contacto con ríos, lagos o animales contaminados que portan Leptospira. La leptospirosis humana tiene una amplia gama de manifestaciones clínicas inespecíficas que van desde fiebre, hipotensión y mialgia hasta disfunción multiorgánica, lo que dificulta gravemente el diagnóstico clínico y el tratamiento oportunos de la leptospirosis. Por lo tanto, existe una necesidad clínica urgente de una estrategia/método eficiente que se pueda utilizar para el diagnóstico preciso de la leptospirosis, especialmente en pacientes críticos. Aquí, informamos un caso de un paciente masculino de 75 años con presentación clínica de fiebre, tos y diarrea. Las pruebas de laboratorio iniciales y una tomografía computarizada (TC) del tórax sugirieron solo tuberculosis. Finalmente, el paciente fue diagnosticado con tuberculosis pulmonar (PTB) combinada con leptospirosis por esputo Xpert MTB RIF, investigaciones epidemiológicas y pruebas serológicas retrasadas. Además, a través de la secuenciación metagenómica de próxima generación (mNGS) de muestras clínicas de líquido cefalorraquídeo (LCR), orina, plasma y esputo, se identificaron los patógenos causantes como Mycobacterium tuberculosis complex y Leptospira spp. Con tratamiento específico tanto para la leptospirosis como para la tuberculosis, y cuidados de apoyo asociados (por ejemplo, hemodiálisis), el paciente mostró un buen pronóstico. Este informe de caso sugiere que la mNGS puede generar un complemento útil a los métodos de diagnóstico patogénico convencionales a través de un cribado etiológico más detallado (es decir, a nivel de especie o complejo de especies).Files
pdf.pdf
Files
(3.4 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:33bbc92075d210177560cabf56672e6f
|
3.4 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تشخيص داء البريميات المعقد بسبب السل الرئوي المكمل بتسلسل الجيل التالي من الميتاجينوم: تقرير حالة
- Translated title (French)
- Le diagnostic de leptospirose compliquée par une tuberculose pulmonaire complétée par un séquençage métagénomique de nouvelle génération : un rapport de cas
- Translated title (Spanish)
- El diagnóstico de la leptospirosis complicada por la tuberculosis pulmonar complementado por la secuenciación metagenómica de próxima generación: un informe de caso
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4300818808
- DOI
- 10.3389/fcimb.2022.922996
References
- https://openalex.org/W1520458414
- https://openalex.org/W1709704437
- https://openalex.org/W1719194587
- https://openalex.org/W1747225952
- https://openalex.org/W1970025329
- https://openalex.org/W1971321218
- https://openalex.org/W1974753843
- https://openalex.org/W1982943029
- https://openalex.org/W1984808281
- https://openalex.org/W2035542801
- https://openalex.org/W2045517532
- https://openalex.org/W2055666215
- https://openalex.org/W2066947305
- https://openalex.org/W2096117114
- https://openalex.org/W2099063463
- https://openalex.org/W2101785003
- https://openalex.org/W2170551349
- https://openalex.org/W2290143593
- https://openalex.org/W2465798912
- https://openalex.org/W2531474624
- https://openalex.org/W2538367519
- https://openalex.org/W2580457116
- https://openalex.org/W2727327750
- https://openalex.org/W2758686321
- https://openalex.org/W2791302640
- https://openalex.org/W2806904932
- https://openalex.org/W2810245211
- https://openalex.org/W2888790183
- https://openalex.org/W2898604559
- https://openalex.org/W2903261926
- https://openalex.org/W2974423343
- https://openalex.org/W2990027863
- https://openalex.org/W2990618091
- https://openalex.org/W2991411251
- https://openalex.org/W2996020779
- https://openalex.org/W3043579420
- https://openalex.org/W3119403965
- https://openalex.org/W3179609383
- https://openalex.org/W3197921008
- https://openalex.org/W3209358310
- https://openalex.org/W4200185730
- https://openalex.org/W4200260000
- https://openalex.org/W4200299423
- https://openalex.org/W4221118780
- https://openalex.org/W75505851